| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 1533866 = | 136 (1.050) | 7 (0.060) | 7/232 | NT | 5.7% | coding (207/576 nt) | USA300HOU_1400 | hypothetical protein |
| ? | CP000730 | 1533900 = | 108 (0.920) | coding (173/576 nt) | USA300HOU_1400 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 166 total aligned reads displayed.
ACTATTAAATCATCTAGCCTTTGCTCACGCTTTGACACGTTTGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAACTGCAATACGCGACT > CP000730/1533726‑1534005 | tttattgaatagttactttttcaatatcgatttaagtcgcgtattgcagtttgggtgcttaactatataaaagtgaatgaggcgaaattggcaaacattcattttgtagatacaaaaattaatcatcatgaaacattagaa > 2:946704‑M1/141‑141 (MQ=255) ttattgaatatttactttttcaatatcgatttaagtcgcgtattgcagtttgggtgcttaactatataaaagtgaatgaggcgaaattggcaaacattcattttgtagatacaaaaattaatcatcatgaaacattagaaa < 1:347637‑M1/2‑1 (MQ=255) tATTAAATCATCTAGCCTTTGCTCACGCTTTGACACGTTTGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAaattgaat > 2:1171859/1‑141 (MQ=255) attgaatatttactttttcaatatcgatttaagtcgcgtattgcagtttgggtgcttaactatataaaagtgaatgaggcgaaattggcaaacattcattttgtagatacaaaaattaatcatcatgaaacattagaAAtt < 1:1629226‑M1/4‑1 (MQ=255) ttAAATCATCTAGCCTTTGCTCACGCTTTGACACGTTTGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAaattgaattg > 2:1573496/1‑141 (MQ=255) ttAAATCATCTAGCCTTTGCTCACGCTTTGACACGTTTGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAaattgaattg < 1:299913/141‑1 (MQ=255) ttAAATCATCTAGCCTTTGCTCACGCTTTGACACGTTTGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAaattgaattg < 1:999701/141‑1 (MQ=255) gaatatttactttttcaatatcgatttaagtcgcgtattgcagtttgggtgcttaactatataaaagtgaatgaggcgaaattggcaaacattcattttgtagatacaaaaattaatcatcatgaaacattagaAATTGCa > 1:588458‑M1/135‑141 (MQ=255) gaatatttactttttcaatatcgatttaagtcgcgtattgcagtttgggtgcttaactatataaaagtgaatgaggcgaaattggcaaacattcattttgtagatacaaaaattaatcatcatgaaacattagaAATTGCa > 1:1414222‑M1/135‑141 (MQ=255) gaatatttactttttcaatatcgatttaagtcgcgtattgcagtttgggtgcttaactatataaaagtgaatgaggcgaaattggcaaacattcattttgtagatacaaaaattaatcatcatgaaacattagaAATTGCa < 1:79689‑M1/7‑1 (MQ=255) aatatttactttttcaatatcgatttaagtcgcgtattgcagtttgggtgcttaactatataaaagtgaatgaggcgaaattggcaaacattcattttgtagatacaaaaattaatcatcatgaaacattagaAATTGCAg > 2:78859‑M1/134‑141 (MQ=255) aatatttacttgttcaatatcgatttaagtcgcgtattgcagtttgggtgcttaactatataaaagtgaatgaggcgaaattggcaaacattcattttgtagatacaaaaattaatcatcatgaaacattagaAATTGCAg > 1:809840‑M1/134‑141 (MQ=255) tatttactttttcaatatcgatttaagtcgcgtattgcagtttgggtgcttaactatataaaagtgaatgaggcgaaattggcaaacattcattttgtagatacaaaaattaatcatcatgaaacattagaAATTGCAGaa > 1:1129601‑M1/132‑141 (MQ=255) ccTTTGCTCACGCTTTGACACGTTTGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACt < 2:83314/141‑1 (MQ=255) cTTTGCTCACGCTTTGACACGTTTGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACtt < 2:1519131/141‑1 (MQ=255) tcTCACGGTTTGACACGTTTGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAgtgggaagtcacg < 2:1397323/140‑13 (MQ=255) aatatcgatttaagtcgcgtattgcagtttgggtgcttaactatataaaagtgaatgaggcgaaattggcaaacattcattttgtagatacaaaaattaatcatcatgaaacattagaAATTGCAGAAGCGTGACTCCCCa > 2:320456‑M1/119‑141 (MQ=255) cTCACGCTTTGACACGTTTGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCg < 1:62885/130‑1 (MQ=255) cTCACGCTTTGACACGTTTGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCg > 2:62885/1‑130 (MQ=255) cTCACGCTTTGACACGTTTGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCAc < 1:1159917/141‑1 (MQ=255) tCACGCTTTGACACGTTTGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACt > 1:415715/1‑141 (MQ=255) aCGCGTTGACACGTTTGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTc < 2:674433/141‑1 (MQ=255) gCTTTGACACGTTTGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTg > 2:1049063/1‑141 (MQ=255) gCTTTGACACGTTTGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTg > 1:203679/1‑141 (MQ=255) cTTTGACACGTTTGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGc < 2:1566019/141‑1 (MQ=255) cTTTGACACGTTTGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGc < 2:835351/141‑1 (MQ=255) gACACGTTTGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAAtt > 2:369116/1‑141 (MQ=255) gACACGTTTGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAAtt > 2:470939/1‑141 (MQ=255) cacGTTTGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATCATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTc < 1:1605968/141‑1 (MQ=255) cacGTTTGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTc < 1:36874/141‑1 (MQ=255) cacGTTTGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTc < 2:580032/141‑1 (MQ=255) cacGTTTGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTc > 2:1069096/1‑141 (MQ=255) cacGTTTGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTc > 2:423772/1‑141 (MQ=255) tttGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAAt > 1:1659264/1‑141 (MQ=255) tttGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAAt > 1:43424/1‑141 (MQ=255) ttGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATg < 2:911784/141‑1 (MQ=255) cGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGttt > 2:973339/1‑141 (MQ=255) tgaagggggatGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑c < 2:1117267/131‑1 (MQ=255) aaGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑Ca > 2:116081/1‑141 (MQ=255) aaGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑Ca > 1:237010/1‑141 (MQ=255) gAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑Catgat < 2:1308209/141‑1 (MQ=255) gAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑Catgat < 1:347957/141‑1 (MQ=255) aTTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CAtgatga < 1:1144252/141‑1 (MQ=255) ttGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGAtt < 1:219309/141‑1 (MQ=255) aaTATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAAt > 2:358590/1‑141 (MQ=255) atatCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAAtt < 2:1016138/141‑1 (MQ=255) atCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATGTGTTTGGATTAACTGTATGTTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAAtttt < 1:1485014/141‑1 (MQ=255) cAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTg > 2:108104/1‑141 (MQ=255) cAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTg < 1:381575/141‑1 (MQ=255) aaGCACCGTTATGATTAGCGATATAACCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTTGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTAACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTAt < 2:539529/141‑1 (MQ=255) aaGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTAt > 2:1641123/1‑141 (MQ=255) aGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAAt > 1:1111167/1‑115 (MQ=255) aGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAAt < 2:1111167/115‑1 (MQ=255) cacaGTTATGATTAGCGATATAATCACATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTa > 1:465652/1‑141 (MQ=255) cacaGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTa > 1:1524502/1‑141 (MQ=255) cacaGTTAAGGTTAGCAATATAGACAAAGATTTCATTTGTATTCGTTAACTTTATCTTTAGCATATTAAATTGAATTGCAGAAGCTTGACTTCCCACTTCTACAATTTTTACTATTG‑AATGATGATCAATATTTGTATCtt > 2:1650071/1‑140 (MQ=255) gTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACaaa > 2:1110667/1‑141 (MQ=255) ttATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACaaaa < 1:1646552/141‑1 (MQ=255) tATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAaat < 1:1435117/141‑1 (MQ=255) tGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAaatga < 1:1452098/141‑1 (MQ=255) aTTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTACTGTTTCCATG‑TCACTAATTTTTGTATCTACAAaatgaat < 2:73834/141‑1 (MQ=255) aGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGtt < 1:259549/141‑1 (MQ=255) gCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGttt > 2:825435/1‑141 (MQ=255) gCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATAACGATTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTATGCAATTTCTAATGTTA‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGttt > 2:644099/1‑141 (MQ=255) atatAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGcc < 1:1536965/141‑1 (MQ=255) tCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTCGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCGAATTTc > 2:407675/1‑141 (MQ=255) tCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTc > 2:1264407/1‑141 (MQ=255) tCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTc > 2:373591/1‑141 (MQ=255) cAAATATGTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCg < 2:1164456/141‑1 (MQ=255) aaTATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGcc < 1:821920/141‑1 (MQ=255) ttCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCacctcgaaataatt > 2:59812/1‑128 (MQ=255) ttCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCAtt > 1:1501712/1‑141 (MQ=255) tCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTGATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTc < 1:1641517/141‑1 (MQ=255) tCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCAttt > 1:766239/1‑140 (MQ=255) tCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTc > 2:801175/1‑141 (MQ=255) aTTTGTATTCATTAACTTTCAATTACGCGTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCTCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCAc > 2:419597/1‑141 (MQ=255) aTTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCAc > 1:779387/1‑141 (MQ=255) aTTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCAc < 1:1500941/141‑1 (MQ=255) tATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTta > 2:754673/1‑141 (MQ=255) atacaaaaattaatcatcatgaaacattagaAATTGCAGAAGTGGGAAGTCACGCTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTtatat < 2:447119‑M1/110‑1 (MQ=255) cATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGCCTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CAAGATGATTAATTTTTGTATTTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCGTCATTCACTTTattata > 1:890459/1‑141 (MQ=255) ttAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGt < 2:278373/141‑1 (MQ=255) tAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGtt > 2:485467/1‑141 (MQ=255) cTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAg > 2:187580/1‑141 (MQ=255) ttATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCa < 1:1205729/141‑1 (MQ=255) ttATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCa < 2:1641968/141‑1 (MQ=255) ttATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCa < 1:939410/141‑1 (MQ=255) atatTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCTCCTCATTCACTTTTATATAGTTATGCAcc > 2:250267/1‑141 (MQ=255) atatTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCa > 2:80933/1‑139 (MQ=255) atatTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCAcc > 1:783790/1‑141 (MQ=255) atatTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCAcc > 1:628548/1‑141 (MQ=255) atatTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCAcc > 2:125827/1‑141 (MQ=255) tatTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCAccc > 1:512856/1‑141 (MQ=255) tatTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCAccc < 1:1065737/141‑1 (MQ=255) tcatcatgaaacattagaAATTGCAGAAGTGGGAAGTCACGCTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGtt > 1:951776‑M1/19‑99 (MQ=255) tcatcatgaaacattagaAATTGCAGAAGTGGGAAGTCACGCTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGtt < 2:951776‑M1/81‑1 (MQ=255) aCGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAAc > 1:1266758/1‑141 (MQ=255) tAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAACTGCaa < 1:187580/141‑1 (MQ=255) gaattgCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAACTGCAATAcgc < 2:1500158/137‑1 (MQ=255) gaattgCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAACTGCAATACGCGACt < 1:928120/141‑1 (MQ=255) | ACTATTAAATCATCTAGCCTTTGCTCACGCTTTGACACGTTTGCGAAGTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTACGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTT‑CATGATGATTAATTTTTGTATCTACAAAATGAATGTTTGCCAATTTCGCCTCATTCACTTTTATATAGTTAAGCACCCAAACTGCAATACGCGACT > CP000730/1533726‑1534005 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |