| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 96,897 | A→G | 7.8% | intergenic (+1413/+66) | gloB → / ← USA300HOU_0095 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 96,897 | 0 | A | G | 7.8% | 493.0 / 24.5 | 167 | intergenic (+1413/+66) | gloB/USA300HOU_0095 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (85/69); new base G (5/8); total (90/77) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.63e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.01e-01 | |||||||||||
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
ATGACGTGTCAGTGTTGTGTTTATATGTCGTGAATTTTTAGCTCTAAATAGTATAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATGGTATTTGAGCACGTTTAGCGACTTTATGACTGACATTACCAATTTCCATTTC > CP000730/96761‑97034 | aTGACGTGTCAGTGTTGTGTTTATATGTCGTGAATTTTTAGCTCTAAATAGTATAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGat < 2:836458/141‑1 (MQ=255)aTGACGTGTCAGTGTTGTGTTTATATGTCGTGAATTTTTAGCTCTAAATAGTATAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGat < 1:1343862/141‑1 (MQ=255) tGACGTGTCAGTGTTGTGTTTATATGTCGTGAATTTTTAGCTCTAAATAGTATAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGat‑a > 1:136629/1‑141 (MQ=255) tGACGTGTCAGGGATGTGTTTATATGTCGTGAATTTTTAGCTCTAAATAGTACAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGCTCACGATGAAGTCATCCATTAAAAATCATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGat‑a > 2:38623/1‑141 (MQ=255) gACGTGTCAGTGTTGTGTTTATATGTCGTGAATTTTTAGCTCTAAATAGTATAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGat‑at > 1:300933/1‑141 (MQ=255) gACGTGTCAGTGTTGTGTTTATATGTCGTGAATTTTTAGCTCTAAATAGTATAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGat‑at < 1:153581/141‑1 (MQ=255) cAGTGTTGTGTTTATATGTCGTGAATTTTTAGCTCTAAATAGTATAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTaa > 1:1161405/1‑141 (MQ=255) gtgttgtgttTATATGTCGTGAATTTTTAGCTCTAAATAGTATAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAAtt < 1:1438088/141‑1 (MQ=255) gttgtgttTATATGTCGTGAATTTTTAGCTCTAAATAGTATAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑Ga < 2:1260009/141‑1 (MQ=255) gttgtgttTATATGTCGTGAATTTTTAGCTCTAAATAGTATAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑Ga > 1:1110555/1‑141 (MQ=255) tgtgttTATATGTCGTGAATTTTTAGCTCTAAATAGTATAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTGAGATGATTTTcaattagaa < 2:713650/141‑9 (MQ=255) tgtgttTATATGTCGTGAATTTTTAGCTCTAAATAGTATAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑Gaaa < 1:1304539/141‑1 (MQ=255) gtgttTATATGTCGTGAATTTTTAGCTCTAAATAGTATAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑Gaaaa < 2:1410559/141‑1 (MQ=255) ttATATGTCGTGAATTTTTAGCTCTAAATAGTATAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAatcat < 2:131656/141‑1 (MQ=255) atatGTCGTGAATTTTTAGCTCTAAATAGTATAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTGAGATGATTTTC‑AATTAGAAAatatct > 2:366329/1‑137 (MQ=38) tatGTCGTGAATTTTTAGCTCTAAATAGTATAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCAtctc > 1:1600177/1‑141 (MQ=255) tGTCGTGAATTTTTAGCTCTAAATAGTATAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTGAGATGATTTTC‑AATTAGAAAatatcttac < 1:372560/141‑8 (MQ=37) gTGAATTTTTAGCTCTAAATAGTATAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCActgct > 1:1066982/1‑141 (MQ=255) tGAATTTTTAGCTCTAAATAGTATAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCActgctg < 2:1041604/141‑1 (MQ=255) tGAATTTTTAGCTCTAAATAGTATAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCActgctg < 2:798319/141‑1 (MQ=255) gAATTTTTAGCTCTAAATAGTATAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGAGTGAGTCGCTCAAGAAGGATGAAGATGAAAATAGAAACAGCATTAAGAT‑ATCTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCGGt > 1:1653465/1‑141 (MQ=255) aTTTTTAGCTCTAAATAGTATAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTGAGATGATTTTC‑AATTAGAAAAT‑ATCTTACTGCTGttt < 1:590330/141‑1 (MQ=25) aTTTTTAGCTCTAAATAGTATAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGttt < 2:1520604/141‑1 (MQ=255) ttttAGCTCTAAATAGTATAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGttttt < 1:1072193/141‑1 (MQ=255) tttAGCTCTAAATAGTATAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGtttttt > 1:518240/1‑141 (MQ=255) tttAGCTCTAAATAGTATAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGtttttt > 2:142891/1‑141 (MQ=255) tAGCTCTAAATAGTATAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTGAGATGATTTTC‑AATTAGAAAatatcttact < 2:783126/129‑9 (MQ=37) aGCTCTAGATAGTATAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTaaa > 1:1313337/1‑141 (MQ=255) aGCTCTAAATAGTATTAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTaaa < 1:1378564/141‑1 (MQ=255) aGCTCTAAATAGTATAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTaaa > 1:875277/1‑141 (MQ=255) aGCTCTAAATAGTATAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTaaa < 1:272788/141‑1 (MQ=255) gCTCTAAATAGTATAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAg < 2:922645/141‑1 (MQ=255) ctAAATAGTATAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGtt > 2:1498653/1‑141 (MQ=255) aaacaGTATAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTta < 2:230375/137‑1 (MQ=255) aaaTAGTATAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTta < 1:119738/141‑1 (MQ=255) aaaTAGTATAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTta < 1:1328246/141‑1 (MQ=255) tataAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCTTACAATTTGGATGATTATTAATATAGAAACTTCAGTAATAT‑TTTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTc > 1:328073/1‑141 (MQ=37) tataAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTc < 1:48/141‑1 (MQ=255) tataAGATTGAAAAAGTTGTTACTGCTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATTATCTCACTGCCGTTTTTTAAAGGTTTATACATc > 1:1148286/1‑141 (MQ=255) ataAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCa < 2:4543/141‑1 (MQ=255) taAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAATCAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCAt < 2:803487/141‑1 (MQ=255) taAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCAt > 2:1351985/1‑141 (MQ=255) aGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATcc > 2:1534053/1‑141 (MQ=255) aGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATcc > 1:902411/1‑141 (MQ=255) gATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCct < 1:390993/141‑1 (MQ=255) ttGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCctct > 1:269324/1‑141 (MQ=255) gAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTaa < 1:1480690/141‑1 (MQ=255) aaaaaGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTaaa > 2:229054/1‑141 (MQ=255) aaaaGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAat > 1:1009765/1‑141 (MQ=255) aaaaGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAat > 1:47622/1‑141 (MQ=255) aaGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAatta < 2:172580/141‑1 (MQ=255) aGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAattat > 2:1596181/1‑141 (MQ=255) gttgttACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAattatt > 2:414878/1‑141 (MQ=255) ttgttACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTAttt < 1:844085/141‑1 (MQ=255) tgttACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTa < 1:74073/141‑1 (MQ=255) ttACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTaaa > 2:330675/1‑141 (MQ=255) ttACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTaaa > 2:904215/1‑141 (MQ=255) ttACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTaaa < 1:1138351/141‑1 (MQ=255) tACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTaaaa < 1:1422583/141‑1 (MQ=255) cTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAaat > 2:532895/1‑141 (MQ=255) tGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAaata < 1:420656/141‑1 (MQ=255) ttttAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAaataat < 1:1463608/141‑1 (MQ=255) aaTGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATg > 1:698981/1‑141 (MQ=255) aaTGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATg > 1:1130384/1‑141 (MQ=255) tGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATGGt > 2:966962/1‑141 (MQ=255) gATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATGGTa < 1:554097/141‑1 (MQ=255) cGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATGGTATTTGa < 1:1521319/141‑1 (MQ=255) cGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATGGTATTTGa > 1:468674/1‑141 (MQ=255) gATGAAGTCATTCAAGAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATGGTATTTGAg < 1:1373962/141‑1 (MQ=255) aTGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATGGTATTTGAGc > 1:1338643/1‑141 (MQ=255) gAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATGGTATTTGAGCAc > 2:912739/1‑141 (MQ=255) aaGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCActg > 2:292040/1‑74 (MQ=255) aGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTATTTTTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATGGTATTTGAGCACGt > 2:1085231/1‑141 (MQ=255) tCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATGGTATTTGAGCACGTTTAGCg < 2:746332/141‑1 (MQ=255) aTAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATGGTATTTGAGCACGTTTAGCGACt > 2:680293/1‑141 (MQ=255) aTAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATGGTATTTGAGCACGTTTAGCGACt > 2:1479556/1‑141 (MQ=255) aaGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTTTTTTTTTTTACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATGGTATTTGAGCACGTTTAGCGACttt > 2:569091/1‑141 (MQ=38) gcaTGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATGGTATTTGAGCACGTTTAGCGACTTTAt < 2:61155/139‑1 (MQ=255) gAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATGGTATTTGAGCACGTTTAGCGACTTTAt > 1:121811/1‑141 (MQ=255) aaTGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATAGTATTTGAGCACGTTTATCTACTTTagt > 2:1403040/1‑139 (MQ=255) aTTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAACATAATTAATGGTATTTGAGCACGTTTAGCGACTTTAtgactg > 2:1583433/1‑141 (MQ=255) tATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATGGTATTTGAGCACGTTTAGCGACTTTAtgactgac < 2:1371360/141‑1 (MQ=255) tGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATGTTATTTGAGCACGTTTAGCGACTTTATGACTGACAt < 2:1217605/141‑1 (MQ=255) tGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATGGTATTTGAGCACGTTTAGCGACTTTATGACTGACAt > 1:1631611/1‑141 (MQ=255) gAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATGGTATTTGAGCACGTTTAGCGACTTTATGACTGACAtt < 1:1631022/141‑1 (MQ=255) aaaaTAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATGGTATTTGAGCACGTTTAGCGACTTTATGACTGACATTa < 1:541558/141‑1 (MQ=255) aaaTAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATGGTATTTGAGCACGTTTAGCGACTTTATGACTGACATTAc > 1:349208/1‑141 (MQ=255) aaaTAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATGGTATTTGAGCACGTTTAGCGACTTTATGACTGACATTAc < 2:252395/141‑1 (MQ=255) tAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATGGTATTTGAGCACGTTTAGCGACTTTATGACTGACATTACCaa < 1:387838/141‑1 (MQ=255) aaaCAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATGGTATTTGAGCACGTTTAGCGACTTTATGACTGACATTACCAAttt > 1:638498/1‑141 (MQ=255) aaaCAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATGGTATTTGAGCACGTTTAGCGACTTTATGACTGACATTACCAAttt > 1:1174946/1‑141 (MQ=255) aaCAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATGGTATTTGAGCACGTTTAGCGACTTTATGACTGACATTACCAATTTc > 2:595716/1‑141 (MQ=255) aaCAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATGGTATTTGAGCACGTTTAGCGACTTTATGACTGACATTACCAATTTc > 2:1480104/1‑141 (MQ=255) aCAGCAGTGAGATGATTTTC‑AATTAGAAAAT‑ATCTTACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATGGTATTTGAGCACGTTTAGCGACTTTATGACTGACATTACCAATTTcc > 1:771958/1‑141 (MQ=37) aCAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATGGTATTTGAGCACGTTTAGCGACTTTATGACTGACATTACCAATTTcc < 2:104274/141‑1 (MQ=255) cagcagTGAGATGATTTTC‑AATTAGAAAAT‑ATCTTACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATGGTATTTGAGCACGTTTAGCGACTTTATGACTGACATTACCAATTTCCa > 1:1204955/1‑141 (MQ=37) agtagTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATGGTATTTGAGCACGTTTAGCGACTTTATGACTGACATTACCAATTTCCAt < 2:1392613/138‑1 (MQ=255) agcagTGAGATGATTTTC‑AATTAGAAAAT‑ATCTTACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATGGTATTTGAGCACGTTTAGCGACTTTATGACTGACATTACCAATTTCCAt > 1:58610/1‑141 (MQ=37) agcagTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATGGTATTTGAGCACGTTTAGCGACTTTATGACTGACATTACCAATTTCCAt < 2:638498/141‑1 (MQ=255) agcagTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATGGTATTTGAGCACGTTTAGCGACTTTATGACTGACATTACCAATTTCCAt < 2:1521136/141‑1 (MQ=255) | ATGACGTGTCAGTGTTGTGTTTATATGTCGTGAATTTTTAGCTCTAAATAGTATAAGATTGAAAAAGTTGTTACTGTTTTAAATGATCACGATGAAGTCATTCAATAAGAATGATTATGAAAATAGAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATCATCTCACTGCTGTTTTTTAAAGGTTTATACCTCATCCTCTAAATTATTTAAAAATAATTAATGGTATTTGAGCACGTTTAGCGACTTTATGACTGACATTACCAATTTCCATTTC > CP000730/96761‑97034 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |