| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 803,528 | C→T | 6.5% | intergenic (+36/+42) | USA300HOU_0750 → / ← dtpT | hypothetical protein/POT family proton (H+)‑dependent oligopeptide transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 803,528 | 0 | C | T | 6.5% | 453.6 / 12.4 | 149 | intergenic (+36/+42) | USA300HOU_0750/dtpT | hypothetical protein/POT family proton (H+)‑dependent oligopeptide transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (61/75); new base T (5/5); total (69/80) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.55e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.08e-01 | |||||||||||
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
AAAATGGTAATAAATGAAATTGATTTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAGTAAT > CP000730/803388‑803667 | aaTGGTAATAAATGAAATTGATTTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCa > 2:144044/1‑141 (MQ=255) aaTGGTAATAAATGAAATTGATTTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCa < 1:82675/141‑1 (MQ=255) aaTGGTAATAAATGAAATTGATTTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCa > 1:938102/1‑141 (MQ=255) aaTGGTAATAAATGAAATTGATTTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAAAAAATAAAAAAACAGTAAGCCa < 2:1361521/141‑1 (MQ=255) aaTGGTAATAAATGAAATTGATTTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCCATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCa < 1:29585/141‑1 (MQ=255) aTGGTAATAAATGAAATTGATTTCTATAGAGCGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCAt > 2:1159278/1‑141 (MQ=255) tGGTAATAAATGAAATTGATTTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCAtt > 2:75949/1‑141 (MQ=255) aataaATGAAATTGATTTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTaaa < 2:1100533/141‑1 (MQ=255) ataaATGAAATTGATTTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAAt > 2:859837/1‑141 (MQ=255) ataaATGAAATTGATTTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAAt < 1:342677/141‑1 (MQ=255) attaaaTTGATTTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACt < 2:201326/138‑1 (MQ=255) aaTTGATTTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACt < 1:198659/141‑1 (MQ=255) aaTTGATTTCTATAGAGTGAGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGACTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTatt < 2:303502/141‑3 (MQ=255) tGATTTCTATAGAGTGGTACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑tt < 1:349054/141‑1 (MQ=255) gatttgaagagagGGGGACGAGAAAATAAAGTTAGAGTTAGCAGTAATTGGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGTATTTTATAAAAAAACTTTATACTATTTAAATTACTTACTG‑ttt > 2:829856/10‑141 (MQ=255) gATTTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTG‑ttt > 2:1427038/1‑141 (MQ=255) aTTTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑tttt < 2:809437/141‑1 (MQ=255) ttCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTG‑tttttt < 1:1427038/141‑1 (MQ=255) gagTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAg < 1:1588844/141‑1 (MQ=255) gggACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCca > 2:617608/1‑141 (MQ=255) ggACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCcaa < 2:1612100/141‑1 (MQ=255) ggACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCcaa > 2:340016/1‑141 (MQ=255) gACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCcaac < 2:291290/141‑1 (MQ=255) gACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCcaac < 1:1641954/141‑1 (MQ=255) aCGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCcaaca > 1:547537/1‑141 (MQ=255) gaAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAatat < 2:1507884/141‑1 (MQ=255) aaaaTATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATAtt < 1:856890/141‑1 (MQ=255) aaaaTATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATAtt < 2:1112603/141‑1 (MQ=255) aaTATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTaa > 1:1219900/1‑141 (MQ=255) aaTATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTaa > 1:1311252/1‑141 (MQ=255) atatAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAAc > 1:618313/1‑141 (MQ=255) ataGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCAAACAATATTAACGt > 1:1510312/1‑141 (MQ=255) taGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGta > 1:972408/1‑141 (MQ=255) taGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGta > 1:972333/1‑141 (MQ=255) gTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGtata > 2:471830/1‑141 (MQ=255) taGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCtt < 1:5900/141‑1 (MQ=255) taGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCtt < 2:1466863/141‑1 (MQ=255) gCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTTTTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTc > 2:1237456/1‑141 (MQ=255) gCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTTAATTAGGCCAACAATCTTAACGTATACCTTTc > 2:1035780/1‑141 (MQ=255) cTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCa < 1:248967/141‑1 (MQ=255) aaTGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTCCTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTtg < 1:417685/141‑1 (MQ=255) aTGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTtga < 2:51238/141‑1 (MQ=255) aTGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAAAGTATACCTTTCATCGCTTtga > 1:850420/1‑141 (MQ=255) gAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTtgatg < 2:207078/141‑1 (MQ=255) aGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTACTAGAACCCTATCATTACACTGTAAGCCAATTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTtgatga < 1:1653200/141‑1 (MQ=255) gCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTgatgat < 1:1089207/141‑1 (MQ=255) cATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGAtt > 2:794617/1‑141 (MQ=255) ttAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAg < 2:1184422/141‑1 (MQ=255) tAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAgg < 2:285089/141‑1 (MQ=255) tAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAgg < 1:1470282/141‑1 (MQ=255) tAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAgg < 1:1470522/141‑1 (MQ=255) aGTATTTATTTATACTGATATTTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTg < 2:432232/141‑1 (MQ=255) gTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTACTAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTga < 1:1536249/141‑1 (MQ=255) gTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTtga > 2:757494/1‑128 (MQ=255) ttttATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTgaga < 1:651571/141‑1 (MQ=255) tatttttACTGTAATCTTAAAATTAATTAAGATAATCTTAGTAAAAAACAGTAAGGCATTTAATTTACTCACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAGTATTGGCGTATACCTTTTTTCTCTATGATGAGGAAATGCGTGATTg > 2:1184260/1‑141 (MQ=255) atttatACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGc > 2:185396/1‑141 (MQ=255) tttatACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCt < 1:75949/141‑1 (MQ=255) ataCTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAAt > 1:671431/1‑141 (MQ=255) ataCTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAAt < 1:883754/141‑1 (MQ=255) cTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACa > 1:1018498/1‑141 (MQ=255) tGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACaa > 2:196685/1‑141 (MQ=255) tGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACaa < 2:687635/141‑1 (MQ=255) gATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAAt > 1:1004816/1‑141 (MQ=255) tCTTGAATTTAATTAATAGAAACACCTAATGCAAATTTAGGGTATTTTAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAAttgtt > 2:494329/1‑141 (MQ=255) ttGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATtgttgt > 1:789131/1‑141 (MQ=255) ttGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGAAATCTAAATGACATACTG‑TATATTGAATTAGGCCAACAAAATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTAATGATTAAAGGTAACATTGCTAATACAAGtgttgt > 2:417534/1‑141 (MQ=255) tGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTa > 2:491193/1‑141 (MQ=255) gactctaattattAGAAATCTGTAAAAAAACAGTAATCCATTTATATGACTTACTG‑CTTTTTGAATTAGGCCAAAAATATTAACGTATACCTTTCATCTCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTaa > 2:849285/6‑141 (MQ=255) gAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTaa > 2:278986/1‑141 (MQ=255) aaTTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAAc < 1:42722/141‑1 (MQ=255) aTTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAAc < 1:658024/141‑1 (MQ=255) aTTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACa < 2:587548/141‑1 (MQ=255) aTTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACa > 2:700582/1‑141 (MQ=255) aTTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACa > 1:474295/1‑141 (MQ=255) taattaatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTATTGTTACaaca < 1:544753/141‑3 (MQ=255) aattaatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACaataa > 1:1049978/1‑141 (MQ=255) aattaatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACATATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACaataa > 2:879555/1‑141 (MQ=255) attaatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACaataat > 2:1496034/1‑141 (MQ=255) attaatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACaataat > 1:1515734/1‑141 (MQ=255) attaatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACaataat > 2:1304467/1‑141 (MQ=255) attaatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACaataat > 1:372209/1‑141 (MQ=255) tAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTCCTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATCCCTTTCAGCGCTTTGATGATCAAAAGCGAGATTGCTAATACAATTTTTGTACCAATAATCGcaa > 2:292318/1‑141 (MQ=255) tAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGcaa > 1:1612879/1‑141 (MQ=255) aaGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGcaa < 1:1067073/140‑1 (MQ=255) aaaCCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGcaacaa < 1:1047604/141‑1 (MQ=255) aaaCCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGcaacaa < 1:1615887/141‑1 (MQ=255) aCCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAacaaca < 2:404290/141‑1 (MQ=255) cTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGcaacacttta > 1:1145978/1‑136 (MQ=255) tataAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCt < 1:769130/141‑1 (MQ=255) ataAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTa > 2:677390/1‑141 (MQ=255) taAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAg < 1:519340/141‑1 (MQ=255) aaCAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAAt > 1:1317024/1‑141 (MQ=255) aCAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCcaac > 2:1445340/1‑46 (MQ=255) aCAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCcaac < 1:1445340/46‑1 (MQ=255) gTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAg > 1:703822/1‑141 (MQ=255) tAAGTCATTTAAATGGCTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTa > 2:1224260/1‑107 (MQ=255) tAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAGt < 2:524283/141‑1 (MQ=255) aaGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAGTa < 2:1526350/141‑1 (MQ=255) gCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATGCCTTTCAGCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAGATAAGGTAAt < 2:63540/141‑1 (MQ=255) | AAAATGGTAATAAATGAAATTGATTTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAGTAAT > CP000730/803388‑803667 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |