| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 803,539 | A→G | 8.6% | intergenic (+47/+31) | USA300HOU_0750 → / ← dtpT | hypothetical protein/POT family proton (H+)‑dependent oligopeptide transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 803,539 | 0 | A | G | 8.6% | 432.3 / 23.4 | 151 | intergenic (+47/+31) | USA300HOU_0750/dtpT | hypothetical protein/POT family proton (H+)‑dependent oligopeptide transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (62/76); new base G (8/5); total (70/81) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.84e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.38e-01 | |||||||||||
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
ATGAAATTGATTTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAGTAATTTGTTTGACCT > CP000730/803401‑803678 | aTGAAATTGATTTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACt < 2:201287/141‑1 (MQ=255) tGAAATTGATTTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACtt < 2:27605/141‑1 (MQ=255) gAAATTGATTTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTa < 2:680716/141‑1 (MQ=255) aaTTGATTTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACt < 1:198659/141‑1 (MQ=255) tGATTTCTATAGAGTGGTACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑tt < 1:349054/141‑1 (MQ=255) gatttgaagagagGGGGACGAGAAAATAAAGTTAGAGTTAGCAGTAATTGGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGTATTTTATAAAAAAACTTTATACTATTTAAATTACTTACTG‑ttt > 2:829856/10‑141 (MQ=255) gATTTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTG‑ttt > 2:1427038/1‑141 (MQ=255) gATTTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑ttt < 2:28845/141‑1 (MQ=255) aTTTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑tttt < 2:809437/141‑1 (MQ=255) ttCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGTCATTTAAATGGCTTACTG‑tttttt < 1:1427038/141‑1 (MQ=255) tataGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGaa < 2:1508379/141‑1 (MQ=255) ataGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAAt > 2:18140/1‑141 (MQ=255) gggACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCca > 2:617608/1‑141 (MQ=255) ggACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCcaa < 2:1612100/141‑1 (MQ=255) ggACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCcaa > 2:340016/1‑141 (MQ=255) ggACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCcaa < 2:1025345/141‑1 (MQ=255) gACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCcaac < 1:1641954/141‑1 (MQ=255) aCGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCcaaca > 1:547537/1‑141 (MQ=255) aaaaTATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATAtt < 1:856890/141‑1 (MQ=255) aaaaTATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATAtt > 2:526169/1‑141 (MQ=255) aaaaTATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATAtt < 2:1112603/141‑1 (MQ=255) aaTATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTaa > 1:1219900/1‑141 (MQ=255) aaTATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTaa > 1:1311252/1‑141 (MQ=255) atatAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAAc < 1:177229/141‑1 (MQ=255) ataGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCAAACAATATTAACGt > 1:1510312/1‑141 (MQ=255) taGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGta > 1:972333/1‑141 (MQ=255) taGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGta > 1:972408/1‑141 (MQ=255) gTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGtata > 2:471830/1‑141 (MQ=255) taGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCtt < 1:5900/141‑1 (MQ=255) gCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTTTTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTc > 2:1237456/1‑141 (MQ=255) aaTGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTCCTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTtg < 1:417685/141‑1 (MQ=255) aaTGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTtg < 1:1593169/141‑1 (MQ=255) aTGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTtga > 1:275831/1‑141 (MQ=255) aTGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAAAGTATACCTTTCATCGCTTtga > 1:850420/1‑141 (MQ=255) gAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTtgatg < 2:207078/141‑1 (MQ=255) gCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTgatgat < 1:1089207/141‑1 (MQ=255) cATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGAtt > 2:794617/1‑141 (MQ=255) ttAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAg < 2:1184422/141‑1 (MQ=255) tAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAgg < 1:1470282/141‑1 (MQ=255) tAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAgg < 2:285089/141‑1 (MQ=255) tAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAgg < 1:1470522/141‑1 (MQ=255) gTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTACTAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTga < 1:1536249/141‑1 (MQ=255) gTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTtga > 2:757494/1‑128 (MQ=255) gTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTga < 2:1484150/141‑1 (MQ=255) ttttATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTgaga < 1:651571/141‑1 (MQ=255) ttttATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTgaga < 1:1025461/141‑1 (MQ=255) tatttttACTGTAATCTTAAAATTAATTAAGATAATCTTAGTAAAAAACAGTAAGGCATTTAATTTACTCACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAGTATTGGCGTATACCTTTTTTCTCTATGATGAGGAAATGCGTGATTg > 2:1184260/1‑141 (MQ=255) tatttatACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTg < 2:499472/141‑1 (MQ=255) tttatACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCt < 1:75949/141‑1 (MQ=255) ataCTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAAt < 1:883754/141‑1 (MQ=255) tGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACaa > 2:196685/1‑141 (MQ=255) gATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAAt > 1:1004816/1‑141 (MQ=255) tCTTGAATTTAATTAATAGAAACACCTAATGCAAATTTAGGGTATTTTAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAAttgtt > 2:494329/1‑141 (MQ=255) ttGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATtgttgt > 1:789131/1‑141 (MQ=255) ttGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGAAATCTAAATGACATACTG‑TATATTGAATTAGGCCAACAAAATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTAATGATTAAAGGTAACATTGCTAATACAAGtgttgt > 2:417534/1‑141 (MQ=255) tGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTa > 2:491193/1‑141 (MQ=255) gactctaattattAGAAATCTGTAAAAAAACAGTAATCCATTTATATGACTTACTG‑CTTTTTGAATTAGGCCAAAAATATTAACGTATACCTTTCATCTCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTaa > 2:849285/6‑141 (MQ=255) aaTTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAAc < 1:42722/141‑1 (MQ=255) aTTTAATTAATAGAAACCTATCAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTCGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTagaa > 2:354976/1‑138 (MQ=255) aTTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAAc < 1:658191/141‑1 (MQ=255) aTTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACa > 1:474295/1‑141 (MQ=255) aTTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACa > 2:700582/1‑141 (MQ=255) taattaatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTATTGTTACaaca < 1:544753/141‑3 (MQ=255) aattaatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACaataa > 1:1049978/1‑141 (MQ=255) aattaatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACATATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACaataa > 2:879555/1‑141 (MQ=255) attaatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACaataat > 1:372209/1‑141 (MQ=255) attaatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACaataat > 2:1496034/1‑141 (MQ=255) attaatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACaataat > 1:1515734/1‑141 (MQ=255) attaatAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACaataat > 2:1304467/1‑141 (MQ=255) tAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTCCTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATCCCTTTCAGCGCTTTGATGATCAAAAGCGAGATTGCTAATACAATTTTTGTACCAATAATCGcaa > 2:292318/1‑141 (MQ=255) tAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGcaa > 1:1612879/1‑141 (MQ=255) aCCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAacaaca < 2:404290/141‑1 (MQ=255) tataAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCt < 1:769130/141‑1 (MQ=255) ataAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTa > 2:677390/1‑141 (MQ=255) taAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAg < 1:112531/141‑1 (MQ=255) taAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAg < 1:519340/141‑1 (MQ=255) aaCAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAAt > 1:1317024/1‑141 (MQ=255) aCAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCcaac > 2:1445340/1‑46 (MQ=255) aCAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCcaac < 1:1445340/46‑1 (MQ=255) aCAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCcaac < 1:619048/46‑1 (MQ=255) aCAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCcaac > 2:619048/1‑46 (MQ=255) gTAAGTCATTTAAATGGCTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAg > 1:1062601/1‑141 (MQ=255) gTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAg > 1:703822/1‑141 (MQ=255) taagttaTTTAAATGGCTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTa < 1:1224260/101‑1 (MQ=255) tAAGTCATTTAAATGGCTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTa > 2:1224260/1‑107 (MQ=255) tAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAGt < 2:524283/141‑1 (MQ=255) aaGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAGTa < 1:1616725/141‑1 (MQ=255) aaGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAGTa < 2:1526350/141‑1 (MQ=255) cATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAGTAAttt > 1:336636/1‑141 (MQ=255) aTTTAAATGGCTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAGTAAtttg > 1:1011406/1‑141 (MQ=255) aTTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAGTAAtttg < 1:671262/141‑1 (MQ=255) tttAAATGGCTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACCATATTAACGTATACTTTTCATCGGTTTGGTGTGTAAAGGTGGGTTTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAGTAAtttgt > 1:746237/1‑141 (MQ=255) tttAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAGTAAtttgt < 1:617608/141‑1 (MQ=255) ttAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAGTAAtttgtt < 2:1004816/141‑1 (MQ=255) tAAATGGCTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAg > 1:1038623/1‑121 (MQ=255) tAAATGGCTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAg < 2:1038623/121‑1 (MQ=255) tAAATGACTTACTG‑TTTTTTTTTTTTTTTCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAGTAAtttgttt > 2:292875/1‑141 (MQ=255) tAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAGTAAtttgttt < 1:1574838/141‑1 (MQ=255) tGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAGTAATTTGTTTGAcc < 1:794617/141‑1 (MQ=255) gACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAGTAATTTGTTTGACCt < 2:1311748/141‑1 (MQ=255) | ATGAAATTGATTTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTG‑TTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGATTGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAGTAATTTGTTTGACCT > CP000730/803401‑803678 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |