| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,372,946 | G→T | A277D (GCT→GAT) | pbuG ← | NCS2 family nucleobase:cation symporter‑2 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,372,946 | 0 | G | T | 98.7% | 255.3 / NA | 78 | A277D (GCT→GAT) | pbuG | NCS2 family nucleobase:cation symporter‑2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base T (39/38); minor base C (1/0); total (40/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CACCTGAAGTTGATTCGATATAAGAAGTTGTTGTAGTTGTTCCAAAAACTGATCCTACAATCGTAGCTAAAGAATCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTAGCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTTAATAATTGACTTGGGTCTTTAAACGCTTCAAATGCAGCACCGAACGTTGGTTCAATA > CP000730/2372809‑2373083 | cacCTGAAGTTGATTCGATATAAGAAGTTGTTGTAGTTGTTCCAAAAACTGATCCTACAATCGTAGCTAAAGAATCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCaa > 2:134778/1‑141 (MQ=255) tGAAGTTGATTCGATATAAGAAGTTGTTGTAGTTGTTCCAAAAACTGATCCTACAATCGTAGCTAAAGAATCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGc < 1:497361/141‑1 (MQ=255) aaGTTGATTCGATATAAGAAGTTGTTGTAGTTGTTCCAAAAACTGATCCTACAATCGTAGCTAAAGAATCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGcta > 2:685292/1‑141 (MQ=255) aaGTTGATTCGATATAAGAAGTTGTTGTAGTTGTTCCAAAAACTGATCCTACAATCGTAGCTAAAGAATCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGcta > 2:685287/1‑141 (MQ=255) gTTGATTCGATATAAGAAGTTGTTGTAGTTGTTCCAAAAACTGATCCTACAATCGTAGCTAAAGAATCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGctact > 1:560875/1‑141 (MQ=255) ttGATTCGATATAAGAAGTTGTTGTAGTTGTTCCAAAAACTGATCCTACAATCGTAGCTAAAGAATCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGctacta > 1:188824/1‑141 (MQ=255) aTTCGATATAAGAAGTTGTTGTAGTTGTTCCAAAAACTGATCCTACAATCGTAGCTAAAGAATCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATg > 1:358989/1‑141 (MQ=255) ttCGATATAAGAAGTTGTTGTAGTTGTTCCAAAAACTGATCCTACAATCGTAGCTATAGAATGTGAGAAAAGTTCGCTGCCAGCGCTGGGGAATTTATTATCGTTCATAATACCTGCTTGAGTACCAACAGCGACTAATG‑t > 1:915780/1‑141 (MQ=255) tataAGAAGTTGTTGTAGTTGTTCCAAAAACTGATCCTACAATCGTAGCTAAAGAATCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAg > 2:593211/1‑141 (MQ=255) ataAGAAGTTGTTGTAGTTGTTCCAAAAACTGATCCTACAATCGTAGCTAAAGAATCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGc < 1:561407/141‑1 (MQ=255) ataAGAAGTTGTTGTAGTTGTTCCAAAAACTGATCCTACAATCGTAGCTAAAGAATCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGc < 1:128335/141‑1 (MQ=255) ataAGAAGTTGTTGTAGTTGTTCCAAAAACTGATCCTACAATCGTAGCTAAAGAATCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGc < 1:842810/141‑1 (MQ=255) gttgttGTAGTTGTTCCAAAAACTGATCCTACAATCGTAGCTAAAGAATCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCa > 2:762294/1‑141 (MQ=255) tgttgtAGTTGTTCCAAAAACTGATCCTACAATCGTAGCTAAAGAATCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCaaa > 1:205445/1‑141 (MQ=255) tgtAGTTGTTCCAAAAACTGATCCTACAATCGTAGCTAAAGAATCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGaa > 1:341094/1‑141 (MQ=255) gtAGTTGTTCCAAAAACTGATCCTACAATCGTAGCTAAAGAATCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGc < 2:85192/128‑1 (MQ=255) gtAGTTGTTCCAAAAACTGATCCTACAATCGTAGCTAAAGAATCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGc > 1:85192/1‑128 (MQ=255) gtAGTTGTTCCAAAAACTGATCCTACAATCGTAGCTAAAGAATCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGaaa < 2:189032/141‑1 (MQ=255) ttgttCCAAAAACTGATCCTACAATCGTAGCTAAAGAATCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCaa < 1:505696/141‑1 (MQ=255) gtatGATCCTACAATCGTAGCTAAAGAATCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGaa > 2:192377/4‑141 (MQ=255) aCTGATCCTACAATCGTAGCTAAAGAATCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAAc > 1:520015/1‑141 (MQ=255) cTGATCCTACAATCGTAGCTAAAGAATCTGAGAACAATGCTCTACCATCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACg < 1:420637/141‑1 (MQ=255) cTGATCCTACAATCGTAGCTAAAGAATCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACg > 1:821537/1‑141 (MQ=255) tCCTACAATCGTAGCTAAAGAATCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTaa > 2:161400/1‑141 (MQ=255) tCCTACAATCGTAGCTAAAGAATCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTaa > 2:262250/1‑141 (MQ=255) ccTACAATCGTAGCTAAAGAATCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTaaa < 2:136385/141‑1 (MQ=255) tACAATCGTAGCTAAAGAATCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAAt < 1:2890/141‑1 (MQ=255) tACAATCGTAGCTAAAGAATCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAAGG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAAt < 2:180406/141‑1 (MQ=255) cAATCGTAGCTAAAGAATCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATaa > 1:916962/1‑141 (MQ=255) tcctAGCTAAAGAATCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACaa < 2:738635/138‑1 (MQ=255) tCGTAGCTAACGAATCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACaa > 2:562633/1‑141 (MQ=255) tCGTAGCTAAAGAATCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACaa < 2:218832/141‑1 (MQ=255) cGTAGCTAAAGAATCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAAt > 1:703572/1‑141 (MQ=255) tAAAGAATCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGaa < 1:292052/141‑1 (MQ=255) tAAAGAATCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGaa < 1:294927/141‑1 (MQ=255) gAATCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGt < 2:720153/141‑1 (MQ=255) aaTCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTa < 1:713739/141‑1 (MQ=255) aTCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTAt > 1:794566/1‑141 (MQ=255) aTCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTAt < 1:38464/141‑1 (MQ=255) gagaACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGtt > 1:437251/1‑141 (MQ=255) agaACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTta > 1:809180/1‑141 (MQ=255) cAATGCTCTACCAGCTCGTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTtaataa < 2:603282/141‑1 (MQ=255) tGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTTAATAATTg > 1:356994/1‑141 (MQ=255) gCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTTAATAATTGa > 1:891572/1‑141 (MQ=255) gCTCTACCAGCTCTGGGTAATTTTTAATTTTCAAAAATACCGGCTTGCGCATCACCA‑CTACTTATGTTACCACCGGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATACCAATGAAGAACTGTACCGTAAAAAATTGa > 2:596509/1‑141 (MQ=255) ctctACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTTAATAATTGAc < 2:358989/141‑1 (MQ=255) tctACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTTAATAATTGACt < 2:560875/141‑1 (MQ=255) aCCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTTAATAATTGACTTgg < 1:73735/141‑1 (MQ=255) ccAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTTAATAATTGACTTggg > 1:249563/1‑141 (MQ=255) cAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTTAATAATTGACTTGGGt < 1:673327/141‑1 (MQ=255) aGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTTAATAATTGACTTGGGTc > 1:338161/1‑141 (MQ=255) ctctTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTTAATAATTGACTTGGGTCtt < 1:384516/141‑1 (MQ=255) tctTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTTAATAATTGACTTGGGTCttt < 2:191471/141‑1 (MQ=255) tGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTTAATAATTGACTTGGGTCTTTaaa > 2:398091/1‑141 (MQ=255) tAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTTAATAATTGACTTGGGTCTTTAAACGc < 2:156224/141‑1 (MQ=255) aaTTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTTAATAATTGACTTGGGTCTTTAAACGCt < 1:285989/141‑1 (MQ=255) aaTTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTTAATAATTGACTTGGGTCTTTAAACGCt < 2:511833/141‑1 (MQ=255) tttATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTTAATAATTGACTTGGGTCTTTAAACGCTTc > 1:211889/1‑141 (MQ=255) ttCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTTAATAATTGACTTGGGTCTTTAAACGCTTCAAATgcagca < 2:891572/141‑1 (MQ=255) tCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTTAATAATTGACTTGGGTCTTTAAACGCTTCAAATGCAGCAc > 2:904578/1‑141 (MQ=255) tCATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTTAATAATTGACTTGGGTCTTTAAACGCTTCAAATGCAGCAc < 2:520015/141‑1 (MQ=255) cATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTTAATAATTGACTTGGGTCTTTAAACGCTTCAAATGCAGCAcc > 1:753844/1‑141 (MQ=255) cATAATACCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTTAATAATTGACTTGGGTCTTTAAACGCTTCAAATGCAGCAcc > 2:700589/1‑141 (MQ=255) taataCCTGCTTGAGAATATCCATCTACTTATG‑TATCTGCTGTATCAATGAAACCAATATATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGCACTGTATCGTTAATAATTGACTTGAGTCTTTAAACGCTTCAAATGCAGCACCGa < 1:100201/141‑1 (MQ=255) taCCTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTTAATAATTGACTTGGGTCTTTAAACGCTTCAAATGCAGCACCGAACg > 2:883499/1‑141 (MQ=255) ccTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTTAATAATTGACTTGGGTCTTTAAACGCTTCAAATGCAGCACCGAACGtt > 2:809541/1‑141 (MQ=255) cTGCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTTAATAATTGACTT‑GGTCTTTAAACGCTTCAAATGCAGCACCGAACGTTgg > 2:290595/1‑141 (MQ=255) gCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTTAATAATTGACTTGGGTCTTTAAACGCTTCAAATGCAGCACCGAACGTTGGt > 2:481327/1‑141 (MQ=255) gCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTTAATAATTGACTTGGGTCTTTAAACGCTTCAAATGCAGCACCGAACGTTGGt < 1:158954/141‑1 (MQ=255) gCTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTTAATAATTGACTTGGGTCTTTAAACGCTGCTAATGCAGCACCGAACGTTGGt > 2:37542/1‑141 (MQ=255) cTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTTAATAATTGACTTGGGTCTTTAAACGCTTCAAATGCAGCACCGAACGTTGGtt < 2:821537/141‑1 (MQ=255) cTTGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTTAATAATTGACTTGGGTCTTTAAACGCTTCAAATGCAGCACCGAACGTTGGtt < 2:116997/141‑1 (MQ=255) ttGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAACCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTTAATAATTGACTTGGGTCTTTAAACGCTTCAAATGCAGCACCGAACGTTGGTTc < 1:398200/141‑1 (MQ=255) tGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTTAATAATTGACTTGGGTCTTTAAACGCTTCAAATGCAGCACCGAACGTTGGTTCa > 2:193484/1‑141 (MQ=255) tGAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTTAATAATTGACTTGGGTCTTTAAACGCTTCAAATGCAGCACCGAACGTTGGTTCa < 2:500371/141‑1 (MQ=255) gAGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTTAATAATTGACTTGGGTCTTTAAACGCTTCAAATGCAGCACCGAACGTTGGTTCaa < 2:481784/141‑1 (MQ=255) aGTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTTAATAATTGACTTGGGTCTTTAAACGCTTCAAATGCAGCACCGAACGTTGGTTCAAt > 1:612283/1‑141 (MQ=255) gTATCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTTAATAATTGACTTGGGTCTTTAAACGCTTCAAATGCAGCACCGAACGTTGGTTCAATa < 1:206758/141‑1 (MQ=255) | CACCTGAAGTTGATTCGATATAAGAAGTTGTTGTAGTTGTTCCAAAAACTGATCCTACAATCGTAGCTAAAGAATCTGAGAACAATGCTCTACCAGCTCTTGGTAATTTATTATCTTTCATAATACCTGCTTGAGTAGCAACAGCTACTAATG‑TACCAGCTGTATCAAAGAAATCAATAAATAAGAACGTTAAAATAACAATTAAGAACTGTATCGTTAATAATTGACTTGGGTCTTTAAACGCTTCAAATGCAGCACCGAACGTTGGTTCAATA > CP000730/2372809‑2373083 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |