| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 2567817 = | 82 (0.930) | 3 (0.040) | 3/244 | NT | 3.9% | coding (104/1830 nt) | ydaO | APC family amino acid‑polyamine‑organocation transporter |
| ? | CP000730 | 2567861 = | 72 (0.860) | coding (60/1830 nt) | ydaO | APC family amino acid‑polyamine‑organocation transporter | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ATAAGACATAATTAAAGCAGCTAATAAGATCAGAACAGCACCTGCAATCGGTAAAGTATACCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTCTTTTAAATTGATTGAACATAATCTCCTATTCCTTTTTATAGTTTTTGATGGA > CP000730/2567678‑2567953 | attaattaactctctatactttttttaaagataggcgtatagtgatatccatcaaaaactataaaaaggaataggagattatgttcaatcaatttaaaagacttattatagggcaacctaaaaaaacagataactaaaaGa < 2:645518‑M1/2‑1 (MQ=255) aCATAATTAAAGCAGCTAATAAGATCAGAACAGCACCTGCAATCGGTAAAGTATACCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGaaa > 2:174416/1‑141 (MQ=255) ttaTTAAAGCAGCTAATAAGATCAGAACAGCACCTGCAATCGGTAAAGTATACCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGat < 1:1030544/139‑2 (MQ=255) tAATTAAAGCAGCTAATAAGATCAGAACAGCACCTGCAATCGGTAAAGTATACCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGaa > 1:335676/1‑141 (MQ=255) aaTTAAAGCAGCTAATAAGATCAGAACAGCACCTGCAATCGGTAAAGTATACCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAAt > 2:354655/1‑141 (MQ=255) gcTAATAAGATCAGAACAGCACCTGCAATCGGTAAAGTATACCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCt < 1:708832/141‑1 (MQ=255) gcTAATAAGATCAGAACAGCACCTGCAACCGTTAAAGTATACTAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCt < 1:856071/141‑1 (MQ=255) taataaGATCAGAACAGCACCTGCAATCGGTAAAGTATACCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCttt > 2:300858/1‑141 (MQ=255) taaGATCAGAACAGCACCTGCAATCGGTAAAGTATACCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTaaa > 1:16510/1‑141 (MQ=255) aaGATCAGAACAGCACCTGCAATCGGTAAAGTATACCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAAc > 2:187560/1‑141 (MQ=255) aGATCAGAACAGCACCTGCAATCGGTAAAGTATACCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGATAGAATCGCTAACCCTTTAAACt < 2:1033808/141‑1 (MQ=255) aTCAGAACAGCACCTGCAATCGGTAAAGTATACCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTc > 2:922483/1‑141 (MQ=255) cAGAACAGCACCTGCAATCGGTAAAGTATACCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGa < 1:26273/141‑1 (MQ=255) cAGAACAGCACCTGCAATCGGTAAAGTATACCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGa < 1:429079/141‑1 (MQ=255) aGAACAGCACCTGCAATCGGTAAAGTATACCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGat > 2:208138/1‑141 (MQ=255) aGAACAGCACCTGCAATCGGTAAAGTATACCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGat > 1:361829/1‑141 (MQ=255) aGAACAGCACCTGCAATCGGTAAAGTATACCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGat > 2:757217/1‑141 (MQ=255) aaCAGCACCTGCAATCGGTAAAGTATACCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGatat > 1:394977/1‑141 (MQ=255) aaCAGCACCTGCAATCGGTAAAGTATACCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGatat < 1:259078/141‑1 (MQ=255) aGCACCTGCAATCGGTAAAGTATACCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCtt < 1:509570/141‑1 (MQ=255) aGCACCTGCAATCGGTAAAGTATACCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCtt < 1:655086/141‑1 (MQ=255) aGCACCTGCAATCGGTAAAGTATACCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCtt < 2:346154/141‑1 (MQ=255) gCACCTGCAATCGGTAAAGTATACCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCttt > 2:1021707/1‑141 (MQ=255) gCACCTGCAATCGGGAAAGTATACCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCttt > 2:513246/1‑141 (MQ=255) cACCTGCAATCGGTAAAGTATACCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCtttt < 1:238894/141‑1 (MQ=255) aCCTGCAATCGGTAAAGTATACCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTc < 1:289639/141‑1 (MQ=255) tGCAATCGGTAAAGTATACCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTc > 2:318170/1‑141 (MQ=255) atccatcaaaaactataaaaaggaataggagattatgttcaatcaatttaaaagacttattatagggcaacctaaaaaaaacagagaactaaaaGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCttt > 1:400364‑M1/95‑141 (MQ=255) tCGGTAAAGTATACCAAGTTGCAACTGCACCCANTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGTTACCTTTTCGTNTTTTa > 1:58490/1‑141 (MQ=255) cGGTAAAGTATACCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAg > 2:217484/1‑141 (MQ=255) cGGTAAAGTATACCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAATGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAg < 2:1086428/141‑1 (MQ=255) gTAAAGTATACCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGtt > 2:842812/1‑141 (MQ=255) tAAAGTATACCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTtc < 2:27179/141‑1 (MQ=255) tAAAGTATACCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTtc > 2:401249/1‑141 (MQ=255) aaGTATACCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTtctc > 1:228340/1‑141 (MQ=255) gTATACCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTg < 2:142502/141‑1 (MQ=255) tataCCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑t < 2:571050/141‑1 (MQ=255) tataCCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑t < 1:230009/141‑1 (MQ=255) ataCCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑tt < 2:109553/141‑1 (MQ=255) aCCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑tttt < 1:697944/141‑1 (MQ=255) aGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑tttttttt < 2:235517/141‑1 (MQ=255) tGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAgg < 1:411462/141‑1 (MQ=255) ggaataggagattatgttcaatcaatttaaaagacttattatagggcaacctaaaaaaaacagagaactaaaaGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAgg < 2:630816‑M1/68‑1 (MQ=255) cTGCAGCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAGGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCGAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGcc < 2:838984/141‑1 (MQ=255) tGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGccc < 2:12081/141‑1 (MQ=255) cACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTCGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCta < 2:545907/141‑1 (MQ=255) aCCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCtat < 1:354655/141‑1 (MQ=255) ccACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTataa < 1:1019316/141‑1 (MQ=255) cACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTataat > 1:1027496/1‑141 (MQ=255) tactGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAg < 2:37712/141‑1 (MQ=255) tactGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAg < 2:155163/141‑1 (MQ=255) ctGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTTTGTTTCCCTATAATAAGTc > 2:905439/1‑141 (MQ=255) ctGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTc < 2:460272/141‑1 (MQ=255) tGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTCt < 1:850077/141‑1 (MQ=255) tGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTCt > 1:77925/1‑141 (MQ=255) gATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTCtt < 1:273253/141‑1 (MQ=255) aTAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTCttt < 2:296548/141‑1 (MQ=255) ttacactaTCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTCtttt > 1:889865/8‑141 (MQ=255) tcgtgtAATCAGTATTTGGTCGAGAACGAAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCAATAAAACATCGACATCTTTTCGTCCTTTAGTTCCCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTCtttt < 2:58490/139‑1 (MQ=255) tAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTCtttt > 2:928177/1‑141 (MQ=255) gtgtAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTCTTTTaa > 1:894444/1‑141 (MQ=255) tAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTCTTTTAAatt > 2:321299/1‑141 (MQ=255) tAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTCTTTTAAatt > 2:384191/1‑141 (MQ=255) aaTCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTCTTTTAAattg > 1:558490/1‑141 (MQ=255) tCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTCTTTTAAattgat > 1:853825/1‑141 (MQ=255) tATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTCTTTTAAATTGATTGaa < 1:174416/141‑1 (MQ=255) tATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTCTTTTAAATTGATTGaa > 1:537212/1‑141 (MQ=255) tttGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTCTTTTAAATTGATTGAACa > 2:921806/1‑141 (MQ=255) tGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGCCGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTCTTTTAAATTGATTGAACATa > 1:584734/1‑141 (MQ=255) ggACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTCTTTTAAATTGATTGAACATAATCTcc > 1:429948/1‑141 (MQ=255) gACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTCTTTTAAATTGATTGAACATAATCTCCt < 2:398425/141‑1 (MQ=255) ccGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTCTTTTAAATTGATTGAACATAATCTCCTAt > 2:737313/1‑141 (MQ=255) cctaaaaaaaacagagaactaaaaGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTCTTTTAAATTGATTGAACATAATCTCCTATTcc > 1:630816‑M1/25‑141 (MQ=255) cTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTCTTTTAAATTGATTGAACATAATCTCCTATTCCTTTTtat < 2:688302/141‑1 (MQ=255) cTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTCTTTTAAATTGATTGAACATAATCTCCTATTCCTTTTtat < 1:928177/141‑1 (MQ=255) tGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTCTTTTAAATTGATTGAACATAATCTCCTATTCCTTTTtata < 2:356340/141‑1 (MQ=255) gAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTCTTTTAAATTGATTGAACATAATCTCCTATTCCTTTTTATAg > 1:574193/1‑141 (MQ=255) gAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTCTTTTAAATTGATTGAACATAATCTCCTATTCCTTTTTATAg > 2:393007/1‑141 (MQ=255) gAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTCTTTTAAATTGATTGAACATAATCTCCTATTCCTTTTTATAg > 2:393097/1‑141 (MQ=255) gAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTCTTTTAAATTGATTGAACATAATCTCCTATTCCTTTTTATAg < 1:512793/141‑1 (MQ=255) aaGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTCTTTTAAATTGATTGAACATAATCTCCTATTCCTTTTTATAGt < 1:942959/141‑1 (MQ=255) aaGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCCAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCGCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTCTTTTAAATTGATTGAACATAATCTCCTATTCCTTTTTATAGt < 1:1071530/141‑1 (MQ=255) gATAATGCATCCGACGAAAGAAGCGCTAGCCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCGCTGTTTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTCTTTTAAATTGATTGAACATAATCTCCTATTCCTTTTTATAGtt < 1:451848/141‑1 (MQ=255) tAATGCATCGGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTCTTTTAAATTGATTGAACATAATCTCCTATTCCTTTTTATAGttttt > 1:953493/1‑141 (MQ=255) aaTGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATAACTTTTCGTCTTTTAGATCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTCTTCTAAATTGATTGAACATAATCTCCTATTCCTTTTTATAGTTTTTg > 1:766609/1‑141 (MQ=255) aTGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCGTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTCTTTTAAATTGATTGAACATAATCTCCTATTCCTTTTTATAGTTTTTGa < 2:788826/141‑1 (MQ=255) tCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTGTTTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTCTTTTAAATTGATTGAACATAATCTCCTATTCCTTTTTATAGTTTTTGATGGa < 1:983642/141‑1 (MQ=255) | ATAAGACATAATTAAAGCAGCTAATAAGATCAGAACAGCACCTGCAATCGGTAAAGTATACCAAGTTGCAACTGCACCCACTACTGATAGTGTAATCAGTATTTGTTCGGGACCGTAAGCCACTGAAGATAATGCATCCGACGAAAGAATCGCTAACCCTTTAAACTTCGATATCTTTTCGTCTTTTAGTTCTCTG‑TTTTTTTTAGGTTGCCCTATAATAAGTCTTTTAAATTGATTGAACATAATCTCCTATTCCTTTTTATAGTTTTTGATGGA > CP000730/2567678‑2567953 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |