| New junction evidence | |||||||||||
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CATCACTGATTAAAGCAACATTTGGTCATTAATATGCTTATACAAATGATACTAATCTGATAAGGCAATTTGTTTTATCAGGTTTTTTGATGAAGAATAGTCGGACAGTTGATGGTATTCATTTGATACCTT‑AACTGTCCATTTTTTTATACATATTTTAATCTTAATAATGAAATTCAACCTGAAAACATAAAGATAGGTTATGATATAGAGTGTAGGGAAAATCTTTATGACGTTAAAATTATGCCTGAAGATGATTTTGTTTTATCGAAACGAC > CP000730/1129191‑1129467 | cATCACTGATTAAAGCAACATTTGGTCATTAATATGCTTATACAAATGATACTAATCTGATAAGGCAATTTGTTTTATCAGGTTTTTTGATGAAGAATAGTCGGACAGTTGATGGTATTCATTTGATACCTT‑AACTGTCCa > 2:210896/1‑141 (MQ=255)cATCAATGATTAAAGCAACATTTGGTCATTAATATGCTTATACAAATGATACTAATCTGATAAGGCAATTTGTTTTATCAGGTTTTTTGATGAAGAATAGTCGGACAGTTGATGGTATTCATTTGATACCTT‑AACTGTCCa > 2:813528/1‑141 (MQ=255) tCACTGATTAAAGCAACATTTGGTCATTAATATGCTTATACAAATGATACTAATCTGATAAGGCAATTTGTTTTATCAGGTTTTTTGATGAAGAATAGTCGGACAGTTGATGGTATTCATTTGATACCTT‑AACTGTCCAtt > 2:600452/1‑141 (MQ=255) cACTGATTAAAGCAACATTTGGTCATTAATATGCTTATACAAATGATACTAATCTGATAAGGCAATTTGTTTTATCAGGTTTTTTGATGAAGAATAGTCGGACAGTTGATGGTATTCATTTGATACCTT‑AACTGTCCAttt > 2:345350/1‑141 (MQ=255) aCTGATTAAAGCAACATTTGGTCATTAATATGCTTATACAAATGATACTAATCTGATAAGGCAATTTGTTTTATCAGGTTTTTTGATGAAGAATAGTCGGACAGTTGATGGTATTCATTTGATACCTT‑AACTGTCCAtttt < 2:524196/141‑1 (MQ=255) tGATTAAAGCAACATTTGGTCATTAATATGCTTATACAAATGATACTACTCTGATAAGGCAATTTGTTTTATCAGGTTTTTTGATGAAGAATAGTCGGACAGTTGATGGTATTCATTTGATACCTT‑AACTGTCCAtttttt > 1:247694/1‑141 (MQ=255) gtcataaagattttccctacactctataacataacctatctttatgttttcaggttgaatttcattattaagattaaaatatgtataaaaaaatggacagttgatggtattcatttgataccttaactgtccATTTTTTta < 1:171783‑M2/9‑1 (MQ=255) tAAAGCAACATTTGGTCATTAATATGCTTATACAAATGATACTAATCTGATAAGGCAATTTGTTTTATCAGGTTTTTTGATGAAGAATAGTCGGACAGTTGATGGTATTCATTTGATACCTT‑AACTGTCCATTTTTTtata > 1:764628/1‑141 (MQ=255) tAAAGCAACATATGGTCATTAATATGCTTATACAAATGATACTAATCTGATAAGGCAATTTGTTTTATCAGGTTTTTTGATGAAGAATAGTCGGACAGTTGATGGTATTCATTTGATACCTT‑AACTGTCCATTTTTTtatc > 2:410385/1‑140 (MQ=255) gCAACATTTGGTCATTAATATGCTTATACAAATGATACTAATCTGATAAGGCAATTTGTTTTATCAGGTTTTTTGATGAAGAATAGTCGGACAGTTGATGGTATTCATTTGATACCTT‑AACTGTCGATTTTTTTATACata > 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< 1:426024/141‑1 (MQ=255) aggtatcaaatgaataccatcaactgtccATTTTTTTATACATATTTTAATCTTAATAATGAAATTCAACCTGAAAACATAAAGATAGGTTATGATATAGAGTGTAGGGAAAATCTTTATGACGTTAAAATTATGCCTGaa > 2:992328‑M2/30‑141 (MQ=255) ggTATTCATTTGATACCTT‑AACTGTCCATTTTTTTATACATATTTTAATCTTAATAATGAAATTCAACCTGAAAACATAAAGATAGGTTATGATATAGAGTGTAGGGAAAATCTTTATGACGTTAAAATTATGCCTGAAga < 1:290304/141‑1 (MQ=255) tATTCATTTGATACCTT‑AACTGTCCATTTTTTTATACATATTTTAATCTTAATAATGAAATTCAACCTGAAAACATAAAGATAGGTTATGATATAGAGTGTAGGGAAAATCTTTATGACGTTAAAATTATGCCTGAAgatg < 2:70442/141‑1 (MQ=255) aTTCATTTGATACCTT‑AACTGTCCATTTTTTTATACATATTTTAATCTTAATAATGAAATTCAACCTGAAAACATAAAGATAGGTTATGATATAGAGTGTAGGGAAAATCTTTATGACGTTAAAATTATGCCTGAAgatga < 2:160203/141‑1 (MQ=255) tCATTTGATACCTT‑AACTGTCCATTTTTTTATACATATTTTAATCTTAATAATGAAATTCAACCTGAAAACATAAAGATAGGTTATGATATAGAGTGTAGGGAAAATCTTTATGACGTTAAAATTATGCCTGAAGATGAtt < 1:548044/141‑1 (MQ=255) 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2:450510/141‑1 (MQ=255) ccTT‑AACTGTCCATTTTTTTATACATATTTTAATCTTAATAATGAAATTCAACCTGAAAACATAAAGATAGGTTATGATATAGAGTGTAGGGAAAATCTTTATGACGTTAAAATTATGCCTGAAGATGATTTTGTTTTATc < 2:450434/141‑1 (MQ=255) tt‑AACTGTCCATTTTTTTATACATATTTTAATCTTAATAATGAAATTCAACCTGAAAACATAAAGATAGGTTATGATATAGAGTGTAGGGAAAATCTTTATGACGTTAAAATTATGCCTGAAGATGATTTTGTTTTATCGa > 1:312027/1‑141 (MQ=255) tgtccATTTTTTTATACATATTTTAATCTTAATAATGAAATTCAACCTGAAAACATAAAGATAGGTTATGATATAGAGTGTAGGGAAAATCTTTATGACGTTAAAATTATGCCTGAAGATGATTTTGTTTTATCGAAACGa < 2:1043472‑M2/136‑1 (MQ=255) gtccATTTTTTTATACATATTTTAATCTTAATAATGAAATTCAACCTGAAAACATAAAGATAGGTTATGATATAGAGTGTAGGGAAAATCTTTATGACGTTAAAATTATGCCTGAAGATGATTTTGTTTTATCGAAACGac > 1:273427‑M2/5‑141 (MQ=255) | CATCACTGATTAAAGCAACATTTGGTCATTAATATGCTTATACAAATGATACTAATCTGATAAGGCAATTTGTTTTATCAGGTTTTTTGATGAAGAATAGTCGGACAGTTGATGGTATTCATTTGATACCTT‑AACTGTCCATTTTTTTATACATATTTTAATCTTAATAATGAAATTCAACCTGAAAACATAAAGATAGGTTATGATATAGAGTGTAGGGAAAATCTTTATGACGTTAAAATTATGCCTGAAGATGATTTTGTTTTATCGAAACGAC > CP000730/1129191‑1129467 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |