| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | = 1205323 | 76 (0.860) | 35 (0.560) +AGCGAAGCCATTCAATACGAAGTATTGTATAAATAGAG |
7/182 | NT | 38.0% | intergenic (+459/‑365) | yfiE/lspA | possible lactoylglutathione lyase/A8 family signal peptidase II |
| ? | CP000730 | 2478252 = | 86 (0.970) | intergenic (+139/+932) | USA300HOU_2340/htrB | hypothetical membrane protein/hemin ABC superfamily ATP binding cassette transporter, ABC protein | |||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
TCCACAAACAAACTATTATTATAGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAATTTTTGATGACGGGTC > CP000730/2478114‑2478392 | tCCACAAACAAACTATTATTATAGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAAc < 1:90302/141‑1 (MQ=255) ccACAAACAAACTATTATTATAGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAAca > 2:39161/1‑141 (MQ=255) ccACAAACAAACTATTATTATAGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAAca > 2:255001/1‑141 (MQ=255) acaaacaaACTATTATTATAGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAAcagc > 2:1052838/1‑141 (MQ=255) caaacaaaCTATTATTATAGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAAcagca > 1:623807/1‑141 (MQ=255) aaacaaacTATTATTATAGGTAGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAAcagcaa > 2:372522/1‑140 (MQ=255) aaaagtaaaattacatgttaatacgtagtattaatggcgagactcctgagggagcagtgccagtcgaagaccgaggctgagacggcaccctaggaaagcgaagccattcaatacgaagtattgtataaatagagAAcagca > 1:204193‑M2/135‑141 (MQ=255) aaaagtaaaattacatgttaatacgtagtattaatggcgagactcctgagggagcagtgccagtcgaagaccgaggctgagacggcaccctaggaaagcgaagccattcaatacgaagtattgtataaatagagAAcagca > 1:439711‑M2/135‑141 (MQ=255) aaagtaaaattacatgttaatacgtagtattaatggcgagactcctgagggagcagtgccagtcgaagaccgaggctgagacggcaccctaggaaagcgaagccattcaatacgaagtattgtataaatagagAAcagcag > 1:1067824‑M2/134‑141 (MQ=255) aagtaaaattacatgttaatacgtagtattaatggcgagactcctgagggagcagtgccagtcgaagaccgaggctgagacggcaccctaggaaagcgaagccattcaatacgaagtattgtataaatagagAACAGCAGt 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2:1055992‑M2/131‑141 (MQ=255) gaaaattacatgttaatacgtagtattaatggcgagactcctgagggagcagtgccagtcgaagaccgaggctgagacggcaccctaggaaagcgaagccattcaatacgaagtattgtataaatagagAACAGCAGTAAg < 1:817723‑M2/12‑1 (MQ=255) aaaattacatgttaatacgtagtattaatggcgagactcctgagggagcagtgccagtcgaagaccgaggctgagacggcaccctaggaaagcgaagccattcaatacgaagtattgtataaatagagAACAGCAGTAAGa > 1:347132‑M2/129‑141 (MQ=255) cTATTATTATAGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATa > 1:803596/1‑141 (MQ=255) aaattacatgttaatacgtagtattaatggcgagactcctgagggagcagtgccagtcgaagaccgaggctgagacggcaccctaggaaagcgaagccattcaatacgaagtattgtataaatagagAACAGCAGTAAGAt > 2:972114‑M2/128‑141 (MQ=255) aaattacatgttaatacgtagtattaatggcgagactcctgagggagcagtgccagtcgaagaccgaggctgagacggcaccctaggaaagcgaagccattcaatacgaagtattgtataaatagagAACAGCAGTAAGAt < 1:532987‑M2/14‑1 (MQ=255) 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1:3638‑M2/23‑1 (MQ=255) ggtaatacgtagtattaatggcgagactcctgagggagcagtgccagtcgaagaccgaggctgagacggcacactaggaaagcgaagccattcaatacgaagtattgtataaatagagAGCAGCAGTAAGATAATTTTCaa < 2:680228‑M2/23‑1 (MQ=255) aGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAAtt > 2:545342/1‑141 (MQ=255) aGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAAtt > 2:769628/1‑141 (MQ=255) ggTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTACTCCTTGATCAGACCATTGTTATATTGAACATAAATAAACTAAATAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTa < 1:647307/141‑1 (MQ=39) gttTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGaaa > 2:727281/1‑141 (MQ=255) 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1:827923‑M2/35‑1 (MQ=255) aaTATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCt > 2:488842/1‑141 (MQ=255) aaTATTGCGACAAACGATCGTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGATTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCt < 2:921131/141‑1 (MQ=255) attaatggcgagactcctgagggagcagtgccagtcgaagaccgaggctgagacggcaccctaggaaagcgaagccattcaatacgaagtattgtataaatagagAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCt < 1:740311‑M2/36‑1 (MQ=255) atTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTAc > 1:816118/1‑141 (MQ=255) aatgtctatactccttagtgagcagttccagtcgaagaccaaggctgagacggcaccctaggaaagcgaagccattcaatacgaagtattgtagaaatagatAACATCAGTAATATTATTTTCAATTAGAAAATAtcttgc < 2:1081302‑M2/39‑3 (MQ=255) 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1:379344/1‑141 (MQ=255) aataaaCTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTa > 2:653620/1‑141 (MQ=255) taaaCTAAAGAGTCTGGGACAATAACACCT‑AAAAAACACAGCAGTAAGCTAAAGTCCAACTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACt < 1:485369/141‑1 (MQ=17) aaaCTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCTAAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACt > 2:155313/1‑141 (MQ=255) cTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTaa > 2:1041949/1‑141 (MQ=255) aaaGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTaaaa < 2:309819/141‑1 (MQ=255) 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1:656512/141‑1 (MQ=255) ggACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAAt < 1:80643/141‑1 (MQ=255) ggACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAAt < 2:439634/141‑1 (MQ=255) ggACATTAATCACT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAAt < 2:197142/141‑1 (MQ=255) aCATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCtatttatag < 2:454966/141‑7 (MQ=255) aCATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCtatttatag < 2:955447/141‑7 (MQ=255) cATTAATCCCT‑AATAAAATCAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCtatttataga < 1:372522/141‑8 (MQ=255) aTCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACAGTACTGTAAAATTCTATAAATAGAAtttt < 1:575530/141‑1 (MQ=255) tCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAAttttt > 1:488343/1‑141 (MQ=255) tCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAAttttt > 2:1021872/1‑141 (MQ=255) t‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAATTTTtgatg > 2:487419/1‑141 (MQ=40) aaaaaCAGCAGTAAGATAATTTTCAAGTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAATTTTTGATGACgg < 2:859655/141‑1 (MQ=38) aaCAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAATTTTTGATGACGGGTc > 1:23464/1‑141 (MQ=38) | TCCACAAACAAACTATTATTATAGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAATTTTTGATGACGGGTC > CP000730/2478114‑2478392 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |