| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 795,968 | C→T | 6.3% | R296R (CGC→CGT) | recQ1 → | ATP‑dependent helicase RecQ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 795,968 | 0 | C | T | 6.3% | 315.9 / 4.8 | 102 | R296R (CGC→CGT) | recQ1 | ATP‑dependent helicase RecQ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (47/48); new base T (3/4); total (50/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
AAAATTGAAAGTGTTATATATCATGCAGGTTTGAGCAATAAAGAAAGAGAAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGAAAAGTGAATGTATTTTGTTATTTAGCGAACGCGATATCAATTTACACGAGTATTTTATA > CP000730/795828‑796106 | aaaaTTGAAAGTGTTATATATCATGCAGGTTTGAGCAATAAAGAAAGAGAAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGc < 1:953780/141‑1 (MQ=255) aaaTTGAAAGTGTTATATATCATGCAGGTTTGAGCAATAAAGAAAGAGAAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCt < 1:840128/141‑1 (MQ=255) aaaTAGAAAGTGTTATATATCATGCAGGTTTGAGCAATAAAGAAAGAGAAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCt < 2:463430/141‑1 (MQ=255) aaTTGAAAGTGTTATATATCATGCAGGTTTGAGCAATAAAGAAAGAGAAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCtt < 1:31951/141‑1 (MQ=255) aTTGAAAGTGTTATATATCATGCAGGTTTGAGCAATAAAGAAAGAGAAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCttt < 1:162421/141‑1 (MQ=255) aaaGTGTTATATATCATGCAGGTTTGAGCAATAAAGAAAGAGAAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTGGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑GTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTa > 1:591048/1‑141 (MQ=255) aaGTGTTATATATCATGCAGGTTTGAGCAATAAAGAAAGAGAAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTTTGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTAt > 1:1008025/1‑141 (MQ=255) aaGTGTTATATATCATGCAGGTTTGAGCAATAAAGAAAGAGAAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTAt > 2:762422/1‑141 (MQ=255) aaGTGTTATATATCATGCAGGTTTGAGCAATAAAGAAAGAGAAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTAt < 1:48460/141‑1 (MQ=255) aaGTGTTATATATCATGCAGGTTTGAGCAATAAAGAAAGAGAAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTAt > 2:354470/1‑141 (MQ=255) gtTATATATCATGCAGGTTTGAGCAATAAAGAAAGAGAAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCAt > 2:785453/1‑141 (MQ=255) tatataTCATGCAGGTTTGAGCAATAAAGAAAGAGAAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGCTTTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCAtt > 2:521228/1‑141 (MQ=255) atatatCATGCAGGTTTGAGCAATAAAGAAAGAGAAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATtat < 2:419768/141‑1 (MQ=255) atatatCATGCAGGTTTGAGCAATAAAGAAAGAGAAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATtat > 2:265469/1‑141 (MQ=255) catatCAAGCAGGTTTGAGCAATAAAGAAAGAGCAGCAGCGCAGAATGCGTTCTTATCTGAACGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATtata > 2:940270/2‑141 (MQ=255) aTGCAGGTTTGAGCAATAAAGAAAGAGAAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGc < 2:40606/141‑1 (MQ=255) gCAGGTTTGAGCAATAAAGAAAGAGAAGCAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTCATTCATTATAATATGCCt > 2:800753/1‑141 (MQ=255) gCAGGTTTGAGCAATAAAGAAAGAGAAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCt > 2:594554/1‑141 (MQ=255) cAGGTTTGAGCAATAAAGAAAGAGAAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTg > 2:1031369/1‑141 (MQ=255) aGGTTTGNGCAATAAAGAAAGAGAAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTgg < 2:814830/141‑1 (MQ=255) ggTTTGAGCAATAAAGAAAGAGAAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGTTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGga > 2:905649/1‑141 (MQ=255) gTTTGAGCAATAAAGAAAGAGAAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGgag > 1:620639/1‑141 (MQ=255) tGAGCAATAAAGAAAGAGAAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGAtt < 2:760174/141‑1 (MQ=255) gAGCAATAAAGAAAGAGAAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGAttt < 1:939399/141‑1 (MQ=255) aGCAATAAAGAAAGAGAAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTa > 2:269493/1‑141 (MQ=255) cAATAAAGAAAGAGAAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGa > 2:600634/1‑141 (MQ=255) aTAAAGAAAGAGAAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAAt < 1:310304/141‑1 (MQ=255) aTAAAGAAAGAGAAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGAATTGGTAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAAt < 2:238912/141‑1 (MQ=255) aagaaagaGAAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCtc < 1:1031411/141‑2 (MQ=255) agaaagaGAAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCtta < 1:668133/141‑1 (MQ=255) gaaagaGAAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGTTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCttat > 2:1063317/1‑141 (MQ=255) gaaagaGAAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCttat < 2:430845/141‑1 (MQ=255) aagaGAAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCttatta > 1:871444/1‑141 (MQ=255) aagaGAAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCttatta > 1:447802/1‑141 (MQ=255) gagaAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATc < 1:547668/141‑1 (MQ=255) gagaAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATc > 1:186765/1‑141 (MQ=255) aagaagCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCaag < 2:330865/141‑1 (MQ=255) aagaagCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTGAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCaag < 1:1004699/141‑1 (MQ=255) aagCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCaagaag > 1:541396/1‑141 (MQ=255) gcgcAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCg > 1:188963/1‑141 (MQ=255) cAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGTGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGt < 2:975609/141‑1 (MQ=255) gAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCGTATTATCAAGAAGCGGGTCg > 1:285583/1‑141 (MQ=255) aTGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTc < 1:524512/90‑1 (MQ=255) aTGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTc > 2:524512/1‑90 (MQ=255) gATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCa > 2:201723/1‑141 (MQ=255) tttCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAgg > 2:866091/1‑141 (MQ=255) tttCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAgg < 1:414782/141‑1 (MQ=255) ttCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGt < 2:106962/141‑1 (MQ=255) ttATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGt > 2:680936/1‑141 (MQ=255) ttATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGCTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGt > 2:334317/1‑141 (MQ=255) ttGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACg < 1:672536/141‑1 (MQ=255) gATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACggg < 1:47164/141‑1 (MQ=255) gATCGTGGTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATAC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACggg < 2:88351/141‑1 (MQ=255) aTCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGt < 2:620639/141‑1 (MQ=255) tCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGtt < 1:352327/141‑1 (MQ=255) tCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGtt < 2:731317/141‑1 (MQ=255) cGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGTTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTg < 1:511532/141‑1 (MQ=255) cGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTg > 1:129047/1‑141 (MQ=255) cGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTg < 1:846879/141‑1 (MQ=255) gtgtTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGa < 2:186948/141‑1 (MQ=255) gtgtTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGa < 2:312603/141‑1 (MQ=255) gtgtTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGa < 2:193449/141‑1 (MQ=255) gtgtTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGa < 2:868647/141‑1 (MQ=255) ttAAAGAAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTAGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCGTGGAGATATAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGaaaa > 2:535226/1‑141 (MQ=255) agtCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGAAAAGTGAATg > 2:247339/1‑141 (MQ=255) agtCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGAAAAGTGAATg > 1:548840/1‑141 (MQ=255) tCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGAAAAGTGAATGTa > 2:632699/1‑141 (MQ=255) cGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGAAAAGTGAATGTAt < 2:217314/141‑1 (MQ=255) gTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGAAAAGTGAATGTAtt > 2:731024/1‑141 (MQ=255) ttGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGCTGAAAAGTGAATGTCttt > 1:817857/1‑141 (MQ=255) tGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGAAAAGTGAATGTAtttt < 1:121238/141‑1 (MQ=255) gCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGAAAAGTGAATGTATTTTg < 2:29439/141‑1 (MQ=255) cTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGAAAAGTGAATGTATTTTGt < 1:110951/141‑1 (MQ=255) tACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGACAAGTGAATGTATTTTGtt > 2:281995/1‑141 (MQ=255) aaTGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGAAAAGTGAATGTATTTTGTTAttt > 1:449597/1‑141 (MQ=255) aaTGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGAAAAGTGAATGTATTTTGTTAttt > 1:777095/1‑141 (MQ=255) tGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGTTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGAAAAGTGAATGTATTTTGTTATTTAg < 1:1063317/141‑1 (MQ=255) tGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTCATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGAAAAGTGAATGTATTTTGTTATTTAg < 2:1036573/141‑1 (MQ=255) gC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGAAAAGTGAATGTATTTTGTTATTTAGc < 1:296099/141‑1 (MQ=255) ttttGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGAAAAGTGAATGTATTTTGTTATTTAGCGa < 2:121624/141‑1 (MQ=255) tttGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGAAAAGTGAATGTATTTTGTTATTTAGCGaa > 2:720667/1‑141 (MQ=255) ttcggTATGGGGATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTGATTCATTATAATATGGCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGAAAAGTGAATGTATTTTGTTATTTAGCGaa < 2:925719/138‑1 (MQ=255) tGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGAAAAGTGAATGTATTTTGTTATTTAGCGAAcg > 1:457110/1‑141 (MQ=255) ggTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGGAGAACATTCAGGTCGTGACGGGTTGAAAAGTGAATGTATTTTGTTATTTAGCGAAcgc > 1:342567/1‑141 (MQ=255) gTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGAAAAGTGAATGTATTTTGTTATTTAGCGAAcgcg > 1:228068/1‑141 (MQ=255) gTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGAAAAGTGAATGTATTTTGTTATTTAGCGAAcgcg > 2:757150/1‑141 (MQ=255) tATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGAAAAGTGAATGTATTTTGTTATTTAGCGAACGCGa < 1:453568/141‑1 (MQ=255) gggTATTGATAAATCCAATGTACGTTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGAAAAGTGAATGTATTTTGTTATTTAGCGAACGCGatat < 1:607413/141‑1 (MQ=255) gggTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATGTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGAAAAGTGAATGTATTGTGTTATTTAGCGAACGCGatat > 2:103296/1‑141 (MQ=255) ttGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGAAAAGTGAATGTATTTTGTTATTTAGCGAACGCGATATCAAtt < 1:878847/141‑1 (MQ=255) ttGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGAAAAGTGAATGTATTTTGTTATTTAGCGAACGCGATATCAAtt > 2:258638/1‑141 (MQ=255) aaTCCAATGTACGTTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGAAAAGTGAATGTATTTTGTTATTTAGCGAACGCGATATCAATTTACACg < 2:66922/141‑1 (MQ=255) aaTCCAATGTACGCTTTGTTATTCGTTATAATAGGCCTGGAGATGGAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGAAAAGTGAATGTATTTTGTTATTTAGCGAACGCGATATCAATTTACACg < 1:864254/141‑1 (MQ=255) aaTCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGAAAAGTGAATGTATTTTGTTATTTAGCGAACGCGATATCAATTTACACg > 2:1036475/1‑141 (MQ=255) aTCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGAAAAGTGAATGTATTTTGTTATTTAGCGAACGCGATATCAATTTACACGa < 2:591048/141‑1 (MQ=255) aTGTACGTTTTGTTATTCATTAAAATATGCCTGGAGATATAGAATATTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGAAAAGTGAATGTATTTTGGTATTTAGCGAACGCGATATCAATTTACACGAGTAtt > 2:920249/1‑141 (MQ=255) aTGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGAAAAGTGAATGTATTTTGTTATTTAGCGAACGCGATATCAATTTACACGAGTAtt > 1:325247/1‑141 (MQ=255) gTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGAAAAGTGAATGTATTTTGTTATTTAGCGAACGCGATATCAATTTACACGAGTAtttt < 2:658952/141‑1 (MQ=255) tACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGAAAAGTGAATGTATTTTGTTATTTAGCGAACGCGATATCAATTTACACGAGTATTTta < 2:637274/141‑1 (MQ=255) cGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGAAAAGTGAATGTATTTTGTTATTTAGCGAACGCGATATCAATTTACACGAGTATTTtata > 1:217134/1‑141 (MQ=255) | AAAATTGAAAGTGTTATATATCATGCAGGTTTGAGCAATAAAGAAAGAGAAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTCGTTGCTACAAATGC‑TTTTGGTATGGGTATTGATAAATCCAATGTACGCTTTGTTATTCATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGTCGTGCAGGTCGTGACGGGTTGAAAAGTGAATGTATTTTGTTATTTAGCGAACGCGATATCAATTTACACGAGTATTTTATA > CP000730/795828‑796106 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |