| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,646,189 | G→C | 100% | A155G (GCA→GGA) | pepP ← | M24B family Xaa‑Pro dipeptidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,646,189 | 0 | G | C | 97.8% | 308.3 / ‑0.5 | 91 | A155G (GCA→GGA) | pepP | M24B family Xaa‑Pro dipeptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); new base C (42/46); total (44/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.92e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
TTTTATCACTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTGCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGAT > CP000730/1646052‑1646320 | ttttATCACTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCtt > 1:657355/1‑141 (MQ=255) tATCACTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTa < 1:135423/141‑1 (MQ=255) aTCACTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTac > 2:310525/1‑141 (MQ=255) aTCACTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTac < 2:347265/141‑1 (MQ=255) aTCACTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCAAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTACTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATACCTGCTTTTac < 1:767438/141‑1 (MQ=255) cACTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGCTGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTacaa < 1:803299/141‑1 (MQ=255) ttGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAg < 1:803822/141‑1 (MQ=255) ttGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTGAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAg < 2:863404/141‑1 (MQ=255) tGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGt > 1:74210/1‑141 (MQ=255) acacCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTaaa > 1:624815/1‑141 (MQ=255) cacCATGTGGTAATGCCCCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGATCCATCTGCTTCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTACTTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACCACCGTTaaaa > 1:1047961/1‑141 (MQ=255) cacCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTaaaa > 2:115910/1‑141 (MQ=255) acCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAat > 1:67002/1‑141 (MQ=255) ccATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAata < 2:340887/141‑1 (MQ=255) ccATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCCACAATCGTATCGCATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCCTTACTTC‑TTATTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAata > 2:329082/1‑141 (MQ=255) cATGTGGTGATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGTATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTGATTC‑TTCTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAatat < 1:935151/141‑1 (MQ=255) gtgGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATAtt < 1:382521/141‑1 (MQ=255) gTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCat > 1:672477/1‑141 (MQ=255) aaTGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCatat > 2:319472/1‑141 (MQ=255) gCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGtt > 2:269285/1‑141 (MQ=255) cACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGttt > 1:455974/1‑141 (MQ=255) tGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATcaaca > 1:703633/1‑141 (MQ=255) cAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCTTTCATTCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAatat > 2:4036/1‑141 (MQ=255) gATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACTGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTa < 2:1007734/141‑1 (MQ=255) tGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAgc > 1:321382/1‑141 (MQ=255) cTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCGTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAgctg < 1:550984/141‑1 (MQ=255) cTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAgctg > 1:765874/1‑141 (MQ=255) tACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAgctgc > 1:987205/1‑141 (MQ=255) aaTCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCttt < 1:72605/141‑1 (MQ=255) aTCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCtttt < 1:876496/141‑1 (MQ=255) aTCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCtttt < 2:591159/141‑1 (MQ=255) aTCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATCGCCTGTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCtttt < 1:19396/141‑1 (MQ=255) cGTATCGAATGATGGGCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTg < 2:296813/141‑1 (MQ=255) tATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGaa < 1:697515/141‑1 (MQ=255) tATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGaa > 1:979797/1‑141 (MQ=255) aTCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAAt > 1:480816/1‑141 (MQ=255) aTCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAAt < 1:297242/141‑1 (MQ=255) aTCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAAt < 2:548523/141‑1 (MQ=255) aTCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAAt > 1:888901/1‑141 (MQ=255) gAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTaa < 2:741914/141‑1 (MQ=255) gAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTaa < 1:208473/141‑1 (MQ=255) aaTGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTaa < 2:985694/141‑1 (MQ=255) aaTGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTaaa < 1:986777/141‑1 (MQ=255) atgatgGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAg > 1:471341/1‑141 (MQ=255) aTCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTc > 1:635243/1‑141 (MQ=255) aTCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTc > 2:6801/1‑141 (MQ=255) cTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAg < 1:56846/141‑1 (MQ=255) cTCCTAATTCTAGCATTTTACTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATACCTGCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAACAt > 1:878914/1‑141 (MQ=255) ccTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTACTTC‑TTTTTCAGTCAGGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCCGCATCt > 1:818710/1‑141 (MQ=255) ccTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCt < 2:825464/141‑1 (MQ=255) aaTTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCaaagatgctg < 2:1050635/141‑10 (MQ=255) aTTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGa < 1:893897/141‑1 (MQ=255) tCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACg < 1:601766/141‑1 (MQ=255) cTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGt > 2:1033911/1‑141 (MQ=255) tAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTACTTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCCTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCACTTTCGTCAGCATCTTTGACGtc > 1:1031423/1‑141 (MQ=255) gCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGACTTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGtctc < 1:561806/141‑1 (MQ=255) gCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGtctc > 2:362415/1‑141 (MQ=255) gCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGtctc < 1:32271/141‑1 (MQ=255) gCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGtctc < 1:656927/141‑1 (MQ=255) cATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTctct < 1:139705/141‑1 (MQ=255) tttGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAAt < 2:787094/141‑1 (MQ=255) gCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAAtttt > 1:350538/1‑141 (MQ=255) cTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGtctc < 1:66503/129‑1 (MQ=255) cTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGtctc > 2:66503/1‑129 (MQ=255) tAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTAc > 1:89684/1‑141 (MQ=255) atatTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAg < 2:685453/141‑1 (MQ=255) tatTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGt < 2:619483/141‑1 (MQ=255) tatTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGt < 2:624815/141‑1 (MQ=255) ttGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGCCGTCTCTAATTTTATCTACAGTAt > 1:960531/1‑141 (MQ=255) ttGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTAt < 1:105208/141‑1 (MQ=255) ttGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTAt > 2:893896/1‑141 (MQ=255) ttGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTCTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTTAATTAAATCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTAt > 2:443711/1‑141 (MQ=255) tGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTAtt < 2:471341/141‑1 (MQ=255) tGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTAtt < 2:455974/141‑1 (MQ=255) gCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTGTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTGTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTa < 1:471447/141‑1 (MQ=255) ccTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTTTTTTTTTTTTAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGTATTAAATCAATTTCGTCAGCATCTTTTACGTCTCTATTTTTATCTTTTGTATTAg > 2:440449/1‑141 (MQ=255) ccTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAg < 2:580247/141‑1 (MQ=255) cTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGa > 1:325232/1‑141 (MQ=255) cTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGCCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGa < 1:733771/141‑1 (MQ=255) ttAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGaaa < 2:966266/141‑1 (MQ=255) ctaaaaacaaagtgaGTCATTCTTTCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGaa > 2:404820/15‑141 (MQ=255) tAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAAt < 2:356449/141‑1 (MQ=255) ttC‑TTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCt > 1:32216/1‑141 (MQ=255) ttttCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCttatt > 1:805494/1‑141 (MQ=255) ttttCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCttatt > 2:231924/1‑141 (MQ=255) ttCAGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTaa > 2:512849/1‑141 (MQ=255) aGTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTTATTTAATTCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGa > 2:68272/1‑141 (MQ=255) gTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGat < 2:890342/141‑1 (MQ=255) gTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGat < 2:37254/141‑1 (MQ=255) gTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGat > 2:1001007/1‑141 (MQ=255) gTCATGCCTCCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTATCATGAACAAAATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACTTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATACTTATTAATGat > 2:157416/1‑141 (MQ=255) | TTTTATCACTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTC‑TTTTTCAGTCATGCCTGCTTTTACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGAT > CP000730/1646052‑1646320 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |