| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 18,223 | G→A | 7.5% | V278I (GTT→ATT) | USA300HOU_0013 → | possible membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 18,223 | 0 | G | A | 7.5% | 270.7 / 7.1 | 90 | V278I (GTT→ATT) | USA300HOU_0013 | possible membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (48/35); new base A (4/3); total (52/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GTCAACCGAGTGTGTTCCAGAGCATTCTTTTAAACTTCCAACTTGTGTTATCATTAGTAATGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGAAAAATAATTCTAAAAAGTGAATAGAGGTGGAATAATGAATCGGCAGTCCACT > CP000730/18083‑18362 | gTCAACCGAGTGTGTTCCAGAGCATTCTTTTAAACTTCCAACTTGTGTTATCATTAGTAATGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTgg < 2:248855/141‑1 (MQ=255) cAACCGAGTGTGTTCCAGAGCATTCTTTTAAACTTCCAACTTGTGTTATCATTAGTAATGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGtt > 1:595230/1‑141 (MQ=255) aCCGAGTGTGTTCCAGAGCATTCTTTTAAACTTCCAACTTGTGTTATCATTAGTAATGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTAt < 2:511336/141‑1 (MQ=255) ccGAGTGTGTTCCAGAGCATTCTTTTAAACTTCCAACTTGTGTTATCATTAGTAATGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATc > 1:830889/1‑141 (MQ=255) aGTGTGTTCCAGAGCATTCTTTTAAACTTCCAACTTGTGTTATCATTAGTAATGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGt > 2:20457/1‑141 (MQ=255) gtgtgtTCCAGAGCATTCTTTTAAACTTCCAACTTGTGTTATCATTAGTAATGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGtc > 2:7600/1‑140 (MQ=255) gtgtgtTCCAGAGCATTCTTTTAAACTTCCAACTTGTGTTATCATTAGTAATGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTa > 1:598861/1‑141 (MQ=255) gtgtgtTCCAGAGCATTCTTTTAAACTTCCAACTTGTGTTATCATTAGTAATGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGAGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTa > 2:741233/1‑141 (MQ=255) gtgtTCCAGAGCATTCTTTTAAACTTCCAACTTGTGTTATCATTAGTAATGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACa > 2:55679/1‑141 (MQ=255) gtgtTCCAGAGCATTCTTTTAAACTTCCAACTTGTGTTATCATTAGTAATGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACa < 2:1041195/141‑1 (MQ=255) tgtTCCAGAGCATTCTTTTAAACTTCCAACTTGTGTTATCATTAGTAATGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACaa > 1:390044/1‑141 (MQ=255) tgtTCCAGAGCATTCTTTTAAACTTCCAACTTGTGTTATCATTAGTAATGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACaa < 2:414334/141‑1 (MQ=255) gagCATTCTTTTAAACTTCCAACTTGTGTTATCATTAGTAATGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGATTATCGGTACAATACTGac > 2:622168/1‑141 (MQ=255) gCATTCTTTTAAACTTCCAACTTGTGTTATCATTAGTAATGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGacac > 2:643272/1‑141 (MQ=255) aTTCTTTTAAACTTCCAACTTGTGTTATCATTAGTAATGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTTGTTATCGGTACAATACTGACACCt > 2:609520/1‑141 (MQ=255) cTTTTAAACTTCCAACTTGTGTTATCATTAGTAATGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACg > 1:281245/1‑141 (MQ=255) cTTTTAAACTTCCAACTTGTGTTATCATTAGTAATGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACg < 2:440360/141‑1 (MQ=255) tAAACTTCCAACTTGTGTTATCATTAGTAATGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGa‑cac < 2:310570/141‑1 (MQ=255) tCCAACTTGTGTTATCATTAGTAATGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTg > 2:239018/1‑141 (MQ=255) ccAACTTGTGTTATCATTAGTAATGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGt > 1:393860/1‑141 (MQ=255) ttGTGTTATCATTAGTAATGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGac > 1:350367/1‑141 (MQ=255) gtgtTATCATTAGTAATGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTTTAGGacta > 2:1085225/1‑141 (MQ=255) gtgtTATCATTAGTAATGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGacta > 1:658855/1‑141 (MQ=255) gtTATCATTAGTAATGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGactact < 2:533744/141‑1 (MQ=255) gtTATCATTAGTAATGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGactact > 1:144658/1‑141 (MQ=255) ttATCATTAGTAATGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAGGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACtt > 2:372866/1‑141 (MQ=255) tATCATTAGTAATGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTg > 2:450280/1‑141 (MQ=255) aTCATTAGTAATGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTgg < 1:190811/141‑1 (MQ=255) aTCATTAGTAATGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTgg > 2:786199/1‑141 (MQ=255) aTCATTAGTAATGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGACGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATATTGACACCTACGA‑CACATATTGTATGACTACTTgg > 2:832848/1‑141 (MQ=255) cATTAGTAATGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGgtg > 2:954009/1‑141 (MQ=255) tAGTAATGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTa > 1:1033467/1‑141 (MQ=255) tAGTAATGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTa < 1:17225/141‑1 (MQ=255) aaTGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATTGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGa < 1:550136/141‑1 (MQ=255) aaTGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGa < 1:605329/141‑1 (MQ=255) aTGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGAt > 2:311493/1‑141 (MQ=255) gTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGAttt > 1:429571/1‑141 (MQ=255) gTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGAttt < 2:617162/141‑1 (MQ=255) gTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGAttt < 2:72291/141‑1 (MQ=255) tataTTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTa < 1:906752/141‑1 (MQ=255) tataTTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGATTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTa < 1:169520/141‑1 (MQ=255) atTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGt > 1:159587/1‑141 (MQ=255) ttCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGATTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGtt < 1:451654/141‑1 (MQ=255) aaGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGtttgaatttgaa < 1:978095/141‑1 (MQ=255) gtgtTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGc > 2:473027/1‑141 (MQ=255) gtgtTATTCAGTTCTTTGTGAAAGCGAAATGTTGGCCGAAGGCAGTGACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACGGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGc < 1:217879/141‑1 (MQ=255) tgtTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCg < 1:205364/141‑1 (MQ=255) gtTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTTACTTTGAAGCGa < 2:153594/141‑1 (MQ=255) gtTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGa < 1:131223/141‑1 (MQ=255) ttATTCATTTTTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGaa < 1:965446/141‑1 (MQ=255) tATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAAt < 1:20457/141‑1 (MQ=255) tCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTGGAAGCGAATCAt > 2:742006/1‑141 (MQ=255) tttCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCAGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGACCACA‑ATTGTAGGACTACTTGGTGTTATAGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGaa > 1:431645/1‑141 (MQ=255) ttCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGATTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGCATCATGaaa > 1:60110/1‑141 (MQ=255) ttGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGAAAaata > 1:893749/1‑141 (MQ=255) ttGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGAAAaata > 1:362504/1‑141 (MQ=255) ttGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGAAAaata > 1:175096/1‑141 (MQ=255) ttGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGAAAaata > 2:184384/1‑141 (MQ=255) tGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGAAAaataa < 2:297812/141‑1 (MQ=255) gTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGAAAAATAAtt > 2:685379/1‑141 (MQ=255) gTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGAAAAATAAtt < 1:538893/141‑1 (MQ=255) gTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGAAAAATAAtt > 1:463672/1‑141 (MQ=255) aaaGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGAAAAATAATTCt < 2:779802/141‑1 (MQ=255) aaGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGACGCGAATCATGAAAaataaatata < 2:185965/141‑6 (MQ=255) aaGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGAAAAATAATTCTa > 2:668780/1‑141 (MQ=255) cGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGAAAAATAATTCTaaaa < 2:892911/141‑1 (MQ=255) aaaGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGAAAAATAATTCTAAAAAg < 1:741233/141‑1 (MQ=255) aaGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGATTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTAGAATTTGAAGCGAATCATGAAAAATAATTTNAAAAAGt > 2:816074/1‑141 (MQ=255) aGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGAAAAATAATTCTAAAAAGTg > 2:637222/1‑141 (MQ=255) gTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGAAAAATAATTCTAAAAAGTGaa < 2:727931/141‑1 (MQ=255) ttGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGAAAAATAATTCTAAAAAGTGAATa < 1:740785/141‑1 (MQ=255) ttGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGATTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGAAAAATAATTCTAAAAAGTGAATa < 1:1040818/141‑1 (MQ=255) ccGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGAAAAATAATTCTAAAAAGTGAATagag < 1:686326/141‑1 (MQ=255) ccGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGAAAAAAAATTATAAAAAGTGAATagag < 2:595230/141‑1 (MQ=255) ccGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGATTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGAAAAATAATTCTAAAAAGTGAATagag > 2:97677/1‑141 (MQ=255) aTGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGAAAAATAATTCTAAAAAGTGAATAGAGGTgg > 1:666672/1‑141 (MQ=255) tGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGAAAAATAATTCTAAAAAGTGAATAGAGGTGGa < 1:1043999/141‑1 (MQ=255) aGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGAAAAATAATTCTAAAAAGTGAATAGAGGTGGaata < 1:254425/141‑1 (MQ=255) gTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGAAAAATAATTCTAAAAAGTGAATAGAGGTGGaataa > 2:1054389/1‑141 (MQ=255) gTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGAAAAATAATTCTAAAAAGTGAATAGAGGTGGaataa > 2:619250/1‑141 (MQ=255) tAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGAAAAATAATTCTAAAAAGTGAATAGAGGTGGaataat < 1:977179/141‑1 (MQ=255) aTTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGAAAAATAATTCTAAAAAGTGAATAGAGGTGGAATAATGAATc < 2:666672/141‑1 (MQ=255) ttttACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGAAAAATAATTCTAAAAAGTGAATAGAGGTGGAATAATGAATCg > 2:13943/1‑141 (MQ=255) ttttACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGAAAAATAATTCTAAAAAGTGAATAGAGGTGGAATAATGAATCg > 2:946878/1‑141 (MQ=255) ttttACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGAAAAATAATTCTAAAAAGTGAATAGAGGTGGAATAATGAATCg > 1:664873/1‑141 (MQ=255) tttACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGAAAAATAATTCTAAAAAGTGAATAGAGGTGGAATAATGAATCgg > 1:59596/1‑141 (MQ=255) tttACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGAAAAATAATTCTAAAAAGTGAATAGAGGTGGAATAATGAATCgg > 2:171408/1‑141 (MQ=255) ttACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGAAAAATAATTCTAAAAAGTGAATAGAGGTGGAATAATGAATCGGc > 1:341728/1‑141 (MQ=255) ttACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGAAAAATAATTCTAAAAAGTGAATAGAGGTGGAATAATGAATCGGc > 2:491570/1‑141 (MQ=255) tACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CAAATAATGTCGGAGCCCTTGGTGTTTACGACTGCAGTTTGCCGTTGAAGCTAATCATGAAAAATAATTCTAAAAAGTGAATAGAGGTGGAATAATGAATCGGCa < 1:918444/141‑1 (MQ=255) ttGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCACGAAAAATAATTCTAAAAAGTGAATAGAGGTGGAATAATGAATCGGCAGTCCa > 2:232884/1‑141 (MQ=255) ggTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGAAAAATAATTCTAAAAAGTGAATAGAGGTGGAATAATGAATCGGCAGTCCACt < 1:12025/141‑1 (MQ=255) | GTCAACCGAGTGTGTTCCAGAGCATTCTTTTAAACTTCCAACTTGTGTTATCATTAGTAATGTATATTCAAGGTTTAAGTGTTATTCATTTCTTTGGTAAAGCGAAAGGTTTGCCGAATGCAGTAACGATTTTACTATTGGTTATCGGTACAATACTGACACCTACGA‑CACATATTGTAGGACTACTTGGTGTTATCGATTTAAGTTTGAATTTGAAGCGAATCATGAAAAATAATTCTAAAAAGTGAATAGAGGTGGAATAATGAATCGGCAGTCCACT > CP000730/18083‑18362 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |