BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	CP000730	36,087	A→G	59.8%	C155C (TGT→TGC)	USA300HOU_0026 ←	IS431mec transposase

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	CP000730	36,087	0	A	G	59.8%	467.3 / inf	786	C155C (TGT→TGC)	USA300HOU_0026	IS431mec transposase
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (179/134); new base G (258/207); total (442/344)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.59e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.55e-01

Only 100 of 787 total aligned reads displayed.

TTTTTATATAGAGCGTAAATACATTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTAT  >  CP000730/35947‑36226

tttttATATAGAGCGTAAATGCATTCAACACCTTTTAAAGTATTCTTTGCCGTAGTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGa                                                                                                                                             >  1:501487/1‑141 (MQ=14)

   ttATATAGAGCGTAAATACATTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAg                                                                                                                                          >  1:615969/1‑141 (MQ=39)

   ttATATAGAGCGTAAATACACTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAg                                                                                                                                          >  2:182770/1‑141 (MQ=255)

     atataGAGCGTAAATACACTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCCGTc                                                                                                                                        >  1:464011/1‑141 (MQ=255)

       ataGAGCGTAAATACATTTACTCCCTTTTAAAGTATTCTTTGCCGTTTTGCTGCTTTGATCTCTTCTCTTTCGTACTTTAATATGACGATGATCTGG‑CACAATTAGGTTATTCAGATATTGCGATGTACAATGACAGTCAg                                                                                                                                      <  2:607126/141‑1 (MQ=14)

       ataGAGCGTAAATACATTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAg                                                                                                                                      >  1:634770/1‑141 (MQ=255)

       ataGAGCGTAAATACACTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAg                                                                                                                                      >  1:509129/1‑141 (MQ=255)

        taGAGCGTAAATACACTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTAAACTGGCAGTCAgg                                                                                                                                     >  2:102141/1‑141 (MQ=255)

          gagCGTAGATACAGTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGgtt                                                                                                                                   >  2:669933/1‑141 (MQ=255)

               tAAATACATTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGgtttaagt                                                                                                                              <  1:33439/141‑1 (MQ=255)

               tAAATACACTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATCTGAC‑ACCACGTTGTCGCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGgtttaagt                                                                                                                              >  1:761018/1‑141 (MQ=11)

                 aaTACACTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGgtttaagttt                                                                                                                            >  2:666027/1‑141 (MQ=255)

                   tACATTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGgttaataattta                                                                                                                          <  2:302504/141‑10 (MQ=14)

                   tACACTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGgtttaagtttaa                                                                                                                          >  1:100962/1‑141 (MQ=255)

                   tACACTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGgtttaagtttaa                                                                                                                          >  2:445327/1‑141 (MQ=255)

                   tACACTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGgtttaagtttaa                                                                                                                          >  1:707180/1‑141 (MQ=255)

                    aCATTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCACGTTTAAGTTTaaa                                                                                                                         >  2:361354/1‑141 (MQ=255)

                    aCATACAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGGTATGTTGACTTTCTTCCTTTAATATGACGGCTATCTTG‑CTCAATAAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGTTTTAAGTTTaaa                                                                                                                         >  2:210675/1‑141 (MQ=14)

                     cactCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATATTTTGATAACTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGACGTACAGTGGCAGTCAGGTTTAAGTTTaaaa                                                                                                                        >  2:485057/4‑141 (MQ=11)

                     cATTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTaaaa                                                                                                                        >  1:735132/1‑141 (MQ=255)

                        ttaaTTCCTTTTTAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCt                                                                                                                     <  2:289711/139‑1 (MQ=255)

                          aaTACCTTTTAAAGTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCttt                                                                                                                   <  1:670794/141‑1 (MQ=255)

                           aTACCTTTTAAAGTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTa                                                                                                                  >  2:195733/1‑141 (MQ=255)

                            tACCTTTTAAAGTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTaa                                                                                                                 <  1:321971/141‑1 (MQ=255)

                             aCCTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAAt                                                                                                                >  1:623361/1‑141 (MQ=255)

                              ccTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAACTTTAAAAGATTTAAtt                                                                                                               >  2:118841/1‑141 (MQ=255)

                               atattAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTAAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTa                                                                                                              >  2:343189/4‑141 (MQ=255)

                                ttttAAGGTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTat                                                                                                             <  2:726541/141‑2 (MQ=255)

                                ttttAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTAc                                                                                                             <  1:252783/141‑1 (MQ=255)

                                ttttAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAACCTTTAATTAc                                                                                                             >  2:228458/1‑141 (MQ=255)

                                 tttAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGAAGTAGGGTTAAAGGTTAAAAGCTTTAATTACt                                                                                                            >  2:157153/1‑141 (MQ=14)

                                  ttAAAGTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTattt                                                                                                           >  1:648525/1‑138 (MQ=255)

                                   tAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTACGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACttt                                                                                                          >  1:441157/1‑141 (MQ=255)

                                   tAAAGTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTAtttt                                                                                                          <  2:133967/141‑1 (MQ=255)

                                    aaaGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCTGTCTGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTa                                                                                                         >  1:478820/1‑141 (MQ=255)

                                     aaGTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCCGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTAtttttg                                                                                                        >  2:25052/1‑139 (MQ=14)

                                      agcaTTCTATGCTGTATTAAGACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTaac                                                                                                       <  1:208000/138‑3 (MQ=14)

                                        tATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCtt                                                                                                                    >  1:215734/1‑126 (MQ=255)

                                           tCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTg                                                                                                  <  1:539898/141‑1 (MQ=255)

                                             tttGCTGTATTGATACTTTGATTCCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCt                                                                                                <  1:186238/141‑1 (MQ=255)

                                             tttGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCt                                                                                                <  1:109676/141‑1 (MQ=255)

                                              ttGCCGTATTGATAATGTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTATAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCtg                                                                                               >  1:429477/1‑140 (MQ=14)

                                                gccgTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCtgcc                                                                                             <  1:748735/138‑4 (MQ=255)

                                                gCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTACTTACTTTAACCATTGCTAcc                                                                                             >  1:274601/1‑141 (MQ=255)

                                                gCTGTATTGATACCTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTAcc                                                                                             <  1:142565/141‑1 (MQ=255)

                                                 ccgTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCt                                                                                            <  2:106794/139‑1 (MQ=255)

                                                 cTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCt                                                                                            <  1:350593/141‑1 (MQ=255)

                                                     aTTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGt                                                                                        >  1:717529/1‑141 (MQ=255)

                                                      ttGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAAGTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGtt                                                                                       <  2:426570/141‑1 (MQ=255)

                                                          tACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAg                                                                                   >  1:679993/1‑141 (MQ=255)

                                                          tACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGGTTGAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAg                                                                                   >  1:401750/1‑141 (MQ=255)

                                                           aCTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATAGGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGTTGAAgg                                                                                  >  2:548766/1‑141 (MQ=255)

                                                              ttGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCGGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGc                                                                               >  2:414692/1‑141 (MQ=255)

                                                               tGATATCGTGTTTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTT‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGTCAGCCAGGTTTAAGTTTAAAATCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGcc                                                                              <  2:14083/141‑1 (MQ=11)

                                                                 atatcTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCTGATTTTTTGTTGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTTGCCATTGCTGCCTTGGTTGAAGGTACCTg                                                                            >  1:259184/5‑141 (MQ=11)

                                                                 aTACCTTGTGTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTg                                                                            >  2:496737/1‑141 (MQ=255)

                                                                  tatcTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATGTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGa                                                                           >  1:524913/4‑141 (MQ=255)

                                                                         tctttcttACTTTAATATGCCGGTGATCTTG‑CTCAGTGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACACTGGCAGGCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTCCCTTCGTTGAATGGGCCCGagtgtcat                                                                    >  2:405211/1‑134 (MQ=11)

                                                                              ctttctttAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTAcc                                                               <  2:630990/141‑1 (MQ=255)

                                                                              cttACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTAcc                                                               >  2:576794/1‑141 (MQ=255)

                                                                              cttACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTAcc                                                               >  1:129267/1‑141 (MQ=38)

                                                                                tACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCtt                                                             <  2:173269/141‑1 (MQ=255)

                                                                                tACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGGTATTCAGATATTTCGATGTACAATGCCAGTGAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTGACTACCtt                                                             >  2:752007/1‑141 (MQ=11)

                                                                                 tcTTTAATAGGACGGTTATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTCCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCttt                                                            <  1:600733/140‑1 (MQ=11)

                                                                                 aCTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTGACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAAGTAACttt                                                            >  2:741984/1‑141 (MQ=11)

                                                                                 aCTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCttt                                                            >  2:460768/1‑141 (MQ=255)

                                                                                     tAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAg                                                        >  1:660032/1‑141 (MQ=255)

                                                                                        tatGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCTGGTTTTAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTTATCTGTAATTACCTTTTTAGGtt                                                     >  1:153727/1‑141 (MQ=11)

                                                                                           gaggggtaTCTTG‑CTCAATGTGGTTGTTTAGATATTTCGAGGTTGATGGGCAGTCATGTTTCTGTGTAATAGGTTTTATTACTTTAACAATTGGTACCTTTGTTGTAGGTGGCTGTGCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTAc                                                  <  2:69236/134‑1 (MQ=2)

                                                                                            ccggtcttCTTG‑CGGAATGCGATTATTTTAATAGTTCTTTGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTAcc                                                 <  1:173910/134‑1 (MQ=11)

                                                                                            aCGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTAcc                                                 >  1:767027/1‑141 (MQ=25)

                                                                                             cGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTGAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGGGCCTGATCTGTATTTACCTTTTGAGGTTTACCa                                                >  2:241643/1‑141 (MQ=11)

                                                                                                 gATCTTG‑CTCAATGGGGTCAATCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGCAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGTTTAcctgatt                                            <  2:474889/141‑6 (MQ=11)

                                                                                                   tCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCACATTGt                                          >  2:64952/1‑141 (MQ=17)

                                                                                                      tG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTa                                       >  2:524454/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                          ttaaTGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATg                                    <  1:234963/139‑1 (MQ=12)

                                                                                                           cAATGAGGTTATTCCGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTaaata                                   <  2:710864/141‑4 (MQ=11)

                                                                                                              tGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGAc                                <  1:286966/141‑1 (MQ=17)

                                                                                                               gAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCGGCAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACg                               <  1:411865/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                               gAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTTCTACCTTCATTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTTAGGTTTACCAAATGGTTTAATGAGACg                               >  1:378430/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                  gTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGttt                            <  2:562553/141‑1 (MQ=17)

                                                                                                                   ttATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTCATGAGACGTTTg                           <  2:569050/141‑1 (MQ=12)

                                                                                                                     aTTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGAt                         >  1:297455/1‑141 (MQ=12)

                                                                                                                      ttCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATa                        <  2:82691/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                                       tCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATaa                       >  2:615814/1‑141 (MQ=17)

                                                                                                                        cAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATaaa                      >  2:328882/1‑141 (MQ=12)

                                                                                                                        cAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATaaa                      >  1:365113/1‑141 (MQ=17)

                                                                                                                         aGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAAc                     <  2:764268/141‑1 (MQ=17)

                                                                                                                         aGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAAc                     <  2:588595/141‑1 (MQ=17)

                                                                                                                         aGATATTTCCATGGACAATGGCAGTTAGATTATAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTCTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAAc                     <  1:692294/141‑1 (MQ=11)

                                                                                                                          aatatTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACg                    <  2:39537/140‑1 (MQ=17)

                                                                                                                            tatTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCa                  <  1:548766/141‑1 (MQ=32)

                                                                                                                               ttCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCctat               >  1:89789/1‑141 (MQ=12)

                                                                                                                               tgcGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTAACTTTAGCGGTGTACCAGATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCatat               >  2:349618/3‑141 (MQ=11)

                                                                                                                                 cGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGc             <  1:582766/141‑1 (MQ=11)

                                                                                                                                  gATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCCTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCt            >  2:272011/1‑141 (MQ=12)

                                                                                                                                    tGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGGGGTTTATCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGa          <  2:377238/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                       aCAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTCCCCTTTGGGGTGTACTCTATATTGTAATGAGACGTTTGATAACCGCACTTGCTGAATg       <  1:566500/141‑1 (MQ=11)

                                                                                                                                           tGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTa   <  2:683713/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                            gACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTAt  >  1:391667/1‑141 (MQ=255)

TTTTTATATAGAGCGTAAATACATTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTG‑CTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTAT  >  CP000730/35947‑36226

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 12 ≤` `ATCG/ATCG` `< 13 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`