| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 76,185 | G→A | 16.0% | intergenic (+243/‑891) | USA300HOU_0072 → / → USA300HOU_0075 | universal stress protein/lysophospholipase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 76,185 | 0 | G | A | 16.0% | 363.0 / 48.4 | 167 | intergenic (+243/‑891) | USA300HOU_0072/USA300HOU_0075 | universal stress protein/lysophospholipase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (76/63); new base A (11/16); total (88/79) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.11e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 187 total aligned reads displayed.
TAATATAACTAATATTGCTGCACCTGTATCACTTAGAACAGCTAACCAAAGTGTTAGTAATCCAGGGAATACTAACACAAAGGCAATTAATTTAATAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGA > CP000730/76046‑76324 | tAATGTAACTAATATTGCTGCACCTGTATCACGTAGAACAGCTAACCAAAGTGTTAGTAATCCAGGGAATACTAACACAAAGGCAATTAATTTAATAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGt > 1:791292/1‑141 (MQ=255) aaTATAACTAATATTGCTGCACCTGTATCACTTAGAACAGCTAACCAAAGTGTTAGTAATCCAGGGAATACTAACACAAAGGCAATTAATTTAATAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGta < 2:450422/141‑1 (MQ=255) aaTATAACTAATATTGCTGCACCTGTATCACTTAGAACAGCTAACCAAAGTGTTAGTAATCCAGGGAATACTAACACAAAGGCAATTAATTTAATAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGta < 1:226508/141‑1 (MQ=255) aaTATAACTAATACTGCTGCACCTGTATCACTTAGAACAGCTAACCAAAGTGCTAGTAATCCAGGGAATACTAACACAAAGGCAATTAATTTAATAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGta < 1:340653/141‑1 (MQ=255) aaTATAACGAATATTGCTGCACCTGTATCACTTAGAACAGCTAACCAAAGTGTTAGTAATCCAGGGAATACTAACACAAAGGCAATTAATTTAATAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGta < 1:196832/141‑1 (MQ=255) atatAACTAATATTGCTGCACCTGTATCACTTAGAACAGCTAACCAAAGTGTTAGTAATCCAGGGAATACTAACACAAAGGCAATTAATTTAATAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTCTAGtat > 2:245162/1‑141 (MQ=255) atatAACTAATATTGCTGCACCTGTATCACTTAGAACAGCTAACCAAAGTGTTAGTAATCCAGGGAATACTAACACAAAGGCAATTAATTTAATAATTATAGCAAAATATAGGGTCTGTTGCAAAGTTGAATATATAGtaa > 2:631402/1‑140 (MQ=255) aaTATTGCTGCACCTGTATCACTTAGAACAGCTAACCAAAGTGTTAGTAATCCAGGGAATACTAACACAAAGGCAATTAATTTAATAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTaa < 2:304568/141‑1 (MQ=255) gctgcACCTGTATCACTTAGAACAGCTAACCAAAGTGTTAGTAATCCAGGGAATACTAACACAAAGGCAATTAATTTAATAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACaaaaa > 1:826564/1‑141 (MQ=255) gTATCACTTAGAACAGCTAACCAAAGTGTTAGTAATCCAGGGAATACTAACACAAAGGCAATTAATTTAATAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAACAAGGAGtcttc > 1:578541/1‑141 (MQ=255) ttAGAACAGCTAACCAAAGTGTTAGTAATCCAGGGAATACTAACACAAAGGCAATTAATTTAATAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGa < 2:295877/141‑1 (MQ=255) aGAACAGCTAACCAAAGTGTTAGTAAGCCGAGGAATACTAACACAAAGGCAAGTAATTTAATAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTAGAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAAc < 2:56605/141‑1 (MQ=37) aGTGTTAGTAATCCAGGGAATACTAACACAAAGGCAATTAATTTAATAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGCACTATTTCATATATaaa > 2:1109795/1‑141 (MQ=255) aGTGTTAGTAATCCAGGGAATACTAACACAAAGGCAATTAATTTAATAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTATTCTGTATGAACTATTTCAGATATaaa > 2:247499/1‑141 (MQ=255) ttAGTAATCCAGGGAATACTAACACAAAGGCAATTAATTTAATAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAAt > 1:608961/1‑141 (MQ=255) ttAGTAATCCAGGGAATACTAACACAAAGGCAATTAATTTAATAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAAt > 1:51616/1‑141 (MQ=255) aGTAATCCAGGGAATACTAAGACAAAGGCAATTAATTTAATAATTATAGCAAAATATAGGTTCTCTTGCAAAGTTGAATCTTTAGTAAAAAAAAAAAAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAAttt < 2:800079/141‑1 (MQ=25) aGTAATCCAGGGAATACTAACACAAAGGCAATTAATTTAATAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAAttt > 1:974772/1‑141 (MQ=255) aTCCAGGGAATACTAACACAAAGGCAATTAATTTAATAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACa > 2:554645/1‑141 (MQ=255) gggAATACTAACACAAAGGCAATTGATTTAATAATTATAGCAAAATATAGGTTATGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGAt > 1:807833/1‑141 (MQ=255) gggAATACTAACACAAAGGCAATTAATTTAATAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGAt > 2:521470/1‑141 (MQ=255) gAATACTAACACAAAGGCAATTAATTTAATAATTATAGCAAAATATAGGGTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGAAATAAACAATTT‑AACAAGGATGt > 2:444865/1‑141 (MQ=255) aaGGCAATTAATTTAATATTTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGcc < 1:66209/141‑1 (MQ=255) aaGGCAATTAATTTAATAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGcc > 1:352347/1‑141 (MQ=255) aaGGCAATTAATTTAATAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGcc < 2:850834/141‑1 (MQ=255) cAATTAATTTAATAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTTTAGCCGTTg > 2:149162/1‑141 (MQ=255) ttaatttaatAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTAAAATAATAAAAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGct < 2:58844/141‑1 (MQ=255) ttaatttaatAAATAAAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGGCGTTGGca > 2:1015215/1‑140 (MQ=255) aatttaatAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGctac > 1:281314/1‑141 (MQ=255) aatttaatAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGctac < 1:656568/141‑1 (MQ=255) atttaatAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGctact < 1:758994/141‑1 (MQ=255) atttaatAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGctact < 1:99474/141‑1 (MQ=255) tataGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGata < 1:893217/141‑1 (MQ=255) aaaGCAAAATATAGATTCTGTTGCAAAGATGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGatat < 1:1068754/139‑1 (MQ=255) aGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGc > 2:464188/1‑141 (MQ=255) acagttaggaGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATGTATAATATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCa < 2:1103588/132‑1 (MQ=11) cagttaggaGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATTTATAATATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCAt > 1:7746/9‑141 (MQ=1) cAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTACCAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTAACACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCAt > 2:357933/1‑141 (MQ=255) cAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATTGTATCTCTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCAt > 1:203070/1‑141 (MQ=255) cAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCAt > 1:965373/1‑141 (MQ=255) gtaaatgaGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATTTAGAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCTGTTGGCTACTATCTAAGATATGCAtt > 1:1096080/8‑141 (MQ=11) agttaggaGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATTTATAATATAATTTTAACAAAAAGTAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACCGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCAtt > 1:739828/8‑141 (MQ=1) agtaagggggtcggTTGCAAAGTTGAATTTATAATATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAACGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTg < 2:936023/128‑1 (MQ=1) aaaTATAGGTTCTGTTGCAAATTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTg < 2:908064/141‑1 (MQ=255) aaaTATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTg < 1:708847/141‑1 (MQ=40) taggaGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATTTATAATATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTA‑TTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAgc < 2:96869/137‑2 (MQ=11) taggaGGTTATGTTGCAAAGTTGAATTTATAATATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAg < 2:767783/137‑1 (MQ=255) atatAGTGTCTGTTGCAAAGGTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAg < 2:218842/141‑1 (MQ=255) aatgaGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATTTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCTGTTGGCTACTATCTAAGATATGCCTTGAg > 2:1088049/5‑141 (MQ=255) atgaGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATTTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCTGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGt < 1:563534/138‑1 (MQ=2) aggaGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATTTATAATATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAgc < 1:494634/138‑2 (MQ=0) aggaGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATTTATAATATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTG‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAgc < 2:190633/138‑2 (MQ=2) tacggTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGCATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAATGATGTTATCCCTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATCCATTGAGtt < 2:692683/138‑1 (MQ=1) taGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTa < 1:343361/141‑1 (MQ=38) gaGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATTTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCTGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGTGTTa > 1:93516/2‑141 (MQ=0) gaGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATTTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCTGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTa > 1:579066/2‑141 (MQ=0) gaGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATTTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCTGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTa > 2:833289/2‑141 (MQ=0) aGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATTTATAATATAATTTTAACAGAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTAt > 2:1040065/1‑141 (MQ=0) aGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATTTATAATATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAgcttt > 2:207376/1‑137 (MQ=0) aGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTTAAATTACGTTCCT‑TCACAAAAGCAATTAACTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTAt > 1:1082384/1‑141 (MQ=11) aGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTAt > 2:26866/1‑141 (MQ=35) aGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATATAAGATATGCATTGAGTTAt > 2:510857/1‑141 (MQ=25) aGGTTCTGTTGCAAAATTGAATTTATAATATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTAt > 1:819755/1‑141 (MQ=11) gTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGata < 1:631402/141‑1 (MQ=35) gTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGata < 1:833324/141‑1 (MQ=35) tcaaatgtGAATTCATAATATAATCTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTAGGAACTACTGCAGATATAAACAATTT‑AACAAGTATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGatatat < 1:314337/134‑1 (MQ=11) gCAAAGGTCAATGTAAAATATAATTTTAACAAAACATAGACATGTGTATGACTTGAATGTTAGATATACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGatatat > 2:502922/1‑141 (MQ=2) cAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATc > 2:972953/1‑141 (MQ=34) ataGTTGATTCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATcg > 2:837729/3‑140 (MQ=21) tGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAat > 1:1006344/1‑141 (MQ=35) tGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAat > 1:161672/1‑141 (MQ=35) gAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCATCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGGAata < 1:750572/141‑1 (MQ=21) atttataatataaTTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATAtt > 2:997472/4‑141 (MQ=2) atttataatataaTTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATAtt > 1:371779/4‑141 (MQ=0) atttataatataaTTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATAtt > 1:541955/4‑141 (MQ=2) atttataatataaTTTTAACAAAAAGGAGCCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑ACCAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATAtt < 1:157557/138‑1 (MQ=1) atttataGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCTGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATAtt < 2:250704/138‑1 (MQ=1) atttataGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCTGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATAtt > 1:157915/4‑141 (MQ=11) atttataGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCTGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATAtt < 1:1040855/138‑1 (MQ=11) tttataatataaTTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACACTTT‑AACACGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGAATTGCGCTATCGTGATATATCTGAAATATTa > 2:331393/3‑141 (MQ=11) tttataatataaTTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATCTTa > 1:311804/3‑141 (MQ=2) tttataatataaTTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTa > 2:6779/3‑141 (MQ=2) tCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTa > 1:401708/1‑141 (MQ=33) tCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTAGTTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTa > 1:1037362/1‑141 (MQ=21) ttataatataaTTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTaa > 1:937255/2‑141 (MQ=9) ttataatataaTTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTaa < 2:477015/140‑1 (MQ=12) ttataatataaTTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTaa > 1:23718/2‑141 (MQ=12) ttataatataaTTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTaa > 2:593007/2‑141 (MQ=12) tataatataaTTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAg > 1:782118/1‑141 (MQ=17) tataatataaTTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAg > 1:864915/1‑141 (MQ=12) tataGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAg < 1:673861/141‑1 (MQ=32) tataGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAAAATTCT‑TTCAATTATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAg < 1:525843/141‑1 (MQ=11) ataatataatTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAga < 2:256970/141‑2 (MQ=12) ataataAAATTTTAACAAAAAAGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAga < 2:266407/141‑2 (MQ=255) taGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCTGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAggg > 1:756622/1‑141 (MQ=17) taGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCTGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAggg < 1:575460/141‑1 (MQ=17) taGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCTGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAggg < 1:489401/141‑1 (MQ=17) taGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCTGTTGGCAAATATCAAAGGTATGCGTTGAGTTATCGTGATATATCAGAAACATTAAggg > 2:863510/1‑141 (MQ=11) taGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTATGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCTGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAggg < 1:1003386/141‑1 (MQ=17) aGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGa < 1:354859/141‑1 (MQ=32) | TAATATAACTAATATTGCTGCACCTGTATCACTTAGAACAGCTAACCAAAGTGTTAGTAATCCAGGGAATACTAACACAAAGGCAATTAATTTAATAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTT‑AACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGA > CP000730/76046‑76324 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |