| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,646,189 | G→C | 100% | A155G (GCA→GGA) | USA300HOU_1531 ← | M24B family Xaa‑Pro dipeptidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,646,189 | 0 | G | C | 100.0% | 334.3 / NA | 98 | A155G (GCA→GGA) | USA300HOU_1531 | M24B family Xaa‑Pro dipeptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (57/41); total (57/41) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
TTTATCACTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTGCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGATATAC > CP000730/1646053‑1646324 | tttATCACTTGCAACACCATGTGGTAATGGACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGACTTTATTTCTTTTTTTGTCATGCCTCCttt > 1:321427/1‑141 (MQ=255) ttATCACTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATACCTCCtttt > 2:761007/1‑141 (MQ=255) ttATCACTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAAACGTATCGAATGATGTTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCtttt > 2:529219/1‑141 (MQ=255) tATCACTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑a > 2:271714/1‑141 (MQ=255) ttCACTTGCAGTACCGTGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ac < 2:988688/140‑1 (MQ=255) aTCACTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ac > 1:357874/1‑141 (MQ=255) aTCACTTGCAACACCATGTGGTAATACACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ac > 2:1060083/1‑141 (MQ=255) tCACTTGCAACACCATGTGGTAATGGACCCCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGGATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTACCTTTAATTGTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑act > 2:683928/1‑140 (MQ=255) cTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑acaaca > 2:1059102/1‑141 (MQ=255) ttGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAg < 1:364272/141‑1 (MQ=255) aaCACCATGTGGTAATGCACCTCTAAAACAAGATGCTACAATCGTATCTAATGCTGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTACCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTaa > 2:529217/1‑141 (MQ=255) ctccATGTGGTAATGCACCTCTATGGCCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATCTTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTaaaa < 1:935132/139‑1 (MQ=255) cacCTTGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTaaaa < 2:649263/141‑1 (MQ=255) cacCATGTGGTAATGCACCTCTATGCCCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTaaaa < 2:649676/141‑1 (MQ=255) tgtgGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAatatat > 2:945944/1‑141 (MQ=255) gtgGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATAtt < 2:275815/141‑1 (MQ=255) tgGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTc > 1:256018/1‑141 (MQ=255) ggTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCa < 1:415708/141‑1 (MQ=255) ggTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCa > 1:271963/1‑141 (MQ=255) gTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCat < 1:300346/141‑1 (MQ=255) tGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGt < 1:758954/141‑1 (MQ=255) cACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGttt < 1:252245/141‑1 (MQ=255) aCCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTtc < 1:662523/141‑1 (MQ=255) ctctATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTtctt > 1:485574/1‑139 (MQ=255) gATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTTATTCTTTTTCAGTCATGCATCCTTTT‑GCAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTTATCAACAATATTa > 2:395865/1‑141 (MQ=255) tGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATTCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAgc > 2:34955/1‑141 (MQ=255) cTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATCTTAgctg > 2:266555/1‑141 (MQ=255) cTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAgctg < 2:1016373/141‑1 (MQ=255) tACAAGCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTTCACCCCA‑TTGAATGAGCTTCATATGTTTCATCAACAATATTAgctgc > 2:539947/1‑141 (MQ=255) aCAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAgctgct > 2:24488/1‑141 (MQ=255) cAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCCGTCATGCCCCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCGTATGTTTCTTCAACAATATTAGCTGCtt < 1:780457/141‑1 (MQ=255) cAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCtt < 1:700215/141‑1 (MQ=255) cAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCtt > 1:288132/1‑141 (MQ=255) agtactaagcGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTAATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCtt > 2:309554/10‑141 (MQ=255) aTCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCtttt < 1:673328/141‑1 (MQ=255) aTCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCtttt < 1:1019574/141‑1 (MQ=255) cGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCCACAATATTAGCTGCTTTTTg > 2:1184710/1‑141 (MQ=255) aTCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAAt > 1:124721/1‑141 (MQ=255) aTCGAATGATGGTCCATCTACTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAGTTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATCTGTTTCATCAACACTATTAGCTGCTTTTTGAAt > 2:667000/1‑141 (MQ=255) tCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAAtt < 1:837818/141‑1 (MQ=255) ctaaTGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTATCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTa < 1:230923/139‑1 (MQ=255) atgatgGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAg > 1:670356/1‑141 (MQ=255) atgatgGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAg > 2:276445/1‑141 (MQ=255) tgatgGTCCATCTGCTCCTAATTCTTGCATTTTGCTTTCTAATATTTCCTTTAATTCTGTTGCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATCGTTTATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGc < 2:787395/141‑1 (MQ=255) tgatgGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTGTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCTGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGc < 1:809526/141‑1 (MQ=255) gatgGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCTTTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTGTT‑AGAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCa < 2:682649/141‑1 (MQ=255) atgGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGACTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATGACCAATGTTAGCTGCTTTTTGAATTAAGGCaa > 1:398669/1‑141 (MQ=255) atgGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGATTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCaa > 1:856913/1‑141 (MQ=255) tgttCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAACATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAAt < 2:933003/138‑1 (MQ=255) ggtctactttcTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAAtt < 2:1140891/131‑1 (MQ=255) gTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAAttt > 2:99065/1‑141 (MQ=255) ttCTGCTCCTAATTATAGCCTTTTGCCTTATAATCTTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTc < 1:539947/140‑1 (MQ=255) tCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCa > 2:593160/1‑141 (MQ=255) tGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACATTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCACTTTCGTCCGc > 1:570904/1‑141 (MQ=255) cTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCCTCAGCAt < 1:751633/141‑1 (MQ=255) cTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTCTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCGGCAt > 1:828786/1‑141 (MQ=255) tCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATc > 1:452947/1‑141 (MQ=255) cTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCatgatcgt > 2:737220/1‑134 (MQ=255) tAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCttt < 2:356205/141‑1 (MQ=255) tAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTCAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCAACttt < 1:812690/141‑1 (MQ=255) cTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGt < 1:402043/141‑1 (MQ=255) gCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTACAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGtctc > 1:730845/1‑141 (MQ=255) tttGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAAt < 1:24488/141‑1 (MQ=255) ttGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTACtt > 2:1123368/1‑141 (MQ=255) ttGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAAtt < 1:1060083/141‑1 (MQ=255) tttCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCGCTAATTTTAt > 2:59438/1‑141 (MQ=255) tCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCt < 2:324197/141‑1 (MQ=255) tAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCCTATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTaa > 2:197415/1‑140 (MQ=255) aaTATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTAcc > 2:5358/1‑140 (MQ=255) aaTATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTACTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCAAATTTTATCTACa > 2:321252/1‑141 (MQ=255) tatttactatAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACCGTTAAAATATATACATATGTTTCATCAACAATATTAGCTTCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGt < 1:395865/132‑1 (MQ=255) tatTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGt < 1:981883/141‑1 (MQ=255) atTGCCTTTAATTCTTTTTCCGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGtt > 1:1005630/1‑140 (MQ=255) atTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTCAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTTGTCAGCATCTTTGGCGACTCTAATTTTATCTACAGTa > 1:161789/1‑141 (MQ=255) tGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATTTGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTAtt > 2:8292/1‑141 (MQ=255) tGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTAtt > 1:137506/1‑141 (MQ=255) tGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTAtt < 2:532289/141‑1 (MQ=255) cTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑AAACTTCGTGAAAAAAATTCTTTCTTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGa > 1:280898/1‑141 (MQ=255) ttttATTCTTTTTCAGTCATGCTTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTACTTTTATCTACAGTATTAGaa < 1:529219/141‑1 (MQ=255) tttAATTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGaa < 1:761007/141‑1 (MQ=255) aTTCTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGc > 2:501444/1‑141 (MQ=255) aTTCTTTTTCAGTCATGACTCCTTTT‑ACAAAAGTTAAAATATATTCCTCTGTTTCATAAAGAATCTTAGCTGATTTTTGAATTCAAGAATTTTAGTCAGCATAGTTGACGTCTCTAATTTTATCTACCGAATTATAAAtac > 2:211619/1‑139 (MQ=255) cTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCtta > 1:970746/1‑141 (MQ=255) cTTTTTCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAAGGCtta > 1:970500/1‑141 (MQ=255) tttttCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCttat > 2:885311/1‑141 (MQ=255) tttttCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGAAGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCttat > 2:691413/1‑141 (MQ=255) ttttCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGCCGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCttatt < 1:34955/141‑1 (MQ=255) ttttCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCttatt > 2:765126/1‑141 (MQ=255) ttttCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTCATCTACAGTATTAGAAATGCttatt > 1:1052470/1‑141 (MQ=255) ttttCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATT‑AAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCttatta > 1:597999/1‑141 (MQ=255) tCAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAACGACATTTCGGCATCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAAt < 1:1123368/141‑1 (MQ=255) cAGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATg < 1:271714/141‑1 (MQ=255) aGTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGa < 2:729833/141‑1 (MQ=255) gTCATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGat > 2:643461/1‑141 (MQ=255) cATGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAGTGCTTATTAATGatat > 1:508191/1‑141 (MQ=255) aTGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGAtata > 1:1041869/1‑141 (MQ=255) tGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGATATAc > 1:450705/1‑141 (MQ=255) tGCCTCCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCAGTTCTTTCATCCACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGTATCTTTGACGTCTCTTATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGATATAc < 2:265226/141‑1 (MQ=255) | TTTATCACTTGCAACACCATGTGGTAATGCACCTCTATGACCAGATGCTACAATCGTATCGAATGATGGTCCATCTGCTCCTAATTCTAGCATTTTGCTTTCTAATATTGCCTTTAATTCTTTTTCAGTCATGCCTGCTTTT‑ACAACAGTTAAAATATATTCATATGTTTCATCAACAATATTAGCTGCTTTTTGAATTAAAGCAATTTCGTCAGCATCTTTGACGTCTCTAATTTTATCTACAGTATTAGAAATGCTTATTAATGATATAC > CP000730/1646053‑1646324 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |