| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,063,805 | +T | coding (684/1218 nt) | brpA ← | LytR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,063,804 | 1 | . | T | 98.6% | 223.4 / ‑2.9 | 69 | coding (685/1218 nt) | brpA | LytR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/1); new base T (38/30); total (38/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.49e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.57e-01 | |||||||||||
AATTTCAACATCATTTGTTAAGTACATTTTTGCTAAAGCTTTAATTTCAGAGTTAGTTAAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑A‑TAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTAT > CP000730/1063664‑1063938 | aaTTTCAACATCATTTGTTAAGTACATTTTTGCTAAAGCTTTAATTTCAGAGTTAGTTAAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGa‑a < 1:996582/141‑1 (MQ=255) aTTTCAACATCATTTGTTAAGTACATTTTTGCTAAAGCTTTAATTTCAGAGTTAGTTAAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑A‑t < 1:960614/141‑1 (MQ=255) tttGGTAACTACGTTTGTGCTAAAGCTTTAATTTCAGAGTTAGTTAAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATGTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCttaat < 1:395093/141‑1 (MQ=255) tGTTAAGTACATTTTTGCTAAAGCTTTAATTTCAGAGTTAGTTAAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCttaatta > 1:472832/1‑141 (MQ=255) tGTTAAGTACATTTTTGCTAAAGCTTTAATTTCAGAGTTAGTTAAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCttaatta > 1:953395/1‑141 (MQ=255) tttAAGTACATTTTTGCTAAAGCTTTAATTTCAGAGTTAGTTAAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCCACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCttaattaa < 1:827094/140‑1 (MQ=255) gTTAAGTACATTTTTGCTAAAGCTTTAATTTCAGAGTTAGTTAAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATATAATCAACGTCCAGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCttaattaa > 1:219528/1‑141 (MQ=255) tACATTTTTGCTAAAGCTTTAATTTCAGAGTTAGTTAAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCAt > 1:959561/1‑141 (MQ=255) cATTCTTGCTAAAGCTTTAATTTCAGAGTTAGTTAAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCCGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCAttt < 1:1041899/141‑1 (MQ=255) tGCTAAAGCTTTAATTTCAGAGTTAGTTAAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTTACGtt > 1:504101/1‑141 (MQ=255) tGCTAAAGCTTTAACTTCAGAGTTAATTAAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGtt > 1:657593/1‑141 (MQ=255) gCTAAAGCTTTAATTTCAGAGTTAGTTAAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTg > 1:273418/1‑141 (MQ=255) cTAAAGCTTTAATTTCAGAGTTAGTTAAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGt < 1:1186489/141‑1 (MQ=255) tttAATTTCAGAGTTAGTTAAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGtt > 1:764295/1‑141 (MQ=255) tAATTTCAGAGTTAGTTAAATTATGCTTTGCATTTTTCACTACAATTTGTATCACGTTATCAAGTTTAAAAATTTGATCAACTAACAATTGTGTTTTGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGtttt < 1:1176476/141‑1 (MQ=255) aaTTTCAGAGTTAGTTAAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGGTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGTCGTTGTCCACGTTTTa < 1:974000/141‑1 (MQ=255) aattCAGAGTTAGTTAAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTaa < 1:682153/139‑1 (MQ=255) tttCAGAGTTAGTTAAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTTGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTCAg > 1:351112/1‑141 (MQ=255) ttCAGAGTTAGTTAAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACTTTGTCCATGTTTTAGGt > 1:306609/1‑141 (MQ=255) ttCAGAGTTAGTTAAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGt > 1:321012/1‑141 (MQ=255) cAGAGTTAGTTAAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTTCACGTTTTAAGttg > 1:1106325/1‑139 (MQ=255) agagTTAGTTAAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTg > 1:841889/1‑141 (MQ=255) gagTTAGTTAAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGa > 1:1035605/1‑141 (MQ=255) gttagttaAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAATTCTGAAt < 1:746738/141‑1 (MQ=255) gttagttaAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAAt < 1:935721/141‑1 (MQ=255) ttagttaAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCAGGTTTTAAGTCTGAATc > 1:153430/1‑141 (MQ=255) ttagttaAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATc > 1:988107/1‑141 (MQ=255) ttagttaAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATc > 1:410080/1‑141 (MQ=255) aTGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAg < 1:964711/141‑1 (MQ=255) tttGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCt < 1:471501/141‑1 (MQ=255) tttGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCt > 1:673207/1‑141 (MQ=255) tttGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTGTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCt < 1:1099060/141‑1 (MQ=255) tttGCATTTTGACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGACTCAACTCCCTGTGCTGTCTGGACT‑TCAATTCTTAATTAATTACATTTCACGTTGGTCACGTTTTAAGTCTCAATTATGATGTCTAGTTCt < 1:891886/141‑1 (MQ=255) tttttACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAGAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAAc > 1:457567/1‑141 (MQ=255) tttttACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAAc > 1:697110/1‑141 (MQ=255) ttttACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACt < 1:830297/141‑1 (MQ=255) ttACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGc < 1:1020793/141‑1 (MQ=255) aCCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTa > 1:1143090/1‑141 (MQ=255) aCCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTa > 1:494255/1‑141 (MQ=255) aCAAGTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGc < 1:228598/141‑1 (MQ=255) cAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGcc < 1:890611/141‑1 (MQ=255) aaaTTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGcc < 1:697025/140‑1 (MQ=255) tGAATCACGTTATCAAGTTTCTAGTTACGGACAGCTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTGGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCtcatc > 1:878161/1‑141 (MQ=255) tGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCtcatc > 1:1174373/1‑141 (MQ=255) tGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCtaatc > 1:700717/1‑141 (MQ=255) tGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCAGTGCGTGTTGGA‑ATTAAAATCTTACTTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCtcatc > 1:526234/1‑141 (MQ=255) aaTCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCAc > 1:227249/1‑141 (MQ=255) aaTCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCAc > 1:458125/1‑141 (MQ=255) aaTCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCATCATAAc > 1:637267/1‑141 (MQ=255) aTCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCAcc > 1:72987/1‑141 (MQ=255) cACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTTTCCACGTTTTAAGTCTGAATTATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCAt < 1:1003191/141‑1 (MQ=255) gTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTCTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTGGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTa > 1:413565/1‑141 (MQ=255) aTCAAGTTTATCAATAGAATCAACCTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAAtt < 1:323554/141‑1 (MQ=255) tCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTTATCACTTAGTTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAAttt < 1:863465/141‑1 (MQ=255) tCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTCATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAAttt < 1:215552/141‑1 (MQ=255) tCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAAttt < 1:1195540/141‑1 (MQ=255) cAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAGGCCTCATCACCATTTCAtttt > 1:239299/1‑141 (MQ=255) cAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAAtttt > 1:154963/1‑141 (MQ=255) gTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTgg < 1:805706/141‑1 (MQ=255) aTCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTATAGTGGCAGCACCATTTAATTTTTGGTAcc < 1:877952/141‑1 (MQ=255) cAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAAACTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTttttaatt > 1:769911/1‑141 (MQ=255) aaCTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTttttaattt < 1:685683/141‑1 (MQ=255) aCTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTttttaatttt < 1:645871/141‑1 (MQ=255) aCTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTttttaatttt > 1:118008/1‑141 (MQ=255) aCTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTttttaatttt > 1:376895/1‑141 (MQ=255) aCTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCAAATGTCTGTGGGTACCCTTttttaatttt < 1:579233/141‑1 (MQ=255) cTTCCTGTGCTTTTTGGA‑ATTAAAGTCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCCTCACGATTGAATTTTTGGTCCCCTTttttaatttta > 1:1015476/1‑141 (MQ=255) tgtgCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCtt > 1:1132006/1‑141 (MQ=255) gCTTTTTGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTAcc < 1:193292/141‑1 (MQ=255) ttttGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGt < 1:400330/141‑1 (MQ=255) ttGGA‑ATTAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTat < 1:269299/141‑1 (MQ=255) | AATTTCAACATCATTTGTTAAGTACATTTTTGCTAAAGCTTTAATTTCAGAGTTAGTTAAATTATGCTTTGCATTTTTACCTACAATTTGAATCACGTTATCAAGTTTATCAATAGAATCAACTTCCTGTGCTTTTTGGA‑A‑TAAAATCTTAATTAATTCCATTTGACGTTGTCCACGTTTTAAGTCTGAATCATGATGTCTAGTTCTAGCAACTGCTAAAGCCTCATCACCATTTAATTTTTGGTACCCTTTTTTAATTTTAATCTTACCAGTAT > CP000730/1063664‑1063938 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |