| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 691779 = | 101 (1.130) | 3 (0.040) | 3/248 | 15.1 | 3.2% | coding (43/1056 nt) | USA300HOU_0634 | hypothetical protein |
| ? | CP000730 | 691838 = | 91 (1.130) | intergenic (‑17/+44) | USA300HOU_0634/USA300HOU_0635 | hypothetical protein/possible replication initiation protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
ATTACAATCATCTTACGACGATTTTTAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTAACACTTATCTTTTGATAAGTGCTTTTTTTGTTTTAAAGCCTCCAAATAATGATTAATTCTATTCGTATGCTCATCATTAAATTGTGAATGCGCT > CP000730/691700‑691978 | aTTACAATCATCTTACGACGATTTTTAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATcc > 1:210189/1‑141 (MQ=255)aTTACAATCATCTTACGACGATTTTTAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATcc > 2:381060/1‑141 (MQ=255) aCAATCATCTTACGACGATTTTTAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCttt > 2:568591/1‑141 (MQ=255) aCAATCATCTTACGACGATTTTTAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCttt > 1:960963/1‑141 (MQ=255) aCAATCATCTTACGACGATTTTTAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCttt < 2:38160/141‑1 (MQ=255) cAATCATCTTACGACGATTTTTAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTa < 2:396742/141‑1 (MQ=255) cAATCATCTTACGACGATTTTTAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTa < 2:500937/141‑1 (MQ=255) ctcgtcTTACGACGATTTTTAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACg < 2:905913/137‑1 (MQ=255) tcatcTTACGTTGAGGTGTAAATTTTATTTTTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCTTGTTTTAATAGACTTGCTTAGTAATGTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACgt < 2:482202/141‑2 (MQ=255) gacgaTTTTTAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTtaa < 2:948632/141‑1 (MQ=255) cgaggtttAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCGTTTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATACTTTAAACAATTTAtaat > 2:762986/6‑141 (MQ=255) cgaTTTTTAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTtaata < 1:917057/141‑1 (MQ=255) tttttAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATaaaa < 1:56645/141‑1 (MQ=255) tttttAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATaaaa > 1:908020/1‑141 (MQ=255) tttAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAAt < 2:450700/141‑1 (MQ=255) tttAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAAt < 1:616862/141‑1 (MQ=255) tttAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTAAATAAAAAt < 1:851095/141‑1 (MQ=255) tAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATCAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATca > 2:697315/1‑141 (MQ=255) tAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATca > 2:401278/1‑141 (MQ=255) ttGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATccc < 2:308005/141‑1 (MQ=255) ggAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAg < 1:518345/141‑1 (MQ=255) ggAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTCTTAATAAAAATCACATCCCAg < 1:474990/141‑1 (MQ=255) gAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGt < 1:856249/141‑1 (MQ=255) aTTACTCGGCGTTGTTCTTTTGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTa < 1:342987/141‑1 (MQ=255) ttACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTAt < 1:644578/141‑1 (MQ=255) tACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTAtt < 1:573898/141‑1 (MQ=255) tACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTAtt < 1:136156/141‑1 (MQ=255) aCTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTAttt < 1:819960/141‑1 (MQ=255) aCTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTAttt < 1:585478/141‑1 (MQ=255) aCTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTAttt > 2:373335/1‑141 (MQ=255) aCTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTAttt < 1:948349/141‑1 (MQ=255) tCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTAttttt > 1:724869/1‑141 (MQ=255) gCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTACAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTa > 2:361221/1‑141 (MQ=255) gCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTa > 1:826063/1‑141 (MQ=255) gCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTa > 2:403460/1‑141 (MQ=255) gttgttCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTAac < 1:819698/141‑1 (MQ=255) gttgttCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTAac < 1:934315/141‑1 (MQ=255) ttgttCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTAaca < 2:470415/141‑1 (MQ=255) tgttCTTTAGGAATATCAACTGGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATCTTTTTAacac < 1:496065/141‑1 (MQ=255) tgttCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTAacac < 1:383339/141‑1 (MQ=255) ttCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTAACACtt > 1:135529/1‑141 (MQ=255) cTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTAACACTTAt > 2:341758/1‑141 (MQ=255) ttAGGAATATCAATATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAACTCGTGTTAAAATGTACGTGCTTATTATTGTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAACTTTTAATAAAAATCACATCCCGGTTATTTCTTTACCACTTctct < 2:629048/141‑1 (MQ=255) tAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTAACACTTATCtt > 1:717848/1‑141 (MQ=255) tAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTAACACTTATCtt > 1:506143/1‑141 (MQ=255) gAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTAACACTTATCTTTTg > 1:9234/1‑141 (MQ=255) tatCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTAACACTTATCTTTTGATa < 2:250562/141‑1 (MQ=255) tCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTAATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTAACACTTATCTTTTGATAAg > 1:949856/1‑141 (MQ=255) aaaaTGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTAACACTTATCTTTTGATAAGTg < 2:785762/141‑1 (MQ=255) aaTGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTAACACTTATCTTTTGATAAGTGCt < 2:65785/141‑1 (MQ=255) aaTGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTAACACTTATCTTTTGATAAGTGCt < 1:561780/141‑1 (MQ=255) aTGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTAACACTTATCTTTTGATAAGTGCtt < 1:262475/141‑1 (MQ=255) ccG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTAACACTTATCTTTTGATAAGTGCTTTTTTTGt < 1:650899/141‑1 (MQ=255) g‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTAACACTTATCTTTTGATAAGTGCTTTTTTTGttt > 1:564953/1‑141 (MQ=255) g‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTAACACTTATCTTTTGATAAGTGCTTTTTTTGttt < 2:896367/141‑1 (MQ=255) g‑TTTTTAGAAAAACGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATGCTTTACGAAAAAAATAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTAACACTTATCTTTTGATAAGTGCTTTTTTTGttt < 2:511008/141‑1 (MQ=255) ttAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTAACACTTATCTTTTGATAAGTGCTTTTTTTTTTTTaaa > 2:800821/1‑141 (MQ=255) ttAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTAACACTTATCTTTTGATAAGTGCTTTTTTTGTTTTaaa < 1:98986/141‑1 (MQ=255) ttAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTAACACTTATCTTTTGATAAGTGCTTTTTTTGTTTTaaa < 1:325518/141‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) cGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTAACACTTATCTTTTGATAAGTGCTTTTTTTGTTTTTTATCTTCCAAATAATGATTAATTCTATTCGTATGCTCGTCATTaaa > 2:199917/1‑141 (MQ=255) cGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTAACACTTATCTTTTGATAAGTGCTTTTTTTGTTTTAAAGCCTCCAAATAATGATTAATTCTATTCGTATGCTCATCATTaaa < 2:506143/141‑1 (MQ=255) gATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTAACACTTATCTTTTGATAAGTGCTTTTTTTGTTTTAATGCCTCCAAATAATGATTAATTCTATTCGTATGCTCATCATTAAAt < 1:955906/141‑1 (MQ=255) gATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTAACACTTATCTTTTGATAAGTGCTTTTTTTGTTTTAAAGCCTCCAAATAATGATTAATTCTATTCGTATGCTCATCATTAAAt < 2:469391/141‑1 (MQ=255) gATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTAACACTTATCTTTTGATAAGTGCTTTTTTTGTTTTAAAGCCTCCAAATAATGATTAATTCTATTCGTATGCTCATCATTAAAt > 2:394060/1‑141 (MQ=255) aTTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTAATACTTATCTTTTGATAAGTGCTTTTTTTGTTTTAAAGCCTCCAAATAATGATTAATTCTATTCGTCTGCTCATCATTAAAtt > 2:268344/1‑141 (MQ=255) aTTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTAACACTTATCTTTTGATAAGTGCTTTTTTTGTTTTAAAGCCTACAAATAATGATTAATTCTATTCGTATGCTCATCATTAAAtt > 1:487619/1‑141 (MQ=255) ttttCTACAATCCTTTCCCACATTCTTCATCAAAATCACATCCCAGTTATTCTTCTCCAACTCATATTTAGAAATGTGATTTTTATGTTTTAAAGCCTCCAAATAATGATTAATTCTATTCGTATGCTCATCATTAAATtg < 1:484391/141‑1 (MQ=255) ttttCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTAACACTTATCTTTTGATAAGTGCTTTTTTTGTTTTAAAGCCTCCAAATAATGATTAATTCTATTCGTATGCTCATCATTAAATtg < 2:898855/141‑1 (MQ=255) ttttCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTAACACTTATCTTTTGATAAGTGCTTTTTTTGTTTTAAAGCCTCCAAATAATGATTAATTCTATTCGTATGCTCATCATTAAATtg < 1:326598/141‑1 (MQ=255) tttCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTAACACTTATCTTTTGATAAGTGCTTTTTTTGTTTTAAAGCCTCCAAATAATGATTAATTCTATTCGTATGCTCATCATTAAATtgt > 1:571398/1‑141 (MQ=255) 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(MQ=255) | ATTACAATCATCTTACGACGATTTTTAAATTTTGGAATTACTCGGCGTTGTTCTTTAGGAATATCAAAATGCTTTCCG‑TTTTTAGAAAATCGTGTTAAAATGTACTTGCTTATTATTTTCATAAACGATTTTCTAAAATCCTTTACGAAATTTTTAATAAAAATCACATCCCAGTTATTTTTTTAACACTTATCTTTTGATAAGTGCTTTTTTTGTTTTAAAGCCTCCAAATAATGATTAATTCTATTCGTATGCTCATCATTAAATTGTGAATGCGCT > CP000730/691700‑691978 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |