| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 36142 = | 1802 (16.750) | 6 (0.060) | 4/268 | 12.8 | 0.66% | coding (410/675 nt) | tpn | IS431mec transposase |
| ? | CP000730 | = 76626 | 91 (0.880) | intergenic (+684/‑450) | USA300HOU_0072/USA300HOU_0075 | universal stress protein/lysophospholipase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
GCCATTGATGCAGAGGGATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCAAAATATCAAT > CP000730/76487‑76765 | gCCATTGATGCAGAGGGATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACg > 2:502047/1‑141 (MQ=32) cATTGATGCAGAGGGATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGaa > 1:567626/1‑141 (MQ=32) cATTGATGCAGAGGGATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGaa > 2:963567/1‑141 (MQ=32) aatGATTCAGGAGGATATACAATAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAg < 2:874708/139‑1 (MQ=255) aTTGATGCAGAGGGATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCACCGAAg > 2:6475/1‑141 (MQ=17) aTTGATGCAGAGGGATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAAcacag > 1:1079274/1‑137 (MQ=17) aTTGATGCAGAGGGATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACAAAg > 1:154351/1‑141 (MQ=17) ttGATGCAGAGGGATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAgg > 1:586733/1‑141 (MQ=32) ttGATGCAGAGGGATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCA‑TAAACATATGAGGTAAACCTAAAAAGAGAATTACAGATCAGGCACCTTCAACAAAgt > 1:1183061/1‑140 (MQ=11) tGATGCAGAGGGATTTACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGt > 1:664662/1‑141 (MQ=17) tGATGCAGAGGGATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGt > 2:273103/1‑141 (MQ=32) tGATGCAGAGGGATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGCCACCTTTAACGAAGGt > 2:147499/1‑141 (MQ=17) tGATGCAGAGGGATATACATAAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATAAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGt < 1:944675/141‑1 (MQ=17) gATGCAGAGGGATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTa < 1:128646/141‑1 (MQ=32) agagGGATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAAt < 2:442996/141‑1 (MQ=32) ggggATAGACATTAGATATGTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATgg < 2:8929/140‑1 (MQ=17) agcgacatcaataaGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGTTAAGCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAGCCTCAAAAGGTAGTTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGCAGCAATgg < 2:314437/128‑1 (MQ=11) gggATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGc > 1:138177/1‑141 (MQ=32) gggATATACATTAGATATCTGCTTGCCTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATggt < 2:719048/141‑2 (MQ=12) gggtataCTTTATATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCCTTTATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGTTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCt < 2:510151/138‑1 (MQ=11) ggATATACTTTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCt < 2:683493/141‑1 (MQ=17) gacatgcactggATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGAAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATggtta < 1:388310/130‑4 (MQ=11) aaaataaGATATTTGGTTACGTAAGCAACGAAATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGTTAAAGt < 2:466792/135‑1 (MQ=1) caatAGATATTTAGCTGCCCAAGCAACAAGATAATCATTCAGCATAAGCCTTTATCAAACGGCTCATTAAACA‑ATTAGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGAGCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGTTAAAGTaa < 1:7452/138‑1 (MQ=1) gcgtggcgcAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCCAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAGCCTCAAAAGGTAGTTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAAGCAGCAATGGCTAAAATAATTAAAGCtttt < 2:782270/136‑1 (MQ=1) gggtGCGTAAGAAACTAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCACTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCATGCACCTCCAACGAAGGTAGCAATGGTTAAAGTAATTAAAGCTTtta < 2:1173020/138‑1 (MQ=1) gtggCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAGCCTCAAAAGGTAGTTACAGATCAGGCACCTTCAACGCAGGCAGCAATGGCTAAAATAATTAAAGCTTttaa > 2:1063210/4‑141 (MQ=1) ggtaacaaaCGAGCTAATCATTCAGCATATGCGTTTACCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAGCCTCAAAAGGTAGTTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGCAGCAATGGCTAAAATAATTAAAGCTGttaaactt < 2:232106/134‑1 (MQ=1) ttacgCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAGCCTCAAAAGGTAGTTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGCAGCAATGGCTAAAATAATTAAAGCTTttaaactta > 2:193718/5‑141 (MQ=1) aggaaCGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGAGCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGTTAAAGTAATTAAAGCTTttaaacttaaac < 2:436279/138‑1 (MQ=0) agctatgagaTAATTATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGGCGCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGTTAAAGTAATTAAAGCTTttaaacttaaac < 2:107106/135‑1 (MQ=1) agaaaTAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGAc < 1:44083/137‑1 (MQ=1) agctAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAATCGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAGCCTCAAAAGGTAGTTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGCAGCAATGGCTAAAATAATTAAAGCTTTTAAACTTATACCTGACtt < 2:541601/138‑2 (MQ=1) aTAAGCATTCAGCATATGCGTCTATCAAACGACTCTTTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCACAATATAATTACCGATCAGGCACCTTCAACGAAGCTAGCAATGGCTAAAGTACTTAAAGCTGCTAACCTTAAACCTGACTGtt > 2:517249/1‑141 (MQ=11) aTCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTAtt < 2:458889/141‑1 (MQ=32) aTCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTAtt < 2:982926/141‑1 (MQ=32) tCATTCAGCATATGAGTTTATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTg > 1:787582/1‑141 (MQ=17) ttCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAAATTAAACCTGACTGTTATTGTaa > 2:1133834/1‑140 (MQ=17) tCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACa < 1:998805/141‑1 (MQ=32) tCAGCATAGGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACa < 2:480049/141‑1 (MQ=17) tCAGCATACGCGGTTAACAAATGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTACAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAACTAAAGCTTTTAAGCATAAACCTGACTGTTATTGTACa < 1:764499/141‑1 (MQ=11) atGGGTTTGTCAGACGTCTCATTAAACA‑TTTTGGTAAACGTCAAAAGGTAATTACAGATCGGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTAAATCGAAat > 2:924249/1‑141 (MQ=11) atGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAat < 1:354362/141‑1 (MQ=32) gCGGTTATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAAAGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAatat < 1:140733/141‑1 (MQ=17) gTTTATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCt > 1:1076707/1‑141 (MQ=32) tttATCAATCGTCTCAATAAACA‑ATTTGGCAAAACCAAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTg < 1:515173/141‑1 (MQ=11) tttATCAAACGGCTCATTAACAA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTg < 2:398967/141‑1 (MQ=12) tATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGaa > 2:246864/1‑141 (MQ=32) tATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGaa > 2:985395/1‑141 (MQ=32) cAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATaa < 2:603070/141‑1 (MQ=32) aaaCGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAAc > 2:1169288/1‑141 (MQ=32) aaaCGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAAc > 2:70225/1‑141 (MQ=32) aaCGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAACCTTACACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAAcc < 2:703123/141‑1 (MQ=17) cGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAAGCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAGGCTGTCTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTc < 1:829373/141‑1 (MQ=255) ctcATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTCAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCAtt > 2:369364/1‑141 (MQ=17) tcATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTg > 1:470725/1‑141 (MQ=32) cATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAACGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGa > 2:748944/1‑141 (MQ=17) ttAAACC‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGc < 2:587363/141‑1 (MQ=17) aaCA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATTACCTCATTGAGCAAg < 1:894583/141‑1 (MQ=17) aCA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGa < 2:979583/141‑1 (MQ=32) aCA‑ATTGGGTAAACCGCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGa < 2:335935/141‑1 (MQ=17) 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aCAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACa < 1:6475/141‑1 (MQ=38) cAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACaa > 2:1177324/1‑141 (MQ=38) aGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAg < 1:922379/141‑1 (MQ=38) aGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAg < 2:805214/141‑1 (MQ=38) aTCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAATTAAGAAAGACAAGGt > 2:385224/1‑141 (MQ=21) aTCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAAAAGAACAAGGt > 2:494816/1‑141 (MQ=255) ggctcgttCAAGGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACCTCGAAACCCGTGTCTAAACACATTTATCAAGATTGGTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCa < 2:1161164/135‑1 (MQ=11) ggCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCa < 2:873591/141‑1 (MQ=39) ggCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTCATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCa < 2:322678/141‑1 (MQ=17) gCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAGGGTATCaa > 2:686304/1‑141 (MQ=38) gCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATaaa > 1:433041/1‑141 (MQ=38) gCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCaa > 2:526618/1‑141 (MQ=38) gCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCaa > 1:1159458/1‑141 (MQ=39) cACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCaaa > 2:951430/1‑141 (MQ=38) cACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCaaa < 2:1102312/141‑1 (MQ=38) cACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCaaa < 2:844243/141‑1 (MQ=39) aCCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCaaaa < 1:202540/141‑1 (MQ=40) ccTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCAAAat < 2:884724/141‑1 (MQ=40) cTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCAAAata > 1:709565/1‑141 (MQ=40) cTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCAAAata > 2:370914/1‑141 (MQ=40) acaacaaAGATAACAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCAAAATATc < 2:775345/140‑1 (MQ=255) aCGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTACTTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGAGAAGGTATCAAAATATCAAt > 1:766459/1‑141 (MQ=255) | GCCATTGATGCAGAGGGATATACATTAGATATTTGGTTGCGTAAGCAACGAGATAATCATTCAGCATATGCGTTTATCAAACGTCTCATTAAACA‑ATTTGGTAAACCTCAAAAGGTAATTACAGATCAGGCACCTTCAACGAAGGTAGCAATGGCTAAAGTAATTAAAGCTTTTAAACTTAAACCTGACTGTTATTGTACATCGAAATATCTGAATAACCTCATTGAGCAAGATCACTGTCATATTAAAATAAGAAAGACAAGGTATCAAAATATCAAT > CP000730/76487‑76765 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |