| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | = 1205323 | 51 (0.630) | 32 (0.550) +AGCGAAGCCATTCAATACGAAGTATTGTATAAATAGAG |
8/200 | 8.2 | 39.9% | intergenic (+459/‑365) | yfiE/lspA | possible lactoylglutathione lyase/A8 family signal peptidase II |
| ? | CP000730 | 2478252 = | 82 (1.010) | intergenic (+139/+932) | USA300HOU_2340/htrB | hypothetical membrane protein/hemin ABC superfamily ATP binding cassette transporter, ABC protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
CCACAAACAAACTATTATTATAGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAATTTTTGATGACGGGTC > CP000730/2478115‑2478392 | ccACAAACAAACTATTATTATAGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAAca < 1:599982/141‑1 (MQ=255) cacaAACAAACTATTATTATAGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAAcag > 1:658372/1‑141 (MQ=255) aaacaaacTATTATTATAGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAAcagcag > 2:458221/1‑141 (MQ=255) acaaacTATTATTATAGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTTGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTa < 2:700659/141‑1 (MQ=255) caaacTTTTATTATAGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTaa < 2:571364/141‑1 (MQ=255) caaacTATTATTATAGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTaa > 1:192996/1‑141 (MQ=255) aacTATTATTATAGGTTGTTTATAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATAAAAAAAA‑AAAAAAAACAGCAGTAAGa < 2:661422/141‑1 (MQ=255) cctataataataGTTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGAt > 1:592034/10‑141 (MQ=255) cTATTATTATAGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATa < 1:307003/141‑1 (MQ=255) cTATTATTATAGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATa > 1:870219/1‑141 (MQ=255) cTATTATTATAGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATa < 1:135695/141‑1 (MQ=255) cTATTATTATAGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATa < 2:164144/141‑1 (MQ=255) tattattatAGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATCTAGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATaa > 1:455280/1‑141 (MQ=255) attatAGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATACCTAAAAAAAAACAGCAGTAAGATAAttt > 1:80010/1‑141 (MQ=255) aGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATGGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑‑AAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTa > 1:436984/1‑141 (MQ=255) aGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGGTAAGGCTTGATTAGACAATTTTGATATTTAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑‑AAAAAAACATCAGTAAGATAATTTTC‑AATTa > 1:436915/1‑141 (MQ=37) tgttTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAAGAAACTAAAGAGGCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTctaattgaaa < 1:474371/141‑10 (MQ=255) tttCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGaaaa < 1:219738/141‑1 (MQ=255) atTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTAc < 1:637868/141‑1 (MQ=255) tGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTActg > 2:205393/1‑141 (MQ=255) gcatCAAACAATCATTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTATTATAATGAAAATAAATAAACTAAAGAGTATGGTACATAAAAAAAA‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTActgc < 2:201962/138‑1 (MQ=25) tCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGt > 2:252332/1‑141 (MQ=255) tCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGt > 1:333555/1‑141 (MQ=255) tCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGAT‑ATTTTCTAATT‑GAAAATTATCTTACTGCTGt < 1:272872/141‑1 (MQ=37) cTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTAttt < 1:128237/141‑1 (MQ=255) tttAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTta > 1:279742/1‑141 (MQ=255) tAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTtata < 1:513519/141‑1 (MQ=255) atTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATa < 1:154344/141‑1 (MQ=255) atTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATa < 1:85449/141‑1 (MQ=255) gTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTc > 2:858930/1‑141 (MQ=255) ttAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCg < 1:375934/141‑1 (MQ=255) tAATCCGTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGt < 1:503707/141‑1 (MQ=255) ccTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTg < 1:1250/141‑1 (MQ=255) ccTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTg > 1:706992/1‑141 (MQ=255) ccTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTg > 2:583409/1‑141 (MQ=255) cTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATAcgaagtattgt < 1:623443/141‑11 (MQ=255) gATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATg > 2:240374/1‑141 (MQ=255) gATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATg < 1:532197/141‑1 (MQ=255) gATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATg < 2:535980/141‑1 (MQ=255) aTTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATgg < 1:504493/141‑1 (MQ=255) aTTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATgg < 2:711741/141‑1 (MQ=255) gACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTc > 1:13172/1‑141 (MQ=255) gACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTc < 1:719701/141‑1 (MQ=255) aTTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTa < 2:192996/141‑1 (MQ=255) ttGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTAt > 1:448910/1‑141 (MQ=255) tGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATg < 1:32829/141‑1 (MQ=255) atatTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTCTTTATACAATACTTCGTATTGAATGACTTCGCTATGACCa > 1:480959/1‑141 (MQ=255) atatTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCACTATGCCCa > 1:386938/1‑141 (MQ=255) ttGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCt < 2:732845/141‑1 (MQ=255) taaataaaCTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACAt < 1:248124/141‑1 (MQ=255) aaaaaaaaaTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTCTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTCCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACAt < 2:103868/140‑1 (MQ=255) aaataaaCTAAAGAGTCTAGAACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACACTACTGCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACAtt < 2:306622/141‑1 (MQ=255) aataaaCTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTtat < 2:212239/94‑1 (MQ=255) aataaaCTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTtat > 1:212239/1‑94 (MQ=255) aataaaCTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTa > 2:41365/1‑141 (MQ=255) ataaaCTAAATAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTAc < 2:540604/141‑1 (MQ=255) ataaaCTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTAc < 1:252332/141‑1 (MQ=255) aaaCTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTg > 1:780204/1‑141 (MQ=255) aaCTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGt < 2:192164/141‑1 (MQ=255) cTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTaa > 1:217962/1‑141 (MQ=255) aaaGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTaaaa < 1:754964/141‑1 (MQ=255) aaaGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCCGGCACATTACTGTaaaa > 2:555346/1‑141 (MQ=255) agagTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAAtt < 2:477273/141‑1 (MQ=255) ggcTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACATTACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCta < 1:425030/139‑1 (MQ=255) cTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCtata < 1:556017/141‑1 (MQ=255) tGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATaa > 2:837913/1‑141 (MQ=255) tGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATaa > 1:475315/1‑141 (MQ=255) gggACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATaaa < 1:573250/141‑1 (MQ=255) gggACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATaaa < 1:240374/141‑1 (MQ=255) ggACCTTACTCCCT‑‑AAAAAAACAGCAGTCAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAACTTCtatttata < 2:436915/141‑6 (MQ=11) ggACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAAt > 1:252684/1‑141 (MQ=255) ggACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAAt < 2:346694/141‑1 (MQ=255) ggACATTAATCCCT‑‑AAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCtatttata < 2:436984/141‑6 (MQ=255) gACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAATa < 2:96542/141‑1 (MQ=255) aCATTAGTCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCTTAGTGTATTGCTTCTCTATGCCCATCTTGCACATTACTGTAGAATTCTATAGAtgg < 2:79262/141‑3 (MQ=14) cATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGa < 2:870219/141‑1 (MQ=255) tAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAAtt < 1:3330/141‑1 (MQ=255) aTCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACCTTACTGTAAAATTCTATAAATAGAAtttt > 1:781904/1‑141 (MQ=255) cccT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAATTTTtg < 1:757840/141‑1 (MQ=255) t‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAATTTTtgatg > 1:270907/1‑141 (MQ=40) aaaaaaaaCAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAATTTTtgatga > 1:329573/1‑141 (MQ=38) agaaCAGCAGTAAGATAATTTTT‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTACTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAATTTTTGATGATggg > 2:283625/3‑141 (MQ=255) aaaaCAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAATTTTTGATGACggg < 2:544266/141‑1 (MQ=38) aaCAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAATTTTTGATGACGGGTc > 1:46888/1‑141 (MQ=39) | CCACAAACAAACTATTATTATAGGTTGTTTCTAATATTGCGTCAAACTATCTTTAAATATTCGTTAATCCTTGATTAGACAATTGTTATATTGAAAATAAATAAACTAAAGAGTCTGGGACATTAATCCCT‑AAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAA‑TATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTATGCCCATCTGGCACATTACTGTAAAATTCTATAAATAGAATTTTTGATGACGGGTC > CP000730/2478115‑2478392 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |