| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 638,614 | G→T | T14K (ACA→AAA) | thiD ← | phosphomethylpyrimidine kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 638,614 | 0 | G | T | 98.7% | 254.1 / ‑3.1 | 76 | T14K (ACA→AAA) | thiD | phosphomethylpyrimidine kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base T (35/40); total (36/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.93e-01 | |||||||||||
CATCCATTGGTAATGGTGTAACATCGTGTGACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTGTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTGAAAAATATTAAGCATTCAATATTTGATGATTGTTGAAATG > CP000730/638477‑638751 | cATCCATTGGTAATGGTGTAACATCGTGTGACCATGTATCTTTCTCCATGGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGATTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTttgt > 2:521445/1‑141 (MQ=255) aTCCATTGGTAATGGTGTAACATCGTGTGACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTc < 2:420988/141‑1 (MQ=255) aTTGGTAATGGTGCAACATCGTGTGACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGaa < 1:532992/141‑1 (MQ=255) tGGTAATGGTGTAACATCGTGTGACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAAcc < 1:84048/141‑1 (MQ=255) tGGTAATGGTGTAACATCGTGTGACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAATTCACGGGACCGTGCCCGACGTATCTAATTCTTGGAACTTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAAcc < 1:302173/141‑1 (MQ=255) gTAATGGTGTAACATCGTGTGACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCgg < 2:22330/141‑1 (MQ=255) tAATGGTGTAACATCGTGTGACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGc > 2:160440/1‑141 (MQ=255) aTGGTGTAACATCGTGTGACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCaa > 1:157100/1‑141 (MQ=255) tgtAACATCGTGTGACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGt < 2:183542/141‑1 (MQ=255) gtAACATCGTGTGACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGtt > 1:373514/1‑141 (MQ=255) tAACATCGTGTGACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑a < 1:76780/141‑1 (MQ=255) aaCATCGTGTGACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑aa < 2:800194/141‑1 (MQ=255) aCATCGTGTGACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑aaa < 2:240224/141‑1 (MQ=255) tCGTGTGACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAAct < 1:388039/141‑1 (MQ=255) gtgtGACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAActtt > 2:844951/1‑141 (MQ=255) gtgtGACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAActtt > 2:260768/1‑141 (MQ=255) tgtgACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAActttc < 2:367557/141‑1 (MQ=255) gtgACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAActttct > 1:856999/1‑141 (MQ=255) tgACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAActttctt > 2:362606/1‑141 (MQ=255) ctaTGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCCGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTATTTCTTGGAACTTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTaa < 2:402990/139‑1 (MQ=255) gTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCACAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGcc > 1:595238/1‑141 (MQ=255) aTCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGCACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCATAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCAt > 2:711927/1‑141 (MQ=255) aTCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCAt > 2:804317/1‑141 (MQ=255) aTCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCAt < 2:263181/141‑1 (MQ=255) tttATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGa > 2:157794/1‑141 (MQ=255) tttATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGa < 1:863898/141‑1 (MQ=255) cATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCa > 1:344488/1‑141 (MQ=255) cGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACa > 2:109061/1‑141 (MQ=255) aTGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACata > 1:129248/1‑141 (MQ=255) tGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGGTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGAGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACataa > 2:296230/1‑141 (MQ=255) cAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACataataa > 2:27324/1‑141 (MQ=255) cAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACataataa > 1:832602/1‑141 (MQ=255) ttAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAatat < 2:597160/141‑1 (MQ=255) ttAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAatat > 2:261044/1‑141 (MQ=255) tAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATAtt < 2:583312/141‑1 (MQ=255) tAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATAtt < 2:583342/141‑1 (MQ=255) aGCGACCATGCCATACGTATCCAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTa > 2:160881/1‑141 (MQ=255) cGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTAtt < 2:703008/141‑1 (MQ=255) gACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATtc < 1:504672/141‑1 (MQ=255) gACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACGTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATtc > 2:733215/1‑141 (MQ=255) ccATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAGCCGGCAATTGTG‑AAAACTTTCTGTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATtcat > 1:736420/1‑141 (MQ=255) ccATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTaaaaca > 1:91101/1‑136 (MQ=255) ccATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATtcat > 1:11065/1‑141 (MQ=255) ccATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAAGTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATtcat > 1:86333/1‑141 (MQ=255) gCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCatcata < 2:4753/141‑1 (MQ=255) cATACGTATCTAATTCTTGGGACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTATAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCatcatatc < 2:544948/141‑1 (MQ=255) cATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCatcatatc < 1:109061/141‑1 (MQ=255) cATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCatcatatc < 2:12021/141‑1 (MQ=255) aTCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCAttttt < 2:75572/141‑1 (MQ=255) tCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTaa > 2:491782/1‑141 (MQ=255) cTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAAc > 1:290595/1‑141 (MQ=255) cTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAAc < 2:679943/141‑1 (MQ=255) cTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAAc < 2:196704/141‑1 (MQ=255) tGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTGa > 2:370836/1‑141 (MQ=255) tGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTGa < 1:469116/141‑1 (MQ=255) tGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTGa < 1:469149/141‑1 (MQ=255) gAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTGaaa < 1:14342/141‑1 (MQ=255) gAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTGaaa < 2:212122/141‑1 (MQ=255) aCGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTGaaaaa > 2:670800/1‑141 (MQ=255) cTGCTTGCATACCTGCTCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTGAAAAATATTAAGCATTc < 1:355985/141‑1 (MQ=255) gCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTGAAAAATATTAAGCATTCaa > 1:619242/1‑141 (MQ=255) gCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTGAAAAATATTAAGCATTCaa < 2:680942/141‑1 (MQ=255) tGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTGAAAAATATTAAGCATTCAatat < 1:416308/141‑1 (MQ=255) tGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTGAAAAATATTAAGCATTCAatat < 1:868243/141‑1 (MQ=255) ccTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTGAAAAATATTAAGCATTCAATATTtgatg < 2:659531/141‑1 (MQ=255) cTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTGAAAAATATTAAGCATTCAATATTtgatga < 1:453676/141‑1 (MQ=255) cTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTGAAAAATATTAAGCATTCAATATTtgatga > 2:625313/1‑141 (MQ=255) tacgcCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTGAAAAATATTAAGCATTCAATATTTgatgat > 1:196561/3‑141 (MQ=255) tGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTGAAAAATATTAAGCATTCAATATTTgatgat > 2:448278/1‑141 (MQ=255) cgcCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTGAAAAATATTAAGCATTCAATATTTGATGAttg > 2:249265/1‑141 (MQ=255) cgcCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTGAAAAATATTAAGCATTCAATATTTGATGAttg > 1:289998/1‑141 (MQ=255) cgcCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTGAAAAATATTAAGCATTCAATATTTGATGAttg < 2:518804/141‑1 (MQ=255) cgcCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTGAAAAATATTAAGCATTCAATATTTGATGAttg < 1:358508/141‑1 (MQ=255) gcCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTGAAAAATATTAAGCATTCAATATTTGATGAttgt < 1:491686/141‑1 (MQ=255) cACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTGAAAAATATTAAGCATTCAATATTTGATGATTGTTGaaa > 2:290413/1‑141 (MQ=255) cACTTGTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTGAAAAATATTAAGCATTCAATATTTGATGATTGTTGaaa > 1:744246/1‑141 (MQ=255) cTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTGAAAAATATTAAGCATTCAATATTTGATGATTGTTGAAATg < 1:739034/141‑1 (MQ=255) | CATCCATTGGTAATGGTGTAACATCGTGTGACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTGTGTCAGAACCGGCAATTGTT‑AAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTGAAAAATATTAAGCATTCAATATTTGATGATTGTTGAAATG > CP000730/638477‑638751 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |