| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 2543221 = | 209 (1.220) | 4 (0.030) | 4/270 | 13.4 | 2.1% | intergenic (+15/‑49) | hlgA/USA300HOU_2403 | gamma‑hemolysin component A/hypothetical protein |
| ? | CP000730 | 2543266 = | 187 (1.190) | intergenic (+60/‑4) | hlgA/USA300HOU_2403 | gamma‑hemolysin component A/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 204 total aligned reads displayed.
TTTTAAAAACCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCATAGTAGATACACAAATAATACAAATGAAACAATTTAACTTGAAAGCTTAAATA > CP000730/2543122‑2543411 | ttttGAAAACCGTAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAAGTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAAt < 2:244722/149‑1 (MQ=255) aaaaaCCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGaa < 2:1355158/149‑1 (MQ=255) aaaaCCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCCTACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAAtgtaaa > 2:184294/1‑144 (MQ=255) aCCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAg < 2:1428211/149‑1 (MQ=255) aCCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAg < 1:797560/149‑1 (MQ=255) ccGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGc > 2:925285/1‑149 (MQ=255) ccGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGc > 2:389539/1‑149 (MQ=255) gAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCt < 1:1638092/149‑1 (MQ=255) gAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCt < 1:1233783/149‑1 (MQ=255) gTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGTACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATaa < 2:742707/149‑1 (MQ=255) gTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACTCTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATaa < 1:1229327/149‑1 (MQ=255) attACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACATATGAAGTAAAAATTAAAAGTATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATaa < 2:450303/148‑1 (MQ=255) ttACAGTTAAATATGAACTAAACTTGAAAACACGTTAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAATTAAACATTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGCACACTTCATACTTTTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAAc < 1:556928/149‑1 (MQ=255) aCAGTTAAATATGGAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACAt < 2:1240540/149‑1 (MQ=255) cAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAACCACAGGAAGGAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACAtt < 1:1511276/149‑1 (MQ=255) cAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACAtt < 2:1262609/149‑1 (MQ=255) aaaTATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAatt < 2:841493/149‑1 (MQ=255) atGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTAttt < 1:1418897/149‑1 (MQ=255) tGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTAtttt > 1:1560754/1‑149 (MQ=255) tGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTAtttt > 1:196699/1‑149 (MQ=255) gAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTa > 1:115900/1‑149 (MQ=255) aaatcatcTGGAAAACAGATGAAGTAAAAATTAAAAGCAGCACAACTTATTACACAGTTCAATCATCTT‑ACAAAAGCCTGTGACACTTCATAATTTTCGCAGGATTTTTTAAGAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTAt < 2:107402/142‑1 (MQ=255) aaGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTAt > 1:639719/1‑149 (MQ=255) aaGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTAt < 1:731440/149‑1 (MQ=255) aaGTGAACGGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTAt < 1:30439/149‑1 (MQ=255) aGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATc < 2:1549499/149‑1 (MQ=255) aGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATc < 2:885847/149‑1 (MQ=255) tGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCga > 2:345865/1‑148 (MQ=255) tGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGt < 2:1293054/149‑1 (MQ=255) gAACTGGAAAACACACGAAGGAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTa > 2:1009256/1‑149 (MQ=255) aCTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACa < 1:542633/149‑1 (MQ=255) aCTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACa < 1:1126428/149‑1 (MQ=255) tGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACAtt < 2:42230/149‑1 (MQ=255) gAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCGAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAACTTATTTTATCGTACATTaa < 1:1212686/149‑1 (MQ=255) aaaCACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAAt > 1:168444/1‑149 (MQ=255) aaaCACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAAt > 1:1301854/1‑149 (MQ=255) aaaCACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAAt > 1:499196/1‑149 (MQ=255) aaCACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAAtt < 1:1064016/149‑1 (MQ=255) aaCACATGAAGGAAAAATTAAGAGCATCACACCTACGTAAACAGTTTAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAAtt < 1:647371/149‑1 (MQ=255) aaCACACGAACTAAAAACTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCCTGCTTGCCCCCTAGTAGTTTATCTTAGAAATTGAGCCTTATATCACTAAATTGTTTTATCGTACATTAAAtt < 1:1695938/149‑1 (MQ=255) cacaTGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTta < 1:673820/149‑1 (MQ=255) cacaTGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTta < 1:25168/149‑1 (MQ=255) cacaTGAAGTAAAAATTAAAAGCAACACACTGAAGTAAACACTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTAAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTta < 2:778828/149‑1 (MQ=255) aacctgtaGTTAAAATTATAATCAGCACACCTAAGTAAATAGTTCAATCATCTT‑AAAATATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTACAACATTAAAATATTTTATCGTACATTAAATTta < 1:273045/142‑1 (MQ=255) acaTGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTtaa < 2:1604666/149‑1 (MQ=255) acaTGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTtaa < 1:587808/149‑1 (MQ=255) acaTGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTtaa < 1:1629451/149‑1 (MQ=255) acaTGAAGCAAAAACTAAAAGCATCACACCTGAGTAAACAGTTCAATCCTCTT‑AAAAAATCCTGGGTCACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACCTTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTtaa < 2:602632/149‑1 (MQ=255) acaTAAACTAAAAATTAAAAACATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTCAATTAGTTTATCGTACATTAAATTtaa < 2:1228443/149‑1 (MQ=255) aaGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACTGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATAGTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTtaataata > 2:1033531/1‑149 (MQ=255) aaGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTtaataata > 2:400160/1‑149 (MQ=255) aGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTtaataataa < 1:1406019/149‑1 (MQ=255) aaaaGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGAttt < 1:367379/149‑1 (MQ=255) aaaGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATTGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGAtttt < 1:1256343/149‑1 (MQ=255) aGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTta > 1:1316653/1‑149 (MQ=255) cATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAGTTTAATAATAACAACTGATTCTaata > 1:201604/1‑149 (MQ=255) cacaCCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACCCTTCATACGTGGCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGa > 1:758154/1‑149 (MQ=255) acacCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGaa > 1:682146/1‑149 (MQ=255) acacCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGACTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGaa > 1:318664/1‑149 (MQ=255) ccTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATaa < 1:337321/149‑1 (MQ=255) ccTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATaa > 1:436763/1‑149 (MQ=255) ccTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACACTAAATTCAATAACCACTACTGCTCTTTCTAAGAATaa < 2:1703173/149‑1 (MQ=255) tAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTAGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAg > 1:1341985/1‑149 (MQ=255) tAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATc > 1:615618/1‑149 (MQ=255) tAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATc > 1:533547/1‑149 (MQ=255) aaaCAGTTCAATCATCTT‑AAACATTACCGAATCACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCg > 2:1223325/1‑149 (MQ=255) aaaCAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCg < 2:1316653/149‑1 (MQ=255) aaaCAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCg < 2:1674446/149‑1 (MQ=255) gTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAACTTAGTCATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGAATCGAACCa > 2:177101/1‑149 (MQ=255) tCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCAta < 1:1176163/149‑1 (MQ=255) tcaatttgtt‑AAAAAATCCTCGGTCATTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATGATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATATTTATAAGAATAAAGTATCGAACCAtag < 1:1052376/141‑1 (MQ=255) cAATCATCTTAAAAAAATCCTGGTACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCAta < 2:830151/149‑1 (MQ=255) tt‑AAAAAATGCTGAGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAAGTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATTGAACCATAGTAGATaca < 2:1106315/149‑1 (MQ=255) tt‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCATCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCATAGTAGATaca < 1:232004/149‑1 (MQ=255) tt‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCATAGTAGATaca < 1:1453283/149‑1 (MQ=255) aaaaTCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCATAGTAGATACACaaa > 1:507133/1‑149 (MQ=255) aaaaTCCTGGGACACTTCATACTTCTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCCTAGTAGATACACaaa < 1:1527321/149‑1 (MQ=255) tCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCATAGTAGATACACAaataat < 2:542842/149‑1 (MQ=255) cTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCATAGTAGATACACAAATAATAc > 1:1410634/1‑149 (MQ=255) cTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCATAGTAGATACACAAATAATAc > 2:308855/1‑149 (MQ=255) ggACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCATAGTAGATACACAAATAATACaaa < 1:1715717/149‑1 (MQ=255) acacTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTCAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCATAGTAGATACACAAATAATACAAATg < 2:464018/149‑1 (MQ=255) acTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCATAGTAGATACACAAATAATACAAATGaa < 1:941227/149‑1 (MQ=255) cATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCATAGTAGATACACAAATAATACAAATGAAACaa < 1:1009256/149‑1 (MQ=255) aCTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCATAGTAGATACACAAATAATACAAATGAAACAAttt > 2:808800/1‑149 (MQ=255) aCTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCATAGTAGATAAACAAATAATACAAATAAAACAAttt > 2:511402/1‑149 (MQ=255) cTTGTCTCAGGATTTTTTAACACATTGAACCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAAGAAAGTATCGAACCATAGTAGATACACAAATAATACAAATGAAACAATTTa > 2:1178361/1‑149 (MQ=255) cTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCATAGTAGATACACAAATAATACAAATGAAACAATTTa < 1:660962/149‑1 (MQ=255) cTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCATAGTAGATACACAAATAATACAAAGGAAACAATTTa > 1:1204493/1‑149 (MQ=255) ttGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCATAGTAGATACACAAATAATACAAATGAAACAATTTaa < 2:682146/149‑1 (MQ=255) ttGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTACAAGAATAAAGTATCGAACCATAGTAGAGACACAAATAATACAAATGAAACAATTTaa < 2:318664/149‑1 (MQ=255) tGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCGTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCATAGTAGATACACAAATAATACAAATGAAACAATTTAAc > 1:1097334/1‑149 (MQ=255) gTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCATAGTAGATACACAAATAATACAAATGAAACAATTTAACt < 1:1648311/149‑1 (MQ=255) gTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCATAGTAGATACACAAATAATACAAATGAAACAATTTAACt < 1:988283/149‑1 (MQ=255) ggATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCATAGTAGATACACAAATAATACAAATGAAACAATTTAACTTGAAAg > 1:458266/1‑149 (MQ=255) aTTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCATAGTAGATACACAAATAATACAAATGAAACAATTTAACTTGCAAGCt > 1:886255/1‑149 (MQ=255) ttttAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCATAGTAGATACACAAATAATACTAATGAAACAATTTAACTTGAAAGCTtaa < 2:500458/149‑1 (MQ=255) ttttAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCATAGTAGATACACAAATAATACAAATGAAACAATCTAACTTGAAAGCTtaa < 2:1269768/149‑1 (MQ=255) tattAACAAATTGAATTAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATAGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCATAGTAGATACACAAATAATACAAATGAAACAATTTAACTTGAAAGCTtaa < 2:1058029/147‑1 (MQ=255) tAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATAGTAAAGCAAATTTAATACTAACCACGGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCATAGTAGATACACAAATAATACAAATGAAACAATTTAACTTGAAAGCTtaaata > 1:406427/1‑149 (MQ=255) | TTTTAAAAACCGAAACGTTACAGTTAAATATGAAGTGAACTGGAAAACACATGAAGTAAAAATTAAAAGCATCACACCTAAGTAAACAGTTCAATCATCTT‑AAAAAATCCTGGGACACTTCATACTTGTCTCAGGATTTTTTAACAAATTGAATCAGCCTTATAACATTAAATTATTTTATCGTACATTAAATTTAATAATAACAACTGATTTTTATAAGAATAAAGTATCGAACCATAGTAGATACACAAATAATACAAATGAAACAATTTAACTTGAAAGCTTAAATA > CP000730/2543122‑2543411 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |