| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,337,959 | C→T | intergenic (‑125/‑119) | adhR ← / → USA300HOU_2196 | possible MerR family transcriptional regulator/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,337,959 | 0 | C | T | 98.7% | 499.6 / NA | 160 | intergenic (‑125/‑119) | adhR/USA300HOU_2196 | possible MerR family transcriptional regulator/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base T (104/52); total (107/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
TTTTCATTGCGACTATCCTTTCAGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ACATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCGGAAAAT > CP000730/2337828‑2338088 | tttCATTGCGACTATCCTTTCAGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATAttt > 1:583293/1‑135 (MQ=255) ttCATTGCGACTATCCTTTCAGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTc > 2:567428/1‑135 (MQ=255) cTATCCTTTCAGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTTATCGTTTTTa > 2:446959/1‑135 (MQ=255) tATCCTTTCAGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTaa > 1:570886/1‑135 (MQ=255) ccTTTCAGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTa > 1:676826/1‑135 (MQ=255) aGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCACATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTaa > 2:156503/1‑135 (MQ=255) aGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTCATTACTTTaa > 2:155945/1‑135 (MQ=255) aGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTaa > 1:450751/1‑135 (MQ=255) aGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTaa > 2:471948/1‑135 (MQ=255) aGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTaa > 1:635158/1‑135 (MQ=255) aGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATCACCTTTGATATATTGTCTGCTTCAATATAATTGTTCTGAGGTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTaa > 2:637919/1‑135 (MQ=255) tttGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGt > 1:505661/1‑135 (MQ=255) tttGGTCGTCTAAAGTAATATTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGt > 1:102889/1‑135 (MQ=255) ttGGTCGTCTAAAGTAATGCTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTGATTACTTTAAAAATTGta > 1:369212/1‑135 (MQ=255) tGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGtat > 1:533352/1‑135 (MQ=255) ggTCGTTTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGtata < 2:210460/135‑1 (MQ=255) cgtcTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTATTTACTTTTAATATTGTATAACt > 1:480724/1‑135 (MQ=255) cgtcTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTATCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATaaat > 1:482156/1‑133 (MQ=255) cgtcTAAAGTAATGTTGATAAATATAATGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACt > 1:167063/1‑135 (MQ=255) gtcTAACGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACtt > 1:244908/1‑135 (MQ=255) gtcTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAGATTTGTTTAACtt > 1:383383/1‑135 (MQ=255) gtcTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCACCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACtt > 2:61424/1‑135 (MQ=255) tctattgttttGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTa > 1:152145/11‑135 (MQ=255) tcTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCCTCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTa > 2:394725/1‑135 (MQ=255) tAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTaaa > 1:211555/1‑135 (MQ=255) tAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTATTCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTaaa > 1:404088/1‑135 (MQ=255) aaaGTAATGTTGCTTTATAAAATATCAACTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAat > 1:473552/1‑135 (MQ=255) aGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATCATTATTATTTTATTAATCAGATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAAAATGTT‑ATATTTCTTCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAatct > 2:234600/1‑133 (MQ=255) aTGTTGCTTTGTATATAGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTAAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTaa > 1:290679/1‑135 (MQ=255) aTGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTaa > 2:294075/1‑135 (MQ=255) aTGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTaa > 1:423204/1‑135 (MQ=255) aTGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTaa > 2:295075/1‑135 (MQ=255) ttGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATATCTTAAATATTTAAAAt < 1:514363/135‑1 (MQ=255) tGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAATTg > 2:677083/1‑135 (MQ=255) tGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATg > 1:145509/1‑135 (MQ=255) tGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATg > 1:545965/1‑135 (MQ=255) tGCTATATATATTGTCATCTTCGTTTTTATACTTATTATTTTCTTATTCCAATTTAAATTTGTTTCTATAATACCATCAT‑TAATTGAGGAGTTTTTAATTATTTTTATAAATTTATAACTTAAATTTTTatagag > 2:636689/1‑130 (MQ=255) tttATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAAAATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAGATTGTATAAATTAAATATTTAAAATGata > 2:236992/1‑135 (MQ=255) tatatTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATCATATAAt > 2:511840/1‑135 (MQ=255) atatTGTTAACTTCGTTTGTATACTTCTTATTTTATTACTGAAATTTAAATTTGTCTCTTTGTAACCAGTGT‑ACATGTCATCTTTGTTAATTACTTTAAAAATTGTCTAACTTAAATATTTAAAATGATCTAATc < 2:49899/135‑1 (MQ=255) tatTGTTATCTTTGTTTGAATACTTCTTTTTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATCTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAATTTATATATTTAAAAAGAAATAAGCa < 1:46018/135‑1 (MQ=255) atTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCAc > 2:323403/1‑135 (MQ=255) atTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCAc > 2:575427/1‑135 (MQ=255) tGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTTACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTa > 1:364026/1‑135 (MQ=255) tGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAATTATTATAATAACTa > 2:316028/1‑135 (MQ=255) tGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTa < 2:612963/135‑1 (MQ=255) tGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑AGATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATTTAATCACTa > 2:470519/1‑135 (MQ=255) ttttttttattACTTTTTTTTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGa < 2:98634/125‑1 (MQ=255) ttGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGataata > 2:58697/1‑135 (MQ=255) cataccccccactttactACTCAACCTTACATCTGCCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATAttt > 2:101613/13‑135 (MQ=255) aaTACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATAACTAAAGTGGATAATAttt > 2:358375/1‑135 (MQ=255) aaTACTTCTTATTTTATAACTCAAATTTAAATTTATCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGCTTGATAATAttt > 1:13722/1‑135 (MQ=255) aaTACTTCTTAGTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATAttt > 1:337614/1‑135 (MQ=255) ctACTTCTTATTTTATTACTCAAATTAAAACATCATACATATTTCAGGCCGT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTa > 1:665449/2‑135 (MQ=255) atccttcttATGTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATAtttc > 1:337871/4‑134 (MQ=255) aTACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTGAAATGATATAATCACTAAGATTTATAATATTTa > 1:130803/1‑135 (MQ=255) aTACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTa > 1:207066/1‑135 (MQ=255) aTACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATAATATAATCACTAAGATTGATAATATTTa > 1:93013/1‑135 (MQ=255) tACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTaa < 1:600043/135‑1 (MQ=255) tACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATATGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTaa > 1:27032/1‑135 (MQ=255) aCTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAAt > 1:589/1‑135 (MQ=255) tcttATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAAtttt > 1:533710/1‑135 (MQ=255) tattttattACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTg < 1:625401/135‑1 (MQ=255) tattaCTTAAATTTAATTTTGTATCTCGGTTAACATTTTGTTATTTTGTAGATAAG‑ATTACTTTAAAAATTGTAGAACTTATATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAat < 1:448227/135‑1 (MQ=255) tattaCTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAat > 1:292700/1‑135 (MQ=255) ttaCTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAatta > 2:524199/1‑135 (MQ=255) aCTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTTTTTTTTT‑TTATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGTTATAATCACTAACATTTTTATTATTTAATTTTTTGATAattttt > 2:464399/1‑135 (MQ=255) cTCACATTTAAATTTATCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTAttt > 1:296875/1‑135 (MQ=255) aaatttaaatttGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAg > 1:626730/1‑135 (MQ=255) ttaaatttGTCTATTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATCTTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGc > 2:6456/1‑135 (MQ=255) atttGTCTCTTTTTTAACATTTG‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAAtt < 1:167622/135‑1 (MQ=255) atctGTCTCTTTTTTAACTTTTT‑ATATTTCATCGTTTTTACTTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTTATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAAtt < 2:409323/132‑1 (MQ=255) agttGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAAtt < 1:632802/133‑1 (MQ=255) tGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTGAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAAttttt > 2:463847/1‑135 (MQ=255) tGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAAttttt > 2:514432/1‑135 (MQ=255) gTCTCTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAAATAATTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTg < 2:404088/135‑1 (MQ=255) gTCTCTTTTTTAACACTTT‑ATATTTCATCGATTTTAATTATTTTGATAATTGTTTATCTTCAATTTTGAAAATTTTATAATCATTAAGATTTATAATATTTAATGTTTTTGAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTg < 2:200146/135‑1 (MQ=255) tctcTTTTTTAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTgg < 2:482156/135‑1 (MQ=255) ctTTTTTATCATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAATATTTATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTg < 2:383383/135‑1 (MQ=255) ttttttAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGGGa < 1:66684/135‑1 (MQ=255) tttttAACATTTT‑ATATTTCATCGATTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGAGTGAt > 1:437141/1‑135 (MQ=255) ttttAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATg < 1:323403/135‑1 (MQ=255) tttAACATTTT‑ATATTTCATCGATTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTTTTTTTGTTGCAATGTTTGGGTGATGc > 1:324782/1‑135 (MQ=255) ttAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCg > 2:12011/1‑135 (MQ=255) tAACATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCgg < 1:471948/135‑1 (MQ=255) aaCATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCgca < 2:670242/135‑3 (MQ=255) aaCATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCGGa < 2:547493/135‑1 (MQ=255) aaCATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCGGa < 1:566519/135‑1 (MQ=255) acttttt‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCGGaa < 2:676826/132‑1 (MQ=255) aCATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCGGaa < 2:492581/135‑1 (MQ=255) aCATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCGGaa < 2:562615/135‑1 (MQ=255) aCATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGCTGCACTTTCTGAGTGATACGTaa < 2:669677/135‑1 (MQ=255) aCATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATCATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCTATTTTTGGGTGATGCGGaa < 1:511840/135‑1 (MQ=255) cATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTGAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATCTAATTTTTTGAAAATTATTTTTGTTGCAATTTTTGGGTGATGCGGaaa < 1:397135/135‑1 (MQ=255) cATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATATTATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCGGaaa < 1:294075/135‑1 (MQ=255) cATTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCGGaaa < 1:388418/135‑1 (MQ=255) aTTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTTATTTTTTTTTTATTTGCAATATTTCGGTGTAGCGGagaa > 2:260592/1‑135 (MQ=255) aTTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCGGaaaa < 2:177012/135‑1 (MQ=255) aTTTT‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCGGaaaa < 1:82653/135‑1 (MQ=255) tttt‑ATATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCGGAAAAt < 1:639082/135‑1 (MQ=255) | TTTTCATTGCGACTATCCTTTCAGTTATGTTTGGTCGTCTAAAGTAATGTTGCTTTATATATTGTCATCTTCGTTTGAATACTTCTTATTTTATTACTCAAATTTAAATTTGTCTCTTTTTTAACATTTT‑ACATTTCATCGTTTTTAATTACTTTAAAAATTGTATAACTTAAATATTTAAAATGATATAATCACTAAGATTGATAATATTTAATTTTTTGAAAATTATTTTAGTTGCAATTTTTGGGTGATGCGGAAAAT > CP000730/2337828‑2338088 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |