| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP000730 | 1084754 = | 80 (0.810) | 4 (0.040) | 3/238 | NT | 5.1% | intergenic (+126/+139) | purD/USA300HOU_1019 | phosphoribosylamine‑‑glycine ligase/ABC superfamily ATP binding cassette transporter, membrane protein |
| ? | CP000730 | 1084817 = | 74 (0.810) | intergenic (+189/+76) | purD/USA300HOU_1019 | phosphoribosylamine‑‑glycine ligase/ABC superfamily ATP binding cassette transporter, membrane protein | |||||
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TACAACTTAAATAAGTAAATTTAAAATACTAAGATTAGCTATGAACGAATCTATAACGATAGATTTTTTCATAGCTTTTTTAGTTGTAGAGTCTAGGACATTGATTTCTGTACCAAATTTGTGATTATGCATATGTAATACAAAAGAGGCGCCAC‑AACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTCTAATTTAGTATCTATACAATTATGGATAAAATTT > CP000730/1084615‑1084894 | tACAACTTAAATAAGTAAATTTAAAATACTAAGATTAGCTATGAACGAATCTATAACGATAGATTTTTTCATAGCTTTTTTAGTTGTAGAGTCTAGGACATTGATTTCTGTACCAAATTTGTGATTATACATATGTAATAc < 2:800254/141‑1 (MQ=255) cAACTTAAATAAGTAAATTTAAAATACTAATATTAGCTATGAACGAATCTATAACGATAGATTTGCTCAAAGCCCTGCGAATTGGAAATGCTTGGAGATTGATTTCTGTACGAAATTTGTGAGTATTCATATGTAAGACaa > 1:596806/1‑141 (MQ=255) cAACTTAAATAAGTAAATTTAAAATACTAAGATTAGCTCTGAACGAATCTATAACGATAGATTTTTTCATAGCTTTTTTTGTTGTAGAGTTTAGTACTTTTATTTCTTTATCAAATTTGTGATTATGCATATGTAATACaa > 2:530564/1‑141 (MQ=37) cAACTTAAATAAGTAAATTTAAAATACTAAGATTAGCTATGAACGAATCTATAACGATAGATTTTTTCATAGCTTTTTTAGTTGTAGAGTCTAGGACATTGATTTCTGTACCAAATTTGTGATTATGCATATGTAATACaa < 1:406068/141‑1 (MQ=255) tgttcaatcaccttacccatcacgggcatagatgatgttcgtcttggtcgtgtaggttaaattttatccataattgtatagatactaagttagaaattcattgtatagaaaaagaaaaccatttattccatactaaACaaa < 2:427295‑M1/5‑1 (MQ=255) tgttcaatcaccttacccatcacgggcatagatgatgttcgtcttggtcgtgtaggttaaattttatccataattgtatagatactaaattagaaattcattgtatagaaaaagaaaaccatttattccatactaaACaaa < 2:917127‑M1/5‑1 (MQ=255) tgttcaatcaccttacccatcacgggcatagatgatgttcgtcttggtcgtgtaggttaaattttatccataattgtatagatactaaattagaaattcattgtatagaaaaagaaaaccatttattccatactaaACaaa > 1:863843‑M1/137‑141 (MQ=255) tgttcaatcaccttacccatcacgggcatagatgatgttcgtcttggtcgtgtaggttaaattttatccataattgtatagatactaaattagaaattcattgtatagaaaaagaaaaccatttattccatactaaACaaa < 1:739284‑M1/5‑1 (MQ=255) aaCTTAAATAAGTAAATTTAAAATACTAAGATTAGCTATGAACGAATCTATAACGATAGATTTTTTCATAGCTTTTTTAGTTGTAGAGTCTAGGACATTGATTTCTGTACCAAATTTGTGATTATGCATATGTAATACaaa < 1:45876/141‑1 (MQ=255) aaCTTAAATAAGTAAATTTAAAATACTAAGATTAGCTATGAACGAATCTATAACGATAGATTTTTTCATAGCTTTTTTAGTTGTAGAGTCTAGGACATTGATTTCTGTACCAAATTTGTGATTATGCATATGTAATACaaa < 1:494186/141‑1 (MQ=255) gttcaatcaccttacccatcacgggcatagatgatgttcgtcttggtcgtgtaggttaaattttatccataattgtatagatactaaattagaaattcattgtatagaaaaagaaaaccatttattccatactaaACaaaa < 1:1186134‑M1/6‑1 (MQ=255) ttcaatcaccttacccatcacgggcatagatgatgttcgtcttggtcgtgtaggttaaattttatccataattgtatagatactaaattagaaattcattgtatagaaaaagaaaaccatttattccatactaaACAAAag < 2:319397‑M1/7‑1 (MQ=255) cTTAAATAAGTAAATTTAAAATACTAAGATTAGCTATGAACGAATCTATAACGATAGATTTTTTCATAGCTTTTTTAGTTGTAGAGTCTAGGACATTGATTTCTGTACCAAATTTGTGATTATGCATATGTAATACAAAag < 2:509743/141‑1 (MQ=255) caatcaccttacccatcacgggcatagatgatgttcgtcttggtcgtgtaggttaaattttatccataattgtatagatactaaattagaaattcattgtatagaaaaagaaaaccatttattccatactaaACAAAagag > 1:90551‑M1/133‑141 (MQ=255) caatcaccttacccatcacgggcatagatgatgttcgtcttggtcgtgtaggttaaattttatccataattgtatagatactaaattagaaattcattgtatagaaaaagaaaaccatttattccatactaaACAAAagag < 2:254859‑M1/9‑1 (MQ=255) aatcaccttacccatcacgggcatagatgatgttcgtcttggtcgtgtaggttaaattttatccataattgtatagatactaaattagaaattcattgtatagaaaaagaaaaccatttattccatactaaACAAAAGAgg < 1:530564‑M1/10‑1 (MQ=255) aaaTAAGTAAATTTAAAATACTAAGATTAGCTATGAACGAATCTATAACGATAGATTTTTTCATAGCTTTTTTAGTTGTAGAGTCTAGGACATTGATTTCTGTACCAAATTTGTGATTATGCATATGTAATACAAAAGAgg > 2:850138/1‑141 (MQ=255) aaTAAGTAAATTTAAAATACTAAGATTAGCTATGAACGAATCTATAACGATAGATTTTTTCATAGCTTTTTTAGTTGTAGAGTCTAGGACATTGATTTCTGTACCAAATTTGTGATTATGCATATGTAATACAAAAGAGgc > 1:691958/1‑141 (MQ=255) aaTAAGTAAATTTAAAATACTAAGATTAGCTATGAACGAATCTATAACGATAGATTTTTTCATAGCTTTTTTAGTTGTAGAGTCTAGGACATTGATTTCTGTACCAAATTTGTGATTATGCATATGTAATACAAAAGAGgc > 1:367226/1‑141 (MQ=255) aaTAAGTAAATTTAAAATACTAAGATTAGCTATGAACGAATCTATAACGATAGATTTTTTCATAGCTTTTTTAGTTGTAGAGTCTAGGACATTGATTTCTGTACCAAATTTGTGATTATGCATATGTAATACAAAAGAGgc > 1:406727/1‑141 (MQ=255) tAAGTAAATTTAAAATACTAAGATTAGCTATGAACGAATCTATAACGATAGATTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTTGTAGAGTCTAGAACATTTATTTCTGTATCAAATTTGTGATTATGCATATGTAATACAAATGAGacgc > 2:520874/1‑141 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gAATCTATAACGATAGATTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTTGTAGAGTCTAGGACATTGATTTCTGTACCAAATTTGTGATTATGCATATGTAATACAAAAGAGGCGCCAC‑AACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTtg > 2:155926/1‑141 (MQ=255) aTCTATAACGATAGATTTTTTCATAGCTTTTTTAGTTGTAGAGTCTAGGACATTGATTTCTGTACCAAATTTGTGATTATGCATATGTAATACAAAAGAGGCGCCAC‑AACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTtgtg > 1:603687/1‑141 (MQ=255) cgtggaggttaaattttatccataattgtatagatactaaattagaaattcattgtatagaaaaagaaaaccatttattccatactaaACAAAAGAGGCGCCAC‑AACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCa > 2:647459‑M1/89‑141 (MQ=255) taACGATAGATTTTTTCATAGCTTTTTTTTTTTTTTTGTCTAGGACATTGATTTCTGTACCAAATTTGTGATTATGCATATGTAATACAAAAGAGGCGCCAC‑AACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCAcc > 2:436817/1‑141 (MQ=255) taACGATAGATTTTTTCATAGCTTTTTTAGTTGTAGAGTCTAGGACATTGATTTCTGTACCAAATTTGTGATTATGCATATGTAATACAAAAGAGGCGCCAC‑AACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCAcc < 1:464573/141‑1 (MQ=255) aCGATAGATTTTTTCATAGCTTTTTTAGTTGTAGAGTCTAGGACATTGATTTCTGTACCAAATTTGTGATTATGCATATGTAATACAAAAGAGGCGCCAC‑AACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACctc < 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2:278862/1‑141 (MQ=255) atGTAATACAAAAGGGGCGCCAC‑AACATGTTGGGATGAACAAAATAACATTGTGGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGGTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTCTAATTTAGTATCTATACAATTATGGAt < 1:354711/141‑1 (MQ=255) atGTAATACAAAAGCGGCGCCAC‑AACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTCTAATTTAGTATCTATACAATTATGGAt < 2:143986/141‑1 (MQ=255) atGTAATACAAAAGAGGCGCCAC‑AACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTCTAATTTAGTATCTATACAATTATGGAt < 1:371271/141‑1 (MQ=255) atGTAATACAAAAGAGGCGCCAC‑AACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTCTAATTTAGTATCTATACAATTATGGAt < 1:643418/141‑1 (MQ=255) atGTAATACAAAAGAGGCGCCAC‑AACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTCTAATTTAGTATCTATACAATTATGGAt < 2:173550/141‑1 (MQ=255) aTACAAAAGAGGCGCCAC‑AACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTCTAATTTAGTATCTATACAATTATGGATAAAAt < 2:401703/141‑1 (MQ=255) ACAAAAGAGGCGCCAC‑AACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGACACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTCTAATTTAGTATCTATACAATTATGGATAAAAttt < 2:116020‑M1/141‑1 (MQ=255) | TACAACTTAAATAAGTAAATTTAAAATACTAAGATTAGCTATGAACGAATCTATAACGATAGATTTTTTCATAGCTTTTTTAGTTGTAGAGTCTAGGACATTGATTTCTGTACCAAATTTGTGATTATGCATATGTAATACAAAAGAGGCGCCAC‑AACATGTTTGGATGAACAAAATAACATGTTTGTGGCACCTCTTTTGTTTAGTATGGAATAAATGGTTTTCTTTTTCTATACAATGAATTTCTAATTTAGTATCTATACAATTATGGATAAAATTT > CP000730/1084615‑1084894 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |