| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 2017687 = | 67 (1.030) | 3 (0.050) | 3/248 | NT | 4.2% | coding (162/819 nt) | recX | hypothetical protein |
| ? | CP000730 | 2017716 = | 73 (1.160) | coding (133/819 nt) | recX | hypothetical protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CAATATTCAATCACTTCAGAAATCGCTTGCTCTGATATCTCTTCTTTTTGTAAATATTGTATAACTTCTTTTTCAGTTCTCTTTTTATATGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCAAATTGTTCGTCTAAAAAAAGATTAAACCGTTCTTTGTTTTTCTTTTGAACTTC > CP000730/2017547‑2017827 | tgatccagtgccgaagattactaaaatagaagttcaaaagaaaaacaaagaacggtttaatctttttttagacgaacaatttgaaatgggtatagatattgatacattagtcaaatttaatttaaaaaaagggcaacaact > 1:420029‑M1/141‑141 (MQ=255)tgatccagtgccgaagattactaaaatagaagttcaaaagaaaaacaaagaacggtttaatctttttttagacgaacaatttgaaatgggtatagatattgatacattagtcaaatttaatttaaaaaaagggcaacaact < 1:528410‑M1/1‑1 (MQ=255) gatccagtgccgaagattactaaaatagaagttcaaaagaaaaacaaagaacggtttaatctttttttagacgaacaatttgaaatgggtatagatattgatacattagtcaaatttaatttaaaaaaagggcaacaactt < 2:465204‑M1/2‑1 (MQ=255) atatTCAATCACTTCAGATCTCGCTTGCTCTGATATCTCTTCTTTTTGTAAATATTGTATAACTTCTTTTTCAGTTCTCTTTTTTTATGATATATATTGGATTGCTTTATTTAGACCTATGCGATAATGATCATACTTTTg < 2:448753/141‑1 (MQ=255) atTCAATCACTTCAGAAATCGCTTGCTCTGATATCTCTTCTTTTTGTAAATATTGTATAACTTCTTTTTCAGTTCTCTTTTTATATGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGaa < 1:352739/141‑1 (MQ=255) cAATCACTTCAGAAATCGCTTGCTCTGATATCTCTTCTTTTTGTAAATATTGTATAACTTCTTTTTCAGTTCTCTTTTTATATGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAAtct < 1:523989/141‑1 (MQ=255) aaaTCGCTTGCTCTGATATCTCTTCTTTTTGTAAATATTGTATAACTTCTTTTTCAGTTCTCTTTTTATATGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTcag < 2:343894/141‑1 (MQ=255) aaaTCGCTTGCTCTGATATCTCTTCTTTTTGTAAATATTGTATAACTTCTTTTTCAGTTCTCTTTTTATATGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTcag < 1:217312/141‑1 (MQ=255) ctaaaatagaagttcaaaagaaaaacaaagaacggtttaatctttttttagacgaacaatttgaaatgggtatagatattgatacattagtcaaatttaatttaaaaaaagggcaacaacTTGAATCT‑CTGCCATGTcagc > 2:332172‑M1/121‑141 (MQ=255) aTCGCTTGCTCTGATATCTCTTCTTTTTGTAAATATTGTATAACTTCTTTTTCAGTTCTCTTTTTTTTTGTTTTTTATTGGATTGCTTTATTTAAACTTATGCGATAATGTTCATACTTTTGAATTT‑TTGCCATGTctgct > 2:344426/1‑140 (MQ=255) aTCGCTTGCTCTGATATCTCTTCTTTTTGTAAATATTGTATAACTTCTTTTTCAGTTCTCTTTTTATATGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTcagca > 1:120932/1‑141 (MQ=255) cTTGCTCTGATATCTCTTCTTTTTGTAAATATTGTATAACTTGTTTTTCAGTTCTCTTTTTATATGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGCATCT‑CTGCCCTGTCAGCAGCtt < 1:210318/141‑1 (MQ=255) tctctAATATCTCTTCTTTTTGTAAATATTGTATAACTACTTTTTCAGTTCTCTTTTTATATGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTTTGCGATAACGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCaa < 2:419500/140‑1 (MQ=255) tGATATCTCTTCTTTTTGTAAATATTGTATAACTTCTTTTTCAGTTCTCTTTTTATATGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAgttg < 2:448591/141‑1 (MQ=255) tatCTCTTCTTTTTGTAAATATTGTATAACTTCTTTTTCAGTTCTCTTTTTATATGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGttgttg > 1:347069/1‑141 (MQ=255) ctctTCTTTTTGTAAATATTGTATAACTTCTTTTTCAGTTCTCTTTTTATATGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGccc < 2:443206/141‑1 (MQ=255) tcttctTTTTGTAAATATTGTATAACTTCTTTTTTTGTTTTCTTTTTATATGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCt > 2:299857/1‑141 (MQ=255) tcttctTTTTGTAAATATTGTATAACTTCTTTTTCAGTTCTCTTTTTATATGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCt < 1:492602/141‑1 (MQ=255) tcttTTTGTAAATATTGTATAACTTCTTTTTCAGTTCTCTTTTTATATGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCtttt > 2:698037/1‑141 (MQ=255) ttttGTAAATATTGTATAACTTCTTTTTTTGTTTTCTTTTTATATGATAAATATTGGATTGCTTTATTTATACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTTTTGCCCttttttt > 2:740836/1‑141 (MQ=255) tGTAAATATTGTATAACTTCTTTTTCAGTTCTCTTTTTATATGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTttaaa > 1:636923/1‑141 (MQ=255) tGTAAATATTGTATAACTTCTTTTTCAGTTCTCTTTTTATATGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTttaaa > 1:536909/1‑141 (MQ=255) tAAATATTGTATAACTTCTTTTTCAGTTCTCTTTTTATATGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTttaaatt > 1:143189/1‑141 (MQ=255) tAAATATTGTATAACTTCTTTTTCAGTTCTCTTTTTATATGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTttaaatt > 2:215144/1‑141 (MQ=255) tAAATATTGTATAACTTCTTTTTCAGTTCTCTTTTTATATGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTttaaatt > 1:123764/1‑141 (MQ=255) tAAATATTGTATAACTTCTTTTTCAGTTCTCTTTTTATATGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTttaaatt > 2:250765/1‑141 (MQ=255) aaTATTGTATAACTTCTTTTTCAGTTCTCTTTTTATATGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGACATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTttaaattaa > 2:768741/1‑141 (MQ=255) atatTGTATAACTTCTTTTTCAGTTCTCTTTTTATATGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTttaaattaaa < 1:12060/141‑1 (MQ=255) tGTATAACTTCTTTTTCAGTTCTCTTTTTATATGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTg < 2:332894/141‑1 (MQ=255) cttcttTTTCAGTTCTCTTTTTATATGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATg > 2:612719/1‑141 (MQ=255) cttcttTTTCAGTTCTCTTTTTATATGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATg < 1:596713/141‑1 (MQ=255) cttcttTTTCAGTTCTCTTTTTATATGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAACTTGACTAATg > 2:126510/1‑141 (MQ=255) ttcttTTTCAGTTCTATTTTTATATGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGt < 2:141218/141‑1 (MQ=255) acgaacaatttgaaatgggtatagatattgatacattagtcaaatttaatttaaaaaaagggcaacaacTTGAAGCTGCTGACATGGCAG‑AGATTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAat < 1:245753‑M1/72‑1 (MQ=255) ttCTCTTTTTATATGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCta > 1:482802/1‑141 (MQ=255) tctcTTTTTATATGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCTAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCtat > 2:235613/1‑141 (MQ=255) ctTTTTATATGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCCGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATAcc > 2:502878/1‑141 (MQ=255) ctTTTTATATGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATAcc > 1:619251/1‑141 (MQ=255) tttttATATGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATAccc < 2:565746/141‑1 (MQ=255) tataTGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGttgttg < 1:393010/91‑1 (MQ=255) tataTGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGttgttg > 2:393010/1‑91 (MQ=255) tataTGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCAttt > 2:59063/1‑141 (MQ=255) atatGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTGTGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTc < 1:726633/141‑1 (MQ=255) atatGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTc < 2:98661/141‑1 (MQ=255) atGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCaa > 2:641957/1‑141 (MQ=255) tGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTg > 2:773299/1‑54 (MQ=255) tGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTg < 1:773299/54‑1 (MQ=255) tGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCaaa < 1:162501/141‑1 (MQ=255) tGATAAATATTGGATTGCATTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCaaa < 1:403478/141‑1 (MQ=255) gATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTTACTAATGTATCACTATCTATACCCATTTCAAAt > 2:24245/1‑141 (MQ=255) gATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTTAAAt > 2:235816/1‑141 (MQ=255) gATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTACCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCAAAt > 1:602606/1‑141 (MQ=255) tGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCAAATTGTTCGTCt < 1:75918/141‑1 (MQ=255) aTTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCAAATTGTTCGTCTaaa > 2:229756/1‑141 (MQ=255) gCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCAAATTGTTCGTCTaaaaaa > 1:112409/1‑141 (MQ=255) tttatttaAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCAAATTGTTCGTCTaaaaaaat > 1:603298/1‑140 (MQ=255) tttatttaAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCAAATTGTTCGTCTAAAAAAAg > 1:423939/1‑141 (MQ=255) atttaAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCAAATTGTTCGTCTAAAAAAAGAtt > 2:419247/1‑141 (MQ=255) atttaAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCAAATTGTTCGTCTAAAAAAAGAtt > 2:535611/1‑141 (MQ=255) atttaAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATAAATATCTATACCCATTTCAAATTGTTCGTCTCAAAAAAGAtt > 2:538534/1‑141 (MQ=255) tttaAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCAAATTGTTCGTCTAAAAAAAGATTa < 1:487979/141‑1 (MQ=255) ttaAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCAAATTGTTCGTCTAAAAAAAGATTaa < 2:482011/141‑1 (MQ=255) aaCCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCAAATTGTTCGTCTAAAAAAAGATTAAAcc > 2:655485/1‑141 (MQ=255) aCCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCAAATTGTTCGTCTAAAAAAAGATTAAACCg > 1:319192/1‑141 (MQ=255) aCCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCAAATTGTTCGTCTAAAAAAAGATTAAACCg > 1:463477/1‑141 (MQ=255) aCCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCAAATTGTTCGTCTAAAAAAAGATTAAACCg > 2:63025/1‑141 (MQ=255) ccTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCAAATTGTTCGTCTAAAAAAAGATTAAACCGt > 1:41037/1‑141 (MQ=255) ccTATGCGATAATGATAATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCTGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTTACTAATATATTAATATCTATACTCTTTTCATATTAAAAAAAAAAAAAAAGATTAAACCGt < 2:784504/141‑1 (MQ=255) aTGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCAAATTGTTCGTCTa < 2:267324/121‑1 (MQ=255) aTGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCAAATTGTTCGTCTa > 1:267324/1‑121 (MQ=255) aTGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCAAATTGTTCGTCTAAAAAAAGATTAAACCGTTCt > 1:647232/1‑141 (MQ=255) ttaaaaaaagggcaacaacTTGAAGCTGCTGACATGGCAG‑AGATTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCTATTTCAAATTGTTCGTCTAAAAAAAGATTAAACCGTTCtt < 2:12637‑M1/122‑1 (MQ=255) gCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCAAATTGTTCGTCTAAAAAAAGATTAAACCGTTCttt < 2:656974/141‑1 (MQ=255) cGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCAAATTGTTCGTCTAAAAAAAGATTAAACCGTTCTTTg > 1:237342/1‑141 (MQ=255) gATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCAAATTGTTCGTCTAAAAAAAGATTAAACCGTTCTTTGt < 1:263207/141‑1 (MQ=255) aaTGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCAAATTGTTCGTCTAAAAAAAGATTAAACCGTTCTTTGtttt < 1:583633/141‑1 (MQ=255) aaTGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCAAATTGTTCGTCTAAAAAAAGATTAAACCGTTCTTTGtttt < 1:384942/141‑1 (MQ=255) tACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCAAATTGTTCGTCTAAAAAAAGATTAAACCGTTCTTTGTTTTTCTTTTGa > 1:292792/1‑141 (MQ=255) aCTTTTTAATCT‑CTTCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTATTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGCCTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCAAATTGTTAAAATAAAAAAAGATTAAACCGTTCTTTGTTTTTCTTTTGaa < 2:402269/141‑1 (MQ=255) aCTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTTTATTAAATTTGACTAATGCATCAATAGCTATACCCAGTTCAAATTGTTCGTCTAAAAAAAGATTAAACCGTTCTTTGTTTTTCTTTTgct > 2:147913/1‑139 (MQ=255) aCTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCAAATTGTTCGTCTAAAAAAAGATTAAACCGTTCTTTGTTTTTCTTTTGaa < 2:143189/141‑1 (MQ=255) aCTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCAAATTGTTCGTCTAAAAAAAGATTAAACCGTTCTTTGTTTTTCTTTTGaa < 2:6382/141‑1 (MQ=255) aCTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCAAATTGTTCGTCTAAAAAAAGATTAAACCGTTCTTTGTTTTTCTTTTGaa < 2:123764/141‑1 (MQ=255) ttttGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCAAATTGTTCGTCTAAAAAAAGATTAAACCGTTCTTTGTTTTTCTTTTGAACt < 1:462319/141‑1 (MQ=255) ttttGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCAAATTGTTCGTCTAAAAAAAGATTAAACCGTTCTTTGTTTTTCTTTTGAACt > 1:671361/1‑141 (MQ=255) tttGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCAAATTGTTCGTCTAAAAAAAGATTAAGCCGTTCTTTGTTTTTCTTTTGAACtt < 1:686794/141‑1 (MQ=255) tttGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCAAATTGTTCGTCTAAAAAAAGATTAAACCGTTCTTTGTTTTTCTTTTGAACtt > 2:783139/1‑141 (MQ=255) TTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAATTTTAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCAAATTGTTCGTCTAAAAAAAGATTACACCGTTCTTTGTTTTTCTTTTGAActtt < 2:233349‑M1/141‑2 (MQ=255) | CAATATTCAATCACTTCAGAAATCGCTTGCTCTGATATCTCTTCTTTTTGTAAATATTGTATAACTTCTTTTTCAGTTCTCTTTTTATATGATAAATATTGGATTGCTTTATTTAAACCTATGCGATAATGATCATACTTTTGAATCT‑CTGCCATGTCAGCAGCTTCAAGTTGTTGCCCTTTTTTTAAATTAAATTTGACTAATGTATCAATATCTATACCCATTTCAAATTGTTCGTCTAAAAAAAGATTAAACCGTTCTTTGTTTTTCTTTTGAACTTC > CP000730/2017547‑2017827 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |