| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1096961 = | 189 (0.710) | 63 (0.330) | 15/390 | 21.4 | 31.5% | intergenic (+132/+604) | ycdU/serX | putative inner membrane protein/tRNA‑Ser |
| ? | NC_000913 | = 1097503 | 140 (0.740) | intergenic (+674/+62) | ycdU/serX | putative inner membrane protein/tRNA‑Ser | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 190 total aligned reads displayed.
TATTGGCAACGCTTGTAGAATGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCT‑CGCCCTGCGGGCAGCCCGCT‑CACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTC‑T‑CATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTC > NC_000913/1096666‑1097255 | cAACGCTTGTAGAATGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCATGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCGGGtgtgtgt > 2:1612040/1‑300 (MQ=255) gAATGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCATCTGGCATAACGAGTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGAGATAGGAAGTGACCAGATAATACAAATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTTAGTCACCAGCCAATTATTGTGAACGATTTCCCCTCGCCCTACCATACGTGGACGGGGGCCCCCGGTGTGTGCAATATACTaa > 1:588707/1‑300 (MQ=255) cGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGaaaaaaaa > 1:1128147/1‑300 (MQ=255) ttttGTTTTGAAGCTTTTTTTTTACTCTCGTATTTACAGTTCTTATTTGTATTTTTTTTCTGTTGTCGATTCTTTTGGCGTAACTGTTTTATGTGAGCATTTGTAATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAATTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGcc < 2:1774570/299‑1 (MQ=255) tcggTTGGAACACTAGTTTTTACTCCGCTATGTACCGTACTTAATTTTCTATTTTTCCCTTTTGCGATTCCTTTTGCATAACGCTTTTAGGATGGCATGTTACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGGGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCg < 1:1155399/298‑1 (MQ=255) actgtagttcagatgtgtgttagtccgatctGCTTAATTTCATATTTGTTATATTGTCGATTCCACTGACAGAACGAGTTTATAATGGCATTTGACATGTATTGACGTGGGGGGCATTTTAATAAGTGATGAAGTGATACGAAGTGACCAGATAATACATATATGTACTGTACGCCCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTACACGATTTCCCCCCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCg < 1:1666997/271‑1 (MQ=255) aGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCGGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGAGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCACGTACTTTCGt > 1:1613520/1‑300 (MQ=255) gCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGc < 1:2233731/287‑1 (MQ=255) cTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACg > 1:182574/1‑300 (MQ=255) ttttACTATGCTAGGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGctc < 1:1331974/300‑1 (MQ=255) 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tGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACAAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAAAAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGGTTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACGTTCGTACGCGCTCTTCTTTAAATGTgg > 2:1333426/1‑301 (MQ=255) tccgttctaTTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCAAAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGt < 1:2028056/292‑1 (MQ=255) ttGCTTATTTTTCATTTTTTTGTTTTGTCGATTCCTTTGGCATAACATTTTTATGATGGCATTTGAAATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTg < 2:1127815/299‑1 (MQ=39) gattAATTTACTTTTTTTTCTAGTGTCTATGTCTCTGGCAAAACGATTTGTTGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTTGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAATTTACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATGTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATGCGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAg < 1:286465/298‑1 (MQ=39) ttAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAggg < 1:561379/300‑1 (MQ=255) aTTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAATCAGACAGTTGATGTGCACGATTTTCCCCTGCCCTAACAGACGTCGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCACTATACGAAAAAAAAGACCGAAGTTTCTTACGAGCTCTTATTTAAATATGGCGGAGAggggggg > 2:729663/1‑301 (MQ=255) ttACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTCCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATCCGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAACATGGCGGTGAgggggggcg > 2:2127342/1‑299 (MQ=255) ttcttttttttttATTGTAGTTTCCTCTGTCATCAGTTTTTTATGATGGCATGGTACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATCTATGTTCTGTACTCTCTTGCGCTTTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCCCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGAt < 2:2538570/295‑1 (MQ=38) tttgttATGGTCGATTCCGCTGACAAAACGTTTTTATGATGGCATGGTACATAGATTGCCGTTGGGGGAATTTTAATAAGGGATGAAGTGATAGGAAGTCACCAGATAATACATTAATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGTTTTTTGACTGATTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACtcg < 1:2112237/295‑1 (MQ=37) tCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACtcgcttc > 1:2067730/1‑301 (MQ=255) tttttgATTCGTCTGGCATTACGATTTTTTGATGGGATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTGTAATAAGTGAGGAAGTGTTAGGAAGTTACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACtcgcttcgct < 2:182541/295‑1 (MQ=255) gATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTa > 1:529293/1‑245 (MQ=255) 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ggCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCT‑CGCCCTGCGGGCCACCCGCT‑CACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCACCCTTGAGCTACCCCCGGGCGGGCACGC‑G‑CTTCCGCCCGGTGTGGACATTACCTTAAATACAATCGCTGCCTTTCCTGCAACCTCTTCTTTATAACTGGCGATGACGTGGGGAtttagttgctcagcattctcttctcgttctct > 2:248708/1‑271 (MQ=2) ggggCACCCGGTTGGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTGTCGTACGGATTTTGCTTTAAATATGGGGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCT‑AGCCCTGCGGGAAGCCCGCT‑CACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCGGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTC‑T‑CATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTc < 1:1260326/301‑1 (MQ=11) gggCCCCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTTCTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCT‑CGCCCTGCGGGCAGCCCGCT‑CACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTC‑T‑CATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGa < 2:1566672/232‑1 (MQ=17) | TATTGGCAACGCTTGTAGAATGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCT‑CGCCCTGCGGGCAGCCCGCT‑CACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTC‑T‑CATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTC > NC_000913/1096666‑1097255 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |