| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2904386 = | 292 (1.090) | 11 (0.040) | 10/536 | 31.4 | 3.7% | intergenic (+1012/+361) | ygcE/queE | putative kinase/7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase; queosine biosynthesis |
| ? | NC_000913 | 2904404 = | 288 (1.110) | intergenic (+1030/+343) | ygcE/queE | putative kinase/7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase; queosine biosynthesis | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 293 total aligned reads displayed.
GCGCGGGGAACACCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGG‑AACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAATGATTTTTTAAGCCAGTCACAATCTACCAACTTTATAGTATCACACAAACAACACATCCATTATGTTAAAGAGCACTTAATCCATTGATTAAAAAGGTAAATATTTAAAATAACTCTATACAAACTAAAATCTACCAAACTTTACCGCAATAATTTTCACTCCAGCGAAAAATTAATGCCACAGAATTTGTAGAGAATGCTAATGATTAGCCCTGGATGGGTAAAATGGAGGAGTTTTCAGAGGCGACA > NC_000913/2904090‑2904682 | cagctggcaaCCCCTTTTTTCGCAAAGCTATGTGCGATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGAACGGAATACCAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGG‑AACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATcccc < 2:1054855/293‑1 (MQ=255) cacCTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGACCCCTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGGCGGTTTACCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGGTAGCGGTAATCCCGCAAACACAGCTTTGTCCACCCTGGCCCGGGGCAACA‑ATTACGCCGTTTTGTCGTTGCCCTGTTTTTTCCGGGTTTTTCCTGCTggacatt > 2:1357797/1‑296 (MQ=255) cccTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGGGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGG‑AACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCggg < 1:461413/300‑1 (MQ=255) ccTGTTTTCGCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTCGCGCGGGG‑AACACATTACGCCTTTTTGCGATTGGCCGGGTTTTGCCGGTTTGTCCCCGCTGGCGCgggg > 2:1997349/1‑301 (MQ=255) ggtttCGCAAATCTATGGACAATTGCTATTCGGTGTAGCCCCGCGGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGGGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGG‑AACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAac < 1:2169564/299‑1 (MQ=255) gTTTTCGCAAATCTATGGACTATGTCTATTCGGTTTAACCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTTTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGG‑AACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGa < 1:1105790/299‑1 (MQ=255) taggatatatatgggctacgcgtaagcGGGTTATCCGCGCCGGGGCGGAGAACAAGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTCTCGGCTCTGTGTATCCCCGCTGGGGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTGTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGG‑AACACAGTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACAct < 2:509339/274‑1 (MQ=255) gCAAATCTATGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGG‑AACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTGTCTCCGCTGGCGCGGGGGACAcgct > 1:601594/1‑300 (MQ=255) aactaagggagaatgcgagacGGTGTAGCCCCGCTGGCGGGGGGAAAACGGGCGAACGGAATACAAAGCCGGGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACAATGGCTCTGCAAAAGCAGCACAAATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGG‑AACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACa < 1:676951/281‑1 (MQ=255) aTGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCCCGGGG‑AACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCACGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTCTAAACATaa > 1:132703/1‑300 (MQ=255) tGGACTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTATTGCCGCAAAAACAGTGTTATACCCGATGGCTCGGGG‑ACAACATTCCGCCTTTTTGCGATGTCCCGGTTTTTGCCGGTTTACTCCCGCTGGCCGGGGGatcccgcataaacaaacc > 2:1376718/1‑284 (MQ=255) gtccttttGCTATTCGTTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACCGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGG‑AACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACATAAcc < 2:1021720/294‑1 (MQ=255) cTATTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGG‑AACACATTCCGCCTTTTTGCGATTGCCCGGGTTTTGCCGGTTTATTCCCGCTTGCGCGGGGAACACCCTAAACATAACCtatt > 2:1549836/1‑301 (MQ=255) aTTGCTATTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGG‑AACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACCCTCCAAACATAACCtattat > 1:2077435/1‑301 (MQ=255) ccccGGTAGCGCGTGGCACACGGGCGCACGGAAATCAAAGCCGGGTATTCGGTCGGTTTTTCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGG‑AACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAATGAttttt < 2:1455656/299‑1 (MQ=255) ccccGCTGGCGCGGGGAACACGGGCGCACGGAATACAAAGCCGTGTATCTGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGG‑AACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACATAACCTATTATtaattaat < 1:526431/292‑1 (MQ=255) 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atccTGCTCGGTGTCTCCCCGCGGGCGCGGGGAACACTGGCCCTGCAACAGAAGCACCCATGACCACGTTGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGG‑AACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAATGATTTTTTAAGCCAGTCACAATCTACCAACTTTATAGTATCACACAAACAacac < 2:285054/298‑1 (MQ=255) tCTGCTCGTGTATTCCCCGCTTGCGCGGGGACCCCTTGCTCTGCAACAGCCGCACCCATGCCCACGTCGCTTTCTCCCCGCTGTGCCGGGGAACACGAAAGGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGG‑AACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTAAACATAACCTATTATTAATTAATGATTTTTTAAGCCAGTCACAATCTACCAACTTTATAGTATCACACAAACAAcaca < 2:821872/300‑1 (MQ=255) tGCTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTGGCTCTGCAACAGCAGCACCCATGACCACGTCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACGAAATGCTGGTGAGCGTTAATGCCGCAAACACAGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGG‑AACACATTACGCCTTTTTGCGATTGCCCGGTTTTTGCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACACTCTACACATACCCTAGTATTAATTAATGATTTTTTAAGCCAGTCACAATCTACCAACTTTATAGTATCACACAAAAAAaacaaa > 1:285119/1‑298 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |