| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2900306 = | 90 (1.470) | 6 (0.100) | 6/540 | 6.3 | 6.7% | intergenic (‑33/‑286) | ygcW/yqcE | putative SDR family oxidoreductase/putative MFS transporter, inner membrane protein |
| ? | NC_000913 | 2900346 = | 83 (1.440) | intergenic (‑73/‑246) | ygcW/yqcE | putative SDR family oxidoreductase/putative MFS transporter, inner membrane protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
GTGATACCCACCTGCATGAAGTCCACCTCAACACCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGC‑GAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCACACAACACCTCTGCTTTCCATGTTATTTATTATTTCAATTACTAGAGACCTGAGAAAAGTAATCCACCTGAAAGGGCGGCTTACTTTTCTCTTTTTTTTGTCTATTACAAATGGGAATACGATATGCAACACAACTCATATCGCCGTTGGATAACCCTCGCG > NC_000913/2900047‑2900630 | gTGATACCCCCCTGCATGAATTCCACCTCAACACCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTTGTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGC‑GAGAGGGAAGTTACCTTTCTCa < 1:229188/301‑1 (MQ=255) cATGAAGTCCACCTCAACACCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGC‑GAGAGGGAAGTAACCTTTCCCAATATTTCTGGTaa > 2:244823/1‑300 (MQ=255) tGAAGTCCACCTCAACACCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAACGAAAGGTAACTTCCCCCGA‑GAGAGGGAATGTACCTTTCTAATTTTCTCTGGTAACtt > 2:243036/1‑300 (MQ=255) accccccctgatctctctctctttttCACTCCTGTTCTTGGTTTGTCCGTTATAGTTGAAGAAAATATGGATAAAGAATTTTGAGCCAGATTTGGACAACGACAATGGAAATTCCTGTCCTCAACCGTTCTGGCCATCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGTAGAAAAAATCCAATGAGAACGCACTGAGAGATTCGTTTGACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑‑AAAAAAAAGAAAGGTGACTTCCCCCGC‑GAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGga < 2:297754/280‑1 (MQ=255) ccaccaCAACACACGGTTTTTCAATCATTACCTTGTTTTCGCCGTTAGGTTTGACGAAACTAGGAACAAAGAGATTTGCGCCAGATTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAAACGCCATTCCCACCTGTAAGAAGTGCGGTTTTACCTGTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAAATTCGATTGACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTACCCCGC‑GAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATa < 2:201431/301‑1 (MQ=255) cccAACACCCGTTTTTTCATTCATTTCCTTTTTTTCTCCGTTATTTTTGAAGAAATGAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCGTGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGC‑GAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAAttt < 2:395377/299‑1 (MQ=255) accacCCCTTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCGTTGACGAAACTAGGAATAAAGAGATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGC‑GAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTa < 1:558436/299‑1 (MQ=255) acCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGC‑GAGAGGGAAGTTAACTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGc > 1:34203/1‑300 (MQ=255) cccTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGCACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAG‑TTCGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGAAAATTCCCCCGC‑GAGAGGAAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGCTAACTGGAGATAATTTTTAGCAt > 1:517340/1‑301 (MQ=255) cATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATCGAGAACGCATTGAGAGATTAGATCGACCAAG‑TTAGATCTAATTTCAGTAAGTC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTATCTCGC‑GAGAGGGAAGTTAACTTGCTCATTATATTTGTTAACTGAAGATAATTTTTAGCATTAGAGAATAACTgt > 2:126901/1‑300 (MQ=255) ccGCCGTTATCTTGGACGTAACTAGGAATAAAGATATTTGCTCAAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGC‑GAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTa < 1:243105/300‑1 (MQ=255) cTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGCGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATAGACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCACGC‑GAGAGGGAAGTTACCTTGCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATACTTTTTAGCATAAGGGCATAACTGTTAATTTGATCGTAATCACAgagg > 1:320759/1‑298 (MQ=255) tttGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGC‑GAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGtgtg > 1:111008/1‑301 (MQ=255) tttGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGC‑GAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAAATGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATTACTGCTAATGTGAGCGTAATCAAAGtgtg > 1:145684/1‑301 (MQ=255) tttGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGC‑GAGAGGGAAGTCACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATCACTGCTAATGTGATGTTAATCACAGtgtg > 1:507147/1‑301 (MQ=255) tttGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑‑AAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGC‑GAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTTATCGTAATCACAGtgtg > 1:245295/1‑300 (MQ=255) gACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAG‑TTAGCTCCAATTTACGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTACCACGCGGAGAGGTAGGTACCTTTTCTC‑TTATATCTGGTAAACTGAAATAATTTTTAGAATAAAGGACAAAATGCTAATTGTATTGTAATCACTGTGTGat > 2:248536/1‑300 (MQ=255) cGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAAATTCCCCCGC‑GAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTTTCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACGGATAATGTGATATTATTCCCAGTGTGATAtt > 2:307972/1‑301 (MQ=255) aaaCTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGC‑GAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATACGGCCATAATTGCTAATGTGATCGTAATCACAGGGTGATAtttg > 1:462753/1‑299 (MQ=255) aaTAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATTGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGTGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGC‑GAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGt < 2:320124/299‑1 (MQ=255) aaTAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGTGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGC‑GAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGt > 1:320209/1‑299 (MQ=255) atcacgtacattggcccacgtttGGCCAACTCCCGTGCAAATTCGTGGACTAAACCGATATTCCCAACGGTAACAAGTGCGGTTTTACCATTTAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGTATTGAGAGATTCGATTGACATAG‑TTAGCCCCAATTGCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAGCTTCCCCCGC‑GAGAGGGAAGTTACCGTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCaa < 2:517216/281‑1 (MQ=255) caaGATATTTACGCCCGGTTTGTCCCAGCCCCTTGCCATTGTCTGGCTTAAGGCGCTGTTCCCACCCGTTAGATTTGCGGTTTTACCTTTCAGGTAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGCGCGATTCGATTGACATAG‑TTAGCGCCAAGTTCCGTAAGGC‑CAAAAAAAATAAAGGTAACTTCCCCCGC‑GAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTGAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGACATTCGTATTGTCaaa < 2:490627/299‑1 (MQ=255) atgATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCGAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGAATTGAGAGATTCGATTGACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGC‑GAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAaata < 2:110986/299‑1 (MQ=255) gATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGC‑GAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGt > 2:457861/1‑220 (MQ=255) gATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCGGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGC‑GAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGt < 1:457973/220‑1 (MQ=255) atgtGCGCCAGCGTTTGCGAACTTCAGGGAAAATGCCAGGCCTAAAGCGCGATGCCCACCGGGAACAATTACGGTTTTACCTTTAAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAATGAATTTAGAGATTCGATTGACAAAG‑TTAGCTCCAATGTCCATAAGGA‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACGTCCCCCGC‑GAGAGGGAAGTTACCTGTCTCATTAGCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAAtttt < 1:423189/298‑1 (MQ=255) ttGCGCCACCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTGCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGC‑GAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTa < 1:410411/300‑1 (MQ=255) 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cccAGCTTTGGCCACAGTCATGGCAAAGTGCTGGCCTAAACCGCTATGCCAGCCGGTAACACTTGCTGTTTTACCTTTCAGGGCGAAAAAATCCAGGGAGAACGCAGTGAGATATGCGATTGACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGAC‑AAAAAAAAAGAAAGGTATCTTCTCCCGC‑GAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAg < 1:480732/300‑1 (MQ=255) cccgatttggtaaccGCCATGGAAAATGCCTGACCAAAACGGTAATTCCAACGGGAAAAATTGGCGTTTTTACCTTTACGGGAGAAAAAATCAATTGGTAACCAATGGAGAACTTGAAGTGACATAG‑TAACCTCCAATTTCCGAAGGCC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGC‑GAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGc < 1:248605/287‑1 (MQ=255) cAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACACTTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGC‑GAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTACTGTGATCGTAATCACATTGGGCTATTCGTATTGCAAAATAATTTTAAAAAgtc > 2:92489/1‑299 (MQ=255) 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ccTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAG‑TTAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTACCCCCGC‑GAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGACATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGAGATTCGTATTGTGAAATATTTTTCAACAGAAGAAGCGTGATTACTCTCATACCACACCTCTGCTTTCTATGTTCTTTATTATTTCATCTACTAGTGAcatt > 1:55471/1‑297 (MQ=255) ccTTTAAAGGAGAAAAAAGCCATTGAGAACGCATGGAAAAATTCGATTGACATAT‑ATAGCTCCAATTTCCGTAAGGC‑AAAAAAATAGAAAGCTAACGTCCCCCGC‑GAGAGTGAAGTTCCCATTGTCAATATCTCTGGTAACTGGAGATTATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTAATCGTGATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAAGAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCACACAACACCTCTGCTTTCCATGTTATTTATTATTTCAATTACTAGAGACCTga < 1:338776/301‑1 (MQ=255) cAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGAAATAG‑TTAGCTCCAAATTCCGTAAAGC‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGC‑GAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCACACAACACCTCTGCTTTCCATGTTATTTATTATTTCAATTACTAGAGACCTGAGaaaa < 2:312266/301‑1 (MQ=255) 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aaaaaaaGAAAGGTAACTTCCCCCGC‑GAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGTTTACTCTCACACAACACCTCTGCTTTCCATGTTATTTATTATTTCAATTACTAGAGACCTGAGAAAAGTAATCCACCTGAAAGGGCGGCTTAATTTTCTCTTTTTTTTGTTTATTACAAATGGGAATACGattagaaaca > 2:96887/1‑292 (MQ=255) aatagcaatgTAACTTCACCCGC‑GAGTGTGAAGTTCGCTGTCTCATTATCGCTGGTAACGTGAGATAAGTTTTAGCATATGTGACTTACTGATAATTTTATCTTAATCACATTGTGATATTGTAATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTTATTACTCTCACACAACACCTCTGCTTTCAATTTTATTTATTATTTCAATTACTAGAGACCTGCGAAAAGTAATCCACCTTACAGGGCGGCTTACTTTTCTCTTTTTTTTGTCTATTACAAATTGGAATACGATATGCAACACAAc < 2:17061/292‑1 (MQ=255) aaagaaacGTGATCTCCCCCGC‑TAGAGGTAATTTACCTTTCCCTTTATCTCTGGTACCTGGAGATAATTTTTATCATTAGGTCATCTGTGCGAATGTGATCAGAATCAAAGTGTGATATTAGTATTGTAAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCTTGATTACTCTCACACAACACCTCTGCTTTCCATGATATTTATTCTTTCAATTACTAGAGACCTGGGAAAAGTAATCCACCTGAAAGGGCGGCTTACTTTTCTCTTTTTTTTGTCTATTACAAATGGGAATACGATATGCAACACAACt < 1:419604/301‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |