| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2700550 = | 90 (1.130) | 5 (0.070) | 5/530 | 9.2 | 6.0% | intergenic (‑353/+68) | shoB/acpS | toxic membrane protein/holo‑[acyl‑carrier‑protein] synthase 1 |
| ? | NC_000913 | 2700601 = | 73 (0.980) | intergenic (‑404/+17) | shoB/acpS | toxic membrane protein/holo‑[acyl‑carrier‑protein] synthase 1 | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
ACTCGTTTCAATGGGGGAATTCTGTGGCATGGTGTAAAGCACAGCAAAATCTTCAATAACGAAGCCAATTTTAATGTACTTACGAATTGGCGGTCACGTTAATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTC‑GGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGCCGAGCTCATCATTGAATACTTCAAATTGATTAAACGCCAGACCATTGCGGATCCCGGTGCCAAACGCTTTTGCTGCGGCTTCTTTCACAGCAAAACGCTTCGCCAGAAAACGCACCGGCTGGTGGTGCGTTTTCCAGATAGCCCATTCGTTAT > NC_000913/2700317‑2700898 | acTCGTTTCAATGGGGGAATTCTGTGGCATGGTGTAAAGCACAGCAAAATCTTCAATAACGAAGCCAATTTTAATGTACTTACGAATTGGCGGTCACGTTAATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTC‑GGGGGTTTTACTTTTTAAATAGAACGGTATTAttt > 2:378379/1‑301 (MQ=255) ttaaaTGGGTTAATTTCGTTGCATTGTGTAAAGCACAGCAAAAACTTCAATAACGAAGCCAATTTTAATGTACTTACGAATTGGCGGTCACGTTAATCTTTCCATCAATAATGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTC‑GGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAAc < 2:394225/297‑1 (MQ=255) ttCAATGGGGGAATTCTGTTGCATTGTTTAAAGCACAGCAAAATCTTCAATAACGAAGCCAATTTTAATGTACTTACGAAATGGCGGTCACGTTAATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTC‑GGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAAc < 1:126396/300‑1 (MQ=255) aaaTGTGGGAATTATGTGGCATTGTGTAAAACACAGCAAAATCTTCAATAACGAAGCCAATTTTAATGAACTTACGAATTGGCGGTGACGTTAATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTC‑GGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACttt < 1:378258/300‑1 (MQ=255) ggggAATTCTGTGGCATGGTGTAAAGCACAGCAAAATCTTCAATAACGAAGCCAATTTTAATGTACTTACGAATTGGCGGTCACGTTAATCTTTCCATCAATATTTCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGATGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCAGTTCCATACCAGCTC‑GGGGGTGTTATTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCaat > 1:277084/1‑300 (MQ=255) cagactggtgatcttccgatctcAAAATCTTCAATAACGAAGCTAATTTTAATGTACTTACGAATTGGCGGTCACGTTAATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACGGATCCAGAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTC‑GGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTg < 2:641393/279‑1 (MQ=255) gtgGAATGGTGTAAAGCACATCAAAATCTGCAATAACGAAGCCAATTTTAATGTACTTACGAATTGGCGGTCACGTTAATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTC‑GGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTg < 2:106130/300‑1 (MQ=255) 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cAAAATCTTCAATAACGAAGCCAATTTTAATGTACTTACGAATTGGCGGTCACGTTAATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAACGATAAGTACACTGATCAATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACACCCGTTCCTTACCATGTA‑GGGGGTTTTACTTTTAAAAGAGAAAGGTATTTTTTTTAATTTTCAATAATTACCATgaaattggagaaacgtcttta > 1:641221/1‑279 (MQ=255) aaTCTTCAATAACGAATCCAATTTTAATGTACTTACGAATTGTCGGTTACTTTTATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTAGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAATACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTC‑GGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTg < 1:539608/301‑1 (MQ=255) aaaTAACGAAGCCAATTTAAATGTACTGACGAATTGGCGGTCACGTGAATCTTTCCATCAATATTGCTTTCTTCGTAAAGGCTCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTC‑GGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCg < 2:653828/300‑1 (MQ=255) 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tttACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGCCGAGCTCATCATTGAATACTTCAAATTGATTAAACGCCAGACCATTGCGGATCCCGGTGc > 2:665380/1‑217 (MQ=255) tttACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGCCGAGCTCATCATTGAATACTTCAAATTGATTAAACGCCAGACCATTGCGGATCCCGGTGc < 1:665195/217‑1 (MQ=255) tttACGTTTTAAAGAGAACGGTATTAGTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTAATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGCCGAGCTCATCATTGAATACTTCAAATTGATTAAACGCCAGACCATTGCGGATCCCGGTGCCAAACGCTTTTGCTGCGGCTTCTTTCACAGCAAAACGCTTCGCCAGAAAACGCACCGGCTGGTGGTGCGTTTTCCAGATAGct < 2:4451/300‑2 (MQ=255) tACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGCCGAGCTCATCAtt > 2:614469/1‑168 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |