| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 732824 = | 77 (1.030) | 5 (0.070) | 4/554 | 9.1 | 6.6% | coding (3242/4194 nt) | rhsC | Rhs protein with putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | NC_000913 | 734645 = | 67 (0.920) | pseudogene (513/1521 nt) | rhsO | pseudogene, Rhs family | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
TATGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACGGGTATGGCGGCGTGAACGGGACCTGAC‑GGGCTGGATGTCGCTGTCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAA‑GCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGAC‑GGTGGCGCAGATGCAAAGCCAGAT‑GGACCCGGTATACACGCCGGCGCGAAAAATTCACCTGTACCACTGCGACCA‑TCGCGGCCTGCCGCTGGCCCTTATCAGCACGGAAGGGACAACAGCGTGGTACGCAGAATACGATGAATGGGGTAACCTGCTGAATGAA > NC_000913/732529‑733119 | gcggcgcagCCGGTGGGCGAAAGGCGCTATCTTTAGCCCCCGCGGGGCCCCAGGGGGGCAAAACGGGTATGGCGGCGGGAACGGGACCTGAC‑GGGCTGGATGGCGCGGTCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTg < 1:478869/294‑1 (MQ=11)aatgcagtgcccgtcgtagcacgtcgtgaTCTTTCCGCCCCGTGGGCCCGCAGGTTGCCACAACGGGACTGGCGGCGTGACCGGGACTGGAC‑GGTCTGGCTGGCGCGGTCACGGAAACCGCAATTCACCTGGTACGGCTTGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGCCAGAACCCGCATCCAGTCGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCTGATACCCTTCAGCCGTCCGGTg < 2:115597/273‑1 (MQ=11) atGCAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACGGGTATGGCGGCGTGAACGGGACCTGAC‑GGGCTGGATGTCGCTGTCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCCCCGGCGACCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCCGCCCGGCGGGTACCCCTCACCAGGCCggggc > 1:78798/1‑298 (MQ=255) ccctccccgacgacctgccgatctCTTGACGGCCCGTTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACGGGTATGGCGGCGTGAACGGGACCTGAC‑GGGCTGGATGTCGCTGTCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACTCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAg < 1:115054/278‑1 (MQ=11) cccGCGGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGTGGGGCCGCAGGGTGGCAAAACGGGTATGGCGGCGTGAACGGGACCTGAC‑GGGCTGGATGTCGCTGTCACGGAAACCGCAAGTGACCGGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGAc < 2:553001/300‑1 (MQ=18) gCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACGGGTATGGCGGCGTGAACGGGACCTGAC‑GGGCTGGATGTCGCTGTCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGt < 2:188509/301‑1 (MQ=33) gTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACGGGTATGGCGGCGTGAACGGGACCTGAC‑GGGCTGGATGTCGCTGTCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCTAAGACGGTGGCAGTgtggg > 2:356563/1‑300 (MQ=18) tCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACGGGTATGGCGGCGTGAACGGGACCTGAC‑GGGCTGGATGTCGCTGTCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCAAGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCCGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGGCCGGGGGCCGAAACGGGGGCAGGggggtg > 2:350183/1‑301 (MQ=255) cGCTATCTGTACTGCCCGCGGTGCCGCAGGGTGGCAAAACGGGTATGGCGGCGTGAACGGGACCTGAC‑GGGCTGGATGTCGCTGGCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTgtggtg < 2:523764/300‑1 (MQ=12) aTCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACGGGTATGGCGGCGTGAACGGGACCTGAC‑GGGCTGGATGTCGCTGTCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTcc < 2:78817/300‑1 (MQ=32) tCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACGGGTATGGCGGCGTGAACGGGACCTGAC‑GGGCTGGATGTCGCTGTCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGGGGCAGTGGGGTGTTCccg > 2:660982/1‑301 (MQ=17) cTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACGGGTATGGCGGCGTGAACGGGACCTGAC‑GGGCTGGATGTCGCTGTCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGAGACTCTTCAGCAGTCCGGTGGCGgagagaacggaagagcaaacgcctga > 2:115087/1‑278 (MQ=11) ttACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACGGGTATGGCGGCGTGAACGGGACCTGAC‑GGGCTGGATGTCGCTGTCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCccgcc < 2:663219/300‑1 (MQ=32) accGACGCGGTGTGCCGAAGGGTGGAAAAACGGGGATGGCGTCGGTAACAGGACCTGGG‑GGGCTGGAGGTGGCGGACACGGAAACGCAAAGAGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCTCCTAACCACGAGACAGAACGGCAGAACCCGAATCCAGACGATGTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCgg < 1:632198/299‑1 (MQ=11) ccgacgcgtggggCCCGAGGGTGGCAAACAGGGGATGGGTGCGTGTA‑GGGACCCTACGGGGCTGGATGTCGCTGGCACGGAAACCCCAAGTGGCCGTGTAGGGTTGGGCCGGCGACCGCCTGACCACGATCAAGAACGACAGAACCAGCATCCAAACAATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACCCAGCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGt < 1:607502/291‑1 (MQ=11) aCGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACGGGTATGGCGGCGTGAACGGGACCTGAC‑GGGCTGGATGTCGCTGTCACGGAAACCGCAAGTGACCTTGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTGCACGCCACTCATCCGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGTAAACGCAGCGCCGCAGCCTCGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGGGGCCACGACTGTGGCCCGGGGGTGTTCCCGCCAGt > 2:607671/1‑301 (MQ=11) gggCCGCAGGGTGGCAAAACGGGTATGGCGGCGTGAACGGGACTTGAC‑GGGCTGGACGTCGCTGTCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATGTATCAGCCGGGGAGCGTGACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGAAGCGCCGACGACTGGCGGGTACACCGCAGCAGACACGGGGCGAAGACGGTGGTTGGGTGGTGGTCCCGACGGCGCCGGGGc > 1:482140/1‑299 (MQ=11) gggCCGCAGGGTGGCAAAACGGGTATGGCGGCGTGAACGGGACCTGAC‑GGGCTGGATGTCGCTGTCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAg < 2:358469/301‑1 (MQ=32) gCCGCAGGGTGGCAAAACGGGTATGGCGGCGTGAACGGGACCTGAC‑GGGCTGGATGTCGCTGTCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGGGGCGAAGCCGGTGGCAGGGTGGGGGTGCCGGGGGGGCGGGTGCAggg > 2:90480/1‑299 (MQ=11) gCAGGGTGGCAAAACGGGTATGGCGGCGTGAACGGGACCTGAC‑GGGCTGGATGTCGCTGTCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCCCCCATCAGGGGTGAAACCGCCACATGCGAGCTGTCGCAAACGCAGCGCCGCAACCTGCCGGTGACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGCGTGGTGCAGGGAGGGGTTCGCCCCGGGGCTGGTGCGGGTGCt > 1:59220/1‑301 (MQ=11) ggCAAAACGGGTATGGCGGCGTGAACGGGACCTGAC‑GGGCTGGATGTCGCTGTCACGGAAACCGCCAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGCAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCACCCTGGCGGCAACCCTTCAGCAGGCCGGGCGCGCAGACGGTGGCAGGGGGGTGTGCCCCCCGGTGCCGGGGCAGCTGCTCGTcccg > 1:388072/1‑299 (MQ=11) aaaaGGGGGATGGCGGGGGGAACGGGACCTGAC‑GGGCTGGATGTGGCTGGCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGCCCACGATCCAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAACCCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTg < 1:660798/301‑1 (MQ=255) aaCGGGTATGGCGGCGTGAACGGGACCTGAC‑GGGCTGGATGTCGCTGTCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGa < 2:388190/301‑1 (MQ=32) cGGGTATGGCGGCGTGAACGGGACCTGAC‑GGGCTGGATGTCGCTGTCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATACAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGGCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCCGTCCGGTGGCGAAGACGGCGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCGGGTGCAGATGATGGACCGGCTGGaa > 2:502906/1‑300 (MQ=12) gggaTGGCGGCGTGAACGGGACCTGAC‑GGGCTGGATGTCGCTGTCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAg < 1:68000/239‑1 (MQ=17) ggTATGGCGGCGTGAACGGGACCTGAC‑GGGCTGGATGTCGCTGTCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAg > 2:68014/1‑242 (MQ=33) cggcgTGAACGGGACCTGAC‑GGGCTGGATGTCGCTGTCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTGCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGCATACCCTTCAGCAGTCCGCGGGCGAAGCCGGTGGCAGTGGGCGGGTCCCGCCGGTGCGGGCGCCGCTGCTGGCCCGCCTGGACGGGGAAATcc > 1:593513/1‑301 (MQ=11) ggggcaCGGGACCTGAC‑GGGCTGGATGTCGCTGTCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTgg < 2:130845/296‑1 (MQ=11) gTGAACGGGACCTGAC‑GGGCTGGATGTCGCTGTCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGGGGGGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGGTCGACCGGCTGGAAACGGAAAGCCgggg > 2:196608/1‑300 (MQ=2) gAACGGGACCTGAC‑GGGCTGGATGTCGCTGTCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCAACCGACGAGCTGGCGCAAACGCAGCGCGGCAGCCCGGCGGATACCCTTCCGCCGTCCGGTGGCGAAGGCGGAGGCAGTCTGGGCGTCCTGCCGGTGCTGGTTCAGGGGCGCGCCAGGGTGGAAAGGGAACACCTggagg > 1:643109/1‑298 (MQ=11) ccccgAC‑GGGCTGGATGTCGCTGTCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGgt < 2:643290/297‑1 (MQ=11) gCTGGATGTCGCTGTCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAgg > 2:403084/1‑300 (MQ=11) ggATTTCTCTGTCACGGAAACCTAAAGTGAACTGGTACGGCTGGGACGGCGCCCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTAGCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAA‑g < 2:59234/301‑1 (MQ=2) cTGTCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCATCAGCTCGGTGGCGCAGACGGTGGCAGTGTGGTGGTACCGCCGGTGCTGGTCCAGATGGCTGACCGGCTGGACAGTGAAATCCTGGGGGCCCGGGTGAGTGGGGAAG‑GCcgccgcc > 1:116329/1‑300 (MQ=11) gTCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCCGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGGGAGTGAGGAAA‑GACGCCgctgg > 2:195198/1‑301 (MQ=11) cACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGGGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGGAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGGGAGGAAA‑GCCGCCgccggct > 2:630435/1‑301 (MQ=11) cGGAAGCCGCAAGTGACCTGGAACAGCTGGGGCGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAAAGACAGACCCCGCAACCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGAGACCCTACAGCAGTCCGGTGGCGGAGACGGAGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTAGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAA‑GCCGCCGctggctgg < 2:482272/301‑1 (MQ=11) 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tACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGCAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGGGGGGGGACA‑GCCGCCGCTGGCGGGCACCGTGCGGCCTGGC‑GGTGGCGCAGGGGCAAAGCCAgcgggcgccgggat > 1:337263/1‑287 (MQ=11) aacaaacctccacacccccCATCCTGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTCCCCGCCCATCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGGCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAA‑GCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGAC‑GGTGGCGCAGATGCAAAGCCAGAT‑GGACCCGGtata < 1:111715/286‑1 (MQ=11) cAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGaa > 2:264282/1‑198 (MQ=31) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |