| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 624176 = | 75 (0.770) | 6 (0.060) | 6/554 | 11.1 | 7.8% | coding (335/957 nt) | fepB | ferrienterobactin ABC transporter periplasmic binding protein |
| ? | NC_000913 | 624218 = | 69 (0.730) | coding (293/957 nt) | fepB | ferrienterobactin ABC transporter periplasmic binding protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
CGTCCAGAGATTGGCACTGTGTGCAGCGGCAGTATAGACAATGGCAGTGACCGGCTGCGGCGGTAATTTGATTTGCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAACTG‑CGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCGGCGCTCGGTTCGC‑CGATATAGAGCCGTTGCAGTTTGCGTTCTTTCGCCACCTTGCTCCACTGGCGTAAAAAGCCCTGGTCATCCGCGACGCGGTTATTCGGCGTGGTCGCGCCGCTGGCGATCACCGGAGCATCAATCGCCAGCAGTGAGCCGGTCAGGGTGACGCTGGTGGAAACAATACGCTGCGGCTGGCTTT‑CCAGTGTATGTGTGCCACGGCTGTCAGTAATCTGACGCGGCCAGTCAGCGGCCTGAACTGCGGCTATTCCTGAAAGCAAAAGTCCTGTTAAT > NC_000913/623881‑624475 | cGTCCAGGGATTGGCACTGTGTGCAGCGGCAGTTTAGACAATGGCAGTGACCGGCTGCGGCGGTAATTTGAGTTGCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAACTG‑CGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACg < 2:786411/301‑1 (MQ=255) aagggaTTGTCACTGTGGGCAGCGGCAGTAGAGACAATGGCAGTGACCGGCTGCGGCGGTAATTTGATTTGCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTTCTTATCAAACTG‑CGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCtt < 2:633939/297‑1 (MQ=255) ggagttgggacttggggccgggtgaGTATAGACAATGGCAGTGACCGGCTGCGGCGGTAATTTGATTTGCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAACTG‑CGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCg < 1:785732/277‑1 (MQ=255) gattggcgcgggtgtcggCGGGAGTTTACACCATGGCCGTGACCGGCTCCGGCGGTAATTTGATTTGCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAACTG‑CGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCGgc < 1:86084/284‑1 (MQ=255) gCACTGTGTGCAGCGGCAGTATAGACAATGGCAGTGACCGGCTGCGGCGGTAATTTGATTTGCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAACTG‑CGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGGTCCGGCATTTGCGCGGCACCGGCTTCGGCGATCg > 2:252073/1‑301 (MQ=255) aCTGTGTGCAGCGGCAGTATAGACAATGGCAGTGACCGGCTGCGGCGGTAATTTGATTTGCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAACTG‑GGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCGGCGCTCGGt < 2:580279/301‑1 (MQ=255) ggCAGTATAGACAATGGCAGTGACCGGCTGCGGCGGTAATTTGATTTGCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAACTG‑CGCAATCCGCTCTGCAGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGTGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGCATCCCCGCCGGTTGCACTACTTAAAATCAGATCAGGAATTTTCGCGGCAACGGCTCCGGCGCTCGGTACGC‑CGaaat > 2:466951/1‑299 (MQ=255) gaaggacaGACAAAGGGAGGGACCGGCTTCGGCGGGAATTTGATTTGCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTACCAAACTG‑AGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCGGCGCTCGGTTCGC‑CGATATaga < 1:421962/294‑1 (MQ=255) tGGCAGTGACCGGCTGCGGCGGTAATTTGCTTTGCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAACTG‑CGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCGGCGCTCGGTTCGC‑CGATATAGAGCCGTTGCAGtt < 2:351569/300‑1 (MQ=255) gTGACCGGCTGCGGCGGTAATTTGATTTGCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAACTG‑CGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGGCTGGCCACGGCTTCTGCGCTCGGTCCGC‑CGCTATAGAGCCTGTGGCGTTTGCGtt > 1:11744/1‑301 (MQ=255) aCCGGCTGCGGCGGTAATTTGATTTGCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAACTG‑CGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGACCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCGGCGCTCGGTCCGC‑CGATATCGAGCCTGTGCatctgtcgttgtt > 1:411621/1‑289 (MQ=255) gtctgcgtggggagtttgttgtgCTCTTTCTCGGCCGCTGTTTGCTTATC‑CACTGACGCAATCCCCTCTGCGGCTTGTTTCTCAGCGCCGGTAATTTGGCAAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGAGTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCAGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCGGCGCTCGGTTCGC‑CGATATAGAGCCGTTGCAGTTTGCGTTCTTTCg < 1:684543/287‑1 (MQ=255) ggCTGGGGCCGTAATTTGTATTGCTCTTCCCGCGCCGCCAGTTGCTTAGCAAACTG‑CGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCGGCGCTCGGTTCGC‑CGATATAGAGCCGTTGCAGTTTGCGTTCTTTCg < 2:284380/301‑1 (MQ=255) tGCGGCGGTAATTTGATTTGCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAACTG‑CGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCGGCGCTCGGTTCGC‑CGATATAGAGCCGTTTCAGTTTGCGTTTTTTCGccc > 2:724125/1‑300 (MQ=255) gcggcgGTAATTTGATTTGCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAACTG‑CGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGGGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGACGGTTGCGCTAATTAAAATCCAATCCGGCATTTCAGCGGCAACGGCTTCGTCGCTCGGTTCGCATCATA‑CGCGCCGTTGCAGGTTGCGTTGTTTcccctc > 1:727341/1‑299 (MQ=255) cggTAATTTGATTTGCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAACTG‑CGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGTATTTGCGCGGCAAc > 2:392692/1‑240 (MQ=255) gTAATTTGATTTGCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAACTG‑CGCCATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCGGCGCTCGGTTCGc‑c < 2:14107/259‑1 (MQ=255) tAATTTGATTTGCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAACTG‑CGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCCTTGGCGCGGCAACGGCTTCGGCGCTCGGTTCGC‑CGGTAGAGAGCCGTTCCAGTTTGCGTTCTTTCGACTCCTTtctc > 1:184345/1‑301 (MQ=255) tttgatttgCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAACTG‑CGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCAGACAGTGCCATCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCTGCATTTGCTCTGCAACGGCTTTCGCCTTCCGTTCCG‑CGGTATAGAGCCTTTTGAGGTTGCGTTCTTTCCACACCCTgtctcac > 1:441382/1‑295 (MQ=255) 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ttgCACTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAGCGG‑CGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCAGGGCGAAGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCGGCGCTCGGTTCGC‑CGATATAGAGCCGTTGCAGTTTGCGTTCTTTCGCCACCTTGCTCCACTGGCg < 2:441503/300‑1 (MQ=255) tgCTCTTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAACTG‑CGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGACCAGACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTATTTAAAATCAGCTCCGGCAATTTCGCGGCAACGGCTTCGGCGCCCGGGTCGC‑CGATCTAGAGCCGCCGCATTTTGCGTTCTTTCACCACCTTACTCTACGTGCGtt > 1:424150/1‑300 (MQ=255) ctTTCGCCGCCGCCAGTTGCTTATCAAACTG‑CGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCGGCGCTCGGTTCGC‑CGAtata > 2:486716/1‑250 (MQ=255) 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tccgtgctgccagccGTTCTGCTGTTTGGTTCTCAGGGCCGGTGATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGGGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCGGCGCTCGGTTCGC‑CGATATAGAGCCGTTGCAGTTTGCGTTCTTTCGCCACCTTGCTCCACTGGCGTAAAAAGCCCTGGTCATCCGCGACGCGGt < 1:12250/287‑1 (MQ=255) aaaCTG‑CGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAAGTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCGGCGCTCGGTTCGC‑CGATATAGAGCCGTTGCAGTTTGCGTTCTTTCGCCACCTTGCTCCACTGCCGTAAAAAGCCCTGGTCCTCCGCCACGCGGtt > 2:654170/1‑300 (MQ=255) aaaCGG‑CGCAATCCGCTCTGCCGCTTGTTTCTCATGCCCGGTAATTTCGCCAATTTGCGTTAACAGCGACTGCCAGCTTTTGTCGTCGTAATTGATGATTAATGTCGGGGCGATGGTGGAAAGCTGATCATACAGTGCCAGCGCCGAATCCCCGCCGGTTGCGCTAATTAAAATCAGATCCGGCATTTGCGCGGCAACGGCTTCGGCGCTCGGTTCGC‑CGATATAGAGCCGTTGCAGTTTGCGTTCTTTCGCCACCTTGCTCCACTGGCGTAAAAAGCCCTGGTCATCCGCGACGCGGTTa < 2:890420/301‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |