| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1096961 = | 118 (0.900) | 27 (0.280) | 9/414 | 11.0 | 24.0% | intergenic (+132/+604) | ycdU/serX | putative inner membrane protein/tRNA‑Ser |
| ? | NC_000913 | = 1097503 | 86 (0.910) | intergenic (+674/+62) | ycdU/serX | putative inner membrane protein/tRNA‑Ser | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
GTCGGTATTGGCAACGCTTGTAGAATGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGT‑GATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTG‑TGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGT‑GCAATACACG‑AAAAAAAAGCCCGTACT‑TTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCAC > NC_000913/1096661‑1097257 | gtCGGTATTGGCAACGCTTGTAGAATGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGT‑GATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTTATTGATTAAGAAGACAGTTGATTGTCAAGATTTTCCTTAGCCCACACAGACGTGGGCGGGGGAAc > 1:606367/1‑301 (MQ=255) ttGGCAAACCTTTTGGAATGGCGGATTTGGGTTTGAGCCTATTTGTTACTCTGCTATGTACCGTTCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGCTTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGT‑GATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGgtg < 2:276077/300‑1 (MQ=255) ggCAACGCTTGTAGTATGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTGTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTTGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGT‑GATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGgtg‑tg < 2:1164397/300‑1 (MQ=255) gCTTGTTGAATGGCGGATTTGTTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGT‑GATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTG‑TGTGCAata < 2:70320/301‑1 (MQ=255) gCTTGTAGAATGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGT‑GATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGCCGTGGGCGGGGGCACCCGGTG‑GGTGCAat > 2:562077/1‑300 (MQ=255) tGTAGAATGGCTGATTTTTTTTGAATTCTATTTTTTACTCTGCTATGTTCCGTGCTTTATTTACTATTTTTACTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGT‑GATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTG‑TGTGCAata < 1:673358/298‑1 (MQ=255) tgaGAAGGGCTGTTTTTGTTTGAAGCTTGTTTTTTATTCTGCTATGGTCCGTGCTTAATTTACTTTTTTTTCTATTGTCTATTCCTCTGGCATTACGTTTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTTGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGT‑GATATGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTTATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTG‑TGTGCAATATAc < 2:1755/298‑1 (MQ=255) 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ggTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCTTGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGT‑GATAGGAAGTGACCAGATAATACATATTCGTTCTGTTCTCTCTTTCGCATTTCGATTGTTGCCTGAGTAACTAGACTGTTGATGTGCCAGTTGTCCCTTCGCCCTCATCGCTGTGGTCTGGGGCATCCGggg‑ttgctattccaacaacaacgagccctgct > 1:468568/1‑273 (MQ=255) gTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGT‑GATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGgtg > 1:59660/1‑271 (MQ=255) gTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGT‑GATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGgtg < 2:59672/271‑1 (MQ=255) 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aTTTTTTACTTTGTTATTTACCTTTTTTTATTTACTTTTTTTTTTTTTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATTTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGT‑GATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTG‑TGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAg < 1:1049676/300‑1 (MQ=255) ttctcttatATGTACCATTCTTACTTTTGTATTTTATTTTGTGGTGAGTCCTGTGGCATATCGATGTTATTATGACATGTGACATATATTTCTGTTGGGGCCATTTTAATAAGTGAGGAAGT‑GATAGGAAGTTAACAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCGTGCGCATTTTGATTGTTGAGTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCGAACAGCCGTGTGCGGGGGCACCCGGTG‑TTGGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCtcttc < 1:662050/292‑1 (MQ=255) ctctGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGT‑GTTAGGAAGTGACAAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTTAGTAACCAGACAGTGGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGCCGTGGTCGGGGGCACCCGGTT‑TGTGCAATATTCTACACAAAAGCACGTAGTTTTGTCAGAGCtgttttat > 2:912203/1‑297 (MQ=255) ctGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGT‑GATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTG‑TGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTCCGTatattgaacacaccgg > 2:637091/1‑286 (MQ=255) gCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTTTATTGTCGATTCCTCTGTCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGT‑GATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTG‑TGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAat < 2:1113545/301‑1 (MQ=255) ttttcctttttttaTTTACTATTTTTTTTTTTGTTGATTCCTCTGGCATAACGATTTTTTGTTTGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGAATTTTAATAAGTGAGGAAGT‑GATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTG‑TGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATg < 1:293820/287‑1 (MQ=255) 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gggtgCGGGGGCATCGTGGT‑TGTGAATTATACGAACAAAAAGCCGGTGCTTTTGAACGAGCGCTGCGTTAAATAGGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGTTTTGCACGCCCTGCGGGCAGCCCGCTGTCTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTGGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGT‑GCAATACACG‑AAAAAAAAGCCCGTACT‑TTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAg < 1:561933/297‑1 (MQ=11) tGGGCGGGGGCACCCGGTG‑TGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCGGCGGGCAGCCCGCCCACTGCGTTCAGGGTTTGGCCAACGGGCGGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGT‑GCAATACACG‑AAACAAAAGCCCGTACT‑TTCGTACGCGCTCTTCTTTAAATATGGCGGCTCGGGGGGGATTTCCTCGGTTGGCTCTcccgatcggga > 1:241915/1‑291 (MQ=11) ggCACCGGGGG‑TGGGCAATATAAGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCTGACGAGCTCTTCTTTAAATGTGGCGGTGAGGTGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCGGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGT‑GCAATACACG‑AAAAAAAAGCCCGTACT‑TTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCAc < 2:987840/301‑1 (MQ=255) | GTCGGTATTGGCAACGCTTGTAGAATGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGT‑GATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTG‑TGTGCAATATACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAGTTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCTCATCCCCCCGGTGTGT‑GCAATACACG‑AAAAAAAAGCCCGTACT‑TTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGCGGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCAC > NC_000913/1096661‑1097257 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |