| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 2819836 = | 121 (0.920) | 5 (0.040) | 5/554 | 17.0 | 4.2% | coding (2176/2631 nt) | alaS | alanyl‑tRNA synthetase |
| ? | NC_000913 | 2819907 = | 112 (0.880) | coding (2105/2631 nt) | alaS | alanyl‑tRNA synthetase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
TGACGTCCTTAGATACGCCTGCAATCAGAGAAACCTTACCTTCGACTACCGTTGCCAGCACGATAATTGTCGACCCCAGCTGATTTTTTAAATCGTCAACCATGGTACGCAACATTTTCGGCTCAACACCGCTAAGCTCGCTAACCAACAGCTTAACACCATTAACATCAATTGCCTTACTGGAAAGATTTGCGCTC‑TCCTGTGCGGCAGCTTGTTCTTTAAGCTGTTGTAACTCTTTTTCCAGCTGACGC‑GTACGTTCCAGTACTGAGCGCACTTTATCAGCCAGATTATTGCTATCGCCTTTCAGCAGATGCGCGACTTCGCTTAAGCGATCGCTGTCTGCATGAACGGTGGCGATAGCACCTTCTCCGGTTACCGCTTCGATACGACGAACGCCTGCAGCAGTACCCGATTCAGAGATGATGCGGAACAGACCAATATCACCAGTGCGGCTGGCGTGAGTACCGCCACACAACTCGGTAGAGAAATCGCCCATGCTCAGCACGCGTACGCGCTCATCATACTTCTCGCCGAACAGCGCCATCGCACCTTTCGCTTTCGCCGCTTCGAGATCCATGATGTTGGTTTC > NC_000913/2819545‑2820133 | tgccgacctttgagtatccTGCCATCACAGAAACCTTCCCTCTGATTTCCCTTGTCACGACGATCATTGTCGTGCTCATCTGATTTTTTAACTCGTCAACCATTTTACGAAACATTTTCGGCTCAACACCGCTAAGCTCGCTAACTCCCAGCTTAACACCATTAACATCACTTGCCTTACTGCAAAGATTTTCGCTC‑TCTTGTGCGGCAGCTTGTTCTTTACGCTGTTGTAACTCTTTTTCCAGCGTACTC‑GTACGTTCCAGTACTGAGCGCACTTTATCAGCCAGATTATTGCTATCGc < 1:1172151/283‑1 (MQ=255)tgACGTCCTTAGATACGCCTGCAATCAGAGAAACCTTACCTTCGACTACCGTTGCCAGCACGATAATTGTCGACCCCAGCTGATTTTTTAAATCGTCAACCATGGTACGCAACATTTTCGGCTCAACACCGCTAAGCTCGCTAACCAACAGCTTAACACCATTAACATCAATTGCCTTACTGGAAAGATTTTCGCTC‑TCCTGTGCGGCAGCTTGTTCTTTAAGCTGTGGTAACTCTTTTTCTATCTGACGC‑GTACGTTCCAGTACGGCGCGTACTTTATGAGCCTGATTATTACTAtttcc > 1:755746/1‑297 (MQ=255) tacctaagttccccacataTCAGACAAACCTTACCTTCGACTACCGCTCCCAGCACGTTGAGTATCGACCCCAGCGGAATTTTTAAATCGGCGGCCATGGTGAAAGACATTTTCGGCTCAACACCGCTAAACTCGCTAACCAACAGCTTTAAACCTTTAACGTCAATTGCCATACTGGAAGGAATTGCGCTC‑TCCGTGGCGGCAACTTGTTAGTTAAGCTGTTGTAACTCTTTTTCCAGCTGACGC‑GGACGTTCCAATACTGAGCGCACTTTATCGGCCAGATTATTGCGATCACCATTc < 1:561213/282‑1 (MQ=255) tCCTTAGATACGCCTGCAATCAGAGAAACCTTACCTTCGACTACCGTTGCCAGCACGATAATTGTCGACCCCAGCTGATTTTTTAAATCGTCAACCATGGTACGCAACATTTTCGGCTCAACACCGCTAAGCTCGCTAACCAACAGCTTAACACCATTAACATCAATTGCCTTACTGGAAAGATTTTCGCTC‑TCCTGTTCGGCAGCTTGTTCTTTAAGCTGTTGTAACTCTTTTTCCAGCTGACCC‑CTACGTTCCAGTATTGAGCGCCCTTCTTCAGCTATATAATTGCCATCGACTTTcc > 1:927452/1‑300 (MQ=255) tCCTTAGATACGCCTGCAATCAGAGAAACCTTACCTTCGACTACCGTTGCCAGCACGATAATTGTCGACCCCAGCTGATTTTTTAAATCGTCAACCATGGTACGCAACATTTTCGGCTCAACACCGCTAAGCTCGCTAACCAACAGCTTAACACCATTAACATCAATTGCCTTACTGGAAAGATTTGCGCTC‑TCCTGTGCGGCAGCTTGTCCTTTAAGCTGTTGTAACTCTTTTTCCAGCTGCCTC‑GTACGTTCCAGTACTGAGCGCCCTTTATCAGCCAGATTATTTCTCTCCCCTTTc > 1:465324/1‑300 (MQ=255) cTTAGATACGCCTGCAATCAGAGAAACCTTACCTTCGACTACCGTTGCCAGCACGATAATTGTCGACCCCAGCTGATTTTTTAAATCGTCAACCATGGTACGCAACATTTTCGGCTCAACACCGCTAAGCTCGCTAACCAACAGCTTAACACCATTAACATCAATTGCCTTACTGGAAAGATTTGCGCTC‑TCCTGTGCGGCAGCTTGTTCTTTAAGCTGTTGTAACTCTTTTTCCAGCTGACGC‑GTACGTTCCAGTACTGCGCGCCCTTTATCAGCCAGATTATTGCTAACGCCTTTcagc > 2:688851/1‑301 (MQ=255) tAGATACGCCTGCAATCAGAGAAACCTTACCTTCGACTACCGTTGCCAGCACGATAATTGTCGACCCCAGCTGATTTTTTAAATCGTCAACCATGGTACGCAACATTTTCGGCTCAACACCGCTAAGCTCGCTAACCAACAGCTTAACACCATTAACATCAATTGCCTTACTGGAAAGATTTGCGCTC‑TCCTGTGCGGCAGCTTGTTCTTTAAGCTGTTGTAACTCTTTTTCCAGCTGACGC‑GTACGTTCCAGTACTGAGCGCACTTTATAAGCCAGATTATTGCTATCGCCTTTcagc > 2:940327/1‑299 (MQ=255) 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aGATTATTGCTATCGCCTTTCAGCAGATGCGCGACTTCGCTTAAGCGATCGCTGTCTGCATGAACGGTGGCGATAGCACCTTCTCCGGTTACCGCTTCGATACGACGAACGCCTGCAGCAGTACCCGATTCTGAGATGATGCGGAACTGACCAATATCACCAGTTCGGCTGGTGTGAGTACCGCAACACAACGCGGTAGAGAAATCGCCCATGCTCCGCACGCGTACGCGCTCATCATAGTTCTCCCCGAACAGCCCCCTCCCCCCTTCCCATTTCTCCGCTTCGTGACCCacgccgtcgg > 1:275127/1‑292 (MQ=255) attGCTATCGCCTTTCAGCAGATGCGCGACTTCGCTTAAGCGATCGCTGTCTGCATGAACGGTGGCGATAGCACCTTCTCCGGTTACCGCTTCGATACGACGAACGCCTGCAGCAGTACCCGATTCAGAGATGATGCGGAACAGACCAATATCACCAGTGCGGCTGGCGTGAGTACCGCCACACAACTCGGTAGAGAAATCGCCCATGCTCAGCACGCGTACGCGCTCATCATACTTCTCGCCGAACAGCGCCATCGCACCTTTCGCTTTCGCCGCTTCGAGATCCATGATGTTGGTTTc < 2:390256/300‑1 (MQ=255) attGCTAACGCCTTTCAGCAGATGCGCGACTGCGCTTAAGCGATCGCTGTCTGCATGAACGGTGGCGATAGCACCTTCTCCGGTTACCGCTTCGATACGACGAACTCAGGCAGCAGTACCCGATTCAGAGATGATGCGGAACAGACCAATATCACCAGTGCGGCTGGCGTGAGTACCGCCACACAACTCGGTAGAGAAATCGCCCATGCTCAGCACGCGTACGCGCTCATCATACTTCTCGCCGAACAGCGCCATCGCACCTTTCGCTTTCGCCGCTTCGAGATCCATGATGTTGGTTTc < 2:275191/300‑1 (MQ=255) | TGACGTCCTTAGATACGCCTGCAATCAGAGAAACCTTACCTTCGACTACCGTTGCCAGCACGATAATTGTCGACCCCAGCTGATTTTTTAAATCGTCAACCATGGTACGCAACATTTTCGGCTCAACACCGCTAAGCTCGCTAACCAACAGCTTAACACCATTAACATCAATTGCCTTACTGGAAAGATTTGCGCTC‑TCCTGTGCGGCAGCTTGTTCTTTAAGCTGTTGTAACTCTTTTTCCAGCTGACGC‑GTACGTTCCAGTACTGAGCGCACTTTATCAGCCAGATTATTGCTATCGCCTTTCAGCAGATGCGCGACTTCGCTTAAGCGATCGCTGTCTGCATGAACGGTGGCGATAGCACCTTCTCCGGTTACCGCTTCGATACGACGAACGCCTGCAGCAGTACCCGATTCAGAGATGATGCGGAACAGACCAATATCACCAGTGCGGCTGGCGTGAGTACCGCCACACAACTCGGTAGAGAAATCGCCCATGCTCAGCACGCGTACGCGCTCATCATACTTCTCGCCGAACAGCGCCATCGCACCTTTCGCTTTCGCCGCTTCGAGATCCATGATGTTGGTTTC > NC_000913/2819545‑2820133 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |