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gACAATTGGTGCCAAACTG‑TCCATAATATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACG‑ACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTTCTGTGGCTCGACGCATCTTCCTCATTCTTCTCTCCAAAAACCACCTCATGCAATATAAACATCTATAAATAAAGAT‑AACAATAGAATATTAAGCCAACAAATAAACTGAAAAAGTTTGTCCGCGATGCTTTCCTCTAt < 2:893106/301‑1 (MQ=255) gACAATTGGGGCCAAACTG‑TCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACG‑ACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTTCTGTGGCTCGACGCATCTTCCTCATTCTTCTCTCCAAAAACCACCTCATGCAATATAAACATCTATAAATAAAGAT‑AACAATAGAATATTAAGCCAACAAATAAACTGAAACAGTTTGTCCGCGATGCTTTCCTCTa > 2:1196342/1‑300 (MQ=255) ggCCAAACTG‑TCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACG‑ACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTTCTGTGGCTCGACGCATCTTCCTCATTCTTCTCTCCAAAAACCACCTCATGCAATATAAACATCTATAAATAAAGAT‑AACAATAGAATATTAAGCCAACAAATAAACTGAAAAAGTTTGTCCGCGATGCTTTCCTCTATGAGTCaaa > 2:1126096/1‑300 (MQ=255) ccAAACTG‑TCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACG‑ACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTTCTGTGGCTCGACGCATCTTCCTCATTCTTCTCTCCAAAAACCACCTCATGCAATATAAACATCTATAAATAAAGAT‑AACAATAGAATATTAAGCCAACAAATAAACTGAAAAAGTTTGTCCGCGATGCTTTCCTCTATGAGTCAAAATg < 2:55165/301‑1 (MQ=255) ccAAACTG‑TCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACG‑ACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTTCTGTGGCTCGACGCATCTTCCTCATTCTTCTCTCCAAAAACAACCTCATGCAATATAAACATCTATAAATAAAGAT‑AACAATAGAATATTAAGCCAACAAATAACCTGAAAAAGTTTGTACGCAATGCTACCCACTATGAATCAAAAtt > 2:524602/1‑300 (MQ=255) aaaCTG‑TCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACG‑ACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTTCTGTGGCTCGACGCATCTTCCTCATTCTTCTCTCCAAAAACAACCTCATGCAATATAAACATCTATAAATAAAGAT‑AACAATAGAATATTAAGCCAACAAATAAACTGAAAAAGATTATACGAGATGCTTTCCTCTTTGAGTAAATATGGc > 2:1159668/1‑301 (MQ=255) | GCGATGCCGGTATTGAAGCTGGAACCGTAACGCAGACTCATCCTCATATGT‑TAAGGCATGCTTGCGGTTATGAATTGGCGGAGCGTGGTGCAGATACTCGTTTAATTCAGGATTATCTCGGGCATCGAAATATTCGCCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAACAAATAAATAC‑AAGACAATTGGGGCCAAACTG‑TCCATATCATAAATAAGTTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACG‑ACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTAAAGCTAACGTTTCTGTGGCTCGACGCATCTTCCTCATTCTTCTCTCCAAAAACCACCTCATGCAATATAAACATCTATAAATAAAGAT‑AACAATAGAATATTAAGCCAACAAATAAACTGAAAAAGTTTGTCCGCGATGCTTTCCTCTATGAGTCAAAATGGC > NC_000913/4542398‑4542990 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |