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ggggTGAGGAGCTTCATCGTCTCCAGCGTCTGATACGCCTGCTGCACGGTGCTGATACTGACGCCGTGCTCCTGACTTAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCGTGCTCAATCCGTTCGGCAAGCAGAGTCGCCAGATGTTGATAACGCGTCATGCTGTATTCCTTATGTGGACCATACAGAGAGAAAAACCGGTACAGATGAGGCTAAAAAACCGGATGCAGATGCTGTTTTAACCTGTCTGTATGTTAAATATAAGTAATATTTGAATCTGTATTGTGa < 2:196115/297‑1 (MQ=255) cgttcacagctgcTGAGACGCTGGCTGCACGGCTCTGATACTGACGGCGTGCGCATGACTTAAGTAGGGCGCCGACGGCAATTGCTCCCCGTGTGGCTACTGCCCGTGCTGAAGCCGTTGGGCAAGAAGAGTCGCCAGATGTTGATAACGCGTCATGCGGTATTCCTTATGTGGACCATACAGAGAGAAAAACCGGTACAGATGAGGCTAAAAAACCGGATGCAGATGCTGTTTTAACCTGTCTGTATGTTAAATAAAAGTAAGATTTGAATCTGTATTGTGAACTGCCAGAAGGTGgatg < 2:935003/289‑1 (MQ=255) cTGATACGCCTGCTGCACGGTGCTGATACTGACGCCGTGCTCCTGACTTAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGTTCGGCAAGCAGAGTCGCCAGATGTTGATAACGCGTCATGCTGTATTCCTTATGTGGACCATACAGAGAGAAAAACCGGTACAGATGAGGCTAAAAAACCGGATGCAGATGCTGTTTTAACCTGTCTGTATGTTAAATAAAAGTAATATTTGACTCTGTATTGTGa > 2:376235/1‑271 (MQ=255) cTGATACGCCTGCTGCACGGTGCTGATACTGACGCCGTGCTCCTGACTTAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGTTCGGCAAGCAGAGTCGCCAGATGTTGATAACGCGTCATGCTGTATTCCTTATGTGGACCATACAGAGAGAAAAACCGGTACAGATGAGGCTAAAAAACCGGATGCAGATGCTGTTTTAACCTGTCTGTATGTTAAATAAAAGTAATATTTGAATCTGTATTGTGa < 1:376245/271‑1 (MQ=255) ccTGCTGCACGGTGCTGATACTGACGCCGTGCTCCTGACTTAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGTTCGGCAAGCAGAGTCGCCAGATGTTGATAACGCGTCATGCTGTATTCCTTATGTGGACCATACAGAGAGAAAAACCGGTACAGATGAGGCTAAAAAACCGGATGCAGATGCTGTTTTAAcc > 2:348878/1‑219 (MQ=255) ccTGCTGCACGGTGCTGATACTGACGCCGTGCTCCTGACTTAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGTTCGGCAAGCAGAGTCGCCAGATGTTGATAACGCGTCATGCTGTATTCCTTATGTGGACCATACAGAGAGAAAAACCGGTACAGATGAGGCTAAAAAACCGGATGCAGATGCTGTTTTAAcc < 1:348887/219‑1 (MQ=255) ctgcACGGTGCTGATACTGACGCCGTGCTCCTGACTTAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGTTCGGCAAGCAGAGTCGCCAGATGTTGATAACGCGTCATGCTGTATTCCTTATGTGGACCATACAGAGAGAAAAACCGGTACAGATGAGGCTAAAAAACCGGATGCAGATGCTGTTTTAACCTGTCTGTATGTTAAATAAAAGTAATATTTGAATCTGTATTGTGAACTGCCAGAAGGTGGATGATGAAGCCTCTGAAAGATgaggag < 1:224404/301‑1 (MQ=255) ctcactggTGCTGTTACTTGCTCCCTGCTCCTCACTTCCGCTGCGCTCCGCAGGCCATTTCTCCCCGGGAGGTTACGGCCCTTTCTCAATCCGTTCGGCAAGCAGAGTCGCCAGATGTTGATAACGCGTCATGCTTTATTCCTTATGTGGACCATACAGAGAGTAAAACCGGTACAGATGAGGCTAAACAACCGGATGCAGATGCTGTTTTAACCTGTCTGCATGTTAAATAAAAGTAATATTTGAATCTGTATTGTGAACTGCCAGAAGGTGGATGATGAAGCCTCTGAAAGATgaggag < 2:860601/295‑1 (MQ=255) gTGCTGATACTGACGCCGTGCTCCTGACTTAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGTTCGGCAAGCAGAGTCGCCAGATGTTGATAACGCGTCATGCTGTATTCCTTATGTGGACCATACAGAGAGAAAAACCGGTACAGATGAGGCTAAAAAACCGGATGCAGATGCTGTTTTAACCTGTCTGTATGTTAAATAAAAGTAATATTTGAATCTGTATTGTGAACTGCCAGAAGGTGGATGATGAAGCCTCTGAAAGATGAGGAGGTAGc < 1:356972/299‑1 (MQ=255) gTGCTGATACTGACGCCGTGCTCCTGACTTAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGTTCGGCAAGCAGAGTCGCCAGATGTTGATAACGCGTCATGCTGTATTCCTTATGTGGACCATACAGAGAGAAAAACCGGTACAGATGAGGCTAAAAAACCGGATGCAGATGCTGTTTTAACCTGTCTGTATGTTAAATAAAAGTAATATTTGAATCTGTATTGTGAACTGCCAGAAGGTGGATGATGAAGCCTCGGAAAGATGAGGAGGTAGc > 2:356963/1‑299 (MQ=255) gTGCTGATACTGACGCCGTGCTCCTGACTTAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGTTCGGCAAGCAGAGTCGCCAGATGTTGATAACGCGTCATGCTGTATTCCTTATGTGGACCATACAGAGAGAAAAACCGGTACAGATGAGGCTAAAAAACCGGATGCAGATGCTGTTTTAACCTGTCTGTATGTTAAATAAAAGTAATATTTGAATCTGTATTGTGAACTGCCAGAAGGGGGATGATGAAGCCTCTGAAAGATGAGGAGGTAGCaa > 2:172122/1‑300 (MQ=255) tACTGACGCCGTGCTCCTGACTTAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGTTCGGCAAGCAGAGTCGCCAGATGTTGATAACGCGTCATGCTGTATTCCTTATGTGGACCATACAGAGAGAAAAACCGGTACAGATGAGGCTAAAAAACCGGATGCAGATGCTGTTTTAACCTGTCTGTATGTTAAATAAAAGTAATATTTGAATCTGTATTGTGAACTGCCAGAAGGTGGATGATGAAGCCTCTGAAAGATGAGGAGGTAGCAGATGGAAt > 1:960384/1‑301 (MQ=255) ttAAGCGGCGCACTCAAGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACATCCCTTGCCTAATCCGTTCGGCAAGCAGAGTCGCCAGATGTTGATAACGCGTCATGCTGTATTCCTTATGTGGACCATACAGAGAGAAAAACCGGTACAGATGAGGCTAAAAAACCGGATGCAGATGCTGTTTTAACCTGTCTGTATGTTAAACAAAAGTAATATTTGAATCTGTATTGTGAACTGCCAGAAGGTGGATGATGAAGCCTCTGAAAGATGAGGAGTTAGCAGATGGAATTTCACGAAAACAGAGCTAAAg < 2:160150/301‑1 (MQ=255) tGCTCAATCCGTTCGGCAAGCAGAGTCGCCAGATGTTGATAACGCGTCATGCTGTATTCCTTATGTGGACCATACAGAGAGAAAAACCGGTACAGATGAGGCTAAAAAACCGGATGCAGATGCTGTTTTAACCTGTCTGTATGTTAAATAAAAGTAATATTTGAATCTGTATTGTGa < 2:703510/177‑1 (MQ=255) tGCTCAATCCGTTCGGCAAGCAGAGTCGCCAGATGTTGATAACGCGTCATGCTGTATTCCTTATGTGGACCATACAGAGAGAAAAACCGGTACAGATGAGGCTAAAAAACCGGATGCAGATGCTGTTTTAACCTGTCTGTATGTTAAATAAAAGTAATATTTGAATCTGTATTGTGa > 1:703530/1‑177 (MQ=255) tttGATAACGCGTCATGCTGTATTCCTTATGTGGACCATACAGAGAGAAAAACCGGTACAGATGAGGCTAAAAAACCGGATGCAGATGCTGTTTTAACCTGTCTGTATGTTAAATAAAAGTAATATTTGAATCTGTATTGTGAACTGCCAGAAGGTGGATGATGAAGCCTCTGAAAGATGAGGAGGTAGCAGATGGAATTTCACGAAAACAGAGCTAAAGCGCCGTTTATCGGCCTGGTGCAACTCTGGCAGGCGGTGAGGCGTTGGCGGCGGCAAATGCAGACCCGACGCGTGTTAcagc < 1:67154/300‑1 (MQ=255) aTGCTGTATTCCTTATGTGGACCATACAGAGAGAAAAACCGGTACAGATGAGGCTAAAAAACCGGATGCAGATGCTGTTTTAACCTGTCTGTATGTTAAATAAAAGTAATATTTGAATCTGTATTGTGAACTGCCAGAAGGTGGATGATGAAGCCTCTGAAAGATGAGGAGGTAGCAGATGGAATTTCACGAAAACAGAGCTAAAGCGCCGTTTATCGGCCTGGTGCAACTCTGGCAGGCGGTGAGGCGTTGGCGGCGGCAAATGCAGACCCGACGCGTGTTACAGCAGATGAGTGATGAg < 1:407565/301‑1 (MQ=255) tATGTGGACCATACAGAGAGAAAAACCGGTACAGATGAGGCTAAAAAACCGGATGCAGATGCTGTTTTAACCTGTCTGTATg < 2:720970/82‑1 (MQ=255) tATGTGGACCATACAGAGAGAAAAACCGGTACAGATGAGGCTAAAAAACCGGATGCAGATGCTGTTTTAACCTGTCTGTATg > 1:720990/1‑82 (MQ=255) | ATCCCACTGGGTAATTTCCACCGGGCGCTGCACCGGACGCGTCATCGGCGGTACTGGCGGCTGGGCTTTACGTTGT‑GCGACAAAATAACCCGAACGCGGCTGCGGAGTGATGAGCTTCATCGTCTCCAGCGTCTGATACGCCTGCTGCACGGTGCTGATACTGACGCCGTGCTCCTGACTTAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGTTCGGCAAGCAGAGTCGCCAGATGTTGATAACGCGTCATGCTGTATTCCTTATGTGGACCATACAGAGAGAAAAACCGGTACAGATGAGGCTAAAAAACCGGATGCAGATGCTGTTTTAACCTGTCTGTATGTTAAATAAAAGTAATATTTGAATCTGTATTGTGAACTGCCAGAAGGTGGATGATGAAGCCTCTGAAAGATGAGGAGGTAGCAGATGGAATTTCACGAAAACAGAGCTAAAGCGCCGTTTATCGGCCTGGTGCAACTCTGGCAGGCGGTGAGGCGTTGGCGGCGGCAAATGCAGACCCGACGCGTGTTACAGCAGATGAGTGATGAG > NC_000913/4571299‑4571873 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |