| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3032402 | 120 (1.030) | 3 (0.030) | 3/532 | NT | 2.5% | coding (1036/1449 nt) | uacT | uric acid permease |
| ? | NC_000913 | = 3032405 | 119 (1.050) | coding (1039/1449 nt) | uacT | uric acid permease | |||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
CGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGACTGCCGTGTTAATCATCGTGTTTATCGAGTCAATGGGGATGTTCCTGGCACTGGGTGAAATAGTCGGTCGTAAACTCTCTTCGCACGATATTATTCGCGGGCTGCGTGTCGATGGCGTAGGGACAATGATAGGCGGCACGTTTAACAGCTTCCCCCACACGTCATTTTCTCAAAACGTTGGCCTGGTTAGCGTGACGCGCGTTCATAGCCGCTGGGTGTGTATTTCTTCGGGAATTATATTAATCCTGTTTGG‑CATGGTGCCAAAAATGGCGGTGCTGGTAGCCTCCATTCCGCAATTTGTGCTGGGCGGCGCTGGTCTAGTGATGTTCGGCATGGTACTGGCGACAGGGATTCGAATTCTGTCGCGCTGTA‑ACTACACCACCAACCGTTACAACC‑TCTATATTGTGGCGATCAGTCTCGGCGTTGGCATGACTCCGACGCTCTCTCACGATTTCTTTTCTAAGTTACCGGCCGTACTGCAACCGCTGCTACATAGCGGCATTATGCT‑CGCAACCCTTAGCGCCGTTGTGCTGAACGTCTTCTTTAATGGCT > NC_000913/3032103‑3032699 | cGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGACTGCCGTGTTAATCATCGTGTTTATCGAGTCAATGGGGATGTTCCTGGCACTGGGTGAAATAGTCGGTCGTAAACTCGCTTCGCACGATATTATTCGCGGGCTGCGTGTCGATGGCGTAGGGACAATGATAGGCGGCACGTTTAACAGCTTCCCCCACACGTCATTTTCTAAAAACGTTGGCCTGGTTAGCGTGACGCGCGGTCATAGCCGCTGGGTGTGTATTTCTTCGGGAATTCTATGAATCCTGTTTGG‑CAt > 1:203901/1‑301 (MQ=255) ttttGGATTCCTTTTCCAGTGGGACCATGACTGGCGTTGTAATCATCGTGTTTAGCGAGTAAATGGGGATGTTCCTGGGTCTGGGTGAAATAGTCGGTCGTAAACTTTCTTCGGACGATATTATTCGCGGGCTGCGTGTCGATGGCGTAGGGACAATGATAGGCGGCACGTTTAACAGCGTCCCCCAAACGTCATTTTCTCAAAACGTTGGCCTGGTTAGCGTGACGCGCGTTCATAGCCGCTGGGTGTGTATTTCTTCGGGAATTATATTAATCCTGTTTGG‑CATGGTGCCAAAAATGGc < 2:109629/301‑1 (MQ=255) ccattctgctcagtcattctgtgtTAAGCACCGTGTTTATCGAGTCAATTGGGATGTTCCGGGCACTGGTTGAAATAGTCGGTCGTAAACTCTCTTCGCACGATATGATTCGCGGGCTGCGTGTCGATGGCGTAGGGACAATGATAGGCGGAACGCTTAACAGCTTCCCCCACACGTCATTTTCTCAAAACGTTGGCCTGGTTAGCGTGACGCGCGTTCATAGCCGCTGGGTGTGTATTTCTTCGGGAATTATATTAATCCTGTTTGG‑CATGGTGCCAAAAATGGCGGTGCTGGTAGCCTc < 2:418506/281‑1 (MQ=255) aTTCTGACCATGACTGCCGTGTTAATCATCGTGTTTATCGAGTCAATGGGGATGTTCCTGGCACTGGGTGAAATAGTCGGTCGTAAACTCTCTTCGCACGATATTATTCGCGGGCTGCGTGTCGATGGCGTAGGGACAATGATAGGCGGCACGTTTAACAGCTTCCCCCACCCGTCATTTTCTCAAAACGTTGGCCTGGTTAGCGTGACCCGCGTTCATAGCCGCCGGGTTTGTATTTCTTCGGGTATTATATTCTTCCTGTTTGG‑CATTGTGCCCAAAATTGGGGTGCTGGTAGCTTcc > 2:487509/1‑300 (MQ=255) tttaCCATGACTGCCGTGTTAATCATCGTGTTTTTCGAGTTAATGGGGATGTTCCGGGCACTGGGTGAAAGAGTCGGTCGTAAACTCTCTTCGCACGATATTATTCGCGGGCTGCGTGTCGATGGCGTAGGGACAATGATAGGCGGCACGTTTAACAGCTTCCCCCACACGTCATTTTCTCAAAACGTTGGCCTGGTTAGCGTGACGCGCGTTCATAGCCGCTGGGTGTGTATTTCTTCGGGAATTATATTAATCCTGTTTGG‑CATGGTGCCAAAAATGGCGGTGCTGGTAGCCTCCATTc < 2:770319/298‑1 (MQ=255) gACCATGACTGCCGTGTTAATCATCGTGTTTATCGAGTCAATGGGGATGTTCCTGGCACTGGGTGAAATAGTCGGTCGTAAACTCTCTTCGCACGATATTATTCGCGGGCTGCGTGTCGATGGCGTAGGGACAATGATAGGCGGCACGTTTAACAGCTTCCCCCACACGTCATTTTCTCAAAACGTTGGCCTGGTTAGCGTGACGCGCGTTCATAGCCGCTGGGCGTGTATTTCTTCGGGAATTATTTTAATCCTGTTTGG‑CATGGTGCCAAAAATGGCGTTGCTTGTAGCCTCCATTcg > 1:400685/1‑299 (MQ=255) gACCATGACTGCCGTGTTAATCATCGTGTTTATCGAGTCAATGGGGATGTTCCTGGCACTGGGTGAAATAGTCGGTCGTAAACTCTCTTCGCACGATATTATTCGCGGGCTGCGTGTCGATGGCGTAGGGACAATGATAGGCGGCACGTTTAACAGCTTCCCCCACACGTCATTTTCTCAAAACGTTGGCCTGGTTAGCGTGACGCGCGTGCATAGCCGCTGGGGGTGTATTTCTTCGGGAATTATATTAATCCTGTTTGG‑CATGGTGCCAAAAATGGCGGTGCTGGTacgccgcattcc > 2:476062/1‑289 (MQ=255) 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ggggATGTTCCTGGCACTGGGTGAAATAGTCGGTCGTAAACTCTCTTCGCACGATCTTATTCGCGGGCTGCGTGTCGATGGCGTAGGGACAATGATAGGCGGCACGTTTAACAGCTTCGCCCACACGTCATTTTCTCAAAACGTTGGCCTGGTTCGCGTAACGCTCGTTCATCCCCGCTGGGTGCTTCTTTCTTCGGGAATTATATTTATGCTGTTTGC‑AAGGGTGCCAACAATTGCGGTGCGGGTTGCCTAACTTCTGCAGTTTGTGCTGCGAGGCGCTGGGCtgtggagtttcggcgtg > 2:287101/1‑285 (MQ=255) ggATGTTCCTGGCACTGGGTGAAATAGTCGGTCGTAAACTCTCTTCGCACGATATTATTCGCGGGCTGCGTGTCGATGGCGTAGGGACAATGATAGGCGGCACGTTTAACAGCTTCCCCCACACGTCATTTTCTCAAAACGTTGGCCTGGTTAGCGTGACGCGCGTTCATAGCCGCTGGGTGTGTATTTCTTCGGGAATTATATTAATCCTGTTTGG‑CA > 2:855540‑M1/1‑219 (MQ=255) gTTCCTGGCACTGGGTGAAATAGTCGGTCGTAAACTCTCTTCGCACGGTATGATTCGCGTGATGAGGGTCGAGGGCGTAGGGACAATGATAGGCGGGGCGTTTAACAGGTTCCACCACACGCCCGTTTCTCAAAACGTTGGCCTGGTTAGCGGGAGTCTCGATGCTAGGCGCTAGGTGTTTATGTCTCTGGGACTTGTATTAATCCTTCGTGG‑CCATGTGCCAAAAATGCCGGTGCTGGTCGACTCCATTCCGGAGTTTGGGCTGTGCGTCCCTGATCCAGTGATGTTGGGAATTGtgtgt > 2:978100/1‑297 (MQ=255) 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ttGT‑CATGGTGCCAAAAATGGCGGTGTGGGTAGCCTCCATTCCGCAATTTGTGCTGGGCGGCGCTGGTCTAGTGATGTTCGGCATGGTACTGGCGACAGGGATTCGAATTCTGTCGCGCTGTA‑ACTACACCACCAACCGTTACAACC‑TCTATATTGTGGCGATCAGTCTCGGCGTTGGCATGACTCCGACGCTCTCTCACGATTTCTTTTCTAAGTTACCGGCCGTACTGCAACCGCTGCTACATAGCGGCATTATGCT‑CGCAACCCTTAGCGCCGTTGTGCTGAACGTCTTCTTTAATgg < 1:15732/301‑1 (MQ=255) | CGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGACTGCCGTGTTAATCATCGTGTTTATCGAGTCAATGGGGATGTTCCTGGCACTGGGTGAAATAGTCGGTCGTAAACTCTCTTCGCACGATATTATTCGCGGGCTGCGTGTCGATGGCGTAGGGACAATGATAGGCGGCACGTTTAACAGCTTCCCCCACACGTCATTTTCTCAAAACGTTGGCCTGGTTAGCGTGACGCGCGTTCATAGCCGCTGGGTGTGTATTTCTTCGGGAATTATATTAATCCTGTTTGG‑CATGGTGCCAAAAATGGCGGTGCTGGTAGCCTCCATTCCGCAATTTGTGCTGGGCGGCGCTGGTCTAGTGATGTTCGGCATGGTACTGGCGACAGGGATTCGAATTCTGTCGCGCTGTA‑ACTACACCACCAACCGTTACAACC‑TCTATATTGTGGCGATCAGTCTCGGCGTTGGCATGACTCCGACGCTCTCTCACGATTTCTTTTCTAAGTTACCGGCCGTACTGCAACCGCTGCTACATAGCGGCATTATGCT‑CGCAACCCTTAGCGCCGTTGTGCTGAACGTCTTCTTTAATGGCT > NC_000913/3032103‑3032699 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |