| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ? | NC_000913 | 915493 = | 272 (1.210) | coding (555/696 nt) | aqpZ | aquaporin Z | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 277 total aligned reads displayed.
GTGCAGGGGGCGGCGGCGATTGGCCGCCCCCTGCGCGCTCCTTGCGCCAGTGGCAATATGTTGCTTAGCTCATGAAAGGAGCGCAACAAGATGATGAATCAACATATAACAACATCTTAAAAAAAGGCCTGACATTACGCCAGGCCTTCTGCGTTAATTAATCACGCTTTTCCAGCAGGGTCCGGTAAATCAGACCACCGATAATGCCGCCGACA‑ATTGGCACCACCCAGAAGAACCACAGTTGTTCTAATGCCCAGCCGCCCTGGAAGATAGCAACCGCGGTGCTGCGCGCCGGGTTAACAGAAGTGTTAGTCACCGGAATACTAATTAAGTGAATCAGGGTTAAGGCCAGAC‑CAATAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACAGGAAACCTGCACTCAATACCAGTTCAACTACCAGCGCGGAAAGCATGGAATAACCGCCTGGTGAATGCTCGCCATAACCGTTAGAAGCAAAACCGCTGGCTGCCGCGTCAAAACCCGTTTTACCACTGGCAATTAAATACAGCAGCGCCGCTGCAACAATACCGCCGACAACCTGGGCAA > NC_000913/915195‑915791 | gttcAGGGGGGGGGCGCGATTGGCCGCCCCCTGCGCGATCCTTGCGCCAGTGGCAAAATGTTGCTTAGCACATGAAAGGGGCGAAACAAGATGATGAATCAACATATAACAACATCTTAAAAAAAGGCCTGACATTACGCCAGGCCTTCTGCGTTAATTAATCACGCTTTTCCAGCAGGGTCCGGTAAATCAGACCACCGATAATGCCGCCGACA‑ATTGGCACCACCCAGAAGAACCACAGTTGTTCTAATGCCCAGCCGCCCTGGAAGATAGCAACCGCGGTGCTGCGCGCCGGGTTAAc < 1:768294/298‑1 (MQ=255) 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gtagctgacgccCCCTGCGCGCCCATGTCGCTATGGGTAACATGGTGCATCTCTAAGGAAAGGCGCGAAACAAGATGAATAATCAACATATAACAACATCGTAAAAAAAGGCCTGACATTACGCAAGGCCTTCGTCGTTAATTAATCACGCTTTTCCAGCAGGCTCCGGTAAATCAGACCACCGATAATGCCGCCGACA‑ATTGGCAACACCCAGAAGACCCACAGTTGTTCTAATGCCCAGCCGCCCTGGAAGATAGCAACCGCGGTGCTGCGCGCCGGGTTAACAGAAGTGTTAGTCAcc < 1:1252686/293‑1 (MQ=255) gccgccCCCTGCGCGCTCCTTGCGCCAGTGGCAATATGTTGCTTAGCTCATGAAAGGAGCGCAACAAGATGATGAATCAACATATAACAACATCTTAAAAAAAGGCCTGACATTACGCCAGGCCTTCTTCGTTAATTAATCACGCTTTTCCAGCAGGGTCCGGTAAATCAGACCACCGATAATGCCGCCGACA‑ATTGGCACCCCCCAGCAGAACCACAGTTGTTCTAATGCCCCACCGCCCTGGAAGATCGCAACCGCGGTGCTGCGCGCCGGGTTACCAGACGTGTTAGTTCCCGGCAtc > 2:1367430/1‑300 (MQ=255) ccTGCGCGCTCCTTGCGCCAGTGGCAATATGTTGCTTAGCTCATGAAAGGAGCGCAACAAGATGATGAATCAACATATAACAACATCTTAAAAAAAGGCCTGACATTACGCCAGGCCTTCTGCGTTAATTAATCACGCTTTTCCAGCAGGGTCCGGTAAATCAGACCACCGATAATGCCGCCGACA‑ATTGGCACCACCCAGAAGAACCACAGTTGTTCTAATGCCCAGCCGCCCTGGAAGATAGCAACCGCGGGGCTGCGCGCCGGGTGAACAGAAGTGTTAGTCACCGGAATACTAAta > 1:355544/1‑299 (MQ=255) 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tgcGCGCCGGGTTAACAGAAGTGTTAGTCACCGGAATACTAATTAAGTGAATCAGGGTTAAGGCCAGAC‑CAATAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACAGGAAACCTGCACTCAATACCAGTTCAACTACCAGCGCGGAAAGCATGGAATAACCGCCTGGTGAATGCGCGCCATAACCGTTAGAAGCAAAACCGCTGGATGCCGCGTCAAAACCCGGTTTACCACTGGCAATTAAAAACAGCAGCACCGCGGCAACAATACCGCCCAc > 1:1604014/1‑301 (MQ=255) cccGGTTAAACAAAAGGGTAAGGCACCGGAATACTAATAAAGTACACCAGGGTTAAGGCCAGAC‑CAGTGGCGATCGGAGCAAAACCGCCCGGGGGAAATTGGTGGGTTGCCCCGTGGATCCCCAAAAGGAAACCTGCACTCAATACCAGTTCAACTACCAGCGCGGAAAGCATGGAATAACCGCCTGGTTAATGCTCGCCATAACCGTTAGAAGCAAAACCGCTGGCTGCCGCGTCAAAACCCGTTTTACCACTGGCAATTAAATACAGCAGCGCCGCTGCAACAATACCGCCGACAACCt < 1:1973709/300‑1 (MQ=255) ggTTAACAGAAGTGTTAGTCACCGGAATACTAATTAAGTGAATCAGGGTTAAGGCCAGAC‑CAATAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACAGGAAACCTGCACTCAATACCAGTTCAACTACCAACGCGGAAAGCATGGAATAACCGCCTGGTGAATGCTCGCCATAACCGTTAGAAGCAAAACCGCTGGCTGCCGCGTCAAAACCCGTTTTACCACTGGCAATTAAATACAGCAGCGCCGCTGCAACAATACCGCCGACAACCTGGGc < 2:1178428/301‑1 (MQ=255) | GTGCAGGGGGCGGCGGCGATTGGCCGCCCCCTGCGCGCTCCTTGCGCCAGTGGCAATATGTTGCTTAGCTCATGAAAGGAGCGCAACAAGATGATGAATCAACATATAACAACATCTTAAAAAAAGGCCTGACATTACGCCAGGCCTTCTGCGTTAATTAATCACGCTTTTCCAGCAGGGTCCGGTAAATCAGACCACCGATAATGCCGCCGACA‑ATTGGCACCACCCAGAAGAACCACAGTTGTTCTAATGCCCAGCCGCCCTGGAAGATAGCAACCGCGGTGCTGCGCGCCGGGTTAACAGAAGTGTTAGTCACCGGAATACTAATTAAGTGAATCAGGGTTAAGGCCAGAC‑CAATAGCGATCGGCGCAAAACCTGCCGGCGCGAATTTGTCGGTTGCGCCGTGGATCACCAACAGGAAACCTGCACTCAATACCAGTTCAACTACCAGCGCGGAAAGCATGGAATAACCGCCTGGTGAATGCTCGCCATAACCGTTAGAAGCAAAACCGCTGGCTGCCGCGTCAAAACCCGTTTTACCACTGGCAATTAAATACAGCAGCGCCGCTGCAACAATACCGCCGACAACCTGGGCAA > NC_000913/915195‑915791 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |