| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2900306 = | 273 (1.190) | 9 (0.040) | 9/548 | 25.4 | 3.4% | intergenic (‑33/‑286) | ygcW/yqcE | putative SDR family oxidoreductase/putative MFS transporter, inner membrane protein |
| ? | NC_000913 | 2900346 = | 253 (1.170) | intergenic (‑73/‑246) | ygcW/yqcE | putative SDR family oxidoreductase/putative MFS transporter, inner membrane protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 266 total aligned reads displayed.
GGTGATACCCACCTGCATGAAGTCCACCTCAACACCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGG‑C‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGTGTGATATTCGTATTGTCAAATAATTTTAAAAAGCAGAAGCGTGATTACTCTCACACAACACCTCTGCTTTCCATGTTATTTATTATTTCAATTACTAGAGACCTGAGAAAAGTAATCCACCTGAAAGGGCGGCTTACTTTTCTC‑TTTTTTTTGTCTATTACAAATGGGAATACGATATGCAACACAACTCATATCGCCGTTGGATAACCCTCGCGATAATTAGTTT > NC_000913/2900046‑2900641 | gcagaccACCTGCCTAAAGTCTACCACCACACCGTGTTTGTCAATACGTACCGTATTCGCTGCGTTATCTTGGACCAAATTAGGAAAACAGGTATTTGCGCCGGCCTTGGACAACGCCATGACAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTAACTTTCAGAGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGG‑C‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCAt < 1:1782517/295‑1 (MQ=255) aCCCACCTGCATGAAGTCCACCTCAACACCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGG‑C‑AAAAAAAAAGACAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTAtt > 2:1437634/1‑300 (MQ=255) cACCTGCATTAAGTCCACCCCAACACCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTTTCTTTGACAAAACATGGAATAAAGATATTTGCGCAAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTGAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGG‑C‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATctct < 1:889127/301‑1 (MQ=255) ccTGCATGAAGTCCACCTCAACACCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGG‑C‑AAAAAAAAAGAAAGGAAATTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACATTTCTCATTATCTCggg > 1:120720/1‑301 (MQ=255) gCATCAAGCCCACCTCACCTCCTTGTTTTTCCATCTTTTCCCTTGTTTTCCCTGTTTTTTGGACGAAACTAGGAATCAAAATATTTGCGCCAGCTTGGGCCAACGTCATGGCAAAGGCCGGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCCTTGAGAACGCATTGAGAGATTCAATTGACATAGTTATCTCCAATTTCCGTAAGG‑CAAAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTgg < 1:1814411/299‑1 (MQ=255) gTCCACCTCAACACCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGTTTCTATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGG‑A‑AAAAAAAAAGAAAGGTAATTTCCCCTCCGATAGGGAATCTACCTTCCTAATATTCTCTGTTAACTggtg > 1:428229/1‑298 (MQ=255) gTCCACCTCAACACCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGG‑C‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCACCCAACGTAGGGAAGGAACCTTTCTAATTAACCCTGGAAAATGgaa > 1:396888/1‑299 (MQ=255) gTCCACCTCAACACCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTAAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGG‑C‑AAAAAAAAAGAAAGGAAACTTCCCCACCGAAAGGGAAGTTACCTTTCACATTaacccgggaaaagggaa > 1:1039248/1‑284 (MQ=255) ccACCTCAACCCCCTGTTTTGCAATCATTTTCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGAAGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCATCCTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGG‑C‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGAt < 2:922808/300‑1 (MQ=255) ccACCTCAACACCCTGTTTTTCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTTCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGG‑A‑AAAAAAAAAGAAAGGTAATTTCCCCCGTGGGAGGGAAGGTACCTTTACTATTATTTCTGGTATCTGGAGAt > 1:853384/1‑300 (MQ=255) ccACCCTAACACCCTGTTTTTTAATCCTTTCCTTTGTTTCTCCGTTAGCTTTGACAAAACTATGAAGAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAAGTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATGGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGG‑C‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGAt < 1:2018385/300‑1 (MQ=255) cacacacCCTTGTTTTTATTCATTTTCTTTTTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGG‑C‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAAtttt < 1:1415028/298‑1 (MQ=255) ccccccgtttttttCAATTATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTTACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCAGGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGG‑C‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTa < 1:314808/292‑1 (MQ=255) ttttCAATCATGTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTGGACGAAACTAGGAATAAAGATATCTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTATACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGG‑C‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAggg < 2:158657/300‑1 (MQ=255) tttCAATCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGG‑C‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGc < 2:120753/300‑1 (MQ=255) tacctttCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACCAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTAGTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGG‑C‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAg < 1:458742/282‑1 (MQ=255) aTCATTTCCTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATGGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCACAAATTTCCGTAAGG‑C‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCAGGAAATTGGAGAGAATTTTTAg > 2:458859/1‑286 (MQ=255) tctgtGTTTCGCCGTTATCTATGAAGAAACTAGTAAGAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTAGTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGG‑C‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAAt < 1:1437248/296‑1 (MQ=255) ccTTTGTTTCGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCGTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGG‑C‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAAt < 2:1920896/300‑1 (MQ=255) ttagCCGTTATCGTTGACGAAACTAGGAAAAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGG‑C‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTCTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCg < 2:428331/297‑1 (MQ=255) cGCCGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGG‑C‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGAt < 1:1751784/261‑1 (MQ=255) ccGTTATCTTTGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGG‑C‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTATGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATc > 2:298271/1‑301 (MQ=255) tttGACGAAACTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGTTTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGG‑C‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAgtgt < 2:968956/300‑1 (MQ=255) tttacaaaaCTATGAAATAAGATATTTGCGCCACCTTTGCCCAACACAAGGAAAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAATTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGG‑C‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCCCCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCATAAGGGCATAACTGCTAATGTGATCGTAATCACAGtgtg < 1:982288/294‑1 (MQ=255) aaCTAGGAATAAAGATATTTGCGCCAGCTTTGGCCAACGCCATGGCAAATGCCTGGCCTAAACCGCTATTCCCACCGGTAACAGTTGCGGTTTTACCTTTCAGGGAGAAAAAATCCATTGAGAACGCATTGAGAGATTCGATTGACATAGTTAGCTCCAATTTCCGTAAGG‑C‑AAAAAAAAAGAAAGGTAACTTCACCCGCGAGAGGGAAGTTACCTTTCTCATTATCTCTGGTAACTGGAGATAATTTTTAGCAAAAGGGAATAACTGTAAATGACACCGTAACCACAGTGTGATATTCGt > 1:1013352/1‑301 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |