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ctACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCA‑CACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCCCCGCGCTACGGCCGCCAGGCAAATTCTGTTTTATCAGACCGCTTCTGCGTTCTGATTTAATCTGTATCAGGCTTAAAATCTTCTCTCATCCGCCAACACTGCTTCGGCGTTGTACGGTTACGCCTC‑ACGGTTCATTAGTCCCGGTTACCTCCACCCATcccctccctt > 1:1321438/1‑292 (MQ=14) ctACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCA‑CACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCAGGCAAATTCTGTTTTATCAGACCGCTTCTGCGTTCTGATTTAATCTGTATCAGGCTGAAAATCTTCTCTCATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTACGGTTAAGCCTC‑ACGGTTCATTAGTCCCGGTTAGCTCACCGCATCTCTGCGCtt > 2:1368659/1‑301 (MQ=255) ctACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCA‑CACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCAGGCAAATTCTGTTTTATCAGACCGCTTCTGCGTTCTGATTTAATCTGTATCAGGCTGAAAATCTTCTCTCATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTC‑CCGGTTCATTCGTACCGGTTAGCTCAACGc > 2:503298/1‑289 (MQ=255) ctACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCA‑CACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCAGGCAAATTCTGTTTTATCAGACCGCTTCTGCGTTCTGATTTAATCTGTATCAGGCTGAAAATCTTCTCTCATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTA‑ACGGTTCATTAGTACCGGTTAGCTCAACGCATCGCTGCGCtt > 2:311462/1‑301 (MQ=40) ctACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCA‑CACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCAGGCAAATTCGGTTTTATCAGACCGCTTCTGCGTTCTGATTTAATCTGGATCAGTCTGAACATATTCTATCATCCGCCAAAACAGCTTCGGCATTGTAAGGTTAAGCCTC‑CCGGGTCATTAGTACCGGGTAACACAACGCCTAGCTGCGCtt > 2:456234/1‑301 (MQ=14) ccAACGGAGCCATATCAGCACGCTAAATTGGATGCCTGGCAGTGCACTACTCTCGCATGGGGAGACCCCA‑CACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCAGGCAAATTCTGTTTTATCAGACCGCTTCTGCTTTCTGATTTAATCTGTATCAGGCTGAAAATCTTCTCTCATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTC‑ACGGTTCATTAGTACCGGTTAGCTCAACGCATCGCTGCGCTTaca < 2:60623/301‑1 (MQ=255) tcTGAGCTAGATCATGACGCTAAATTTGAGGCCTGGCAGTTCCCCACTCCCGGAGGGGGAGACCCCA‑CCCTCCCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCAGGCAAATTCTGTTTTATCAGACCGCTTCTGCGTTCTGATTTAATCTGTATCAGGCTGAAAATCTTCTCTCATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTC‑ACGGTTCATTAGTACCGGTTAGCTCAACGCATCGCTGCGCTTacacac < 1:40756/300‑1 (MQ=11) tatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCA‑CACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCCCTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCAGGCACCTTCTGTTTTATCAGACCGCTTCTGCGTTCTGCTTTAATCTGTATCAGGCTGAAAATCTTCTCTCATCCGCCAAAACAGCTTCGCCGTTTTAAGGTTACGCCTC‑ACGGTTCATTAGTCCCTGTTAGCTCAACGCCTCGCTGCGCTTacacccacgtcccca > 1:1013992/1‑290 (MQ=11) tatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCA‑CACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCAGGCAAATTCTGTTTTATCAGACCGCTTCTGCGTTCTGATTTAATCTGTATCAGGCTGAAAATCTTCTCTCCTCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTCATCCTC‑ACGGTTCATTAGTCCCGTTTACCTCAACGCATCGCTTCCCTTACCCACCCGGCCt > 1:1356857/1‑299 (MQ=255) aaGCACGCTAAAGGTGATGCCGGCCAGTTCCCTAAGCTCGAAGGGGGAGACCCCA‑CACGACCATCTGCGGTAAGGCGTTTAACTTCTGAGTTCGGTATGGGGTAAGGTGGGACCTCCGAGCTACGGCCGCCAGGCAAAGTCTGTTGTATCAGACCGCGTCTGCGTTCTGATTTAATCTGTATCAGGCTGAAAATCTTCTCTCATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCGC‑ACGGTTCATTAGTACCGGTTAGCTCAACGCATCGCTGCGCTAACACACCCGGCCTATCaa < 2:1009243/300‑1 (MQ=11) cgCACGCTCAAATGGAGGCCTGGCAGTCACCTCCCCCCGCATGGGGAGCCCCCA‑CACGACCAGCGGTGTGACGGCGGTTCCCTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACGCCCGCTCTACGGCCGCCAGTCCAATTCTGTTCTATCAGACCGTTTCTGCGGTCTGATTTAATCTGTATCAGGCTGAAAATCTTCTCTCATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTC‑ACGGTTCAGTAGTACCGGTTAGCTCAACGCATCGCTGCGCTTACACACCCGGCCTATCAAc < 1:1158816/300‑1 (MQ=11) cGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCA‑CACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCAGGCAAATTCTGTTTTATCAGACCGCTTCTGCGTTCTGATTTAATc < 1:1204240/172‑1 (MQ=32) cGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCA‑CACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCAGGCAAATTCTGTTTTATCAGACCGCTTCTGCGTTCTGATTTAATCTGTATCAGGCTGAAAATCTTCTCTCATCCTCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTACGGTTAAGCCTC‑ACGGTTCATTAGTACCGGTTAGCTCAACGCATCGCTgcgc > 2:150539/1‑276 (MQ=14) cGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCA‑CACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGAATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCAGGCAAATTCTGTTTTATCAGACCGCTTCTGCGTTCTGATTTAATc > 2:1204269/1‑172 (MQ=17) | CCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTG‑CCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACT‑GGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCA‑CACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCAGGCAAATTCTGTTTTATCAGACCGCTTCTGCGTTCTGATTTAATCTGTATCAGGCTGAAAATCTTCTCTCATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTC‑ACGGTTCATTAGTACCGGTTAGCTCAACGCATCGCTGCGCTTACACACCCGGCCTATCAAC > NC_000913/3423522‑3423953 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |