| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,064,037 | 1 | .→T | 2.7% | 2.2 0.0 ‑0.3 | 74 | coding (259/693 nt) | ompL | outer membrane porin L; putative sulpholipid porin |
| Rejected: Polymorphism does not pass frequency cutoff. | ||||||||||
| Rejected: Polymorphism prediction not supported by minimum number of reads on both strands. | ||||||||||
| Rejected: Polymorphic indel expands or contracts a homopolymer stretch. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (1/1): ref base (36/36): total (37/37) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 4.64e-01 | ||||||||||
GATCTTTCCCGTTGCTACTATTAAAGTCATTCACTCGCATGAAGTAATGTGGCTCAAATGTATAGGAAAATTTATCGGTGATTTTAAAATTCCAGTAGGTGCCAATTTCATAGGTGTCATTATTATCCAGTTCCCCGCTCAAATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCATAACCTCGCCCTGATCGGAGGCAAGATTATATGCCTCCCTGTTTTCGACGTATGCGCCAGCAAATACCGAGGCAGAGGTCAGAGAAGATAATAAAATTATTGCATTAATCTTTTTCATAATAAGTCCATTTTTTAAACGTAGGGAG > NC_000913/4063749‑4064323 | gatCTTTCCCGTTGCTACTATTAAAGTCATTCACTCGCATGAAGTAATGTGGCTCAAATGTATAGGAAAATTTATCGGTGGTTTTAAAATTCCAGTAGGTGACAATTTCATAGGTGTCATTAGTATCCAGTTACCCGCTCAAATCTGTTGAACTGTAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCAAGATACACTGCACCACCCGACCCGTTACTATTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTCTCggttgg > 2:36091/1‑301 (MQ=255) atCTTTCCCGTTGCTACTATTAAAGTCATTCACTCGCATGAAGTAATGTGGCTCAAATGTATAGGAAAATTTATCGGTGATTTTAAAATTCCAGTAGGTGCCAATTTCATAGGTGTCATTATTATCCAGTTCCCCGCTCAAATCTGTTGACCTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCACCCGGGCTTGATTGTTAC‑TTTATCggttggt > 2:52513/1‑301 (MQ=255) tCTTTCCCGTTGCTACTATTAAAGTCATTCACTCGCATGAAGTAATGTGGCTCAAATGTATAGGAAAATTTATCGGTGATTTTAAAATTCCAGTAGGTGCCAATTTCATAGGTGTCATTATTATCCAGTTCCCCGCTCAAATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGCTTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTTCACCACCCGAACCGATCCTCTTATCATTAATTAAGCAACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCggttggtt > 1:284673/1‑301 (MQ=255) ctactaCTAAAGTCATTCACTCGCATGAATTAATGTGGCTCAAATGTGTAGGAAAATTTATCGGTGATTTTAAAATTCCAGTAGGTGCCAATTTCATAGGTGTCATTATTATCCAGTTCCCCGCTCAAATCTGTTGAACTATAGTTATTATGTTTATAGCGATTTCGTAATGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATGTTTGACGTCAAGATACATTGCACCCCCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCCGGATGGTTAA‑TTCATCGGTGGGTTTAAATAACGGAt > 2:99191/1‑301 (MQ=255) ctaTTAAAGTCATTCACTCGCATGAAGTAATGTTGCTCAAATGTATAGGAAAATTTATCGGTGATTTTAAAATTCCAGTAGGTGCCAATTTCATAGGTGTCATTATTATCCATTTCCCCGCTCAAATCTGTTGAACTCTAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACACATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAC‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACTGATAc > 2:95463/1‑300 (MQ=255) ctaTTAAAGTCATTCACTCGCATGAAGTAATGTGGCTCAAATGTATAGGAAAATTTATCGGTGATTTTAAAATTCCAGTAGGTGCCAATTTCATAGGTGTCATTATTATCCAGTTCCCCGCTCAAATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGCCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATACCGGATAc > 1:116496/1‑300 (MQ=255) taTTAAAGTCATTCACTCGCATGAAGTAATGTGGCTCAGATGTATAGGAAAATTTATCGGTGATTTTAAAATTCCCGTAGGTGCCAATTTCATAGGTGTCATTATTATCCAGTTCCCCGCTCAAATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTGTAGCGATTTCGTACTGTCAGATTACACCATTGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTCGACGGTTCA‑TTTATCGTTTGGTTTACATACAGGTTAcc > 2:125871/1‑300 (MQ=255) tCAGTCAATCGCATGAAGTAATGTGGCTCAAATGTATAGGAAAATTTATCGGTGATGTTAAAATGCCAGTAGGTGCCAATTTCATAGGTGTCATTATTATCCAGTTCCCCGCTCAAATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTc < 2:110834/299‑1 (MQ=255) cATTCACTTGCATGAAGTAATGTGGCTTAAAGGTATAGGAAAATTTATCGGTGATTTTAAAATTCCAGTAGGTGCCAATTTCATAGGTGTCATTATTATCCAGTTCCCCGCTCAAATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAAt < 2:333433/301‑1 (MQ=255) gCATGAAGTAATGTGGCTCAAATGTATAGGAAAATTTATCGGTGATTTTAAAATTCCAGTAGGTGCCAATTTCATAGGTGTCATTATTATCCAGTTCCCCGCTCAAATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTtatt > 2:294084/1‑300 (MQ=255) aaGTAATGTGGCTCAAATGGATAGGAAAATTTATCGGTGATTTTAAAATTCCAGTAGGTGCCAATTTCATAGGTGTCATTATTATCCAGTTCCCCGCTCAAATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCCTTAATTAAGACACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGGTTAAATAACGGATACCACCCTTCACTTTCGTTATATCCAt > 2:24311/1‑301 (MQ=255) gTAATGTGGCTCAAATGTATAGGAAAATTTATAGGTGATTTTAAAATTCCAGTAGGTGCCAATTTCATAGGTGTCATTATTATCCAGTTCCCCGCTCAAATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCTGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGTTTGGTTTAAATAACGGATACTAGCCTCCAATTTCGTTATTTCCATGt > 1:253181/1‑301 (MQ=255) gCTCAAAGGTATATGAAAATTTATCGGTGATTTGAAAATTCCAGTAGGTGCCAATTTCATAGGTGTCATTATTATCCAGTTCCCCGCTCAAATCTGTTGAACTAGAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGtt < 1:36091/300‑1 (MQ=255) ggAAAATTTATCGGTGATTTTAAAATTCCAGTAGGTGCCAATTTCATAGGTGTCATTATTATCCAGTTCCCCGCTCAAATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATATTATCGCtta > 2:402929/1‑299 (MQ=255) tggTGATTTTAAAATTCCAGTAGGTGCCAATTTCATAGGTGTCATTATTATCCAGTTCACCGCTCAAATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGt < 1:52513/300‑1 (MQ=255) cgttGATTTTAAAATTCCAGTAGGTGCCAATTTCATAGGTGTCATTATTATCCAGTTCCCCGCTCAAATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGAGTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGt < 2:345398/298‑1 (MQ=255) ggTGATTTTAAAATTCCAGTAGGTGCCAATTTAATAGGTGTCATTATTATCCAGTTCCCCGCTCAAATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGt < 1:95463/300‑1 (MQ=255) tttAAAATTCCAGTAGGTGCTAATTTCAGAGGTGGCATTATTATCCAGTTCCCCGCTCAAATCTGTTGAACTATAGTTATTATTGTTATAGCGAGTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGtt < 1:125870/301‑1 (MQ=255) tttAAAATTACAGTTGGGGCCAATTTCATAGGTGTCATTATTATCCAGTTCCCCGCTCAAATCTGGTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGtt < 1:154555/301‑1 (MQ=255) aaTGCCAGTAGGTGCCAATTTCATAGTTGTCATTATTATGCAGTTCCCCGCTCAAATATGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACat < 2:284679/301‑1 (MQ=255) ttCCAGTAGGTGCCAATTTCATAGGTGTCATTATTATCCAGTTCCCCGCTCAAATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACatat > 1:26364/1‑300 (MQ=255) tAGGTGCTAATTGCATAGGTGTCATTATTATCCAGTTCCCCGCTCAAATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCTAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATTGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATAc < 2:117773/298‑1 (MQ=255) tAGGTGCCAATTTCATAGGTGTCATTATTATCCAGGTCCCCGCTCAAATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCTATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATAcc < 2:116496/299‑1 (MQ=255) tGCCAATTTCATAGGTGTCATTATTATCCAGTTCCCCGCTCAAATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGcc < 2:26364/301‑1 (MQ=255) tttCATAGGTGTCATTATTATCCAGTTCCCCGCTCAAATCTGTTGAACTATCGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTCTCATTAATTACGCCACCGGGCTGGACGGTTAA‑TGTATCGGTTGGTTTGAATAACGGATACCAGCCTGCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGACAGTTGTAGGTCTTGGTTAATTTTATACCCTGGCCCatata > 1:248902/1‑300 (MQ=255) aagagaaagttattaTCCAGGTCCCCGCTCAAATCAGTTGAACTATAGTTAGTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTACGTCACCCGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGTCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGt < 2:330855/292‑1 (MQ=255) gtttCATTATTATCCAGTTCCCCGCTCAAATCTGTTGAACTATAGTGATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATAc < 2:324546/277‑1 (MQ=255) gtgtCATTATTATCCAGTTCCCCGCTCAAATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAGAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAATttca > 2:258647/1‑299 (MQ=255) gtgtCATTATTATCCAGTTCCCCGCTCAAATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCAATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATAc > 1:324538/1‑280 (MQ=255) ttattaTCCAGTTCCCCGCTCAAATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAATCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTTAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATCCCCGCTCCCATTTCGCAGt > 1:330847/1‑292 (MQ=255) ttattaTCCAGTTCCCCGCTCAAATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTCAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTGCAATTTAGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAAAat > 2:219747/1‑269 (MQ=255) ttattaTCCAGTTCCCCGCTCAAATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAATTTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGAGCCCATATCGAAGTTATAAcc > 2:263879/1‑300 (MQ=255) ttattaTCCAGTTCCCCGCTCAAATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCACTTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCca > 1:174178/1‑301 (MQ=255) atCCAGTTCCCCGCTCAAATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCAATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCCTCTCGAAGTTTTAAACCACCCGt > 1:366500/1‑301 (MQ=255) tttCCCCACTCAAATCTGTTTAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGGACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTGGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAATTTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCa < 1:263874/300‑1 (MQ=255) tgtctaagagtcagggtGAACTATAGTTATGATGGTTAAAGCTATATCTCACTGTCAGAGTAAACCATTGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCATCCGAACCGATACTCCTATCATTAATTAAGCCACCTGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGTGTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAACTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTATGTTTTGGTTATCATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCATAAc < 2:375776/285‑1 (MQ=255) ccccTCTTAAATCTGTTGAACTATCTGTATTATTGTTATAGCGATTTCGTAATGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTGATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCATAAc < 1:99191/301‑1 (MQ=255) ctgacaaaaTCTGTTGAACTAGAGTTATTATGGTTATAGCGATGTCGTACTGTCAGATTAAACTATGGTACAAATTTATAGGTGACGTCCATATAAACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATAATGAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCATTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCATAACCt < 2:400716/295‑1 (MQ=255) ccgagcAAATCTTGTGAACTATAGTTATTATGGTGATAGCTATTTCGTACTGTCAGAGTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCAGTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGGTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAAGTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCATAACCt < 2:174179/296‑1 (MQ=255) gCTCAAATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCCATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCTCGCCCATATCGCAGTTATACCCCACACTTAGCCTAACCTc > 2:1306/1‑300 (MQ=255) cTGTTTAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCATAACCt < 1:249514/291‑1 (MQ=255) cTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAAGTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACAGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACACGCGCCCATATCGAAGTTATAACCAACACGTAGCATAACCt > 2:249519/1‑291 (MQ=255) gTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCACCTACCATATCGACGTTATAACCCAAAAGTACCATACCCttcctcttatcca > 1:375767/1‑289 (MQ=255) cTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTACTTAAGCCACCGGGCTGGCTGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATCACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATCTCCATGTTTTCGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTCGGTATCGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCCCACGTAGCATAACCTCGCCCTGATCGGAGCCaa > 1:296956/1‑301 (MQ=255) tgtgctcggagagtgggataagagacaggATTAAACCATGGTACAAAATTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGAAGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCATAACCTCGCCCTGATCGGAGGCAAGATTatat < 2:216335/272‑1 (MQ=255) tatGGTTATGGTGATTTCGTACAGTCAGATTAAATCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTTGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAATGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCATAACCTCGCCCTGATCGGAGGCAAGATTATATGc < 2:253186/301‑1 (MQ=255) tatGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCATAACCTCGCCCTGATCGGAGGCAAGATTATATGc < 1:258642/301‑1 (MQ=255) atGTTTATAGCTATGTGGTATAGTCAGATTAATCCATGGTAAGAAGGTATAGTTGACGTCCAGATACACCGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTGATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TGTATCTGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCTTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTGCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGCATTGGTTAACAGAATACCCGCGCCCATCTCTAAGTTATAACCCACACGAAGCATAACCTCGCCCTGATCGGAGGCAAGATTATATGcc < 2:248907/301‑1 (MQ=255) ggTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAACGTTGTAGGTATTGGTTAACATCATACCCTCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCATAACCTCGCCCTGATCGGAGGCACGATTATATGCCt > 2:19741/1‑300 (MQ=255) cGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTAGCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCATAACCTCGCCCTGATCGGAGGCAAGATTATATGCCTCCCTGttt < 2:366509/300‑1 (MQ=255) aGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGGCGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGAGACTCGTATGATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTGAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTTCAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATAACCGCGCCCATATCTAAGTTATAACCCACGCGTAGCGTAACCTCGCCATGATCCGAGGCCAGATTATATTCCTTCCTGCTTTCGACATATGCTCCa > 2:130565/1‑300 (MQ=255) gATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCATAACCTCGCCCTGCTCGGCGGCAAGATTatat > 1:216331/1‑272 (MQ=255) aCCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATAAACTGCACCAACCGAACCGATACTCTTATCAGTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTGAA‑TTTATCGGTTGGTTGAAATAACGGATACCAGCCGTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCATAACCTCGCCCTGATCGGAGGCAAGATTATATGCCTCCCTGTTTTCGACGTATGCGCCAGCAAATAc < 2:296962/301‑1 (MQ=255) aCCATGGTACAAATTTATAGGTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCATAACCTCGCCCTGATCGGAGGCAAGATTATATGCCTCCCTGTTTTCGACGTATGCGCCAGCAAATAc < 1:19741/301‑1 (MQ=255) aaTTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGc < 1:169692/115‑1 (MQ=255) aaTTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATAcc < 2:49072/188‑1 (MQ=255) aaTTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATAcc > 1:49072/1‑188 (MQ=255) aaTTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATAGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGc > 2:169693/1‑115 (MQ=255) ataGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAAt > 2:25096/1‑117 (MQ=255) ataGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAAt < 1:25096/117‑1 (MQ=255) taGTTGACGTCCAGATACACTGCACCCCCCGAACCGATATTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTTAATTTCGGTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCATAACCTCGCCCTGATCGGAGGCAAGATTATATGCCTCCCTGTTTTCGACGTATGCGCCAGCAAATACCGAGGCAGAGGTCagag < 1:294078/301‑1 (MQ=255) taGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTTGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCg < 1:326798/195‑1 (MQ=255) taGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCAACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCAATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGCATTGGTTAACATAATACCTGCGCCCATATCg > 2:326806/1‑195 (MQ=255) ttGACGTCCAGAGACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCATAACCTCGCCCTGATCGGAGGCAAGATTATATGCCTCCCTGTTTTCGACGTATGCGCCAGCAAATACCGAGGCAGAGGTCAGagaag < 1:402920/301‑1 (MQ=255) acacTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCATAACCTCGCCCTGATCGGAGGCAAGATTATATGCCTCCCTGTTTTCGATGTATGCGCCAGCAAATACGGAGGCAGAGGTCAGAGAAGATAATAAAattat > 2:25727/1‑301 (MQ=255) aTACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCATAACCt < 1:122955/187‑1 (MQ=255) aTACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCATAACCTCGCCCTGATCGGAGGCAAGATTATATGCCTCCCTGTTTTCGACGTATGCGCCAGCAAATACCGAGGCAGAGGTc > 1:165608/1‑261 (MQ=255) aTACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATACATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGACCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCATAACCt > 2:122956/1‑187 (MQ=255) aTACTCTGATCATTAATTAAGCCAACGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCGACACGTAACATAACCTCGCCCTGATCGGAGGCAAGATTATATGCCTCCCTGTTTTCGACGTATGCGCCAGCAAATACCGAGGCAGAGGTc < 2:165609/261‑1 (MQ=255) ctctTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATAc < 2:182974/142‑1 (MQ=255) ctctTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATAc > 1:182973/1‑142 (MQ=255) aattaaGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCATAACCTCGCCCTGATCGGAGGCAAGATTATATGCCTCCCTGTTTTCGACGTATGCGCCAGCAAATACCGAGGCAGAGGTCAGAGAAGATAATAAAATTATTGCATTAATCTTTTTCATAATAAGTCAAtttttt > 1:83305/1‑301 (MQ=255) gCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAAATTCGTTATATCCATGTTTGAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATCATACACGCGATCATATCGAAGGTATAACCCACACGGAGAATAAGCTCGCCCTGATCGGAGGCCAAAGTATATGCCTCCCTGTTTTAGAGTAATGAGCCAGTAAATAACGGAGAAGAGGTCAAGGAAGATAGTAAAATTATTGCATAAATCTTTTTCATAATAAGTCCATTTTTTAAACGt > 2:429022/1‑301 (MQ=255) tgCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCATAACCTCGCCCTGATCGGAGGCAAGATTATATGCCTCCCTGTTTTCGACGTATGCGCCAGCAAATACCGAGGCAGAGGTCAGAGAAGATAATAAAATTATTGCATTAATCTTTTTCATAATAAGTCCATTTTTTAAACGTAGGGAg < 2:83305/299‑1 (MQ=255) | GATCTTTCCCGTTGCTACTATTAAAGTCATTCACTCGCATGAAGTAATGTGGCTCAAATGTATAGGAAAATTTATCGGTGATTTTAAAATTCCAGTAGGTGCCAATTTCATAGGTGTCATTATTATCCAGTTCCCCGCTCAAATCTGTTGAACTATAGTTATTATGGTTATAGCGATTTCGTACTGTCAGATTAAACCATGGTACAAATTTATAGTTGACGTCCAGATACACTGCACCACCCGAACCGATACTCTTATCATTAATTAAGCCACCGGGCTGGATGGTTAA‑TTTATCGGTTGGTTTAAATAACGGATACCAGCCTTCAATTTCGTTATATCCATGTTTTAGTTCATCTTCTCGCTGAAAGTTGTAGGTATTGGTTAACATAATACCCGCGCCCATATCGAAGTTATAACCCACACGTAGCATAACCTCGCCCTGATCGGAGGCAAGATTATATGCCTCCCTGTTTTCGACGTATGCGCCAGCAAATACCGAGGCAGAGGTCAGAGAAGATAATAAAATTATTGCATTAATCTTTTTCATAATAAGTCCATTTTTTAAACGTAGGGAG > NC_000913/4063749‑4064323 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |