| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4073804 | 64 (1.370) | 3 (0.070) | 3/586 | 6.5 | 4.5% | coding (66/897 nt) | yihV | 6‑deoxy‑6‑sulphofructose kinase |
| ? | NC_000913 | = 4073812 | 66 (1.450) | coding (74/897 nt) | yihV | 6‑deoxy‑6‑sulphofructose kinase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
TGGCGAACCCATTTGTCCTAAACCGATAAACG‑CGATTGCTGCCATAACCCTCTCCTGAATACAGTTATGTCACTTTTTGTCATTTATGACATGCTTTGCTTGTCTGTTTTTGATCGTATTT‑GTAATTTATCGTCAAAAAATTGACAGCCGTCACTTTTTAAACAATTGGTGAAATTAAAATGAACGCATCCCAAAATGTTTAAGGAATGACCATGATTCGTGTTGCTTGTGTAGGTATAACCGTGATGGATCGCATCTATTACGTGGAAGGGTTACCGACGGAGAGCGGTAAATACGTGGCGAGAAATTATACGGAAGTTGGTGGCGGGCCAGCGGCGACGGCAGCGGTTGCGGCGGCAAGGCTGGGGGCGCAGGTCGATTTTATTGGTCGCGTAGGTGATGACGACACGGGCAACAGCCTG‑CTGGCAGAGCTGGAATCCTGGGGCGTTAACACCC‑GTTACACCAAACGGTATAACCAGGCGAAATCTTCGCAATCCGCCATCATGGTGGATACCAAAGGCGAGCGGATAATCATTAACTACCCCAGCCCGGATCTGCTGCCTGACGCAGAGTGGTTG > NC_000913/4073527‑4074104 | ctacacgacgctcgtccgatctccGATAAACG‑CGATTGATGCCATAACCCTCTCCTGAATACAGTTATGTCACTTTTTGTCATTTATGACATGCTTTGCTTGTCTGTTTTTGATCGTATTT‑GTAATTTATCGTCAAAAAATTGACAGCCGTCACTTTTTAAACAATTGGTGAAATTAAAATGAACGCATCCCAAAATGTTTAAGGAATGACCATGATTCGTGTTGCTTGTGTAGGTATAACCGTGATGGATCGCATCTATTACGTGGAAGGGTTACCGACGGAGAGCGGTAAATACGTGGc < 1:277184/279‑1 (MQ=255) cGAACCCATTTGTCCTAAACCGATAAACG‑CGATTGCTGCCATAACCCTCTCCTGAATACAGTTATGTCACTTTTTGTCATTTATGACATGCTTTGCTTGTCTGTTTTTGATCGTATTT‑GTAATTTATCGTCAAAAAATTGACAGCCGTCACTTTTTAAACAATTGGTGAAATTAAAATGAACGCATCCCAAAATGTTTAAGGAATGACCATGATTCGTGTTGCTTGTGTAGGTATAACCGTGATGGATCGCATCTATTACGTGGAAGGGTTACCGACGGAGAGCGGTAAATACGTGGCgag < 1:32679/301‑1 (MQ=255) ccttttccctacacgacgctcttccgatctgcCATAACCCTCTCCTGAATACAGTTATGTCACTTTTTGTCATTTATGACATGCTTTGCTTGTCTGTTTTTGATCGTATTT‑GTAATTTATCGTCAAAAAATTGACAGCCGTCACTTTTTAAACAATTGGTGAAATTAAAATGAACGCATCCCAAAATGTTTAAGGAATGACCATGATTCGTGTTGCTTGTGTAGGTATAACCGTGATGGATCGCATCTATTACGTGGAAGGGTTACCGACGGAGAGCGGTAAATACGTGGCGAGAAATtat < 1:232422/273‑1 (MQ=255) ttgtccctacacgacgctcttccgatctgcCATAACCCTCTCCTGAATACAGTTATGTCACTTTTTGTCATTTATGACATGCTTTGCTTGTCTGTTTTTGATCGTATTT‑GTAATTTATCGTCAAAAAATTGACAGCCGTCACTTTTTAAACAATTGGTGAAATTAAAATGAACGCATCCCAAAATGTTTAAGGAATGACCATGATTCGTGTTGCTTGTGTAGGTATAACCGTGATGGATCGCATCTATTACGTGGAAGGGTTACCGACGGAGAGCGGTAAATACGTGGCGAGAAATTATAc < 1:293822/275‑1 (MQ=255) tgccTTAACCGAATAACGCCGATTGTTCCAATAACCTTGTCTGAAATAAAG‑TATGTTACTTTTTTGCAATTATGACATGCTTTGGTTTTCTTTTTTTTGTTGTTTTTGGAAATTTACCGAAAAAAAATTGCAAGCCG‑CAAATTTTAAACAATTGGTGAAATTAAAATGAACGCATCCCAAAATGTTTAAGGAATGACCATGATTCGTGTTGCTTGTGTAGGTATAACCGTGATGGATCGCATCTATTACGTGGAAGGGTTACCGACGGAGAGCGGTAAATACGTGGCGAGAAATTATACgg < 2:336888/299‑1 (MQ=255) ccTAAACCGATAAACG‑CGATTGCTGCCATAACCCTCTCCTGAATACAGTTATGTCACTTTTTGTCATTTATGACATGCTTTGCTTGTCTGTTTTTGATCGTATTT‑GTAATTTATCGTCAAAAAATTGACAGCCGTCACTTTTTAAACAATTGGTGAAATTAAAATGAACGCATCCCAAAATGTTTAAGGAATGACCATGATTCGTGTTGCTTGTGTAGGTATAACCGTGATGGATCGCATCTATTACGTGGAAGGGTTACCGACGGAGAGCGGTAAATACGTGGCGAGAAATTATACGGaa > 2:377155/1‑301 (MQ=255) cTAAACCGATAAACG‑CGATTGCTGCCATAACCCTCTCCTGAATACAGTTATGTCACTTTTTGTCATTTATGACATGCTTTGCTTGTCTGTTTTTGATCGTATTT‑GTAATTTATCGTCAAAAAATTGACAGCCGTCACTTTTTAAACAATTGGTGAAATTAAAATGAACGCATCCCAAAATGTTTAAGGAATGACCATGATTCGTGTTGCTTGTGTAGGTATAACCGTGATGGATCGCATCTATTACGTGGAAGGGTTACCGACGGAGAGCGGTAAATACGTGGCGAGAAATTATACGGAAg > 2:242476/1‑301 (MQ=255) ccGATAAACG‑CGATTGCTGCCATAACCCTCTCCTGAATACAGTTATGTCACTTTTTGTCATTTATGACATGCTTTGCTTGTCTGTTTTTGATCGTATTT‑GTAATTTATCGTCAAAAAATTGACAGCCGTCACTTTTTAAACAATTGGTGAAATTAAAATGAACGCATCCCAAAATGTTTAAGGAATGACCATGATTCGTGTTGCTTGTGTAGGTATAACCGTGATGGATCGCATCTATTACGTGGAAGGGTTACCGACGGAGAGCGGTAAATACGTGGcagatcggaagagcacacgg > 2:277530/1‑279 (MQ=255) cgATTGCTGCCATAACCCTCTGCGGAATACAGTTATGTCACTTTTTTTCATTTATGACATGCTTTGCTTGTCTGTTTTTGATCGTATGT‑GTAATTTATCGTCAAAAAATTGACAGCCGTCACTTTTTAAACAATTGGTGAAATTAAAATGAACGCATCCCAAAATGTTTAAGGAATGACCATGATTCGTGTTGCTTGTGTAGGTATAACCGTGATGGATCGCATCTATTACGTGGAAGGGTTACCGACGGAGAGCGGTAAATACGTGGCGAGAAATTATACGGAAGTTGGTGGCGGGCCAg < 1:9314/301‑1 (MQ=255) aTTGCTGCCATAACCCTCTCCTGAATACAGTTATGTCACTTTTTGTCATTTATGACATGCTTTGCTTGTCTGTTTTTGATCGTATTT‑GTAATTTATCGTCAAAAAATTGACAGCCGTCACTTTTTAAACAATTGGTGAAATTAAAATGAACGCATCCCAAAATGTTTAAGGAATGACCATGATTCGTGTTGCTTGTGTAGGTATAACCGTGATGGATCGCATCTATTACGTGGAAGGGTTACCGACGGAGAGCGGTAAATACGTGGCGAGAAATTATACGGAAGTTGGTGGCGGGCCAgcg > 1:176789/1‑301 (MQ=255) 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aCCCTCTCCTGAATACAGTTATGTCACTTTTTGTCATTTATGACATGCTTTGCTTGTCTGTTTTTGATCGTATTT‑GTAATTTATCGTCAAAAAATTGACAGCCGTCACTTTTTAAACAATTGGTGAAATTAAAATGAACGCATCCCAAAATGTTTAAGGAATGACCATGATTCGTGTTGCTTGTGTAGGTATAACCGTGATGGATCGCATCTATTACGTGGAAGGGTTACCGACGGAGAGCGGTAAATACGTGGCGAGAAATTATACGGAAGTTGGTGGCGGGCCAGCGGCGTGGGCAGCg > 1:163052/1‑301 (MQ=255) ccTCTCCTGAATACAGTTATGTCACTTTTTGTCATTTATGACATGCTTTGCTTGTCTGTTTTTGATCGTATTT‑GTAATTTATCGTCAAAAAATTGACAGCCGTCACTTTTTAAACAATTGGTGAAATTAAAATGAACGCATCCCAAAATGTTTAAGGAATGACCATGATTCGTGTTGCTTGTGTAGGTATAACCGTGATGGATCGCATCTATTACGTGGAAGGGTTACCGACGGAGAGCGGTAAATACGTGGCGAGAAATTATACGGAAGTTGGTGGCGGGCCAGCGGCGACGGCAGCGGt < 1:18734/301‑1 (MQ=255) ctcCTGAATACTGTTATGTTACTTTTTGTCATTTATGACATGCTTTTCTTGTCTGTTTTTGATCGTATTT‑GTAATTTATCGTCAAAAAATTGACAGCCGTCACTTTTTAAACAATTGGTGAAATTAAAATGAACGCATCCCAAAATGTTTAAGGAATGACCATGATTCGTGTTGCTTGTGTAGGTATAACCGTGATGGATCGCATCTATTACGTGGAAGGGTTACCGACGGAGAGCGGTAAATACGTGGCGAGAAATTATACGGAAGTTGGTGGCGGGCCAGCGGCGACGGCAGCGGTTgc < 1:249413/301‑1 (MQ=255) 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TGGCGAACCCATTTGTCCTAAACCGATAAACG‑CGATTGCTGCCATAACCCTCTCCTGAATACAGTTATGTCACTTTTTGTCATTTATGACATGCTTTGCTTGTCTGTTTTTGATCGTATTT‑GTAATTTATCGTCAAAAAATTGACAGCCGTCACTTTTTAAACAATTGGTGAAATTAAAATGAACGCATCCCAAAATGTTTAAGGAATGACCATGATTCGTGTTGCTTGTGTAGGTATAACCGTGATGGATCGCATCTATTACGTGGAAGGGTTACCGACGGAGAGCGGTAAATACGTGGCGAGAAATTATACGGAAGTTGGTGGCGGGCCAGCGGCGACGGCAGCGGTTGCGGCGGCAAGGCTGGGGGCGCAGGTCGATTTTATTGGTCGCGTAGGTGATGACGACACGGGCAACAGCCTG‑CTGGCAGAGCTGGAATCCTGGGGCGTTAACACCC‑GTTACACCAAACGGTATAACCAGGCGAAATCTTCGCAATCCGCCATCATGGTGGATACCAAAGGCGAGCGGATAATCATTAACTACCCCAGCCCGGATCTGCTGCCTGACGCAGAGTGGTTG > NC_000913/4073527‑4074104 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |