| Predicted mutation | |||||||
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| JC | NC_000913 | 3,815,909 | Δ10 bp | 5.2% | pseudogene (632‑641/669 nt) | rph ← | ribonuclease PH (defective);enzyme; Degradation of RNA; RNase PH |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 3815908 | 110 (1.020) | 6 (0.060) | 6/538 | NT | 5.2% | pseudogene (642/669 nt) | rph | ribonuclease PH (defective);enzyme; Degradation of RNA; RNase PH |
| ? | NC_000913 | 3815919 = | 109 (1.010) | pseudogene (631/669 nt) | rph | ribonuclease PH (defective);enzyme; Degradation of RNA; RNase PH | |||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
CGGCCTAACAGTGCCAGATCGCGCCCGGTATTAAACAGCCCGGCGTTGAAGAAATAGGGGCTTTTGCGCCCGGATTTCAGCGTAAACTCGCCAAACTTTAACACCTGCTTGCTAAGCGCAAATTCAATAAACTGGCGCTGATATGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCGT‑CGCTACAATGGATTCGATTCCCCTCGGGCCAGAGCCAACAAGATGAGTAGCTCTTCATGGGTGAACGGCTCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCATCCCTTTCATCGGATTGGTTTTCAGCTTGCCGTTTTCCACCAGCTTCTGTAGCGCATCTACCAGCGCCACGCAGGCACCCGTAATCGACGCGGTACGCGTGCCACCATCAGCCTGAAGCACGTCGCAGTCC > NC_000913/3815617‑3816208 | cGGCCTAAACGTGTCCGATCGTGCCCGGTATATAACAGCCAGGCGTGTAAGAAATAGGGGCTTTTGTGCCCGGATTTCAGCGTAAACTCGCAAAACGTTAACACCTGCTTGCTAAGCGCAAAGTCAATACACTGGCGCTGATATGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGA‑AAAAAAAAAGCGCCTCATCAGTCGCCTTAAAACTCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCGT‑CGCTACAATGGATTCGATTCCCCTCGGGCCAGAGCCAACAAGATGAGTAGCTCTTCAt < 2:701544/301‑1 (MQ=255) ccTAACAGTGCCAGATCGCGCCCGGTATTAAACAGCCCGGCGTTGAAGAAATAGGGGCTTTTGCGCCCGGATTTCAGCGTAAACTCGCCAAACTTTAACACCTGCTTGCTAAGCGCAAATTCAATAAACTGGCGCTGATATGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGACAAAAAAAA‑GCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCGT‑CGCTACAATGGATTCGATTCCCCTCGGGCCAGAGCCAACAAGATGAGTAGCTCTTCATggg < 2:719639/301‑1 (MQ=255) ccTAACAGTGCCAGATCGCGCCCGGTATTAAACAGCCCGGCGTTGAAGAAATAGGGGCTTTTGCGCCCGGATTTCAGCGTAAACTCGCCAAACTTTAACACCTGCTTGCTAAGCGCAAATTCAATAAACTGGCGCTGATATGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGAC‑AAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCGT‑CGCTACAATGGATTCGATTCCCCTCGGGCCAGAGCCAACAAGATGAGTAGCTCTTCATggg < 2:767628/301‑1 (MQ=255) gTGCCAGATCGCGCCCGGTATTAAACAGCCCGGCGTTGAAGAAATAGGGGCTTTTGCGCCCGGATTTCAGCGTAAACTCGCCAAACTTTAACACCTGCTTGCTAAGCGCAAATTCAATAAACTGGCGCTGATATTGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGACAAAAAAAA‑GCGACTCATAAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCACCGCCTTCTTCGT‑CGCTACAATGGATTCGCATCCCCTCGGGCCAGGTCCAACCAGATGAGTAGCTCGTCATGGGTGAAGgg > 2:390496/1‑301 (MQ=255) 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gAGTAGCTCTTCATGGGTGAACGGCTCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGt < 2:62578/89‑1 (MQ=255) tgggtgaacggctcgccttctgccgtcccctgcacttcaatgatgcgcccgtcttcggtcatcactacgttcatgtcggtctctgcggcagagtcttcaacgtattccagatcgcaaaccgcttcgccgttcacaattccgacagaaactgcggctaccatccctttcatcggattggttttcagcttgccgttttccaccagcttctgtagcgcatctaccagcgccacgcaggcccccttaatcgacgcggtacgcgtgccaccctcaccctgaagcacgtcgccgtccagcgtaatgg > 2:670565‑M1/1‑1 (MQ=255) | CGGCCTAACAGTGCCAGATCGCGCCCGGTATTAAACAGCCCGGCGTTGAAGAAATAGGGGCTTTTGCGCCCGGATTTCAGCGTAAACTCGCCAAACTTTAACACCTGCTTGCTAAGCGCAAATTCAATAAACTGGCGCTGATATGGTTTCATGCCTTCGCTCCTCATCTTACTTTTCTACAGACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCGT‑CGCTACAATGGATTCGATTCCCCTCGGGCCAGAGCCAACAAGATGAGTAGCTCTTCATGGGTGAACGGCTCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCATCCCTTTCATCGGATTGGTTTTCAGCTTGCCGTTTTCCACCAGCTTCTGTAGCGCATCTACCAGCGCCACGCAGGCACCCGTAATCGACGCGGTACGCGTGCCACCATCAGCCTGAAGCACGTCGCAGTCC > NC_000913/3815617‑3816208 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |