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Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
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cccTCTATCTGTTCACGTAAAGTCAAAG‑CCAGAGCAGCGAAAATCGAAATTTTAGGTACGGTGAAATAAACCTGCTTCCTTAATCCCCACAGCCGGATGAACTAACGTTCGTCCGGTTTGCTATTGAGTTCCTGCCTGGATACTTACCGCGAAAACAGCACGCCTGACATAAAATAAATATGGTCTAATGGGGAAATTTCTCGTGGAGAGGGAACAGATGCGATATCCGGTTGATGTATACACAGGCAAGATTCAGGCTTATCCCGAAGGCAAACCCAGCGCAATTGCTAAAATCCAGGtt < 1:785769/300‑1 (MQ=255) ctATCTGGTCACGTAAAGTCAAAG‑CCAGAGCAGCGAAAATCGAAATTTTAGGTACGGTGAAATAAACCTGCTTCCTTAATCCCCACAGCCGGATGAACTAACGTTCGTCCGGTTTGCTATTGAGTTCCTGCCTGGATACTTACCGCGAAAACAGCACGCCTGACATAAAATAAATATGGTCTAATGGGGAAATTTCTCGTGGAGAGGGAACAGATGCGATATCCGGTTGATGTATACACAGGCAAGATTCAGGCTTATCCCGAAGGCAAACCCAGCGCAATTGCTAAAATCCAGGt > 2:91830/1‑296 (MQ=255) ggTCACGTAAAGTCAAAG‑CCAGAGCAGCGAAAATCGAAATTTTAGGTACGGTGAAATAAACCTGCTTCCTTAATCCCCACAGCCGGATGAACTAACGTTCGTCCGGTTTGCTATTGAGTTCCTGCCTGGATACTTACCGCGAAAACAGCACGCCTGACATAAAATAAATATGGTCTAATGGGGAAATTTCTCGTGGAGAGGGAACAGATGCGATATCCGGTTGATGTATACACAGGCAAGATTCAGGCTTATCCCGACGGCAAACCCAGCGCAATTGCTAAAATCCAGGTTGATGTTGAGt > 2:823500/1‑301 (MQ=255) cGTAAAGTCAAAG‑CCAGAGCAGCGAAAATCGAAATTTTAGGTACGGTGAAATAAACCTGCTTCCTTAATCCCCACAGCCGGATGAACTAACGTTCGTCCGGTTTGCTATTGAGTTCCTGCCTGGATACTTACCGCGAAAACAGCACGCCTGACATAAaataaata > 1:944574/1‑165 (MQ=255) cGTAAAGTCAAAG‑CCAGAGCAGCGAAAATCGAAATTTTAGGTACGGTGAAATAAACCTGCTTCCTTAATCCCCACAGCCGGATGAACTAACGTTCGTCCGGTTTGCTATTGAGTTCCTGCCTGGATACTTACCGCGAAAACAGCACGCCTGACATAAaataaata < 2:944527/165‑1 (MQ=255) gTCAAAG‑CCAGAGCAGCGAAAATCGAAATTTTAGGTACGGTGAAATAAACCTGCTTCCTTAATCCCCACAGCCGGATGAACTAACGTTCGTCCGGTTTGCTATTGAGTTCCTGCCTGGATACTTACCGCGAAAACAGCACGCCTGACATAAAATAAATATGGTCTAATGGGGAAATTTCTCGTGGAGAGGGAACAGATGCGATATCGGGTTGATGTATACACAGGAAAGATTCAGGCTTATCCCTAAGGCAAACCCAGCGCAATTGCTAAAATCCAGGTTGATGGTGAGTTGATGCTGACg > 1:466066/1‑301 (MQ=255) 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GACTGTGATTGCCCAGACTGGTTTGCTGGGGATCCTGTTGGGTGTGGCAGTAATTATCGTGACCGGTATTCCGTTGATTATCGCCGATAAATTGATTGGCGGTGGCGATGGCACTGCCGGAATTGCCGCTTCCAGTTCCGCAGGGGCCGCGGTAGCGACACCTGTGCTGATTGCAGAAATGGTGCCTGCGTTTAAACCGATGGCTCCGGCAGCAACTTCGCTGGTAGCGACGGCGGTCATTGTGACTTCGATTCTGGTGCCAATTCTTACCTCTATCTGGTCACGTAAAGTCAAAG‑CCAGAGCAGCGAAAATCGAAATTTTAGGTACGGTGAAATAAACCTGCTTCCTTAATCCCCACAGCCGGATGAACTAACGTTCGTCCGGTTTGCTATTGAGTTCCTGCCTGGATACTTACCGCGAAAACAGCACGCCTGACATAAAATAAATATGGTCTAATGGGGAAATTTCTCGTGGAGAGGGAACAGATGCGATATCCGGTTGATGTATACACAGGCAAGATTCAGGCTTATCCCGAAGGCAAACCCAGCGCAATTGCTAAAATCCAGGTTGATGGTGAGTTGATGCTGACGGAGC > NC_000913/4102337‑4102930 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |