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| ? | NC_000913 | 2911492 = | 152 (1.030) | coding (2160/2235 nt) | relA | (p)ppGpp synthetase I/GTP pyrophosphokinase | |||||
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gcCCC‑GGCATGTGCAGGTTGTAAAATCAAATGGTGATGTCGAGGGTCGCCATGGGCTGTTGGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGGTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGGGATATCAC‑GTAACAACCCACTACGATCATTAGC‑TACCACGCGGACCACCAGCGAATATCCGGCGGAGTAGCTCTCACCCCA‑TACCGCGTCAACAATGCGTTCTGGCGCATGGGAGCGCAGTTCCGCCAGTTGTTCGCAATCGGCGCGGTGTACTGAAATACCGCGCCCCTGGGTAATGa < 1:1574449/300‑1 (MQ=255) cccccccgctattGCAGGGTGTAAATCTCAATGGTCATTTCGATGGTCGCGAGGTGCTGTTGGGGGCCGATACGTCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACTTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCAC‑GTAACAACCCACTCAGTTCATTAGC‑TACCACGTGGACCACCAGCGAATATCCGGTGGAGTAGCTCTCACCCCA‑TACCGCGTCAACAATGCGTTCTGGCGCATGGGAGCGCAGTTCCGCCAGTTGTTCGCAATCGGCGCGGTGTACTGAAATACCGCGCCCCTGGGTAATGa < 2:1496575/290‑1 (MQ=255) cccc‑AGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGCGAATGGTCGTGATATCAC‑GTAACAACCCACTACGATCCTTAGC‑TACCACGCGAACCACCAGCGAATATCCGGCGGAGTAGCTCTCCCACCA‑TACCGCGTCAACAATGCCTTCTGCCCCCTGGGCCCGCAGTCCCGCCAGTTGTTCGAAATCGGCTCGGTGTACTGACATCCCGCGCCCCGTGGTacgccaa > 1:1339814/1‑295 (MQ=255) cACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCAC‑GTAACACCCCACTACGATCATTAGC‑TACCACGCGGACCACCAGCGAATATCCGGCGGCGTAGCTCTCACCCCA‑TACCGCGTCAACAATGCGTTCTGGCGCATGGGAGCGCAGTTCCGCACGTTGTTCGCACTCGTCGAGGTGTCCTGGACTACCTCGCCCCTGGGTCATGAAGCCgcc > 2:1437380/1‑298 (MQ=255) cTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGTCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCAC‑GTAACATCCCACTACGATCATTAGC‑TACCACGCGGACCACCAGCGAATATCCGGCGGAGTCGCTCTCACCCCA‑TACCGCGTCCACACTGCGTTCTGGCGCCTGGGCGCGCAGTTCCGCCCGTTGTTCGCAATCAGCGCGGTGTAATGCAATACCTCCCCCCTGGGTACTGAAGCCGACacg > 1:1122700/1‑299 (MQ=255) | GCACTGGCTCAATAATTAATTTGCCATCCACCAGGTCAATCTTCACTTCATCATCAATATTCAGATTGAGCGCCTGCATTAACGTAGCCGGGATCCGCACCGCCGGTGAATTTCCCCAACGCTTTACGCTACTGTGGATCATAACCCTTTCCTCAAACCGCTATCATATGTAGATACAGTATATATCAATCTACATTGTAGATACGAGCAAATTTCGGCCTAACTCCCGTGCAACCGACGCGCGTCGATAACATCCGGCACCTGGTTGAGTTTACCCAGCACGCGCCCC‑AGCACTTGCAGGTTGTAAATCTCAATGGTCATGTCGATGGTCGCCAGTTGCTGTTTGGTGTCGCTACGGCTGGCAACGCCAAGCACGTTCACCTTCTCGTTGGCGAGAATGGTCGTGATATCAC‑GTAACAACCCACTACGATCATTAGC‑TACCACGCGGACCACCAGCGAATATCCGGCGGAGTAGCTCTCACCCCA‑TACCGCGTCAACAATGCGTTCTGGCGCATGGGAGCGCAGTTCCGCCAGTTGTTCGCAATCGGCGCGGTGTACTGAAATACCGCGCCCCTGGGTAATGAAGCCGACAAT > NC_000913/2911198‑2911791 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |