| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | ||||||||||
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| * | NC_000913 | 286,698 | 0 | C→T | 6.0% | 2.8 0.0 ‑0.0 | 102 | A435V (GCC→GTC) | yagG | CP4‑6 prophage; putative sugar transporter |
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Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
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ggCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCCCCGCGCGGCGCAGGGCGAGGCCGTTCCCGACGCCGCGACAGCCGCATCCCATTAACCGGAGACACTATGGAAATCACTAACCCGATACTCACCGGCTTCACCCCGGACCCGTCCCTGTGCCGCCAGGGCGAGTACTCCTACAGCGCACCCTCCACCTTCTAGTGGTTCCAGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCTTGCCCTGACAAACTGGTCGCTGGTCAGCCCCCCTTTGGCCCCAGTGTCGCTGCTGGCCATTACGGGCACCCCCGACCCcg > 2:1108753/1‑301 (MQ=255) ccATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAGGCAGTTCCCGACGCCGCGACAGCCGCATCCCATTAACCGGAGGCAATATGGAAATCACTAACCCGATACTCACAGGCTTAAACCCGGACCCGTCCCTGTGCCGCCAGGGAGAGGACTCCTACATCGCAACCTCGACCTTCGAGTGATTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTTGTCGCTGTTCAGCACCCCGTTGGACCACGTGTCGATGCTGGCCCTGAAGGGCCACCCGGACTCcgg > 2:1226163/1‑300 (MQ=255) | CGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGCTGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTACGTCAACTATTCCGCCAGCA‑GCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCA‑T‑GTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAGGCCGTTCCCGACGCCGCGACAGCCGCATCCCATTAACCGGAGGCAATATGGAAATCACTAACCCGATACTCACCGGCTTCAACCCGGACCCGTCCCTGTGCCGCCAGGGCGAGGACTACTACATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCACCCCGTTGGACCGCGTGTCGATGCTGGACATGAAGGGCAACCCGGACTCCGG > NC_000913/286398‑286997 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |