| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 286650 | 113 (0.740) | 6 (0.040) | 6/510 | NT | 5.2% | coding (1256/1383 nt) | yagG | CP4‑6 prophage; putative sugar transporter |
| ? | NC_000913 | = 286682 | 109 (0.740) | coding (1288/1383 nt) | yagG | CP4‑6 prophage; putative sugar transporter | |||||
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
TTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGC‑TGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTA‑CGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAGGCCGTTCCCGACGCCGCGACAGCCGCATCCCATTAACCGGAGGCAATATGGAAATCACTAACCCGATACTCACCGGCTTCAACCCGGACCCGTCCCTGTGCCGCCAGGGCGAGGACTACTACATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCACCCCG > NC_000913/286353‑286950 | tttttGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGC‑TGGAGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTA‑CGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCCACATCACAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGCCATGtt > 2:1203062/1‑301 (MQ=255) ttttGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGTCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGC‑TGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTA‑CGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTtc < 2:668105/301‑1 (MQ=255) ttttGACCCCAACATCCTGGTCCTGTTCGTCTTTCATCCCACCACGCCGCCGCAGTTGCTGGTGGCTTCTGCCGTGGTGGACTGCGAGGAGCGCCGTAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGC‑GGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGACGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTA‑CGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTtc < 1:404962/301‑1 (MQ=255) tttgGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGGCTTTAAGCCCACCCGGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGC‑TGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGAGCTGGATCCTGGCGTA‑CGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTtc < 2:1228264/301‑1 (MQ=255) tttcccctcccATCCGGTTCCTGTTCGTCGTTAAGACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGC‑TGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTA‑CGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTtcat < 1:146536/291‑1 (MQ=255) cgtaaCCTCCTGGTCCGTGTCGTCTTTAATACCACCCCGTCGCTGCAGTGTCTGCTGGCTTCGGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGC‑TGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCCGGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTA‑CGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGc < 2:1042258/298‑1 (MQ=255) aaCATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCAAGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGCGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGC‑TGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTA‑CGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGt < 2:1488401/301‑1 (MQ=255) tgttcGTCCTTCATCCCCCCGCGCCGTTGCAGTGGCTGCTGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGGGGGCCGCAGCGTTCGCCGCCTCGACGGGC‑TGGTGTTCTCAACCTACCGTGTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTA‑CGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCt < 2:915704/301‑1 (MQ=255) tCTTTAATACCACCCCGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGCCGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGTTCGCCGCCTCGACGGGC‑TGGTGTTCTCCACCTACCTGATCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTA‑CGTCACCTATCCCGCCAGCAGCAGCGTGCCGCCGGTTGGGGTGATCACCACCGTCAAACTTCCGTTCTTACTGGTGCCGGGGGTTCCCTACTCTGGCCTTTTCCTACTGCTGTccatctcccagttccccc > 1:117582/1‑283 (MQ=255) tCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGTCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGC‑TGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTA‑CGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGCGGCGCTCACCACCATCAAAAATCTGTTCTGCGTGGTGCCCGTGGTGCTCTCCGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCCCTCTCCCAGCTCACCg > 1:287887/1‑300 (MQ=255) 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TTTTTGCCCTCAACATCCTGTTCCTGTTCGTCTTTAATACCACCACGCCGCTGCAGTGGCTGATGGCTTCTGACGTGGTGGACTACGAGGAGAGCCGCAGCGGTCGCCGCCTCGACGGGC‑TGGTGTTCTCCACCTACCTGTTCAGCCTGAAGATTGGCCTGGCGATTGGCGGGGCGGTGGTGGGCTGGATCCTGGCGTA‑CGTCAACTATTCCGCCAGCAGCAGCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAGGCCGTTCCCGACGCCGCGACAGCCGCATCCCATTAACCGGAGGCAATATGGAAATCACTAACCCGATACTCACCGGCTTCAACCCGGACCCGTCCCTGTGCCGCCAGGGCGAGGACTACTACATCGCCACCTCGACCTTCGAGTGGTTCCCGGGCGTGCGCATCTACCACTCCCGTGACCTGAAAAACTGGTCGCTGGTCAGCACCCCG > NC_000913/286353‑286950 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |