| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 4187665 | 185 (1.210) | 3 (0.020) | 3/528 | NT | 1.6% | coding (2316/4224 nt) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
| ? | NC_000913 | 4187669 = | 184 (1.210) | coding (2320/4224 nt) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 205 total aligned reads displayed.
GTAACTGCGGGCGAACGCTACAACAAAGTTATCGATATCTGGGCTGCGGCGAACGATCGTGTATCCAAAGCGATGATGGATAACCTGCAAACTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGAAAACTGCGAACTCCGGTTACCTGACTCGTCGTCTGGTTGACGTGGCGCAGGACCTGGTGGTTACCGAAGACGATTGTGGTACCCATGAAGGTATCATGATGACTCCGGTTATCGAGGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCCGCGCAACACGCTGCTGCACGAACAGTGGTGTGACCTGCTG > NC_000913/4187366‑4187965 | ggaagtgcgggCGAACGCAACAAAAAAGGTAACGATATGTGGGCTGGGGCGAACGATCGTGGAGCCAAAGCGATGATGGATAACAGGGAAACTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTGCCTTCCACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGGTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTAC < 1:1520908‑M1/295‑1 (MQ=255) gaacgttcaaatatggatATGGATATCTGGGGTGGGGCGAACGATCGTGTATGCAAAGCGATGAGGGATAACCTGCAAACTGACACCGTGATTAACCGTGACGGGCAGGAAGTGAGGCAGGTTTACTTCCACCGCATCTACATGATGGCCGATGCCGGCGCGCGTGGTGCTGCGGTAGAGGTTCGTCCGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCAGATGGCGCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTccacc < 1:1457771/283‑1 (MQ=255) caacaaAGTTATCGATATCTGGGCTGCGGCGAACGATCGTGTATCCAAAGCGATGATGGATAACCTGCAAACTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCCACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCCCGGTGc > 2:587370/1‑300 (MQ=255) aaaGTTATCGAGGTCTGTGCTGCGGTGAACGATGGTGTATCCAAAGCGATGATGGATAACCCGCAAACTGAACCCGGGATTAACCGTGGCGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCCACCGCATCTACAGGAGGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGGCAGCTTGCTGGTAGGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTa < 1:490585/301‑1 (MQ=255) ttATCGATATCTGGGCGGCGGCGAACGATCGTGTATCCAAAGCGATGATGGATAACCTGCAAACTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCCACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAgg < 2:1220751/301‑1 (MQ=255) aTCGATATGATGGCTGCGGAGAACGAGTGTGTAGTCAAAGCGTTTATCGATAACCTGCAATCGGAAACCGTGATTAACCGTGGCGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTGCCTGTCACAGCATCTACATGATGGCGGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCGGGATGGCTCCATCATCGAAACGCAAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTc < 2:1478792/301‑1 (MQ=255) aTCGATATCTGGGCTGCGGCGAACGATCGTGTATCCAAAGCGATGATGGATAACCTGCAAACTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCCACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGCAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCCCGTAAAgg > 1:191115/1‑299 (MQ=255) atatCTGGGCTGCGGCGAACGATCGTGTATCCAAAGCGATGATGGATAACCTGCAAACTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCCACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCCTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGCTGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCCCCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCATTACTTCATCCCCCCCCACGGTGCCCGTaacgtcctgg > 1:1485442/1‑292 (MQ=255) atatCTGGGCTGCGGCGAACGATCGTGTATCCAAAGCGATGATGGATAACCTGCAAACTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCCACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGAACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATTGCGACGCAGGATGGCTCCATCATCTAAACGCCAATAACCCCGAACTTCCGTGAAGTTCTTAACGTACTACAGTACTTCATCTCACCCCCCGGTGCTCGTACAGGTcgtgg > 2:984650/1‑297 (MQ=255) atagCTGGGCTGCGGCGAACGATCGTGTATCCAAAGCGATGATGGATAACCTGCAAACTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCCACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGc < 2:261813/301‑1 (MQ=255) 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gtgtATCCAAAGCGATGATGGATAACCTGCAAACTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCCACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTCGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGACACGCCAATCACCGCGACCTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTCCTTCATCTCCACCCACGGTTCCCGTGACGGTCTGGCTGATACCGCACTGAAAACTGCgc > 1:565469/1‑299 (MQ=255) cAAAGGGATATTGGAGAACCTGCAACCTTAAACCGGGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCCACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGAAAACTGCGAACTCCGGt < 2:784112/301‑1 (MQ=255) tgGATAACCTGCAAACTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCCACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTAATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCCCTGACACCTGCGAACTCCGGTTACCTGCCt > 2:352899/1‑299 (MQ=255) 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aaCTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCCACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGAAAACTGCGAACTCCGGTTACCTGACTCGTCGTCTGGTTGag > 2:819954/1‑300 (MQ=255) cTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCCACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGCCTGCCGGTTACCGCCCTGCAAACCCCGACATCCGGTTACCTGACTCGTCGTCTGCTTGCCGt > 1:927697/1‑301 (MQ=255) aaaaCCGTGATTAACCGTTGCGGTGAGGAAGAGAAGCAGGTTGCCTTCCACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTGCTGCGGAACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGAAAACTGCGAACTCCGGTTACCTGACTCGTCGTCTGGTTGACGt < 2:721272/298‑1 (MQ=255) 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aCTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGAAAACTGCGAACTCCGGTTACCTGACTCGTCGTCTGGTTGACGTGGTGCAGGACCTGGTGGTTACCGAAGACGATTGTGGTACCCATGAAGGTATCATGATGAATCCGGTTATCGCGGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGCAGCCGGGTACTGCTGATATCATAGTTCCGCGCAGACCGCTGCTTCACGAACCGGGGGTTGACcta > 1:685002/1‑298 (MQ=255) aCTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGAAAACTGCGAACTCCGGTTACCTGACTCGTCGTCTGGTTGACGTGGCGCAGGACCTGGTGGTTACCGAAGACGATTGTGGTACCCATGAAGGTATCATGATGACCCCGGTTATCGAGGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGt > 2:89579/1‑209 (MQ=255) cTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGAAAACTGCTAACTCCGGTTACCTGACTCGTCGTCTGGTTGACGTGGCGCAGGACCTGGTGGTTACCGAAGACGATTGTGGTACCCATGAAGGTATCATGATGACTCCGGTTATCGAGGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGGGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTAATGCTGATATCCTCGTTCCGACCAACCGCCTGCTGCACGacctgggtgggaacctgtgg > 2:604570/1‑282 (MQ=255) | GTAACTGCGGGCGAACGCTACAACAAAGTTATCGATATCTGGGCTGCGGCGAACGATCGTGTATCCAAAGCGATGATGGATAACCTGCAAACTGAAACCGTGATTAACCGTGACGGTCAGGAAGAGAAGCAGGTTTCCTTCAACAGCATCTACATGATGGCCGACTCCGGTGCGCGTGGTTCTGCGGCACAGATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGTCTGATGGCGAAGCCGGATGGCTCCATCATCGAAACGCCAATCACCGCGAACTTCCGTGAAGGTCTGAACGTACTCCAGTACTTCATCTCCACCCACGGTGCTCGTAAAGGTCTGGCGGATACCGCACTGAAAACTGCGAACTCCGGTTACCTGACTCGTCGTCTGGTTGACGTGGCGCAGGACCTGGTGGTTACCGAAGACGATTGTGGTACCCATGAAGGTATCATGATGACTCCGGTTATCGAGGGTGGTGACGTTAAAGAGCCGCTGCGCGATCGCGTACTGGGTCGTGTAACTGCTGAAGACGTTCTGAAGCCGGGTACTGCTGATATCCTCGTTCCGCGCAACACGCTGCTGCACGAACAGTGGTGTGACCTGCTG > NC_000913/4187366‑4187965 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |