| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 1097503 | 79 (0.800) | intergenic (+674/+62) | ycdU/serX | putative inner membrane protein/tRNA‑Ser | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
GGTATTGGCAACGCTTGTAGAATGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAG‑TTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCT‑CATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATAT‑GGC‑GGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTG > NC_000913/1096664‑1097259 | ggTATTGGCAACGCTTGTAGAATGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCg > 2:1194802/1‑301 (MQ=255) 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1:525484/1‑301 (MQ=255) ccccTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATACACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGGGA‑GGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCCCAGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAG‑TTGTCGATCTCCGATCGGGGCTCAT‑CATCCCCACGGCGTGTTCAATATACGAAAAAAAAACCCGTACTTTCGTACGAGCACTTCTTTAAATAT‑GGC‑GATGTGGGGGGGGTTGACtcggtt > 1:1091521/1‑301 (MQ=14) cccTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGAGGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCCGCCCGTTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAG‑TTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCT‑CATCCCCCCGGTCTGTTCCATACACGAAATAAAAGCCCGTACTTTCTTTCGAGCTCTTCTTTAAATGT‑GGCGGGTGTgggggtgtttaacccgtt > 2:1229248/1‑288 (MQ=14) cGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTATCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGT‑GGGGGGGATTGACTCACTTCGCTAGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAG‑TGGTCGACCCCCGGTGCGGGCTTCT‑CATCCCCCCGGTTGGTGCAATACACAACAAATAAACCAGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTTCATATGGGC‑GGT‑AGGGGGGACTTAACtcgcctca > 1:1136963/1‑297 (MQ=14) aaCAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAG‑TTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCT‑CATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATAT‑GGC‑GGTGAGGCGGGGATTGACTCGCGTCGCTCGcc > 1:8389/1‑298 (MQ=255) gTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAG‑TTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCT‑CATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATAT‑GGC‑GGTGTGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGTGCAg > 1:1050321/1‑301 (MQ=38) gggggggCCCCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACGTTCGTACGAGCTCTTCGTTAAATATGGCGGGGGG‑GGGGGGGATTGACTCGCTTCGCCCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAG‑TTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCT‑CATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATAT‑GGC‑GGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGcc < 1:1230742/298‑1 (MQ=255) ggggCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAG‑TTGTCGCCCCCCGGTCGGGGCTTCT‑CATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATAT‑GGC‑GGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCt > 1:1105562/1‑300 (MQ=25) ggCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAG‑TTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCT‑CATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATAT‑GGC‑GGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCa > 1:341560/1‑300 (MQ=34) cACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAG‑TTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCT‑CATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATAT‑GGC‑GGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCCCCCTGCGGGCAGTCCGGTCACtt > 1:1219142/1‑300 (MQ=18) | GGTATTGGCAACGCTTGTAGAATGGCGGATTTGGTTTGAAGCCTATTTTTTACTCTGCTATGTACCGTGCTTAATTTACTATTTTTTCTATTGTCGATTCCTCTGGCATAACGATTTTATGATGGCATGTGACATGTATTTCCGTTGGGGGCATTTTAATAAGTGAGGAAGTGATAGGAAGTGACCAGATAATACATATATGTTCTGTACTCTCTTGCGCATTTTGATTGTTGACTGAGTAACCAGACAGTTGATGTGCACGATTTCCCCTCGCCCTAACAGACGTGGGCGGGGGCACCCGGTGTGTGCAATATACG‑AAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATATGGC‑GGTGA‑GGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTGCGTTCACGGTCTGTCCAACTGGCTGTCGCCAG‑TTGTCGACCCCCGGTCGGGGCTTCT‑CATCCCCCCGGTGTGTGCAATACACGAAAAAAAAGCCCGTACTTTCGTACGAGCTCTTCTTTAAATAT‑GGC‑GGTGAGGGGGGGATTGACTCGCTTCGCTCGCCCTGCGGGCAGCCCGCTCACTG > NC_000913/1096664‑1097259 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |