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ctgtcagtCGTGTGTCCTTCGTGTTGTTCGTAAGGAAGATTCAGGTGTTGCCGTGCGCTACGGGCGGCTTTGAAAGAAACCGATGTACCGCTTAACGGTAAATCGCCAGGGGCGGCA‑GAGAGTTGTATTCGTTTCACAAGGCGACAAACAGGAAGTTTCAGCGCCAGATCGTTGGTTTCGTTACGCGGCATTGCAATGGCGCCGAGGAGTTTATGGTCGGTTGCCTGCGCCGTGCAGCACAGCATCAGGCTAATCGCCAGGCTGGCGGAAATCGTAAAAACGGATTTCATAAGGATTctct < 2:60343/299‑1 (MQ=255) atgcagtGGCTTGCCCTTTTTGTATTTCTGAAGGAATATTCCGGCTCTGACTGGCGCTACGGGCTGCTTTGAAACAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCATGGTCGGCA‑GAGAGTTGTATGCGTTTCACAATGCGACAAACAGGAAGTTTCAGCGCCAGAGCGTGGGTTTCGTTACGCGGCATTGCAATGGCGCCGAGGAGTTTATGGTCGTTTGCCTGCGCCGTGCAGCACAGCATCAGGCTAATCGCCAGGCTGGCGGAAATCGTAAAAACGGATTTCATAAGGATTCTCtt < 2:585872/298‑1 (MQ=255) ggTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGGCTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCATGGTCGGCA‑GAGAGTTGTATGCGTTTCACACTGCGACAAACAGGAAGTTTCAGCTCCATATCGTTGGTTTCGTTACGCGGCATTGCAATGGCGCCGAGGAGGTTATGGTCGTTTTCCTGCGCCATACAGCACACCCTCCGGCTAATCTCCAGGCTGGCGGGAATCGGAAAAACGGGTTTGATTAGGATTCTCTTGGTgggg > 1:608635/1‑300 (MQ=255) tGCCCTTTTTTTATTTCGGAAGGAATATTCAGGCTCTTACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCAGCGCTTAACTGTAAATCGCCATGGTCGGCA‑GAGAGGTGTATGCGTTTCACAATGCGACAAACAGGAATTTTCAGCGCCAGATCGTTGGTTTCGTTACGCGGCATTGCAATGGCGCCGAGGAGTTTATGGTCGTTTGCCTGCGCCGTGCAGCACAGCATCAGGCTAATCGCCAGGCTGGCGGAAATCGTAAAAACGGATTTCATAAGGATTCTCTTAGTGGGAagag < 2:538886/301‑1 (MQ=255) cccTGCTTTGATTTCTGAAGGAATAGTCATGCTCAGGAGGGCGCTAAAGGCGGGTGTGAAATAAACCGAGGCATCGCTTAACTGCAAATCGCCATGGTCGGCA‑GAGAGTTGTATGCGTTTCACAATGCGACAAACAGGAAGTTGCAGCGCCAGATCGTTGGTTGCGTTACGCGGCATTGCAATGGCGCCGAGGAGTTTATGGTCGTTTGCCTGCGCCGTGCAGCACAGCATCAGGCTAATCGCCAGGCTGGCGGAAATCGTAAAAACGGATTTCATAAGGATTCTCTTAGTGGGAAGAGGt < 1:1197036/301‑1 (MQ=255) | GTTCGTTGCGCATCAGTACGCTGGAGAGGCGAGTTTTGCCTTTTTCATTATGGGTGAGCAATCGGGCGAAATTTGCCAACTGTTCCTCACTACAATGCTGAAGAAAATCCAGATCTGAATCATTCAGGTAATTAACATTCATTTTTTGTGGCTTCTATATTCTGGCGTTAGTCGTCGCCGATAATTTTCAGCGTGGCCATATCCGATGAGTTCACCGTATGACCCGAAAAGGTGATTTTTGAGACGCAGCGTTTATTGTCGTTATCGCTGTTAATGTTGATCCAGTCAGTGGTTTGCCCTTCTTTTATTTCTGAAGGAATATTCAGGCTCTGACTGGCGCTACGGGCGGCTTTGAAATAAACCGATGCACCGCTTAACTGTAAATCGCCATGGTCGGCA‑GAGAGTTGTATGCGTTTCACAATGCGACAAACAGGAAGTTTCAGCGCCAGATCGTTGGTTTCGTTACGCGGCATTGCAATGGCGCCGAGGAGTTTATGGTCGTTTGCCTGCGCCGTGCAGCACAGCATCAGGCTAATCGCCAGGCTGGCGGAAATCGTAAAAACGGATTTCATAAGGATTCTCTTAGTGGGAAGAGGT > NC_000913/11215‑11811 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |