| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4034102 | 156 (1.040) | 3 (0.020) | 3/524 | NT | 1.9% | coding (958/1452 nt) | trkH | potassium transporter |
| ? | NC_000913 | = 4034172 | 163 (1.120) | coding (1028/1452 nt) | trkH | potassium transporter | |||||
Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
ATTGGCGGCTTCTCGACACATGATGCCAGTATCGGTTATTTCGATAGCCCGACTATTAACACTATCATTGCTATCTTCCTGCTGATCTCCGGCTGTAACTACGGTCTGCACTTTTCACTGTTAAGTGGGCGTAGTCTGAAGGTTTATTGGCGCGATCCGGAATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGTGGTT‑ATTTGTACCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGTCTACAGTTCGGCGCTGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTGTCGATGGCGACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTA‑TCGGCGGTTGCGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGCATCCGAACGCCGTCTATAGCATTAAGCTGGGGAATCGCGCACTGCCGGAACGTATCCTCGAAGCCGTTTGGGGATTTTTCTCCGCCTATGCATTGGTGTTTATTGTCAGTATGCTGGCGATTATCGCCACGGG > NC_000913/4033802‑4034400 | aTTGGCAGCTTCTCGACACATTATGCCAGTATCGGTGATTTCGAGAGCCCTACTATTAACACGATCATTGCTATCTTCCTGCTGATCTCCGGCTGTAACTACGGTCTGCACTTTTCACTGTTAAGTGGGCGTATTCTGAAGGTGTATTGGCGCTATCCGGAATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGTGGTT‑ATTTGTACCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGTCTACAGTTCGGCGCTGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTGTCGATGGCGACAACCGCCG < 2:1122569‑M1/301‑1 (MQ=255) tctcGACACATGATGCCAGTATCGGTTATTTCGATAGCCCGACTATTAACACTATCAGTGCTATCTTCCTGCTGATCTCCGGCTGTAACTACGGTCTGCACTTTTCACTGTTAAGTGGGCGTAGTCTGAAGGTTTATTGGCGCGATCCGGCATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGTGGTT‑ATTTGTACCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGTCTACAGTTCGGCGCTGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTGTCGATGGCGACAACCGCCGGGTTTACAAc < 2:163937/301‑1 (MQ=255) tgCCAGTATCGGTTATTTCGATAGCCCGACTATTAACACTATCATTGCTATCTTCCTGCTGATCTCCGGCTGTAACTACGGTCTGCACTTTTCACTGTTAAGTGGGCGTAGTCTGAAGGTTTATTGGCGCGATCCGGAATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGTGGTT‑ATTTGTACCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGTCTACAGTTCGGCGCTGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTGTCGATGGCGCCAACCCCCGGGTTTACAGCTGACAGAATTga > 1:194357/1‑299 (MQ=255) cGGTTATTTCGATAGCCCGACTATTAACACTATCATTGCTATCTTCCTGCTGATCTCCGGCTGTAACTACGGTCTGCACTTTTCACTGTTAAGTGGGCGTAGTCTGAAGGTTTTTTGGCGCGATCCGGAATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGTGGTT‑ATTTGTACCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGTCTACAGTTCGGCGTTGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTGTCGATGGCGACACAGGCCGGGTTTACAACTGTCAGCATTGCCCGc > 1:1273736/1‑295 (MQ=255) cGGTTATTTCGATAGCCCGACTATTAACACTATCATTGCTATCTTCCTGCTGATCTCCGGCTGTAACTACGGTCTGCACTTTTCACTGTTAAGTGGGCGTAGTCTGAAGGTTTATTGGCGCGATCCGGAATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGTGGTT‑ATTTGTACCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGTCTACAGTTCGGCGCTGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTGTCGATGGCGACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGc < 2:1273761/295‑1 (MQ=255) gcagggtcagatgggtataagagtcagaTCATTGCTATCGTCCTGCTGGTCTTCGGCTGTAACTATGGTCTGCACTTTTCACTGTTAAGTGGGCGTAGTCTGAAGGTTTATTGGCGCGATCCGGAATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGTGGTT‑ATTTGTACCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGTCTACAGTTCGGCGCTGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTGTCGATGGCGACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGctc < 1:379795/273‑1 (MQ=255) cccGAATATTAACACTATCATTGGTATCTTCCCGCTCATCTTCGGCTGTAACTACGGTCTGCACTTTTCACTGTTAAGTGGGCGTAGGCTGAAGGTTTATTGGCCCGATCCGGAATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGT‑GTT‑ATTTGTACCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGTCTACAGTTCGGCGCTGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTGTCGATGGCGACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTAc < 2:835699/301‑1 (MQ=255) aCTATTAACACTATCATTGCTATCTTCCTGCTGATCCCCGGCTGTAACTACGGTCTGCCCTTTTCCCTGTTAAGTGGGCGTCGTCTGAAGGTTTATTGGCGCGCTCCGGAATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGTGGTT‑ATTTGTACCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGTCTACAGTTCGGCGCTGATGACAATTAACCAGCCGTTTTTCCTGGTGGTGTCGATGGCGACCACCGCCGGCTTTCCACATTACAGCATTTCCCGCTGGCCGCCCttttccccgccactc > 1:275446/1‑289 (MQ=255) cTATTAACACTATCATTGCTATCTTCCTGCTGATCTCCGGCTGTAACTACGGTCTGCACTTTTCACTGTTACGTGGGCGTAGTCTGCAGGTTTATTGGCGCGATCCGGAGTTTCGCATGTTTCTCGGCGTCCAGTTTCCGCTGGTGGTT‑ATTTTTACCCTCGTCCTGTGGTTTCATAATGCCTCCAGTTCGGCGCTGCTGCCAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGTTTTCGATGTCCCCAACCGCCCGGTTTGCAACTGACCACCTTGCCCCCCGGCCCCGCCTTTTCCCgtctctg > 1:1042267/1‑293 (MQ=255) cTATTAACACTATCATTGCTATCTTCCTGCTGATCTCCGGCTGTAACTACGGTCTGCACTTTTCACTGTTAAGTGGGCGTAGTCTGAAGGTTTATTGGCGCGATCCGGAATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGTGGTT‑ATTTGTACCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGTCTACAGTTCGGCGCTGATGACACTTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTTTCGATGGCGACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTg > 2:1385472/1‑299 (MQ=255) 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cgccgGGTGTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGGTCGTTTTGCCGGTACTGCTGTTATGTTCAGCCTTTA‑TCGGCGGTTGCGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGCATCCGAACGCCGTCTATAGCATTAAGCTGGGGAATCGCGCACTGCCGGAACGTATCCTCGAAGCCGTTTGGGGATTTTTCTCCGCCTATGCATTGGTGTTTATTGTCAGTATGCTGGCGATTATCGCCACg < 2:1323062/301‑1 (MQ=255) ccgGGTTTAGAATTGACAGCTTCTGCCGCGGGCCGCGTTGTTGGTCGGGACTGCGTTTATGTTCAGCCTTTA‑CCGGCGGTTGCGCGTGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGTTTGGTCCGCAGGGGAACCTTGAGCTGAAACGACCGGTGCATCAGAACTCCGTCTATAGCATTAAGCTGGGGATTCGCGCACTGCCGGAACGTATCCTCGAAGCCGTTTGGGGCTTTTTCCCCGCCTATGCATTGGTGTTTATTGTCAGTATGCTGGCGATTATCGCCACggg < 1:1394312/301‑1 (MQ=255) cgataaaggctgaacataaaagcaggaccggcaaaaagagcggccagcgggcaatgctgtcagttgtaaacccggcggttgtcgccatcgacaccacctggaaaaacgcctggttaattgtcatcagcgccgaactgtagacattatgaaaccacagtacgagggtacaaataaccaccagcgtaaactgtacgccgataaacatgcgaaattccggatcgcgccaataaaccttcagactacgcccacttaacagtgaaaagtgcagaccgtagttacagccggagatcagcaggaagat < 2:106888‑M1/301‑300 (MQ=255) | ATTGGCGGCTTCTCGACACATGATGCCAGTATCGGTTATTTCGATAGCCCGACTATTAACACTATCATTGCTATCTTCCTGCTGATCTCCGGCTGTAACTACGGTCTGCACTTTTCACTGTTAAGTGGGCGTAGTCTGAAGGTTTATTGGCGCGATCCGGAATTTCGCATGTTTATCGGCGTACAGTTTACGCTGGTGGTT‑ATTTGTACCCTCGTACTGTGGTTTCATAATGTCTACAGTTCGGCGCTGATGACAATTAACCAGGCGTTTTTCCAGGTGGTGTCGATGGCGACAACCGCCGGGTTTACAACTGACAGCATTGCCCGCTGGCCGCTCTTTTTGCCGGTACTGCTTTTATGTTCAGCCTTTA‑TCGGCGGTTGCGCCGGGTCAACGGGCGGTGGCCTGAAGGTGATCCGCATCCTGCTGCTGTTTAAGCAGGGGAACCGTGAGCTGAAACGACTGGTGCATCCGAACGCCGTCTATAGCATTAAGCTGGGGAATCGCGCACTGCCGGAACGTATCCTCGAAGCCGTTTGGGGATTTTTCTCCGCCTATGCATTGGTGTTTATTGTCAGTATGCTGGCGATTATCGCCACGGG > NC_000913/4033802‑4034400 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |