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ggg‑‑CAACAACATTGCCGCCCACGGAGTTGAAGAACGACACGCCTTTCGAGCCGATCATTGCGAGGTCGCATTTAACGCCTTTGTCGGTCCAGGTCTTCATTTCCGCCAGCAGTTTTTTGAACAGGTTAATGTTCAAACCACCGCACAA‑CCCACGGTCGGTCGACACCACCAGGTAGCCCACGCGTTTAACGGCGCGGTCTTCCAGGTAAGGGTGCTTATATTCCAGATTACCGTGTGCAAGGTGA‑CCAATCACTTTGCCCCTGGTTTCGTATTACGGACGGCGGGGCGCCATggcgac > 1:738654/1‑293 (MQ=255) ggg‑‑CAACAACATTGCCGCCCACGGAGTTGAAGAACGACACGCCTTTCGAGCCGATCATTGCGAGGTCGCATTGAACGCCTTTGTCGGTCCAGGTCTTCATTTCCGCCAGCAGTTTTTTGAACAGGTTAATGTTCAAACCACCGCACAA‑ACCACGGTCGGTCGACACCCCCAGGTAGCCCACGCGTTTAACGTCGCGGTCTCCCAGGTAAGGGTGCTTATATTCCAGATTACAGTGTGC‑ACGTGACCCAACCACTTTGCGCATGCGTTCTGCa > 1:1221429/1‑272 (MQ=255) | ACCACGCCCTGATAAACCTGAGATTCGACATAACGACGCAGCAGGGTATCCAGCAACGCCTTCGGATCGGGTTCGTACAGGTAATCCCAGGATTTATGTTTCAGATCATCATCATCTGATGCCGGTAACGGCAGCAGCTGGCTGATGGTCGGAACCTGAGACATGGTGTTAATAAATTTGTTGCTGACAATGTAAAGCTTGTCCAGACGGCCTTCGTCGTAGGCCTGCAACATCACTTTTACCGGACCGATCAGTTCGGACAGGGAAGGGTTATCCCCCATGCCGGTGACCTGGG‑‑CAACAACATTGCCGCCCACGGAGTTGAAGAACGACACGCCTTTCGAGCCGATCATTGCGAGGTCGCATTGAACGCCTTTGTCGGTCCAGGTCTTCATTTCCGCCAGCAGTTTTTTGAACAGGTTAATGTTCAAACCACCGCACAA‑ACCACGGTCGGTCGACACCACCAGGTAGCCCACGCGTTTAACGTCGCGGTCTTCCAGGTAAGGGTGCTTATATTCCAGATTACCGTGTGCAAGGTGA‑CCAATCACTTTGCGCATGGTTTCTGCATAAGGACGGCTGGCCGCCATGCGATCCTG > NC_000913/3917568‑3918160 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |