| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,311,830 | A→G | 9.6% | intergenic (+22/+18) | tonB → / ← yciA | membrane spanning protein in TonB‑ExbB‑ExbD transport complex/acyl‑CoA esterase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,311,830 | 0 | A | G | 9.6% | 139.5 / 4.8 | 52 | intergenic (+22/+18) | tonB/yciA | membrane spanning protein in TonB‑ExbB‑ExbD transport complex/acyl‑CoA esterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (24/23); new base G (3/2); total (27/25) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.64e-01 | |||||||||||
CTTCAGGACCACGCGCATTAAGCCGTAATCAGCCGCAGTATCCGGCACGAGCACAGGCATTGCGCATTGAAGGGCAGGTTAAAGTTAAATTTGACGTTACGCCGGATGGTCGCGTGGATAACGTACAAATCCTCTCAGCCAAGCCTGCGAACATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTAT‑AGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACTTCAATATTAATGCTGACCGATGTCGTCCCTTTCTGGACACAGCGTGCATAGCAGCACACCACATCGCCGACCGCAACCGGCCGTAAGAAAGTCATTCCTTCAACCCGCACAGTCACTACGCGACCGTGGGCAATTTCTTTTGCCAGAATAGCGCCG > NC_000913/1311537‑1312124 | cTTCAGGACCACGCGCATTAAGCCGTAATCAGCCGCAGTATCCGGCACGAGCACAGGCATTGCGCATTGAAGGGCAGGTTAAAGTTAAATTTGACGTTACGCCGGATGGTCGCGTGGATAACGTACAAATCCTCTCAGCCAAGTCTGCGAACATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACACCCGAAATTCAGAAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAgg > 1:458178/1‑301 (MQ=255) cACGCGCATTAAGCCGTAATCAGCCGCAGTATCCGGCACGAGCACAGGCATTGCGCATTGAAGGGCAGGTTAAAGTTAAATTTGACGTTACGCCGGATGGTCGCGTGGATAACGTACAAATCCTCTCAGCCAAGCCTGCGAACATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACt > 2:640855/1‑301 (MQ=255) cgcttgtccgttctgtttCCGGCACTAGCACAGGCATTGCGCTTTGAAGGGCAGGTTAAAGTTAAATTTGACGTTACGCCGGATGGTCGCGTGGATAACGTACTAATCCTCTCAGCCAAGCCTGCGAACATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGt < 1:491696/284‑1 (MQ=255) aTCAGCCGCAGTATCCGGCACGAGCACAGGCATTGCGCATTGAAGGGCAGGTTAAAGTTAAATTTGACGTTACGCCGGATGGTCGCGTGGATAACGTACAAATCCTCTCAGCCAAGCCTGCGAACATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAga > 2:446675/1‑300 (MQ=255) gCCGCAGTATCCGGCACGAGCACAGGCATTGCGCATTGAAGGGCAGGTTAAAGTTAAATTTGACGTTACGCCGGATGGTCGCGTGGATAACGTACAAATCCTCTCAGCCAAGCCTGCGAACATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGAACGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGcgcg > 2:625839/1‑301 (MQ=255) gCAGTATCCGGCACGAGCACAGGCATTGCGCATTGAAGGGCAGGTTAAAGTTAAATTTGACGTTACGCCGGATGGTCGCGTGGATAACGTACAAATCCTCTCAGCCAAGCCTGCGAACATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAgg < 2:408699/301‑1 (MQ=255) gTATCCGGCACGAGCACAGGCATTGCGCATTGAAGGGCAGGTTAAAGTTAAATTTGACGTTACGCCGGATGGTCGCGTGGATAACGTACAAATCCTCTCAGCCAAGCCTGCGAACATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTagatcggaagagca > 2:492342/1‑288 (MQ=255) aaTCCGGCACGGGCACAGGGATTGGGCATTTAAGGGCAGGTTAAAGTTAAATTTGACGTTACGCCGGATGGTCGCGTGGATAACGTACAAATCCTCTCAGCCAAGCCTGCGAACATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGtttt < 1:639978/300‑1 (MQ=255) gcaggggaagagggatgtcggaTTGAAGTGAAGGTTAAAGTTAAATTTGACGTTACGCCGGATGGTCGCGTGGATAACGTACAAAGCCGCTCAGCCAAGCCTGCGAACATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCa < 1:538262/280‑1 (MQ=255) gCACGAGCACAGGCATTGCGCATTGAAGGGCAGGTTAAAGTTAAATTTGACGTTACGCCGGATGGTCGCGTGGATAACGTACAAATCCTCTCAGCCAAGCCTGCGAACATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCa > 2:547964/1‑301 (MQ=255) cATTGCGCATTGAAGGGCAGGTTAAAGTTAAATTTGACGTTACGCCGGATGGTCGCGTGGATAACGTACAAATCCTCTCAGCCAAGCCTGCGAACATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACcgcgc > 1:70994/1‑300 (MQ=255) gcgcATTGAAGGGTATGTTAAAGGTAAATTTGACGTTACGCCGGATGGGTGCGTGGATAACGTACAAATCCTCTCAGCCAAGCCTGCGAACATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATa < 1:396289/301‑1 (MQ=255) gcgcATTGAAGGGCAGGTTAAAGTTAAATTTGACGTTACGCCGGATGGTCGCGTGGATAACGTACAAATCCTCTCAGCCAAGCCTGCGAACATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATa > 2:408904/1‑301 (MQ=255) tGAAGGGCAGGTTAAAGTTAAATTTGACGTTACGCCGGATGGTCGCGTGGATAACGTACAAATCCTCTCAGCCAAGCCTGCGAACATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTAAGGATCAACCGCGACATACTTaaa > 2:615732/1‑301 (MQ=255) aGGGCAGGTTAAAGTTAAATTTGACGTTACGCCGGATGGTCGCGTGGATAACGTACAAATCCTCTCAGCCAAGCCTGCGAACATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCACGACATACTTAaataa > 2:57037/1‑301 (MQ=255) ggtgtggTTAAAGTTCATGTTGGTGTTACGCCGGTTGGTGGCGTGGATACCGTACAAATCCGCTCAGCCAAGCCGGCGAACATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGTATTGTGGTGAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAaataat < 1:429249/296‑1 (MQ=255) taaaTTTGACGTTACGCCGGATGGTCGCGTGGATAACGTACAAATCCTCTCAGCCAAGCCTGCGAACATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACCTACTTAAATAATGCTTCTGTCGCtat > 2:338958/1‑299 (MQ=255) tttGACGTTACGCCGGATGGTCGCGTGGATAACGTAAAAATCCTTTCAGCCAAGCCTGCGAACATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTAT‑Ag < 1:408341/301‑1 (MQ=255) tGACGTTACGCCGGATGGTCGCGTGGATAACGTACAAATCCTCTCAGCCAAGCCTGCGAACATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTAT‑AGCg < 2:71084/301‑1 (MQ=255) ggctttACGCGGGGTGGTCGCGGTGATAATGTACAAATCCTTTCATCCAAGTCTGGGAACATGTTTGCGCGTGAGGTGAATAATGCGATGCGCAGATGGCGTTAGGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGTTTCTGTCGCTTTAT‑AGCGt < 1:614874/297‑1 (MQ=255) tACGCCGGATGGTCGCGTGGATAACGTACAAATCCTCTCAGCCAAGTCTGCGAACATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTAT‑AGCGTTGccc < 2:458742/301‑1 (MQ=255) gcgTGGATAACGTACAAATCCTCTCAGCCAAGCCTGCGAACATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTAT‑AGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACg > 2:560103/1‑301 (MQ=255) cgTGGATAACGTACAAATCCTCTCAGCCAAGCCTGCGAACATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑CCTATTACTCAACAGGTAAGGCACGAGGTTTTCATTCCGGATCAACCCAGCCATACTTAACTAATGCTTCTGTCGCTTTAT‑AGCATTTCCCAATTGCATCAGAAGc > 1:397730/1‑301 (MQ=255) ccggtctgCCAAGCCTTCGAACATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTAT‑AGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCacac < 1:628095/294‑1 (MQ=255) tctgagccaatgtgtctaaCAGGTTTGAGCGTGGGGTGAAAAATGCGATGCGGAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATGGTGGTGAAT‑ATCCGGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTAT‑AGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACtt < 1:329849/284‑1 (MQ=255) cAGCCAAGCCTGCGAACATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTCAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTAT‑AGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTAATTTTTTAACCCAAACTCCaa > 1:35750/1‑301 (MQ=255) gCCAAGCCTGCGAACATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTAT‑AGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCacacagatcgg > 2:628972/1‑294 (MQ=255) aCATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTAT‑AGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACTTCAATATTAATGCTGAcca > 2:500428/1‑300 (MQ=255) tGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGCTGGTGG‑GAATAACCCTGTTTAAAATAACCGCCACCCCCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTAAAAAGCC‑CCGACCCGAGGCCTTTGAACTATTATCCAAAAGTAAAGGCCCAAGGTTTCCCTCAGGGATCAACCCCGCCTTATTAAAATAAT‑CATCCTTCCCTTTTTAAGCTTTGCCAAATTGGTCCAGACACACCTTTTTCCAcaccacctccaaaatcaacccacccccaat > 1:161324/1‑272 (MQ=255) gTTTGGGCGTGATGTGAAAAATGGGGTGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGACAGGCAGTGGGATTGTGGTGAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTAT‑AGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACTTCAATATTAATGCTGACCGATgt < 1:111492/301‑1 (MQ=255) gCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCATATGGGGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTAT‑AGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACTTCAATATTAATGCTGACCGATGTCGTccc < 1:547291/301‑1 (MQ=255) gAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGTCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGGAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTAT‑AGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACTTCAATATTAATGCTGACCGATGTCGTCCCTTTc < 1:305986/301‑1 (MQ=255) aaGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTAT‑AGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACTTCAATATTAATGCTGACCGATGTCGTCCCTTTc < 1:559389/300‑1 (MQ=255) aGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTAT‑AGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACTTCAATATTAATGCTGACCGATGTCGTCCCTTTCTGGACACAGCGTGCATagcag < 2:398244/301‑1 (MQ=255) aGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTAT‑AGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACTTCAATATTAATGCTGACCGATGTCGTCCCTTTCTGGACACAGCGTGCATAGCAGCACACCACATCGc < 2:95909/301‑1 (MQ=255) ttatgCCAGGCAGTGGTATTTTGTTGAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGTGGCTTTTG‑ACTATGAATCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCACGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTAT‑AGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACTTCAATATTAATGCTGACCGATGTCGTCCCTTTCTGGACACAGCGTGCATAGCAGCACACCACATCGCCGACCg < 1:56969/297‑1 (MQ=255) gtctggaaGTGGGAGTGTGGTTCAT‑ATGCTGTTTAAAATTAACGGGACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCGAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTAT‑AGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACTTCAATATTAATGCTGACCGATGTCGTCCCTTTCTGGACACAGCGTGCATAGCAGCACACCACATCGCCGACCGCAAc < 1:181497/294‑1 (MQ=255) cAGTGGGATTGTGGTGAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTAT‑AGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACTTCAATATTAATGCTGACCGATGTCGTCCCTTTATGGACACAGCGTGAATAGCAGCACACAACATCGCCGAACGAAACCggacc > 2:334536/1‑298 (MQ=255) gtggtgAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTAT‑AGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACTTCAATATTAATGCTGACCGATGTCGTCCCTTTCTGGACCCACCATGCAAACAAGCACACCACATCACCGACCCCAACCGACCGAAACAAAgcc > 1:469188/1‑299 (MQ=255) cgatctccaccGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTGTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTAT‑AGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACTTCAATATTAATGCTGACCGATGTCGTCCCTTTCTGGACACAGCGTGCATAGCAGCACACCACATCGCCGACCGCAACCGGCCGTAAGAAAGTCATTCCTTCAACCCGCACAGTCACTa < 1:135730/295‑1 (MQ=255) ctcgcgccttacctgttgagtaataGTCAAAAGCCTCCGGTCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTAT‑AGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACTTCAATATTAATGCTGACCGATGTCGTCCCTTTCTGGACACAGCGTGCATAGCAGCACACCACATCGCCGACCGCAACCGCCCGTAAGAAAGTCATTCCTTCAACCCGCACAGTCACTAcgcgc > 2:356447/25‑300 (MQ=255) ccaccGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTAT‑AGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACTTCAATATTAATGCTGACCGATGTCGTCCCTTTCTGGACACAGCGTGCATAGCAGCACACCACATCGCCGACCGCAACCGGCCGTAAGAAAGTCATTCCTTCAACCCGCACAGTCACTaagatcg > 2:135855/1‑295 (MQ=255) tgagtaataGTCAAAAGCCTCCGGTCGGTGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACGTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTAT‑AGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACTTCAATATTAATGCTGACCGATGTCGTCCCTTTCTGGACACAGCGTGCATAGCAGCACACCACATCGCCGACCGCAACCGGCCGTAAGAAAGTCATTCCTTCAACCCGCACAGTCACTACGCGACCGTGGGCAATTTCtt < 1:355963/293‑1 (MQ=255) aGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTAT‑AGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACTTCAATATTAATGCTGACCGATGTCGTCCCTTTCTGGACACAGCGTGCATAGCAGCACACCACATCGCCGACCGCAACCGGCCGTAAGAAAGTCATTCCTTCAACCCGCACAGTCACTACGCGACCGTGGGCAATTTCttt < 2:35801/301‑1 (MQ=255) aGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTAT‑AGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACTTCAATATTAATGCTGACCGATGTCGTCCCTTTCTGGACACAGCGTGCATAGCAGCACACCACATCGCCGACCGCAACCGGCCGTAAGAAAGTCATTCCTTCAACCCGCACAGTCACTACGCAACCGTAGGCAATTTCttt > 2:383627/1‑301 (MQ=255) tcttccgatctaaaGCCTCCGGTCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTAT‑AGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACTTCAATATTAATGCTGACCGATGTCGTCCCTTTCTGGACACAGCGTGCATAGCAGCACACCACATCGCCGACCGCAACCGGCCGTAAGAAAGTCATTCCTTCAACCCGCACAGTCACTACGCGACCGTGGGCAATTTCtttt < 2:164938/290‑1 (MQ=255) aGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTAT‑AGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACTTCAATATTAATGCTGACCGATGTCGTCCCTTTCTGGACACAGCGTGCATAGCAGCACACCACATCGCCGACCGCAACCGGCCGTAAGAAAGTCATTCCTTCAACCCGCACAGTCACTACGCGACCGTGGGCAATTTCTTTTGc < 2:469789/301‑1 (MQ=255) cAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGCTCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTAT‑AGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACTTCAATATTAATGCTGACCGATGTCGTCCCTTTCTGGACACAGCGTGCCTAGCAGCACACCACATAGCAGACCGCAACCGGCCGACAGCAAGTCATTCCTTCAACCAGCACAGTCACTACGCCCACGTGGGCAATTTCTTTTCCCAGaaca > 1:500018/1‑299 (MQ=255) cAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTAT‑AGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACTTCAAGATTAATGCTGACCGATGTCGTCCCTTTCTGGACACAGCGTGCATAGCAACACACCACACAGCCGACCGCAACCGACCGTCAGACACTCAATCCTTCAACCCACCCAGTCACAACGCCACCCGGCACAATTTCTTTTCCCataata > 1:499997/1‑301 (MQ=255) aaaGCCTCCGGTCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTAT‑AGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACTTCAATATTAATGCTGACCGATGTCGTCCCTTTCTGGACACAGCGTGCATAGCAGCACACCACATCGCCGACCGCAACCGGCCGTAAGAAAGTCATTCCTTCAACCCGCACAGTCACTACGCGACCGTGGGCAATTTCTTTTGCCAGAATAga > 2:640656/1‑300 (MQ=255) aaaGCCTCCGGTCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTAT‑AGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACTTCAATATTAATGCTGACCGATGTCGTCCCTTTCTGGACACAGCGTGCATAGCAGCACACCACATCGCCGACCGCAACCGGCCGTAAGAAAGTCATTCCTTCAACCCGCACAGCCACTAACCGACCGTGGGCAATTTCttttagatcggaaga > 1:164786/1‑290 (MQ=255) ccTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTAT‑AGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACTTCAATATTAATGCTGACCGATGTCGTCCCTTTCTGGACACAGCGTGCATAGCAGCACACCACATCGCCGACCGCAACCGGCCGTAAGAAAGTCATTCCTTCAACCCGCACAGTCACTACGCGACCGTGGGCAATTTCTTTTGCCAGAATAGcgccc > 2:236299/1‑300 (MQ=255) | CTTCAGGACCACGCGCATTAAGCCGTAATCAGCCGCAGTATCCGGCACGAGCACAGGCATTGCGCATTGAAGGGCAGGTTAAAGTTAAATTTGACGTTACGCCGGATGGTCGCGTGGATAACGTACAAATCCTCTCAGCCAAGCCTGCGAACATGTTTGAGCGTGAGGTGAAAAATGCGATGCGCAGATGGCGTTATGAGCCGGGTAAGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAAT‑ATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTG‑ACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGGTTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTAT‑AGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACTTCAATATTAATGCTGACCGATGTCGTCCCTTTCTGGACACAGCGTGCATAGCAGCACACCACATCGCCGACCGCAACCGGCCGTAAGAAAGTCATTCCTTCAACCCGCACAGTCACTACGCGACCGTGGGCAATTTCTTTTGCCAGAATAGCGCCG > NC_000913/1311537‑1312124 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |